Protein

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Genbank accession
QBJ03609.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,68
Protein sequence
MADEVVSSLNKPTRRESALGKNVAVRDLSTNEQLYVSWGIVTNVYYKKGTLDFKTTLMGSSYTAMEKHNTMSGSAKIPVDFWGNNSDGKPFGSYRPISVGNRILVAYINGKTSSPVVIGVYPDTESSYELISPAIDDTSSIDGTTDEVGSDLATKKVYPSGQVYYQSGKGDLYRLFNGKSYFTVNSSYASRINRGIERLGQQGTYSDDSSDTSKSVMAGDWSLVHEDNTEKDTDNITNNHYTRVYLNRYGNLAIIATDKDSGQVVSMIEVSQNGGITLSKQYDGIGDDGIDSSIYTKLTVGDKDKTTSIISSDGTNTGTIDVSPDTVNVNGKPIANTQDTDNEINNAVSGITKEWTENLADEISKVQDEVQKATQEATDAANNAQQVGNQAAGVAEAAKQAASTAQEIANEAQTAGNAALIKANSAYDTGTQAQRAADNAQAAANSAAAIGNSAQEAADSVAAQAKKNTKDIAGLNEDTKDAQQTANSATQQANSAFDKANEALEGIQGISTTKSDKNVDPNRVKGVTVSPSSTMTFSDLNSELSDLQVNTVTFQIRVNFNNAKDSNPVLNVNDYAQVEGFLKKINTLDVIPKVLIEPLPVVSSGYVSPKNYTPTDVSSFFNSWTKIVSSVATMVNQYNVYGLYIGYAFDNLESYTDNWTSLISTVKPIFSGQLLYMSSYWTTATWDTNSNNKYQTKLAYPLWGMVDIIAIAPYFEVTDDAEPTASDLEGYFKNVPLYQRGQNIYQEIKNFYDKWKKPILLGDVGIPAYSGAAQAPYNGTTMSSQVVSSSIQESWLEAWYVTFEDLDWFKGINSYCIGNPYDSYNYDNSTSVYAYWKKIFYYEKSVNQSQIVQLDDMLATKVSDKDFTSQTVELSNQISTKVEQNQYDLDMTTKNTGVVDTNRIKGGNLSDKVQGSTSNIIDSINTLKLNSITLPIYITATDTSDSSPVVSDTDLTGLETSIKAVQANDNTTKILLEPYPLINKGTSSSSGWEPSSVDTWFTSWTSVMSKIAQLAAKYQVYGLYVGSKLDSLESYSSKWDTLITSIRSILSSLDTSTSKNTTRVLYETTHWVTSKDASDTQTAYQNKLNNPLFGYVDIIAIAAYFEVTDKVNPSVQDIKDGIYSVPIHDRGQNIYQEIKNFYDKWNKPILFGELGIPPYDQSASAPYQASIQPGWRPSDTIQHNWFAAWYEVFAPETWLLGFSIFNVGDSNSTYYVQSGDIASFLSQLNLYQSTVSQSQITQLVDDINFRVQKGDVITQINLDDSGVLIDGAKNHITGKTTIDDGIIKTAMIGDAQITDAKIDSLTASKLTAGTIDASVISVTNLNASNITTGTMSASKVVGGELDFNNIVAKNLTASSITSGTIDFSKIEGTNIDATNITTGNLNASLLTTGTINADLITTGTLDASKVVVANLSASSILTGTLDASKVTVSNIDASKIVTGTLDASVVSVINLNASNITAGTLTADLIKTGTFDISKVNVENFSANNIVAGTISGKDLSINLDTGAVNFESGTISGKDLSINLDTGAVNFESGNIKNSANTFEIDVTKGEILSGNNIGVMTINDADISYWKDTNASIWQGQIVLNRIAVGATYPSILLRSSDAIVMDPGNGNSPKDSTSSLTGASYFSGKFTDLATVTKLSEFDRGTNPGGYMYRAYESGTTDVGSDLTHLYINPYASWEVKLPPVYHSTGGNAGSPAFGSKPLVEVYGGGMYLNGSMQIYGSLAVGGAKQSIQPTRDGVRGLYAYETAESYFGDLGDSSTDSTCKVRINIETIFRDTVNTSFPYQVFISSYGKGTLWVSEKHSDYFVVESSLPNIPFGWEVKVRRRGSETDRLPKSDISLKQLQNMDEKHMDSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1857 AA
molecular weight: 201058,85030 Da
isoelectric point:4,62359
aromaticity:0,08885
hydropathy:-0,32849

Domains

Domains [InterPro]
DC_0336
RBD
