Protein

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Genbank accession
YP_006489033.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,53
Protein sequence
MAEIKTSFRATYGIDAGGEKVINVKKADKTVMTDGVNVEYLIQENTTQMYDPERGYPKDFAVLFNGRLWYAKQATPTPAGPFNEGYWSPARTDPKWYQVAGNRTMQVGEYLTIDTLSVRNLELTLPSNAQEGDNITIRDVGGEPGYADILIKAGTQSIIDKGERLKEIKMTIPFSEWTFIYVNKLWTLYNGSEADLARTLRPADTPYKIQSGETILRSYDRASPIKVQFPKNANNGDMIHFVGMDAATSAPYFHLELNSFDANTSIIAPNTPKVVLQRSLSGYFIYNATTRIWMLFDSDMTDRLRTVSSDTNLFPNETVSVVGTSNATVPAFTLTLPTQVSDGDQITVALNYMRKGQTVNITASGRDMILTNKNLTQFPKRKDYPEEGNWVNTKSLQYNGASDYPPVITFVYIIMNPDPDPTKFLAQWMVVDNNPMIERVDPTNPARLGVIALATQNQANLDKGQIAANPIAKELAITPETLANRTALESRQGIAAISTKDQNSLPTDSAAYDDLTIVTPLKLNQKQATETMRGLAEIVDDTEIKSNTNDTHIITPKKLDARRATASLSGVAMLVETGGVSATARNAPGTGVFNYADNARVITPTTLREFKATETQQGGGFLAMDSEVIAGTPNPAGIPLLVTPEQLHKKTATTGRIGFVQTATEAEVLAGTDPLKYVSPFTLAKRVATDSATGLARFAKQTEFNAGTAGLISDPAVIKTFFSDATRTEVDNTSGLTQSGNLWTSTVFNIVAPTDKQRGTARLSTQAEVNTGTDYTTIVTPLTLHNKKSTTTAEGIIRVANTSETDAGTSVNTAVCPLNLKHMIQKQESWAASNTVRGPVLLSEGAMTFAGNDVTGSTAALLPTYKQVGYAISPYELNKTLMNFLPAKAKAVDSDKLDGLDSTQFIRRDIAQTVTGSLTFNAVSTFNANVNLIGANTTLTADGVVQAKQGLTVGRSFNVTVVDNTGLSLGGGIQTNSNNRPMYGMYVGHKNWAGCGAHGAVNQDFAIYNICSVSGSEKRGWVFQRGLVSTEQVNNTNVASISVYGEATFDGYVDAGAHYRLRTIPVVDMDAGKTNIRIGSNSQALTLVSNAPTAIEASDGATLLTTNNYTTLAAPTFVKKAGDTMTGDLLIQAASIKVVRPESAAMATAAPIAGSWSSNIENPAIYSLFKAGYKVPIMDPLKPTIISGYEEFDGPGILSQVGTDKTQGTYQIWVPRPTAANATKPNHAANTIWTRVWNPVKNAWESWSYMFTSSVKPTASDIGAIPNNGSALNNLTIRDWIQVGNLRIYADPLTKNVRFDWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1303 AA
molecular weight: 140940,03780 Da
isoelectric point:5,91583
aromaticity:0,07828
hydropathy:-0,24981

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
9–135
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1148–1251
IPR048391
YP_006489033.1
1 1303
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 9-135 | STR 344-1147 | ATT 1148-1251 | STR 1252-1285 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_006489033.1
1 1303
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 364 364 0,7970
Central domain 365 602 239 0,1230
C-terminal 603 1303 700 0,4275
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-364
Central
365-602
C-terminal
603-1303

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage ZZ1
