Protein

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Genbank accession
YP_009621563.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVSVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQNIQGDANLLRLRNQNANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGSDEVKLYNNKYNSVLTVASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNTFSGLNTFSTSVSISSNAAAIMLKNKAVDESLFIQAKDVENNNLWYIGKGGANDNITFYDYKGDTSIVLNSSGAAFNKTVKITGQVQPSDWDNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFKSGQTIVADGQALLLRSATDSPSLYVRGQNQSGTNKWYVGFSTSNVLGLSNEASGTTLTLDSAGINSNKNLNITGQVKPSDFSNLDARYFTQSASDSRYLRIRSTNFNNGNDDKWAKIATVVMPPSASTAVIEVFGGSGYNYGFPYQASKTEIVLRAGGDSPKGLNIVAWKNSENLIITDIGYVNTSGDTYDIYCRVGPFQNDTTSRVQSSSNASVQLFEAPQTFDDAPQGIVKGTIARYYTSMQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRVAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHSVSGSTNTTGNHTHTVGGHYVGDSIGGKPRVQVYGTEQVSSVAGDHSHTVSGTADSNGNHAHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:840 AA
molecular weight: 89907,95380 Da
isoelectric point:6,74408
aromaticity:0,08452
hydropathy:-0,38024

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–266
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
G3DSA:6.20.80.10
STR
159–218
G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 IPR048388 IPR005003 IPR005003 IPR005003 DC_0147
IPR048388
ATT
159–247
IPR048388 DC_0026 IPR005003 IPR005003
YP_009621563.1
1 840
Architecture
ATT
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-266 | ATT 273-356 | STR 357-381 | ATT 382-465 | STR 466-840
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage BPS17L1
[NCBI] 		2060122 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus BPS17L1
Host Salmonella enterica subsp. enterica serovar Shubra
[NCBI] 		2565028 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Salmonella > Salmonella enterica

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009621563.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_042096.1 [NCBI]
CDS location
range 45443 -> 47965
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGTGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAGCTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACTGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTCTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTTACAAACACATTCTCTGGGACTCAGAACATTCAAGGTGATGCTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATTGAAGGTGTAAACCTAGATGGTTCGGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGTAATGGCTCTGACGAAGTAAAGCTGTACAATAACAAATACAACTCAGTCTTGACTGTTGCAAGTAATATCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAACACTTTTAGTGGTTTAAATACATTCAGTACTAGTGTTAGTATTAGCTCTAATGCTGCTGCTATCATGCTAAAAAATAAAGCTGTTGATGAGTCTTTGTTCATCCAAGCAAAAGATGTTGAAAACAATAACCTGTGGTATATTGGTAAAGGTGGTGCAAATGACAATATCACATTTTATGATTACAAGGGCGACACTTCTATTGTATTAAACTCGTCTGGTGCTGCATTCAACAAGACTGTAAAAATCACTGGTCAAGTCCAACCTTCAGATTGGGATAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAAATCTGGGCAGACAATTGTAGCAGATGGTCAAGCACTATTGTTAAGAAGTGCAACTGATAGTCCCTCTCTCTATGTTAGAGGCCAAAACCAATCTGGAACTAATAAATGGTATGTTGGATTTAGTACTTCAAATGTTCTTGGATTATCAAATGAAGCCTCTGGCACGACATTGACATTGGATTCAGCAGGTATTAATTCTAATAAGAATTTAAATATCACTGGTCAAGTTAAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAAAGTGCTAGTGATAGTAGATACCTGAGAATCAGAAGTACTAACTTCAATAATGGAAACGATGACAAGTGGGCTAAAATTGCTACTGTTGTAATGCCGCCTTCCGCATCTACTGCGGTGATTGAAGTGTTTGGTGGGTCAGGTTATAACTATGGTTTCCCTTACCAAGCTAGTAAAACGGAAATTGTTCTCAGAGCAGGGGGTGATAGCCCAAAAGGTTTAAATATTGTTGCTTGGAAAAACTCGGAGAATCTCATTATTACGGATATCGGTTATGTTAATACATCTGGTGATACTTATGACATTTACTGTAGAGTTGGTCCATTCCAAAATGACACAACATCAAGAGTTCAATCTTCTAGCAATGCAAGTGTGCAATTGTTTGAAGCCCCACAAACATTTGATGATGCTCCACAAGGTATTGTAAAGGGTACAATTGCAAGATACTACACAAGTATGCAAAAACCAACCCCTTCAGATATCGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAATAAAATCTACCCTGTTGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAACGTTAACCCTAATACCGCACTTCCTGGATTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTAGGTAGAACTATCAGGGTTGCAGCAGCTAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTTGGAAACTTACCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCACACCCACTCAGTGAGCGGTTCAACAAATACCACAGGTAATCACACACATACTGTTGGTGGTCATTATGTAGGTGACTCTATCGGTGGTAAACCACGTGTTCAGGTATATGGTACAGAACAGGTTTCCAGTGTAGCTGGTGACCACTCACACACTGTGTCTGGTACTGCTGACTCTAACGGAAACCATGCTCACACAGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTAACTAACCAGTTCTATAAGCTGATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4a4a06e6b7c44765fb0b16fc65acb7c90bcfdcd72f5f974bcc291f7cc7f449d5
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6827
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Salmonella phage assemble Han,H., Li,X., Wang,X., Zheng,S., Zhang,C., Zou,Y. and Zou,J. 2024 — GenBank