1–75
DC_0336 PTHR47372 G3DSA:3.20.20.80 G3DSA:3.20.20.80 DC_1258 DC_1258
DC_1669
ATT
289–538
DC_1669 IPR017853 IPR017853 DC_1258 DC_1054
Coil
Unmapped
356–390
Coil Coil IPR055151 IPR055151
DC_1258
STR
1202–1352
DC_1258
QBJ03609.1
1 1857
Architecture
RBD
ATT
STR
ATT
STR
STR
ATT
STR
RBD 1-75 | ATT 289-538 | STR 539-604 | ATT 605-826 | STR 827-839 | STR 905-989 | ATT 990-1211 | STR 1212-1857
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage 3-521
[NCBI] 		2510943 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactobacillus brevis
[NCBI] 		1580 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBJ03609.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK504444.1 [NCBI]
CDS location
range 60521 -> 66094
strand +
CDS
ATGGCAGATGAGGTTGTTAGCTCTCTTAATAAGCCCACAAGAAGAGAGTCCGCTTTAGGAAAGAATGTAGCAGTACGGGATTTATCTACTAATGAGCAGTTATATGTATCCTGGGGAATTGTTACTAACGTGTATTATAAAAAAGGAACATTAGACTTTAAAACAACCCTTATGGGTTCCTCTTATACAGCAATGGAAAAACATAACACCATGTCAGGTTCAGCTAAGATTCCAGTTGATTTTTGGGGAAATAACAGTGATGGCAAGCCCTTTGGAAGTTATCGTCCTATATCTGTGGGAAATCGTATATTGGTTGCTTACATCAATGGAAAAACTTCATCTCCTGTTGTGATTGGAGTTTATCCAGATACTGAATCTTCTTATGAACTAATTAGTCCAGCAATTGATGATACCTCTAGTATAGATGGAACAACAGATGAAGTTGGTAGTGATTTAGCAACTAAAAAAGTATATCCCTCTGGTCAAGTATACTATCAATCTGGTAAAGGTGACTTATATCGTCTATTTAATGGAAAATCATACTTTACTGTTAATAGTTCGTATGCCTCCAGAATAAATAGAGGTATTGAACGTTTGGGTCAACAGGGGACTTACTCCGATGATTCCTCTGATACTTCTAAGTCAGTTATGGCAGGAGACTGGAGTTTAGTTCATGAGGATAATACTGAGAAAGATACAGATAATATAACCAATAATCACTATACTCGTGTGTACTTAAATAGATACGGAAATTTAGCTATTATTGCTACAGATAAAGATAGCGGTCAAGTAGTTTCTATGATAGAAGTGTCTCAAAATGGTGGGATAACTCTATCTAAACAGTATGATGGTATTGGTGATGATGGAATTGACAGTTCTATTTATACAAAGCTAACTGTAGGAGATAAGGATAAGACAACTTCTATCATCTCAAGTGATGGTACTAATACAGGTACTATTGATGTTTCTCCAGATACTGTAAATGTTAATGGTAAGCCTATTGCTAACACTCAAGATACAGATAATGAGATTAATAATGCAGTATCTGGTATTACCAAAGAGTGGACTGAAAATTTAGCGGATGAAATTAGTAAGGTACAGGATGAAGTACAAAAGGCTACTCAAGAAGCAACGGACGCTGCAAATAATGCACAACAAGTAGGTAACCAAGCTGCTGGAGTTGCAGAAGCTGCTAAGCAAGCAGCAAGCACTGCTCAGGAAATTGCTAATGAAGCGCAAACTGCTGGTAATGCAGCTTTAATTAAGGCGAACAGTGCTTATGATACAGGTACTCAGGCGCAGAGGGCAGCAGATAACGCACAGGCTGCGGCTAATAGTGCAGCAGCAATTGGCAACAGTGCACAAGAAGCAGCTGATAGTGTTGCAGCACAAGCAAAAAAGAATACCAAGGATATTGCAGGATTAAATGAAGATACAAAAGATGCTCAGCAGACTGCTAACAGTGCAACTCAACAGGCTAATAGTGCATTTGACAAAGCCAATGAGGCATTAGAAGGTATACAAGGTATTAGTACAACTAAGAGTGACAAAAATGTTGACCCTAATCGAGTTAAAGGGGTCACTGTATCTCCTAGTTCAACCATGACTTTTTCTGACCTAAATTCGGAATTATCCGATTTGCAGGTTAATACAGTAACTTTTCAGATTAGGGTTAACTTCAATAATGCAAAAGACTCTAATCCAGTGCTTAATGTTAACGACTATGCTCAAGTTGAGGGATTTCTGAAAAAGATTAATACCTTAGATGTTATTCCAAAGGTACTAATTGAGCCCTTGCCTGTAGTATCATCTGGTTATGTTTCTCCTAAAAACTATACGCCTACTGATGTTTCTTCCTTTTTTAATTCTTGGACTAAGATTGTATCCAGTGTTGCTACTATGGTTAATCAGTACAATGTGTACGGATTATATATTGGTTATGCTTTTGATAACTTAGAAAGTTATACAGATAACTGGACAAGTTTAATTAGTACAGTTAAGCCTATTTTTTCTGGACAGCTGTTGTACATGTCAAGTTATTGGACAACTGCTACCTGGGATACTAATTCTAATAATAAGTACCAAACAAAATTAGCTTATCCTTTGTGGGGAATGGTAGACATTATTGCTATTGCTCCTTATTTTGAAGTTACTGATGATGCTGAACCAACTGCTAGTGACTTAGAGGGGTACTTTAAAAATGTTCCTTTATACCAAAGAGGGCAAAACATTTATCAGGAAATTAAGAATTTTTATGATAAGTGGAAGAAGCCTATCTTACTGGGAGACGTTGGGATACCTGCTTACTCAGGAGCTGCACAAGCACCTTATAATGGTACAACAATGTCTAGTCAAGTAGTTTCATCGAGCATTCAGGAGTCTTGGCTAGAAGCTTGGTATGTTACCTTTGAGGACTTAGACTGGTTTAAGGGTATAAACTCCTATTGTATTGGTAATCCATATGATAGTTATAACTATGATAATAGTACCTCTGTATATGCTTACTGGAAAAAGATTTTTTATTATGAAAAGTCTGTTAACCAGTCTCAGATTGTACAGTTAGACGATATGCTTGCTACTAAGGTATCAGACAAAGACTTTACTTCGCAAACGGTAGAACTAAGTAACCAAATTAGTACTAAAGTTGAGCAAAACCAGTACGATTTAGATATGACTACTAAGAATACTGGAGTAGTTGATACGAATCGGATTAAAGGTGGTAACTTATCGGATAAAGTACAAGGGTCTACTAGCAACATTATTGATAGTATTAATACCCTTAAGCTAAATAGTATCACTTTGCCTATTTATATTACTGCGACGGATACTTCAGATAGTTCTCCAGTAGTATCTGATACTGACTTAACAGGATTAGAAACTAGTATTAAGGCAGTTCAAGCTAATGATAATACAACTAAGATACTATTGGAACCTTATCCTTTAATCAATAAAGGTACAAGTAGTAGTTCAGGGTGGGAACCTTCAAGTGTAGATACTTGGTTTACCTCTTGGACTTCAGTAATGAGTAAAATTGCCCAACTAGCAGCCAAGTACCAGGTATATGGCCTATACGTGGGTTCTAAGCTAGATAGTTTGGAATCCTATAGTAGTAAGTGGGATACCCTTATAACCTCTATACGGTCCATTTTGAGCTCTTTAGACACGAGCACTAGTAAGAATACTACTAGAGTTCTTTATGAAACAACCCATTGGGTAACTTCTAAGGATGCTTCTGATACGCAGACAGCCTATCAAAATAAGCTAAATAATCCTTTATTTGGTTATGTAGATATTATTGCTATAGCTGCCTATTTTGAGGTTACTGATAAAGTTAATCCATCGGTACAAGATATTAAAGATGGCATCTATAGTGTACCTATTCATGATAGGGGACAGAACATTTATCAGGAAATCAAGAATTTCTATGACAAGTGGAATAAACCTATCCTGTTTGGAGAGTTAGGGATACCTCCTTATGACCAGTCAGCTAGTGCCCCTTACCAAGCAAGTATTCAACCTGGATGGAGACCCTCAGATACTATTCAGCATAATTGGTTTGCTGCCTGGTACGAAGTGTTTGCTCCAGAAACTTGGTTATTAGGGTTTAGCATATTTAATGTAGGTGATAGTAATTCTACTTATTATGTACAGTCTGGGGATATCGCTAGTTTCTTATCACAGTTAAACCTGTACCAGTCTACGGTTAGTCAATCACAAATTACTCAATTAGTTGATGACATTAATTTCCGAGTACAAAAAGGTGACGTTATCACTCAAATAAATTTGGATGATAGTGGGGTACTTATTGATGGTGCTAAGAATCACATTACAGGTAAAACAACTATTGATGATGGCATTATAAAAACAGCTATGATTGGTGATGCACAAATAACTGATGCTAAAATAGATAGTTTGACTGCTAGTAAATTGACTGCTGGTACCATTGATGCGAGTGTTATTTCAGTTACCAATTTAAATGCCTCTAATATTACTACAGGTACTATGTCTGCAAGTAAAGTTGTTGGTGGAGAGTTAGACTTTAACAACATTGTAGCTAAGAATCTAACTGCTAGTAGTATTACATCTGGTACAATAGACTTTAGTAAGATAGAGGGAACCAACATTGATGCTACCAATATTACTACCGGTAACTTAAATGCGAGTCTACTTACTACTGGTACTATTAATGCTGACTTAATCACAACGGGTACTTTAGATGCAAGCAAAGTAGTTGTTGCTAATTTAAGTGCTTCCTCCATTTTAACTGGTACTTTAGATGCAAGCAAGGTAACAGTATCTAATATTGACGCTAGTAAAATTGTAACAGGTACTTTAGATGCAAGCGTTGTTAGTGTGATTAATTTGAATGCATCAAATATTACTGCGGGTACTTTAACAGCTGACTTAATTAAGACGGGTACCTTTGATATCTCTAAGGTTAACGTGGAAAACTTTAGTGCTAACAATATTGTGGCCGGTACTATTTCTGGTAAGGATTTAAGCATTAATCTTGATACTGGTGCAGTTAACTTTGAATCTGGTACTATTTCTGGTAAGGATTTAAGTATTAACCTTGATACTGGTGCAGTTAACTTTGAATCTGGTAATATAAAAAACAGTGCAAATACCTTTGAAATAGATGTAACTAAGGGTGAAATACTTAGTGGAAATAACATTGGGGTAATGACTATTAATGATGCAGATATTAGTTATTGGAAAGACACTAATGCTTCTATTTGGCAAGGTCAGATTGTTCTTAATAGAATAGCGGTTGGTGCAACTTATCCTAGTATTTTGCTTAGGTCTTCTGATGCTATTGTTATGGACCCAGGAAATGGTAATTCTCCAAAAGACAGTACTAGTTCTCTTACTGGTGCTTCATACTTTAGTGGTAAATTTACAGATTTGGCAACAGTGACTAAATTATCAGAATTTGATAGAGGTACTAATCCGGGAGGATATATGTACAGAGCTTATGAAAGCGGGACAACAGATGTAGGGAGTGACCTTACTCATTTGTATATAAATCCTTATGCTTCCTGGGAAGTTAAGCTTCCTCCTGTTTATCATTCTACTGGAGGAAATGCAGGTTCTCCCGCTTTTGGTAGTAAGCCACTAGTTGAGGTTTACGGTGGTGGTATGTACCTAAATGGTTCTATGCAGATTTATGGTAGCTTGGCTGTTGGTGGTGCTAAACAAAGTATCCAACCTACTCGTGATGGCGTTCGTGGATTGTACGCATACGAAACTGCTGAAAGTTACTTTGGAGACCTTGGCGATAGTTCTACTGATTCTACTTGTAAAGTTCGTATTAATATAGAAACTATATTTAGAGATACCGTTAATACAAGCTTTCCATACCAAGTATTTATTTCCTCATATGGAAAGGGTACCTTATGGGTATCTGAGAAGCATAGTGACTACTTTGTTGTAGAATCTTCTTTGCCCAACATTCCTTTTGGGTGGGAAGTTAAGGTACGTCGTAGAGGGAGTGAAACAGACCGTTTGCCTAAATCAGACATCTCTCTAAAGCAGCTTCAAAATATGGATGAAAAACATATGGACAGCAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
176307aef114ba50b03e42ff3ca67155d8d2582244c47d2a874134fd17217d3a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6102
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation of virulent Lactobacillus brevis phages Feyereisen,M., Mahony,J., O'Sullivan,T. and van Sinderen,D. 2019-04-26 — GenBank