Protein

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Genbank accession
YP_009323446.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,55
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,86
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDIDAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKLQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMIIFANRLWHFWEAANEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDIIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETEWVLNDVLTFNGNISYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTTPATARDTVGTNVYNKNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQTASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQQETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLTGIARIATQVEFDAGTLDNVISTPLKVKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEGALTHSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTANITGNTILGSLEVTGNSTFKNDVSVSSGKSIKFVGPQSGAGTWNSQGDTLAPIFAEINSTPDAKFHPIVKQRLGQGTFSLGTVNDGTRDFKIHYLPSPGSLESFYWTFNTTGDFAVNSGSISISKNANITGITTSNGVSTTTLNASALSSLQNVTTSGTIVSTGQVSANNGLVAQKYVRSVGVKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDSATFNLFPGYWTMKTKRQVNIDTVQTKPAGVSDEIWNASGWLTETGAFSSPAIRYRNEDGSFGDEVLSTTGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGPNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1349 AA
molecular weight: 146351,26100 Da
isoelectric point:5,65886
aromaticity:0,08154
hydropathy:-0,33877

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1143–1176
IPR048391 IPR048391
YP_009323446.1
1 1349
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1142 | ATT 1143-1176 | STR 1177-1234 | ATT 1235-1297 | STR 1298-1331 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage WG01
[NCBI] 		1837931 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Dhakavirus
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009323446.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_031928 [NCBI]
CDS location
range 150858 -> 154907
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCGATGCTCCAGCAGGAACCTTTGTACCGGGTTATTGGACTGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGATTACCGTAGCATCTCCTACACGCCAGCTGGCTTCCGGTGAATATATTGCTGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCGAACCCTACTGATGGTGATACCATCGTAATCAAGGATATTGGTGGCCGTGTAGGTTATAATGAAATTAAGCTCCAGTCTAGTTCTGCTCCAGGTGGTGGTAATCAGAAAATTGTCCGTTTCGGTAACCAGTTCACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCCTATAATATGATTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAAGCAGCTAATGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACACCGCCCAGTTCCAATCACAAGCGGGTGATAACGTTTTACGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGTGATATTATTAAAACCGTTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAATTCCACTTAATCGTTGAAACATTTGATGCGTCATCTTCATTAGGTAAGCCCGGCCAGCATAGCATGGAATTCCGTACTTCAGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGCGACCGACAAACTCGTTTACGTGTAATTCGTGACGATGTTGAACTCTTGGCTAACGAAAGTGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACGACACCCCAGACAATTAATATCACATTACCTACCGGTGTGGCCCAGGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACGGTAAATATTAAGGCTGCCGTAGGAGATAAGATTGCTTCATCCGTCCAGTTGCTTCAATTCCCTAAACGTTCAGAATATCCGCCAGAAACCGAATGGGTATTGAATGACGTACTGACCTTTAATGGCAATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACACCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCCCAGAACGTTCCTACTATAGAACGTGTGGATTCTAAAGATGATTTAACTCGTGCTCGTTTAGGTGTTATTGCCCTTGCGTCCCAGACTCAAGCAAACGTCGACCATGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTGGCAATTACTCCGCAGACTTTAGCTAATCGTGTAGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAAGTGAACCAGGACACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACACGTCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACCAATGCTGGTACAGATGATACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCACGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCACTCCTGCGACTGCTAGGGACACCGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACGGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGTCAAACTGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCTGAAACATTACATGCTCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCAGTAACGCCTAAAACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCTGGTACGTTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAGTTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACTCAACGTGGTACTGCTCGCCTGGCAACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACCGATGATAAAACTATCATCACTCCTTTGAAATTGCATTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCAACGAATACCGAAACAACTGCAGGAACTTCTAAAGTTCTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAAACCGAAACCACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAACTAACCGAAGGTGCTTTAACCCATTCAGGAAATAAAGTTACTGGTTCTGGTGTTAAATTTAACTCAGGTACAGGCCTTTACGAGAACGATGATACTGTTCTGAATGCAGCGAACTATCCTAAAACAGGTTATGCTGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTAGATTCACTTCAGTTCATTCGTAGAGACGTTGACCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACGTTGACAAAACAATTGAACCTGGCAGCTCCTCTAGTGTCTTCTAGTACTGCTAATATTACCGGCAATACTATTTTAGGTTCTCTGGAAGTAACCGGAAATTCTACTTTTAAAAATGATGTATCTGTTAGCTCAGGTAAATCTATTAAATTTGTAGGCCCTCAGTCAGGCGCTGGTACTTGGAACTCTCAAGGTGATACTTTAGCTCCGATTTTTGCCGAGATAAATTCGACCCCAGATGCCAAGTTCCATCCTATTGTTAAACAACGTTTAGGGCAAGGTACGTTCTCTTTAGGCACTGTAAATGATGGAACTCGTGATTTTAAAATACATTATCTTCCATCGCCGGGTTCTTTAGAATCTTTCTACTGGACCTTTAATACGACTGGTGACTTTGCTGTTAATAGTGGTTCCATTAGTATTTCTAAGAATGCTAATATCACAGGTATAACCACTTCTAACGGTGTTTCTACAACTACATTAAATGCTTCTGCTCTGTCTTCATTACAAAACGTAACTACTTCAGGTACTATCGTTTCCACCGGACAGGTATCGGCAAATAATGGTTTGGTTGCTCAAAAATACGTCCGCTCTGTTGGTGTTAAACCTACATTAGCATCGCAGGCCCCTACTGCAGAAACAGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATTCGGCTACATTTAACCTATTCCCAGGTTATTGGACGATGAAAACTAAACGTCAGGTTAATATTGATACGGTCCAAACTAAACCTGCCGGTGTTTCTGATGAGATATGGAATGCTTCTGGTTGGTTGACAGAAACGGGTGCATTTAGTTCTCCGGCTATTCGTTATCGTAACGAAGACGGTAGTTTTGGTGACGAAGTTCTCAGTACGACGGGTCAGAAATTACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAGGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGACCGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCATGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACGGCAGATAACCCTCCTTCTGCGGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCTACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCCGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
14ecbed2e05c30d0244e0b491eea189da44186b393bc8042f175b0e47ef2a2c9
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5332
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome analysis of T4 like phage of avian pathogenic Escherichia coli Xu,J., Chen,M. and Zhang,W. 2016-05 — GenBank