Protein

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Genbank accession
AOO11513.1 [GenBank]
Protein name
short tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLTRLDNLYSSKTGKYLYVSPDDFNATDELDNRGNSPLRPFKTIQRAFIEVSRYSYLPGANNDRFDQFSIMLMPGNHYIDNRPGLVTETAVEARYFDAGNLLEGNRQEVIDRSVAQVSVQHPDFYYPGDPQTGAWSRFKDAYRLIQKNRDLLIDRATAQIPVDHEDFVYPGDPTVGEWSRYKDAYRLIQKNKDLIAQDAFDLMNANPPSPLPDGYASKCIRDIKILIDSLSLDVHEGGGNKYTRKYIQTYFLDDGTDWVNGSLRGEETQSLVAFAEAARLMKLAITNNYTSTSSPGNEYQDLTVVIGAPNYETDSANDVPNTDPTACSDVQTFIDNLYAIVNTTFSDSDLAANNGNFDLTNVLPAETVSDKISAGHAKCKRDTGFVLDALSLDVHEGGGNRYTRKLLQNYFDSTGNNWVVNGLQGETAESLTAFGQLFTEMKRALTNQLYFKDLTITPGDAIFGNTNSPQENLPSGNPAACADIQTQIDTLGAIVTQIINDENLTNLPDETLSDVISAGLAKCKRDAGIITDGIINDLRTEGNANTITNAKAYFDRFGNPIANGLLGEESESITAFNGIATFAKQAVTNQLFFKDLTISPGPAYANANTPEIPNLASGNAATCVDVQATIDTLIKILTDVIEVGNLDELAAIKVTGVLPSFNYNRALEEWQDNSIVDLANPDNVLYKFNAADGGCIVPRGCSLIGYDLRRTVVRPLYVPDPADTSQPRTSIFNLTGGCYIWQFTIKDGDLSAQSPLYDASAGVGKVYYKKGSTDLAIPEYSHHKICIMEYADSKDLDNYYEKVGKSFQQFQPTIDDGGLEALVQENRIVGPLSDSRTIESIRIDDSATFTGNASNSTILNNVTNAESLEVGYEITSPDVSVVISPNTRIESISGTSVTLNQSISGSGNVSFLASFGYANITIQTKIDHGYFEGQYVAIINSGLSDEINGTWKVTKIDGVNPKIFEYEVYNNTAASLGLVSGQTYLSGEVGGVSTNAVVLAEIDSVESASPYVFNCSIRSTWGQCGMWADGSKATGFKSMVVAQYTGVSLQKDDRAFIRYDALTNTWNQASLTDAFATVPYHTKGDAYWKDDWRNFHIRASDDSFVQCVSVFAVGFFDHFLMESGGDMSITNSNSNFGNTSLHSVGFKGFSFNQDKGGYITDIVPPEIVSTSNEVINQWYTLDVPASNSRTNHTRLYLAGDDIENPDDRPASSINGYRIGAKSGETLSVDLARYAIEPTGPIEFSQTLEPNGFKSFTVGIETLTPNSANVDNYAQDSANQIEDNKALIQAEGYQYIIAKYPELLTKPNITIGKCERDIGYFVDAVVNDLRIGGNINSIQAAEGYYIAGEVAYIAGELNETIDSLDYVKNIMIAAMRNFDYLVRDAETFSGSAIVNVPSTQGLMIGMRVVEYDPSDFTNGLLNIANTPIYTNIPQNAFIKNIISDTQIELGIPGAKLNQGSTRNATGSVSGAFLYFTLENPAWASISPAVDPTITQDAQLDGNGNPLPECQNIATTIEGYFNEIFLVLNTGYTALGGREVDAYNAIIDNKRFIAAEAVYRIANDAAYAGTKLGQGLLASTGETIQDACVDDVENVLSQIAYNVKFGGNNRIYDAAELYLTGAHVQGEEAESIAVFNLARDLAINAMRQETITVQGSHGLTQTINSQVLPEYDQNGQLVTPPCADVALTISTLTALVTTAINGGSIGNKTLPAFSAVTRVEPTSDLTGLSARATLFTLATGGFGGNPNPHDLETGTPVRLVPRPKVGTNPDKRVIRLPKGFDTNTKYYVIAPGRNLYPENFSISNSVITVTEAAGTSFSTANATRATVAGIYRSLVAQPKIDTDGTALARGTGLRYNLTVNADGSIEFGNAVNNLDGIANGGSRYEIGDIVVISDGQLGGSGAPDLEIEITAVSPAEYPGVFDGTETNKLMLATSPENAAAGIYMYSSETDSVDSEVEIVINRFVLDTKYDLHKYKSNVVGASEIETNVAHIFDVPAPNTTPQIVFVRLADDIQGSTLPQLSGSASSISTQTEYFVRYVSNKRVTLHLTAADAESGDRALTFVSGTGSNFYIYANKRPSPLRFDPTYSTASNQTGLWYLNVADESSNGTANYNRYSILSRFHGGNELANDFQTKTDPTLDTRYTRVEDKREKEERVYRMRYVVPSYLETVRDPLNGFVIKTRTDDKRRLIPQRVLLKPIAGNPNNVASFYNPVGANEQIGLNKDELIADQIRTIDPSVVDLLPEQQNLYDPYLAPKVVEFDSKIAATVQSARKVIPAGESDEFIELTLFDHTIVNQSVKNEIFTVVRTNFLQGGFLQPNATQSNENNKITWETVSGNAASSGSAYLQAWFNDVNTAQITLVLKDVQGDIYYDPAGNVTFTQSNGANVQLTDVPNSFGEISVSPRDKSLRDNYLYRVEGSNVYTICPGDTITDDTGQNTYYVHTIEDQGDFDDCFYIFDIDTLQKRIPNQQDGIYYLTCLRGNISPFPTGSGVGENFRNFKFSQPISQLYPINYKNDPLWFQVDGTTGVRDTSIVDVPQTFSAADNYVHGLVTVNDAKGSETKEMVEDIIRNTALDQYSYTNSTTDSSSGDIIDNRIQAQEGNATSGSEDRLIPISGDSQFPTERKLYIELRRPSIARSGNHTFEYLGFGPGNYSTGFPLRQEVVLTDKQDFYAQAKREDGGIVFYTGLNSNGDLYIGNKKVNAITGEETFLESAALVDSEDEDEDIGTLVTTFDSPVTFNSTITVAGKSTLNAPVEINVEANEGDALRVFSNIGAGDDPTLFNGSWRTQSDGDVVISKNQIKAAVFYLNARPKPGAQYGQSYTWRTNYLAGEPSNIVPWQETNYFYASQTVSYGGNDPEAGDIIYKGSSIGQSGSIGWILTNQFKSAETSVQTITADGTQNLTITWIATETNDSIGIKGNSTIRISNFSNPVVNGTWEIVGWDETTSPGQQTLKFRISTPIENGTIYNWADQNTGADLQFSVSNWKETGVLGAETLRTYTEQRGDFRLGINTVSRAAHSAVLTANVDDFTTPRATLDVVGTTFISGKTLVEYNAAGDVSDNRYDDNNLNSDQREGLNGAPLLTQGFIPQDNALLVGGDSNDLEQRATLRVATTDAATVDQGIGYQTGGRLGINTTLGLQARDELDRNLVVVGDGRITGNMLLEQDISVDGGDINTTSETFNLINNNANIINFAGDAQLIDMFSNTTNDQTITIGSNANFQTVRIGNNSGRSIFSVHALSANALVDIASVADDATNASQVFIGGAWANTDSKVALGSAQTLAAGNLEIGYKVAAGTGVSRIFTQTGKARLFDDDRTQVIEAFTKANDITIASLGGSTTIRNSLKVQASATVDSNIILDGGTTAGIIEIVRARFSTPLNLHNLGSLDVPNLDFYKYSTTGRFLDTEGNRFWGGSQDQSGGGRIGAFDNLQAAPDPLRVSGQYTFRFADGGTGSGAAFDVGVAFDGTVTVELVAAGSGYADNQTLTIRDNQLGGGGAPDITFDINGVTDASEVFILPITTPAASDFDIGDLILLDRGNAASPDEVTPAGGTSVINLRDQQYSEIMRVVGLDNLTNPNDPQGFRLSVTRAQEGTGDPATGDGWTNHPDGCVIAKLDKQPAASYITGKDVGSFADPNVPDGILDEPRAGIDGTSGNVRIGVAEFGGVLTTLDLLRIDQSEIVAIADVVSTDIQSLIVTDGGDPAVTNFKVESTTGNTVIAGNVGIGLGFNQFTIAGGSGNTNIAGTLTVEDTITLNGSTIPSTEFFTITNGGPSFEDDGVTVITPLRTTFQVDSATGNLLMNGGNINIFGVDGTTPRLTFNNSSGDFTTYGSFSALGDGMSSFGGPVTMAGDLTVNGGDLTVNQNGVEVFAVDDDGSLNIGGISNYFSSTGGRKWVVSNTNIINAEANVNYFVDISGTALFKLPANAQMGDMIRIIDIGGILSYDKSLVVRAPNLVRIQGSVSNTGTTVTGNTLGENFSLTHDGGELVVQTPNAAFGLVFAGTSDADGGPGANPNKAGWYLMDV
