Protein
View in Explore- UniProt accession
- E3SQ53 [UniProt]
- Protein name
- LamG-like jellyroll fold domain-containing protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MNINKVSQSIVQQTPDFLEEEYPLFNRFLEYYYQSQEKTGAGQNIINNFLQYLDIDKLDIGILEGKTKIVEAITDKSTKIVVESIEQFLEENGSIMIGDEVIYYENTTSSPNIALSPGISYEQVKLKWTNLATPINDFDGVQTRFPLVSQDNPIAPPSAQHLIVSVYGEVLIPGTDFTLSGDEIVFTTAPRTKLPADDSTTTFITYLNGFIENTIASLDDISNSFGEGKTSFALTENGEKYEPTVDEYVIAIYDGRLLQPRVDFFIDGDKFIFDTAPINGRQLSVYFIEAPIPSFGAGAKAFSRVNDNGELTSIKVDTGGSQYRFEYPPQVSIKSVNGSGGSARSLVNGIKSTSLLQGGKGYSSTNPPIVQIQAPTKPGAVAATMTATVDNGSVTALELTSSGSGYTFTPRVTFKQPGGATLGTPTITNGSITGTIPVTNNGFGYATAPEVYVDEPTGTNPIRAALRANISADGLVTSISILNAGQGYTTTPRIAIIDPVGAQVLETRVDGNGRVIGIELLNGGSGYDEIPSVYIVDTRTDAQGNYSGGTGAKAVASIFNGQITDINVTEFGTGYSATQPPKIVIQDPPSAQASVEIGLNEVTGFAVQKSGTEYDKAAFNGCARAASGITSYTETGNAEFSNNTLAAAASVDTEVKCLDALFIKRLLDKYTEQFLPDVPQLDYKKIDVRNAIKSIKDFYSAKGTSFSIAYLFKLLYGETVSISYPKDQIIKPSAATWSVDTILRATLVSGNPVDIRDALITQEADIADSNVQAASALVENYISIKTSDVEIFELVLSEETITGTFTVPYKTRLAEPLNTTDSIITVDSTIGWPERNGEFVIGSGLGKEVIQYKEKSLNQFIECTRSVNGTVEDWDSATEVSSNFTIFLNKGTAQEVVMNIVGIVDAQQTTLTDTGSYYLPGDKLSVSKLGGTGTSSQLTTWLYNVKKLVEVSGITFGGVNDQSATVTCANPHGLLVGDQVTVYGANPIIYNGTFLVTSRDSATVFQYQLPQPATTVPQGNILVSIDLNKGKSDSQIVLNAIGPYTTNIQNTFFNDNYVYVASTGIPNYNIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPTTPVTISTKNTIASGPIGTWVNGVSVWSYKSTVTKTFGAVTSIDIPNKGEGYDAANPPVITIDGGGGTGATADVVVDGAISEVTVDSGGTGYTSSPLVSIVGGGGSGAFATAIITKGVVSRILINEGGTGYTSQPSITIVGGGGTGATGTASVRGPIKSVNITNGGASYTSNPSVTLSSGSGAVAQAIVNNGRIISIAIISAGSGYTTAPEIQIQGDGFGAVARATIDTDGENAGRVTGITIVNKGIGYTQGQTVINLNSIGQGAQFSAQVFKWTYNLQETSTIDSAKGFVAEGFNNQYGGEYAHISNPQRLRYILGDNLFQNTSGSILEQEDQLVHSPIIGWAFDGNPIYGPYAYTDPTDQGSSITRMRTSYSLKTELVYNVDTNPTPVRTAGPLLSEEAAGNFVEDYQYVFNSGDLDQYNGRFCKTPDFPEGRYCYFVTIDAAEAGNPVFPYVLGPSFNSVVDKWNLSTDAVQQNIPTGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNALTLENGDVLLFEVEDEDRSGVIEQDELDDPDQVFEESPLQLYDYFPKVKLDSKVDIEVETTTKFEDASVTGFTIENPGTSYQVDDRLIFDNTDTGGSGVSARVSRIKGETVEAYTFESISGQNYGVLTTEEPHNLIVGDTVFVDYSPVMDNTNKQFIVRQYTGIEEIIINQTGSGYNEDIPPTIVIDSDSGTDARLQAVVSSVGSIDTVNILNSGSGYTSNPRVILSHPQVFKKADYYVSFINNNDYVKVNDTFVNENKEVFICGKTKDASANVVAFVAKLSATGVKEWEKTLELGTGQQEAEFLKLVVDGSAVWVVGQNRPNSSILADYNPDIILAKYTQADNGLSATLTFQKGYAGISGSTRGDVVTSLVKYSDTRFLIGGFTNTNSASPEDAFLASIDTSGNFSVKRKFASSNKSEKITDIIVNGEDVYYSLEVADTNTAGDVDVAVGKASIGTSVITSVWIKKYANTLYSTLNSSLCIDEFNEIYVVGNCRLKSDDTNRDSFWVGKINTDGALIWNYRYVAPGREVDMVGNSEIDIFGDLNVAFNRTDNTTGLKTVDTVKIGYDGVVKNHTTNNFDEANIEGITAHSLDVDNSADVHVFGQISWNRNEFIFPFNTGSTTTDTTGHYTLTTESTSGSLDYDGGYAKIYGYQTGQSTWTRGNLKVTGAQLGTKLNGNWTAEMQIFKDTNFTAVSGITQHTLFSIGDATDATGGLWLYYNVADGKLSLVVTNNSTTINAGSAVQSTQTTMFADDTWQFIGLKRNGNTFTVYVNGISVITATLADTNFANKDFLVGQISGRDGTTGTFRVNEQGQYIADNFRLRNRAVDPTTPSDISVLPTAGAIGLSYSYTDLTWFPDYLGRYDYIDYAGFGLKVDKNADAVRLGDKATQTNTGIAFTRTAVTPVTGSSLTISTSEYALGDAGLQSLDFDDADTTMTQDSETLTYTQDVWSSRTATVPSPGSQKLKVTAVVKDRYFFKVTNTLKIDNIQKLTINQSFRFTVGSKLVLRNTSGAFINSGYITKVDTTTNHVFVAVNNNTWSNDLNTGRLSTEQFNEQSTYGITGVIPNDINQIDSYSFAEVINTTPGTFDLDLADFNAPADVGGTNNLDEYAVFKPYSDDDYSIRIDEVSGSSPYIVGSVVQIASGNISFNSAYSTAQITGLTGVTKITVIANLTKILQVTARENGDEVYVITDTNHYLDSGDVIFVDGNPSQDVGGVTYDEYDGAFAVNQVISPLEFVYKLNAAAVSDPATTASGVSIFSKSPTLKMYYGHQYLFDLSHSSLEGGNLSFSKDNLYKLEYSFNSIERVGTPGLTGEGQPTPTVKLKVDRNIVTNISYYFDPSRTGDDSPVIPGSYLDVVDSPYVGTFQLSGVAGATITRGADILKFPLLNEPEGPADISQASYSTSSKKAVGSISDIRVVNAGGFYQRLPIVSDIQSTRQIERVQINEPGTEYAVGQYRGVPITGDGEGGLVEITVADGTDSEGDAIPGQIQAITVTSPGKGYTTATIDIDSVDGILGAGLTGSGAEVEVVIPSFGSGASVFTKGDKVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPINAQLTSTSILTSITVNDPGSGYSQAPAVIISGGGGSGAVAEATIKNGRLDQILIKDPGAGYSSTPSVNLKSSFNYVINLDLGLLQFSFPHGIVNGAEVTVSVTDTGDGAEFPLSSGATGRLNATTTYYAIAGTANSLEDDQLKLAITAANAELGDALTFSNAGTGRQSILTESFGGSATANVGTSTFLEGELVYQGDSLDVATATGYVSTNSGWQVGPRILKIVDYTGDFSANQRITGVISKSSGVISDLKIAKGVLEIGSITETTGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSIGEWKEILIKNVHPASFKVFGELNLNEYGFVPNKETFFELTKSVELTQAAIVPNIQNFALVEPVYSEFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISNLFDGERIAFPLTVDGNNVVANANQLMIVLNGIVQNPGTAFEIQNDSIVFQEPPSPPASVKYVNITINQINTISLTFTNQSGIFPLAGNTLIGTSSAARLIVTSVVGDTVNGFMESGSFIVGELITGSTTGFNANLATNSPVTNLGLFVFGEKITNFDGDTAIVEQINLERGQETPVAKLRYTIGAATTNIEVIDVSAATDSPVPAGTFVVGDNYQVGSEIFLVNSVTDGSESTTIGVTRGQNGTAAAAQQEDAPLYGTAISVTNALTLSKTAGTYQSTPGLFDIQLNDVIIGSQSGVVARVTSTATYQDPTTQEFIGQVNISEGSSFFGLLFNRIASQTYPNVILDDISSSQVNVVQFDDNATAFNSNFPANEQINNYVIPYDNASGDFDADEIIRNYKIDYGNNIGDFQVENGVVRKLTFTDKIGDGFFAAGQIIRTRDTKAEVIGYNSAINTVYLGKIGRSQRNGQDYFQWTWEAGAYINTYNEKFGSSCLALSAGLSDHTFVSGVADGIVAGGGATGTYTAATGTSYNPATGAMTLEIGNHSLTTSNTVTIADNAVTFTCDQDGDTSNKSYPRSTDPASGTALAISAVTSTTITVNVGAVPIDEYISTPSSSEFAFGTSAYTIELWVKPLSASLSGTKTLLDFRTQATDVAGRLYLEAGQVRFNSNNVDVATSGLTTLNNNVWYHIAVVRSSTSSGGTKLYIDGVERGVGIDANNYAAKPLRIGGDYAGANEFAGYIDELRVSTTNRYTTAFTAPTGMFQGDSNTKLLLHFDGEEGQTYVEDWSGGESFTADEYFNNDAILATSRSSTGIGVTGFTGNSHRYINAADNILLNKDFIANEAVYIMKNRYPYFTVPGGEINCEDDVRDILDALVNDLRNGSNDKIWDASALYVNRTVNPITLSHVESEIAETLYTLEKTQEIVEYVINNTPWEVQGDHGLTQKFDTSITESSYATATTFTPSGATYDPATGLMVITSNSHGLVAPSSKTATGATYTATTGVLQITSNSHGLSNGDRIKLADNSLTFTCTMDGNTAQKTYPRANDPASQGWLEVSNVATNTFEVNVGKSPTVNYTPTTATYNPATGIAVITLPENNLEVGQNVQIAQNALTFSRGSGSNGSVPTAATTSYEITQNGATSTATAATYDPASGQLVVTVANHGFTTSDKIRIEDNSLTFTCTKDGNFENKTYPRSTDPFSGRWLRPTAVTTNTFTVNVGPSSAADQYVHTFVSATANGIVKKDNTITVDLGTSGDTSAHTFASATTNGVVAGGNYTHTFVSATTNGITVAGDSVFLATESIVFTCTEDGNTEQKSYPRKSDPAAKQVLVITAADTNTFTVNVGASGQNDQYAHTFVSASSGAVTKSEYNLNDCTDVINTVDNLMSIVSDTLDNASQDPAVDHLGSVTKKLPAYKFLGGTVNAFRETPFD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- Physico‐chemical
properties -
protein length: 6483 AA molecular weight: 694368,90870 Da isoelectric point: 4,45393 aromaticity: 0,09548 hydropathy: -0,16204
Domains
Domains [InterPro]
DC_0042
ATT
1–437
ATT
1–437
DC_0042
ATT
428–516
ATT
428–516
G3DSA:2.60.120.200
STR
4176–4326
STR
4176–4326
PF13385
LEC
4180–4320
LEC
4180–4320
IPR006558
LEC
4195–4331
LEC
4195–4331
DC_0419
STR
4281–4563
STR
4281–4563
1
6483
Architecture