[NCBI] 		1049283 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Twarogvirinae > Zedzedvirus
Host Acinetobacter baumannii
[NCBI] 		470 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Moraxellales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_006489033.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_018087 [NCBI]
CDS location
range 149773 -> 153684
strand +
CDS
ATGGCAGAAATAAAGACAAGTTTCCGTGCCACATACGGAATTGATGCGGGTGGCGAAAAAGTTATCAATGTCAAAAAAGCAGATAAAACTGTAATGACTGATGGCGTAAACGTTGAATACCTAATTCAAGAAAACACAACTCAAATGTATGACCCTGAACGCGGCTATCCAAAAGATTTCGCGGTTTTATTTAATGGTCGTTTATGGTATGCAAAACAAGCTACACCAACTCCAGCTGGGCCTTTTAATGAAGGTTACTGGTCTCCTGCACGTACTGACCCTAAATGGTATCAAGTCGCGGGTAATCGTACAATGCAAGTTGGTGAATATCTAACTATTGATACTCTTTCAGTTCGTAATCTTGAATTAACATTACCATCAAATGCACAAGAAGGCGATAACATTACTATTCGTGATGTAGGCGGTGAACCTGGTTATGCAGATATTTTAATTAAAGCCGGAACTCAATCTATTATAGATAAGGGTGAACGACTTAAAGAAATTAAAATGACAATTCCATTTTCAGAATGGACTTTCATTTATGTTAATAAATTATGGACATTGTACAATGGTTCAGAAGCAGATTTAGCAAGAACTCTTAGACCGGCTGATACTCCATATAAAATTCAATCGGGTGAAACTATTTTACGCTCATATGATAGAGCAAGTCCGATTAAAGTTCAGTTTCCTAAAAATGCTAATAACGGAGACATGATTCACTTTGTTGGTATGGATGCAGCAACATCAGCCCCGTATTTTCATTTAGAATTAAATTCTTTTGACGCAAATACAAGTATTATTGCACCAAATACGCCAAAAGTTGTATTACAACGTTCATTATCTGGTTATTTTATCTATAATGCAACGACTAGAATCTGGATGTTATTTGATTCTGATATGACTGATCGTCTTCGTACAGTTAGTTCAGATACAAACCTATTTCCGAATGAAACTGTATCTGTTGTGGGTACATCAAATGCAACTGTACCTGCATTTACACTGACTTTACCTACTCAAGTGTCAGATGGTGATCAAATTACGGTGGCATTGAATTATATGCGTAAGGGTCAAACAGTTAATATTACGGCTTCGGGACGTGATATGATTTTGACCAATAAAAATCTGACACAATTTCCAAAGCGTAAAGACTACCCAGAAGAAGGTAATTGGGTTAATACAAAATCACTTCAATATAATGGTGCTAGTGATTATCCTCCGGTAATTACGTTTGTATATATTATCATGAATCCAGATCCAGACCCAACCAAATTCCTGGCGCAATGGATGGTTGTTGATAATAATCCTATGATTGAACGCGTTGACCCTACTAATCCAGCACGTTTGGGTGTTATAGCTTTAGCAACTCAAAATCAAGCCAATTTAGATAAAGGTCAAATTGCAGCTAACCCAATTGCAAAAGAACTCGCAATTACTCCTGAAACATTGGCAAATCGTACTGCTCTTGAAAGTAGACAAGGTATTGCGGCAATTTCAACTAAAGATCAAAACTCTTTGCCTACGGATAGTGCAGCTTATGATGATTTAACGATTGTTACACCATTAAAGTTGAATCAAAAACAAGCAACAGAAACTATGCGAGGTTTAGCCGAAATTGTAGATGATACTGAGATAAAGAGTAATACTAATGATACTCATATTATTACACCTAAGAAATTAGATGCTCGTCGCGCGACAGCTTCATTATCTGGTGTGGCAATGTTAGTAGAAACAGGTGGTGTTTCAGCAACTGCTCGTAATGCGCCAGGTACTGGTGTTTTTAACTATGCCGATAATGCACGTGTCATTACCCCTACAACATTGCGTGAATTTAAAGCAACTGAGACCCAACAGGGTGGTGGTTTCTTAGCAATGGACTCAGAAGTTATCGCAGGTACACCTAATCCAGCTGGTATACCATTATTGGTTACCCCTGAACAACTTCATAAAAAGACAGCAACAACAGGCCGTATTGGTTTTGTTCAAACTGCGACCGAAGCTGAAGTTTTAGCCGGAACTGATCCATTGAAATATGTTTCGCCATTTACTTTAGCTAAACGTGTTGCTACAGATAGTGCGACTGGTCTTGCTAGATTTGCAAAACAGACTGAGTTTAATGCAGGCACAGCTGGTTTAATTTCAGACCCTGCTGTAATTAAAACATTCTTTAGTGATGCAACTAGAACCGAGGTGGATAATACTTCAGGACTTACACAAAGTGGAAATTTATGGACTTCTACAGTGTTTAATATTGTTGCGCCAACTGATAAACAACGAGGTACAGCTAGATTATCTACTCAAGCTGAAGTGAATACTGGTACAGATTATACTACTATTGTTACACCTTTAACACTACATAATAAGAAGTCGACTACAACAGCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCTAATACAAGTGAAACTGATGCAGGCACTTCTGTTAATACTGCAGTTTGCCCATTAAACTTAAAGCATATGATTCAAAAACAAGAATCATGGGCTGCAAGTAATACGGTGCGAGGACCAGTATTGTTATCTGAAGGTGCAATGACTTTTGCTGGAAATGATGTAACAGGTTCAACTGCCGCGTTATTGCCTACATATAAACAAGTTGGATATGCAATATCGCCATATGAATTGAATAAAACTTTAATGAATTTCTTGCCAGCTAAAGCTAAAGCCGTTGATTCTGATAAGTTAGATGGATTAGATTCAACTCAATTTATTCGTAGAGATATTGCTCAAACAGTTACAGGTTCTTTAACTTTTAATGCGGTTAGCACTTTTAATGCCAATGTTAATTTAATCGGTGCAAATACAACATTAACTGCTGATGGCGTGGTCCAGGCCAAACAGGGTTTAACTGTAGGTCGTAGTTTTAATGTCACCGTAGTTGATAATACCGGATTAAGTTTAGGTGGTGGCATTCAAACCAATTCAAATAATAGACCAATGTATGGAATGTATGTAGGTCATAAAAATTGGGCGGGTTGTGGTGCACATGGCGCAGTAAATCAAGATTTTGCAATTTATAATATTTGTTCCGTTTCTGGTTCTGAAAAACGAGGCTGGGTTTTTCAACGAGGTTTAGTATCCACTGAGCAAGTTAATAATACAAATGTGGCATCAATATCGGTGTATGGCGAAGCGACGTTTGATGGCTATGTTGATGCTGGCGCGCATTATCGACTTCGTACTATTCCGGTAGTTGATATGGACGCAGGTAAAACAAATATTAGAATAGGATCTAATTCACAAGCTCTTACGTTAGTATCTAATGCGCCAACTGCAATTGAAGCATCTGATGGAGCGACATTATTAACAACTAATAATTATACGACATTAGCTGCACCAACCTTTGTTAAAAAAGCTGGTGATACAATGACTGGTGATTTGTTAATTCAAGCTGCCTCAATTAAAGTTGTTAGACCCGAAAGTGCTGCAATGGCAACAGCTGCACCAATTGCAGGTAGTTGGAGTTCAAATATTGAAAATCCTGCAATTTATAGTTTGTTTAAGGCTGGGTATAAAGTTCCAATTATGGATCCATTAAAACCAACAATTATCTCAGGATATGAAGAATTTGATGGACCTGGTATTTTATCTCAAGTTGGTACGGATAAAACACAAGGTACATATCAAATTTGGGTCCCTAGACCTACTGCAGCCAATGCAACAAAACCAAATCATGCTGCTAATACAATTTGGACACGTGTTTGGAATCCTGTTAAAAATGCATGGGAAAGCTGGTCGTATATGTTCACATCAAGTGTAAAACCAACTGCAAGTGATATAGGGGCAATTCCTAATAACGGTTCGGCTTTAAATAACTTAACTATTCGCGACTGGATTCAAGTTGGTAATTTGCGCATTTATGCTGATCCATTAACTAAAAATGTCCGCTTTGATTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
66f10a334b46b4931f40d7ef1bb602bdc1047a1a1dc080c4ad0cd12f4705e804
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5218
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50