Protein

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Genbank accession
YP_010660627.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
Protein sequence
MRKLTNFKFFYNTPFTDYQNTIHFNSNQERDDYFLNGRHFKSLDYSKQPYNFIRDRMEINVDMQWHDAQGINYMTFLSDFEDRRYYAFVNQIEYVNDVVVKIYFVIDTIMTYTQGNVLEQLSNVNIERQHLSKRTYNYMLPMLRNNDDVLKVSNKNYVYNQMQQYLENLVLFQSSADLSKKFGTKKEPNLDTSKGTIYDNITSPVNLYVMEYGDFIEFMDKMSAYPWITQNFQKVQMLPKDFINEKDLEDVKTSESIKGLKTLKQGGKSKEWSLNDLSLSFTKLQEMMLSKTDEFKHMIRNEYMTIEFYDWNGNTMLLDAGKISEKTGIKLRTKSIIGYHNEVRVYPVDYNSAENDRPILSKNKDILIDTGSFLNTNITFNSFAQVPILINNGILGQSQQANRQRNAESQLITSRIDNVLNGSDPKSRFYDAVSVASNLSPTALFGKFNEEYNFYKQQQAEYKDLALQPPSVTESEMGNAFQIANSINGLTMKISVPSPKEITFLKKYYMLFGFEVNDYNTFIEPINSMTICNYLKCTGTYTIRDIDPMLMEQLKAILESGVRFWHNDGSGNPMLQNPLNNKFREGV
Physico‐chemical
properties
protein length:587 AA
molecular weight: 68525,77490 Da
isoelectric point:5,82505
aromaticity:0,12606
hydropathy:-0,55690

Domains

Domains [InterPro]
IPR031772
TAS
3–115
IPR031772
IPR031772
TAS
3–110
IPR031772
DC_0080
STR
84–428
DC_0080
YP_010660627.1
1 587
Architecture
TAS
STR
TAS 3-83 | STR 84-428 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage JPL-50
[NCBI] 		2851077 Uroviricota > Caudoviricetes > Rountreeviridae > Rosenblumvirus > Rosenblumvirus jpl50
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010660627.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_070878 [NCBI]
CDS location
range 7763 -> 9526
strand -
CDS
ATGAGAAAATTAACGAATTTTAAGTTTTTCTATAACACACCGTTTACAGATTATCAAAATACAATTCATTTTAATAGTAATCAAGAACGTGATGATTATTTTTTAAATGGTCGTCATTTTAAATCGTTAGACTATTCCAAACAACCGTATAATTTTATACGTGATAGAATGGAAATCAATGTTGATATGCAGTGGCATGACGCACAAGGGATTAACTACATGACGTTTTTATCAGATTTTGAGGACAGACGCTATTACGCTTTTGTGAATCAAATAGAATACGTGAATGATGTAGTGGTTAAAATATATTTTGTGATTGATACTATTATGACGTACACGCAAGGTAATGTATTAGAGCAACTCTCAAACGTTAATATTGAACGTCAACACTTATCAAAACGCACGTATAACTATATGTTACCAATGTTACGTAACAATGATGATGTGTTAAAAGTATCGAATAAAAACTATGTGTATAACCAAATGCAACAGTATTTGGAAAATTTAGTTTTATTTCAATCTAGTGCTGATTTATCAAAGAAATTTGGTACAAAAAAAGAACCTAATTTGGATACATCAAAAGGAACGATTTATGATAATATTACATCTCCCGTTAATCTATATGTCATGGAATATGGTGACTTTATAGAATTTATGGATAAGATGAGTGCATATCCATGGATCACACAAAACTTCCAAAAGGTTCAAATGTTACCTAAAGATTTTATTAATGAAAAGGATTTAGAAGACGTAAAAACAAGTGAAAGTATTAAAGGTTTAAAAACATTAAAACAAGGCGGTAAATCAAAAGAATGGAGTTTAAACGATTTATCATTAAGTTTTACTAAACTACAAGAAATGATGTTATCTAAAACAGATGAATTTAAACATATGATACGTAATGAATATATGACGATTGAATTTTATGACTGGAATGGAAATACAATGTTGTTAGATGCTGGTAAAATATCAGAAAAAACAGGGATTAAGTTACGTACAAAGTCAATTATTGGTTATCATAATGAGGTTCGTGTGTATCCAGTAGATTATAACAGTGCAGAAAACGATAGACCAATACTATCTAAAAATAAAGATATATTGATTGATACAGGTTCATTCTTAAACACAAATATCACATTTAATAGTTTTGCACAAGTACCAATATTAATTAATAACGGTATTTTAGGACAATCACAACAAGCAAATAGACAACGTAATGCAGAAAGTCAATTAATCACAAGTCGTATAGATAATGTATTAAATGGTAGTGACCCTAAATCACGTTTTTATGACGCTGTCAGTGTAGCAAGTAATTTAAGTCCAACTGCATTATTTGGTAAATTTAATGAAGAATATAATTTCTATAAACAACAACAAGCAGAATATAAAGATTTAGCATTACAACCACCATCAGTGACAGAGTCAGAAATGGGAAACGCATTTCAAATCGCAAATAGTATTAATGGTTTAACGATGAAGATTAGTGTACCGTCACCTAAAGAAATTACATTTTTAAAAAAATATTATATGTTGTTTGGTTTTGAAGTAAATGACTATAATACATTTATTGAGCCAATTAACAGTATGACTATATGCAACTATTTAAAATGTACAGGTACGTATACAATACGTGACATTGACCCTATGTTAATGGAACAATTAAAAGCGATTTTAGAATCTGGTGTGAGATTTTGGCATAATGACGGTTCAGGTAACCCTATGTTACAAAATCCATTAAATAACAAATTTAGAGAGGGTGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
25891360ae797c50b08e30563913e833b6004328a7ade47bdf9bde66faf29da6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4035
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50