UniProt accession
E3SQ53 [UniProt]
Protein name
LamG-like jellyroll fold domain-containing protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,60
Protein sequence
MNINKVSQSIVQQTPDFLEEEYPLFNRFLEYYYQSQEKTGAGQNIINNFLQYLDIDKLDIGILEGKTKIVEAITDKSTKIVVESIEQFLEENGSIMIGDEVIYYENTTSSPNIALSPGISYEQVKLKWTNLATPINDFDGVQTRFPLVSQDNPIAPPSAQHLIVSVYGEVLIPGTDFTLSGDEIVFTTAPRTKLPADDSTTTFITYLNGFIENTIASLDDISNSFGEGKTSFALTENGEKYEPTVDEYVIAIYDGRLLQPRVDFFIDGDKFIFDTAPINGRQLSVYFIEAPIPSFGAGAKAFSRVNDNGELTSIKVDTGGSQYRFEYPPQVSIKSVNGSGGSARSLVNGIKSTSLLQGGKGYSSTNPPIVQIQAPTKPGAVAATMTATVDNGSVTALELTSSGSGYTFTPRVTFKQPGGATLGTPTITNGSITGTIPVTNNGFGYATAPEVYVDEPTGTNPIRAALRANISADGLVTSISILNAGQGYTTTPRIAIIDPVGAQVLETRVDGNGRVIGIELLNGGSGYDEIPSVYIVDTRTDAQGNYSGGTGAKAVASIFNGQITDINVTEFGTGYSATQPPKIVIQDPPSAQASVEIGLNEVTGFAVQKSGTEYDKAAFNGCARAASGITSYTETGNAEFSNNTLAAAASVDTEVKCLDALFIKRLLDKYTEQFLPDVPQLDYKKIDVRNAIKSIKDFYSAKGTSFSIAYLFKLLYGETVSISYPKDQIIKPSAATWSVDTILRATLVSGNPVDIRDALITQEADIADSNVQAASALVENYISIKTSDVEIFELVLSEETITGTFTVPYKTRLAEPLNTTDSIITVDSTIGWPERNGEFVIGSGLGKEVIQYKEKSLNQFIECTRSVNGTVEDWDSATEVSSNFTIFLNKGTAQEVVMNIVGIVDAQQTTLTDTGSYYLPGDKLSVSKLGGTGTSSQLTTWLYNVKKLVEVSGITFGGVNDQSATVTCANPHGLLVGDQVTVYGANPIIYNGTFLVTSRDSATVFQYQLPQPATTVPQGNILVSIDLNKGKSDSQIVLNAIGPYTTNIQNTFFNDNYVYVASTGIPNYNIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPTTPVTISTKNTIASGPIGTWVNGVSVWSYKSTVTKTFGAVTSIDIPNKGEGYDAANPPVITIDGGGGTGATADVVVDGAISEVTVDSGGTGYTSSPLVSIVGGGGSGAFATAIITKGVVSRILINEGGTGYTSQPSITIVGGGGTGATGTASVRGPIKSVNITNGGASYTSNPSVTLSSGSGAVAQAIVNNGRIISIAIISAGSGYTTAPEIQIQGDGFGAVARATIDTDGENAGRVTGITIVNKGIGYTQGQTVINLNSIGQGAQFSAQVFKWTYNLQETSTIDSAKGFVAEGFNNQYGGEYAHISNPQRLRYILGDNLFQNTSGSILEQEDQLVHSPIIGWAFDGNPIYGPYAYTDPTDQGSSITRMRTSYSLKTELVYNVDTNPTPVRTAGPLLSEEAAGNFVEDYQYVFNSGDLDQYNGRFCKTPDFPEGRYCYFVTIDAAEAGNPVFPYVLGPSFNSVVDKWNLSTDAVQQNIPTGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNALTLENGDVLLFEVEDEDRSGVIEQDELDDPDQVFEESPLQLYDYFPKVKLDSKVDIEVETTTKFEDASVTGFTIENPGTSYQVDDRLIFDNTDTGGSGVSARVSRIKGETVEAYTFESISGQNYGVLTTEEPHNLIVGDTVFVDYSPVMDNTNKQFIVRQYTGIEEIIINQTGSGYNEDIPPTIVIDSDSGTDARLQAVVSSVGSIDTVNILNSGSGYTSNPRVILSHPQVFKKADYYVSFINNNDYVKVNDTFVNENKEVFICGKTKDASANVVAFVAKLSATGVKEWEKTLELGTGQQEAEFLKLVVDGSAVWVVGQNRPNSSILADYNPDIILAKYTQADNGLSATLTFQKGYAGISGSTRGDVVTSLVKYSDTRFLIGGFTNTNSASPEDAFLASIDTSGNFSVKRKFASSNKSEKITDIIVNGEDVYYSLEVADTNTAGDVDVAVGKASIGTSVITSVWIKKYANTLYSTLNSSLCIDEFNEIYVVGNCRLKSDDTNRDSFWVGKINTDGALIWNYRYVAPGREVDMVGNSEIDIFGDLNVAFNRTDNTTGLKTVDTVKIGYDGVVKNHTTNNFDEANIEGITAHSLDVDNSADVHVFGQISWNRNEFIFPFNTGSTTTDTTGHYTLTTESTSGSLDYDGGYAKIYGYQTGQSTWTRGNLKVTGAQLGTKLNGNWTAEMQIFKDTNFTAVSGITQHTLFSIGDATDATGGLWLYYNVADGKLSLVVTNNSTTINAGSAVQSTQTTMFADDTWQFIGLKRNGNTFTVYVNGISVITATLADTNFANKDFLVGQISGRDGTTGTFRVNEQGQYIADNFRLRNRAVDPTTPSDISVLPTAGAIGLSYSYTDLTWFPDYLGRYDYIDYAGFGLKVDKNADAVRLGDKATQTNTGIAFTRTAVTPVTGSSLTISTSEYALGDAGLQSLDFDDADTTMTQDSETLTYTQDVWSSRTATVPSPGSQKLKVTAVVKDRYFFKVTNTLKIDNIQKLTINQSFRFTVGSKLVLRNTSGAFINSGYITKVDTTTNHVFVAVNNNTWSNDLNTGRLSTEQFNEQSTYGITGVIPNDINQIDSYSFAEVINTTPGTFDLDLADFNAPADVGGTNNLDEYAVFKPYSDDDYSIRIDEVSGSSPYIVGSVVQIASGNISFNSAYSTAQITGLTGVTKITVIANLTKILQVTARENGDEVYVITDTNHYLDSGDVIFVDGNPSQDVGGVTYDEYDGAFAVNQVISPLEFVYKLNAAAVSDPATTASGVSIFSKSPTLKMYYGHQYLFDLSHSSLEGGNLSFSKDNLYKLEYSFNSIERVGTPGLTGEGQPTPTVKLKVDRNIVTNISYYFDPSRTGDDSPVIPGSYLDVVDSPYVGTFQLSGVAGATITRGADILKFPLLNEPEGPADISQASYSTSSKKAVGSISDIRVVNAGGFYQRLPIVSDIQSTRQIERVQINEPGTEYAVGQYRGVPITGDGEGGLVEITVADGTDSEGDAIPGQIQAITVTSPGKGYTTATIDIDSVDGILGAGLTGSGAEVEVVIPSFGSGASVFTKGDKVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPINAQLTSTSILTSITVNDPGSGYSQAPAVIISGGGGSGAVAEATIKNGRLDQILIKDPGAGYSSTPSVNLKSSFNYVINLDLGLLQFSFPHGIVNGAEVTVSVTDTGDGAEFPLSSGATGRLNATTTYYAIAGTANSLEDDQLKLAITAANAELGDALTFSNAGTGRQSILTESFGGSATANVGTSTFLEGELVYQGDSLDVATATGYVSTNSGWQVGPRILKIVDYTGDFSANQRITGVISKSSGVISDLKIAKGVLEIGSITETTGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSIGEWKEILIKNVHPASFKVFGELNLNEYGFVPNKETFFELTKSVELTQAAIVPNIQNFALVEPVYSEFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISNLFDGERIAFPLTVDGNNVVANANQLMIVLNGIVQNPGTAFEIQNDSIVFQEPPSPPASVKYVNITINQINTISLTFTNQSGIFPLAGNTLIGTSSAARLIVTSVVGDTVNGFMESGSFIVGELITGSTTGFNANLATNSPVTNLGLFVFGEKITNFDGDTAIVEQINLERGQETPVAKLRYTIGAATTNIEVIDVSAATDSPVPAGTFVVGDNYQVGSEIFLVNSVTDGSESTTIGVTRGQNGTAAAAQQEDAPLYGTAISVTNALTLSKTAGTYQSTPGLFDIQLNDVIIGSQSGVVARVTSTATYQDPTTQEFIGQVNISEGSSFFGLLFNRIASQTYPNVILDDISSSQVNVVQFDDNATAFNSNFPANEQINNYVIPYDNASGDFDADEIIRNYKIDYGNNIGDFQVENGVVRKLTFTDKIGDGFFAAGQIIRTRDTKAEVIGYNSAINTVYLGKIGRSQRNGQDYFQWTWEAGAYINTYNEKFGSSCLALSAGLSDHTFVSGVADGIVAGGGATGTYTAATGTSYNPATGAMTLEIGNHSLTTSNTVTIADNAVTFTCDQDGDTSNKSYPRSTDPASGTALAISAVTSTTITVNVGAVPIDEYISTPSSSEFAFGTSAYTIELWVKPLSASLSGTKTLLDFRTQATDVAGRLYLEAGQVRFNSNNVDVATSGLTTLNNNVWYHIAVVRSSTSSGGTKLYIDGVERGVGIDANNYAAKPLRIGGDYAGANEFAGYIDELRVSTTNRYTTAFTAPTGMFQGDSNTKLLLHFDGEEGQTYVEDWSGGESFTADEYFNNDAILATSRSSTGIGVTGFTGNSHRYINAADNILLNKDFIANEAVYIMKNRYPYFTVPGGEINCEDDVRDILDALVNDLRNGSNDKIWDASALYVNRTVNPITLSHVESEIAETLYTLEKTQEIVEYVINNTPWEVQGDHGLTQKFDTSITESSYATATTFTPSGATYDPATGLMVITSNSHGLVAPSSKTATGATYTATTGVLQITSNSHGLSNGDRIKLADNSLTFTCTMDGNTAQKTYPRANDPASQGWLEVSNVATNTFEVNVGKSPTVNYTPTTATYNPATGIAVITLPENNLEVGQNVQIAQNALTFSRGSGSNGSVPTAATTSYEITQNGATSTATAATYDPASGQLVVTVANHGFTTSDKIRIEDNSLTFTCTKDGNFENKTYPRSTDPFSGRWLRPTAVTTNTFTVNVGPSSAADQYVHTFVSATANGIVKKDNTITVDLGTSGDTSAHTFASATTNGVVAGGNYTHTFVSATTNGITVAGDSVFLATESIVFTCTEDGNTEQKSYPRKSDPAAKQVLVITAADTNTFTVNVGASGQNDQYAHTFVSASSGAVTKSEYNLNDCTDVINTVDNLMSIVSDTLDNASQDPAVDHLGSVTKKLPAYKFLGGTVNAFRETPFD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Physico‐chemical
properties
protein length:6483 AA
molecular weight: 694368,90870 Da
isoelectric point:4,45393
aromaticity:0,09548
hydropathy:-0,16204

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.60.120.200
STR
4176–4326
PF13385
LEC
4180–4320
IPR006558
LEC
4195–4331
DC_0419
STR
4281–4563
E3SQ53
1 6483
Architecture
ATT
STR
STR
STR
RBD
RBD
ATT 1-1246 | STR 1247-2930 | STR 3145-3974 | STR 4073-4836 | RBD 4837-5319 | RBD 5571-6482 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Syn19
[NCBI]
445684 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Pontusvirus > Pontusvirus syn19
Host Synechococcus sp. WH 8109
[NCBI]
166314 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO99469.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071106 [NCBI]
CDS location
range 54654 -> 74105
strand +
CDS
ATGAATATTAACAAGGTATCTCAATCGATTGTCCAACAGACTCCAGACTTTCTTGAGGAAGAATATCCTCTGTTTAATAGATTTCTGGAGTACTATTATCAGTCACAGGAAAAAACAGGTGCTGGTCAAAATATTATCAACAACTTTCTTCAATATCTTGATATTGATAAGTTGGACATCGGTATCTTGGAAGGCAAAACCAAGATTGTTGAGGCAATTACCGATAAATCTACAAAAATTGTTGTAGAAAGCATTGAACAGTTCTTAGAAGAGAACGGTTCGATCATGATTGGCGATGAAGTCATCTATTATGAGAACACAACTAGTTCTCCTAACATCGCACTGTCTCCTGGTATCTCTTATGAGCAGGTAAAACTTAAGTGGACCAACCTGGCAACACCAATCAATGATTTTGATGGTGTACAGACAAGATTTCCCCTGGTTTCCCAGGATAACCCGATTGCTCCTCCTTCAGCACAACATTTGATTGTTAGTGTCTATGGAGAAGTTTTAATTCCTGGCACAGATTTCACTCTTTCTGGTGATGAGATTGTATTTACTACTGCACCGAGAACAAAACTCCCTGCAGATGATTCTACAACAACTTTCATCACTTATTTGAACGGTTTTATTGAAAATACCATTGCTTCTCTTGATGATATTTCCAATTCGTTCGGTGAAGGTAAGACTTCCTTCGCTTTAACTGAAAATGGCGAAAAATATGAACCGACTGTTGATGAATATGTAATTGCTATCTACGACGGTCGTCTTTTACAACCCAGAGTCGATTTCTTTATCGACGGAGATAAGTTTATCTTCGATACTGCACCTATCAATGGTCGTCAACTCTCGGTGTACTTTATTGAAGCACCTATTCCCTCTTTTGGTGCTGGTGCAAAGGCATTTTCTCGTGTTAATGATAATGGTGAACTAACTTCTATTAAAGTTGACACTGGCGGTAGTCAATACCGTTTTGAATATCCTCCCCAAGTTTCGATTAAGTCTGTTAACGGGTCTGGCGGTTCTGCTAGGTCTCTTGTTAATGGTATTAAGTCTACAAGTCTTCTTCAAGGTGGTAAGGGATATAGTTCTACCAATCCTCCTATTGTTCAAATCCAAGCTCCGACAAAACCTGGTGCTGTAGCAGCAACCATGACCGCAACTGTCGATAATGGTTCAGTAACTGCGTTAGAACTGACCAGTTCTGGTTCTGGATATACATTTACTCCTAGAGTTACGTTCAAACAACCTGGTGGTGCTACTCTGGGAACTCCCACAATCACTAATGGTTCAATTACAGGAACTATTCCTGTTACAAATAACGGTTTTGGATATGCCACTGCTCCTGAGGTTTATGTTGATGAACCTACGGGCACAAATCCAATCAGAGCAGCTCTGAGAGCAAATATTTCTGCCGATGGATTAGTTACTAGTATTTCTATTTTAAATGCTGGTCAAGGTTATACCACAACCCCTAGAATTGCAATTATCGACCCAGTTGGTGCTCAAGTTCTTGAAACTAGAGTGGATGGTAATGGTCGTGTTATCGGTATTGAACTCCTTAATGGTGGTAGCGGATATGACGAGATCCCTTCGGTCTATATCGTTGATACTCGCACTGATGCTCAAGGTAACTACTCTGGAGGAACTGGTGCTAAGGCAGTAGCATCGATCTTTAATGGTCAGATTACTGATATTAACGTAACTGAGTTTGGTACTGGTTATAGCGCCACACAACCTCCAAAGATCGTCATTCAAGATCCTCCTTCTGCTCAGGCATCAGTTGAAATCGGTCTTAATGAGGTAACTGGTTTTGCAGTTCAAAAATCAGGAACGGAATATGATAAAGCAGCATTTAATGGATGTGCCAGAGCTGCAAGTGGCATAACCTCTTACACCGAAACTGGTAATGCTGAGTTTTCCAACAATACTTTAGCAGCAGCTGCTTCAGTAGACACTGAAGTCAAGTGTTTGGATGCTTTGTTCATTAAGAGACTGCTTGACAAGTATACTGAGCAGTTCTTACCCGATGTTCCTCAATTAGACTATAAAAAGATTGACGTTCGTAACGCAATCAAGTCAATTAAAGATTTTTATTCGGCAAAAGGAACTTCCTTTAGTATTGCATATCTTTTCAAACTACTTTATGGTGAAACGGTCTCTATTTCGTATCCGAAAGACCAAATCATCAAACCTTCTGCTGCAACTTGGTCTGTTGATACAATTCTTCGTGCTACTTTGGTTAGTGGTAATCCTGTAGACATTAGAGACGCTCTGATTACTCAAGAAGCAGATATTGCAGACTCTAATGTTCAAGCAGCGAGTGCTTTGGTTGAAAACTATATTTCAATTAAAACTTCTGATGTAGAAATTTTTGAACTTGTTCTTTCCGAAGAAACCATTACAGGAACTTTTACTGTTCCTTACAAAACACGTCTTGCAGAGCCTCTCAACACCACTGATAGTATTATCACTGTTGACTCTACGATTGGTTGGCCAGAAAGAAACGGAGAATTTGTAATTGGTAGTGGACTTGGCAAAGAAGTTATCCAATACAAAGAAAAATCACTAAACCAGTTCATTGAGTGTACTCGTTCTGTAAATGGAACTGTAGAAGACTGGGATTCTGCTACAGAAGTCTCTTCTAACTTTACAATCTTCTTAAACAAGGGAACTGCTCAGGAAGTTGTAATGAACATCGTTGGTATTGTTGATGCTCAACAAACCACTCTTACCGATACTGGTTCTTACTATCTTCCTGGTGATAAACTGTCAGTTTCTAAACTGGGCGGCACAGGAACGTCTTCTCAGTTAACAACTTGGTTGTACAACGTTAAAAAACTAGTTGAAGTATCTGGTATCACTTTTGGTGGTGTAAATGACCAGTCTGCAACTGTTACTTGTGCTAATCCCCACGGTCTTCTGGTTGGAGACCAAGTTACAGTCTATGGTGCAAACCCAATCATCTATAACGGAACGTTCCTGGTAACTTCTAGAGATAGTGCTACGGTCTTCCAGTATCAATTACCTCAACCTGCAACTACAGTTCCTCAAGGTAATATTCTGGTTTCTATTGACTTGAACAAAGGTAAATCTGATAGTCAGATTGTTCTTAATGCTATTGGACCTTACACCACTAACATTCAGAATACTTTCTTTAATGACAACTATGTCTACGTTGCATCCACGGGTATTCCGAACTATAATATTGGTCCTTTCCCTGGATCTGCTCTTTTACCTGGTAACCAGCGTAAACTGAATAGATTCCCAACAACTCCTGTAACTATTTCGACTAAGAATACAATTGCTTCTGGTCCTATCGGAACATGGGTAAATGGTGTCTCTGTATGGTCCTACAAGTCTACTGTCACAAAAACTTTTGGTGCAGTTACTTCAATTGACATTCCTAACAAAGGTGAGGGATATGATGCAGCAAATCCTCCTGTTATTACTATCGATGGTGGCGGAGGAACTGGTGCTACTGCAGATGTAGTTGTTGATGGTGCTATTAGCGAAGTCACCGTCGATTCTGGTGGAACTGGGTATACATCCTCCCCTCTTGTCTCTATCGTTGGTGGAGGCGGTTCTGGTGCGTTTGCAACGGCAATTATCACCAAGGGTGTAGTTTCTAGAATCCTTATTAATGAAGGCGGAACTGGATATACATCACAACCTTCTATTACGATTGTTGGTGGAGGCGGCACAGGTGCTACTGGTACTGCATCTGTCAGAGGTCCTATCAAATCTGTTAATATTACTAATGGTGGTGCTTCTTATACTTCAAATCCCTCTGTTACACTGAGTTCTGGTTCTGGTGCAGTTGCTCAAGCAATTGTTAATAACGGTAGAATTATTTCTATTGCTATTATTTCTGCTGGTTCTGGATACACTACTGCACCAGAGATTCAAATTCAAGGTGATGGTTTTGGTGCTGTAGCGAGAGCAACTATTGATACTGACGGTGAAAATGCTGGTAGAGTTACTGGTATCACTATTGTTAACAAGGGTATTGGATATACTCAAGGACAAACTGTTATCAATCTGAATTCTATTGGTCAGGGTGCTCAATTCTCAGCACAAGTATTTAAGTGGACTTATAACTTACAAGAAACCTCCACAATTGATAGCGCAAAAGGATTTGTTGCTGAAGGATTCAATAATCAGTATGGTGGAGAATATGCACACATCTCCAATCCACAAAGATTGAGATATATCCTTGGTGATAACCTTTTCCAAAATACTTCTGGTAGTATTCTTGAGCAAGAGGATCAACTCGTTCACTCTCCTATCATTGGTTGGGCGTTTGATGGTAACCCGATCTATGGTCCTTATGCATACACCGATCCCACCGATCAGGGTTCTTCGATTACAAGAATGCGTACTTCGTATAGTCTCAAGACCGAATTGGTATATAACGTTGATACTAATCCAACTCCTGTAAGAACTGCTGGTCCTTTACTCTCTGAAGAAGCGGCAGGTAACTTTGTTGAAGATTATCAATATGTTTTCAACTCAGGTGACCTAGACCAATATAACGGTCGTTTCTGTAAGACACCTGATTTCCCTGAAGGTAGATATTGCTATTTTGTCACTATTGATGCTGCAGAAGCAGGTAATCCTGTATTCCCATATGTTCTTGGTCCTAGTTTCAACTCCGTTGTTGATAAGTGGAACTTGAGCACCGATGCAGTTCAACAGAATATTCCAACTGGTGTTGTTCGTTATCGCGATCCATATGAAAATGTTGATATTGATGTTGAGCGTGCTCCTAACGCATCTACAAATGCATTGACATTAGAAAATGGTGATGTTCTTCTGTTTGAAGTAGAAGACGAAGATAGAAGTGGTGTTATTGAACAAGATGAACTCGATGATCCCGATCAGGTCTTTGAAGAGTCTCCTCTGCAACTTTATGATTATTTCCCGAAGGTAAAACTTGATTCTAAGGTTGACATTGAAGTTGAAACGACTACTAAGTTTGAAGATGCTTCTGTAACTGG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Genome Context

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