Physico‐chemical
properties
protein length:4017 AA
molecular weight: 432797,91080 Da
isoelectric point:4,43176
aromaticity:0,08713
hydropathy:-0,25668

Domains

Domains [InterPro]
DC_0231
STR
1–324
DC_0231 DC_0231
DC_0231
STR
318–583
DC_0231 IPR009050
AOO11513.1
1 4017
Architecture
STR
STR
STR 1-583 | STR 807-4017
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM44
[NCBI] 		1278485 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Vellamovirus > Vellamovirus rhodeisland44
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO11513.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349291.1 [NCBI]
CDS location
range 22255 -> 34308
strand +
CDS
ATGCCGCTAACAAGACTTGATAATCTGTATTCAAGTAAGACTGGTAAGTATCTTTACGTATCACCAGATGACTTTAATGCAACTGATGAACTAGACAATAGAGGTAACTCACCTTTACGTCCATTCAAGACAATCCAGAGGGCATTTATTGAAGTATCGAGATATTCATATCTCCCTGGTGCCAACAACGACAGATTCGACCAGTTCAGCATCATGCTGATGCCTGGTAATCACTATATTGATAACCGTCCTGGTCTTGTAACAGAGACTGCTGTTGAGGCACGTTATTTTGATGCTGGAAATCTTCTTGAGGGTAACCGTCAGGAAGTTATCGATCGTTCTGTAGCACAAGTATCTGTTCAGCATCCTGATTTCTATTATCCTGGTGATCCTCAGACTGGTGCATGGTCTCGCTTCAAAGATGCATACCGTCTGATTCAGAAGAACAGAGATCTTCTGATCGATAGAGCAACAGCACAGATTCCTGTTGATCATGAAGATTTCGTTTATCCTGGTGACCCAACTGTAGGTGAGTGGTCACGTTATAAGGATGCATATCGTCTAATCCAAAAAAATAAAGATCTTATTGCACAAGATGCGTTCGATTTGATGAACGCAAATCCACCATCTCCTCTACCTGATGGTTATGCTAGTAAGTGTATTCGTGACATCAAGATCCTGATTGATTCACTTTCTCTTGATGTTCATGAAGGTGGTGGTAACAAATATACTAGAAAGTATATCCAAACTTATTTCCTTGATGATGGCACAGATTGGGTAAATGGTAGTCTTCGTGGTGAAGAGACTCAATCTTTAGTTGCATTTGCTGAAGCAGCTAGATTAATGAAGTTGGCAATCACCAACAACTACACTTCCACATCTTCTCCTGGTAACGAGTATCAGGATCTGACAGTTGTTATCGGTGCTCCTAACTATGAGACCGATTCTGCAAACGACGTTCCTAACACCGATCCTACAGCATGTTCTGACGTTCAGACTTTCATTGATAACCTGTATGCAATCGTAAACACTACCTTTAGTGATTCTGACCTTGCTGCAAATAATGGTAACTTTGATCTAACTAATGTTCTCCCTGCTGAAACTGTATCTGATAAGATCTCTGCAGGTCATGCTAAGTGTAAGCGTGACACAGGATTTGTTCTAGATGCACTTTCACTAGACGTTCATGAAGGTGGTGGTAACCGCTACACCAGAAAACTACTCCAGAACTATTTCGACTCTACAGGTAACAACTGGGTAGTCAATGGTTTACAAGGAGAAACTGCAGAATCTCTAACTGCATTTGGTCAACTCTTCACTGAGATGAAGAGAGCACTTACAAACCAACTGTATTTTAAAGATTTAACAATCACCCCTGGTGATGCAATCTTTGGTAACACCAACAGTCCACAGGAGAATCTACCTTCTGGTAACCCTGCTGCGTGTGCTGACATTCAAACCCAGATTGATACTCTAGGTGCAATCGTTACGCAAATCATTAACGATGAGAACCTAACCAATTTGCCTGACGAAACTCTATCTGATGTTATCTCTGCTGGTCTTGCTAAGTGTAAGCGTGATGCTGGTATCATTACTGATGGCATCATCAATGACCTTCGCACAGAAGGTAATGCAAACACGATTACTAATGCAAAAGCATACTTCGATCGCTTCGGCAATCCTATTGCTAATGGTCTTCTGGGTGAAGAATCAGAATCTATCACTGCATTCAACGGCATTGCAACATTTGCTAAGCAAGCAGTTACTAACCAACTGTTCTTTAAGGATCTGACTATCTCTCCTGGTCCTGCATATGCCAATGCAAATACACCTGAGATTCCAAATCTAGCATCAGGTAATGCTGCTACTTGTGTAGATGTTCAGGCAACAATTGATACTCTCATCAAAATTCTGACTGATGTTATCGAAGTTGGTAATTTAGATGAATTAGCAGCAATCAAAGTTACAGGTGTTCTTCCTTCATTCAACTACAATAGAGCACTCGAAGAGTGGCAGGATAACTCTATTGTTGATCTAGCAAACCCTGACAACGTTCTTTACAAATTCAATGCTGCTGATGGTGGTTGTATTGTTCCTAGAGGTTGTTCACTGATTGGTTACGACCTGAGAAGAACAGTTGTTCGTCCTCTGTATGTTCCTGATCCTGCTGATACTTCGCAACCAAGAACTTCTATCTTTAACCTGACTGGTGGTTGTTACATCTGGCAGTTCACTATTAAAGATGGTGACCTATCTGCACAATCTCCTCTGTATGATGCCTCTGCTGGTGTTGGTAAAGTTTACTATAAGAAAGGTTCAACTGATCTTGCAATTCCTGAGTATTCTCACCACAAGATCTGCATCATGGAGTATGCAGATTCTAAAGATCTTGACAACTACTATGAAAAAGTAGGAAAATCATTCCAACAGTTCCAACCAACTATCGATGATGGTGGACTGGAAGCACTGGTTCAGGAAAACAGAATCGTTGGTCCTCTGTCTGACAGCAGAACTATCGAAAGTATCAGAATTGATGACTCTGCAACCTTCACTGGTAATGCATCTAACAGCACAATTCTGAATAATGTTACTAATGCTGAGAGTCTTGAAGTTGGATATGAGATTACATCACCTGATGTCAGTGTTGTTATCTCTCCAAACACTAGAATTGAGAGCATCTCTGGCACTTCAGTTACGCTGAACCAATCGATTTCAGGATCTGGTAATGTATCATTCCTTGCATCCTTTGGTTATGCTAACATCACAATTCAGACAAAAATTGATCATGGATACTTTGAAGGTCAGTATGTTGCTATCATCAACTCTGGACTATCTGATGAAATTAATGGAACCTGGAAGGTTACCAAGATTGATGGCGTAAATCCCAAAATCTTTGAGTATGAAGTATACAATAATACTGCAGCATCCCTTGGATTGGTATCTGGACAGACCTATCTGTCAGGTGAAGTCGGTGGAGTTAGCACAAACGCGGTAGTTCTTGCGGAAATTGACTCTGTTGAGTCCGCATCTCCGTATGTTTTCAACTGCTCGATTCGTTCTACCTGGGGTCAGTGCGGCATGTGGGCGGATGGATCCAAGGCCACTGGATTCAAGTCAATGGTCGTGGCTCAATATACTGGAGTTTCACTTCAGAAAGATGATAGAGCATTCATCCGTTATGATGCACTAACTAATACTTGGAACCAAGCATCACTTACTGACGCATTTGCTACTGTTCCTTATCATACCAAAGGTGATGCATACTGGAAAGATGACTGGAGAAACTTCCACATCCGTGCTTCGGATGACTCTTTCGTTCAGTGCGTCTCGGTCTTCGCTGTTGGTTTCTTCGATCACTTCCTGATGGAAAGTGGTGGAGATATGTCCATCACGAACTCTAACTCTAACTTCGGTAATACATCACTTCACTCTGTTGGTTTCAAAGGATTCTCCTTTAACCAAGATAAGGGTGGTTACATCACTGACATTGTTCCTCCCGAGATTGTATCTACAAGCAACGAAGTTATCAATCAGTGGTATACTCTAGATGTTCCTGCATCTAACTCAAGAACTAACCACACCAGACTGTATCTTGCTGGTGATGATATTGAAAATCCAGATGATCGTCCAGCATCTTCTATCAATGGATACAGAATTGGTGCTAAGTCTGGTGAAACTCTATCTGTTGACCTTGCACGTTATGCAATTGAACCAACTGGTCCTATTGAGTTCTCTCAGACTTTGGAACCAAATGGATTCAAATCCTTTACAGTTGGTATCGAGACACTGACACCTAACAGTGCAAACGTTGACAACTATGCACAGGATTCTGCTAATCAGATTGAAGATAACAAGGCACTAATTCAAGCAGAAGGTTATCAGTATATCATTGCTAAGTATCCTGAGCTACTCACCAAACCAAACATCACGATTGGTAAGTGCGAAAGAGACATCGGATATTTTGTTGATGCTGTTGTCAATGACTTGAGAATCGGTGGTAACATCAACTCTATTCAAGCAGCAGAAGGTTATTACATCGCTGGCGAAGTTGCATACATTGCTGGTGAACTAAACGAAACGATTGATTCTCTTGATTATGTCAAGAACATCATGATCGCAGCAATGCGTAACTTTGATTATCTGGTTAGAGATGCTGAGACATTTAGCGGTTCTGCAATTGTCAATGTTCCCTCTACTCAGGGTCTGATGATTGGTATGAGAGTTGTTGAGTATGATCCTAGCGATTTTACCAACGGTCTTCTCAACATTGCCAATACACCAATCTACACCAACATTCCTCAGAATGCATTCATTAAGAACATCATTAGTGATACTCAGATTGAACTTGGTATCCCTGGTGCTAAACTAAATCAAGGTTCTACTAGAAACGCTACTGGTAGTGTTAGTGGTGCATTCCTCTACTTTACTCTAGAGAATCCTGCATGGGCAAGTATCTCACCTGCTGTTGATCCTACTATCACTCAGGATGCTCAACTTGATGGTAATGGTAATCCTTTACCTGAGTGTCAGAACATTGCAACCACAATCGAAGGTTACTTCAATGAAATCTTCCTGGTTCTGAACACTGGTTACACTGCACTTGGTGGTAGAGAAGTTGATGCATACAATGCTATCATCGATAACAAGCGTTTCATTGCTGCAGAAGCAGTTTACAGAATTGCTAACGATGCTGCATATGCTGGCACTAAACTGGGTCAAGGTCTACTAGCATCGACTGGTGAGACCATTCAGGATGCTTGTGTAGACGACGTTGAGAACGTTCTTAGTCAGATTGCTTACAACGTCAAGTTTGGCGGCAACAACAGAATCTACGACGCAGCAGAACTGTATCTGACTGGTGCTCATGTTCAAGGTGAAGAAGCAGAATCTATTGCTGTATTCAACTTGGCAAGAGACTTGGCAATCAATGCAATGCGCCAGGAAACAATTACAGTTCAAGGTAGTCATGGTTTAACTCAGACAATTAATAGTCAAGTTCT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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
cb240433a7d37b5e8ee7a8befa724ee78fc06b7514aedf53dc5cdef61568a8f8
AlphaFold3
Source AlphaFold3
Method AlphaFold3
Resolution 0,8446
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50