ATT 1-1246 | STR 1247-2930 | STR 3145-3974 | STR 4073-4836 | RBD 4837-5319 | RBD 5571-6482 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage Syn19 [NCBI] |
445684 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Pontusvirus > Pontusvirus syn19 |
| Host |
Synechococcus sp. WH 8109 [NCBI] |
166314 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO99469.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071106
[NCBI]
CDS location
range 54654 -> 74105
strand +
strand +
CDS
ATGAATATTAACAAGGTATCTCAATCGATTGTCCAACAGACTCCAGACTTTCTTGAGGAAGAATATCCTCTGTTTAATAGATTTCTGGAGTACTATTATCAGTCACAGGAAAAAACAGGTGCTGGTCAAAATATTATCAACAACTTTCTTCAATATCTTGATATTGATAAGTTGGACATCGGTATCTTGGAAGGCAAAACCAAGATTGTTGAGGCAATTACCGATAAATCTACAAAAATTGTTGTAGAAAGCATTGAACAGTTCTTAGAAGAGAACGGTTCGATCATGATTGGCGATGAAGTCATCTATTATGAGAACACAACTAGTTCTCCTAACATCGCACTGTCTCCTGGTATCTCTTATGAGCAGGTAAAACTTAAGTGGACCAACCTGGCAACACCAATCAATGATTTTGATGGTGTACAGACAAGATTTCCCCTGGTTTCCCAGGATAACCCGATTGCTCCTCCTTCAGCACAACATTTGATTGTTAGTGTCTATGGAGAAGTTTTAATTCCTGGCACAGATTTCACTCTTTCTGGTGATGAGATTGTATTTACTACTGCACCGAGAACAAAACTCCCTGCAGATGATTCTACAACAACTTTCATCACTTATTTGAACGGTTTTATTGAAAATACCATTGCTTCTCTTGATGATATTTCCAATTCGTTCGGTGAAGGTAAGACTTCCTTCGCTTTAACTGAAAATGGCGAAAAATATGAACCGACTGTTGATGAATATGTAATTGCTATCTACGACGGTCGTCTTTTACAACCCAGAGTCGATTTCTTTATCGACGGAGATAAGTTTATCTTCGATACTGCACCTATCAATGGTCGTCAACTCTCGGTGTACTTTATTGAAGCACCTATTCCCTCTTTTGGTGCTGGTGCAAAGGCATTTTCTCGTGTTAATGATAATGGTGAACTAACTTCTATTAAAGTTGACACTGGCGGTAGTCAATACCGTTTTGAATATCCTCCCCAAGTTTCGATTAAGTCTGTTAACGGGTCTGGCGGTTCTGCTAGGTCTCTTGTTAATGGTATTAAGTCTACAAGTCTTCTTCAAGGTGGTAAGGGATATAGTTCTACCAATCCTCCTATTGTTCAAATCCAAGCTCCGACAAAACCTGGTGCTGTAGCAGCAACCATGACCGCAACTGTCGATAATGGTTCAGTAACTGCGTTAGAACTGACCAGTTCTGGTTCTGGATATACATTTACTCCTAGAGTTACGTTCAAACAACCTGGTGGTGCTACTCTGGGAACTCCCACAATCACTAATGGTTCAATTACAGGAACTATTCCTGTTACAAATAACGGTTTTGGATATGCCACTGCTCCTGAGGTTTATGTTGATGAACCTACGGGCACAAATCCAATCAGAGCAGCTCTGAGAGCAAATATTTCTGCCGATGGATTAGTTACTAGTATTTCTATTTTAAATGCTGGTCAAGGTTATACCACAACCCCTAGAATTGCAATTATCGACCCAGTTGGTGCTCAAGTTCTTGAAACTAGAGTGGATGGTAATGGTCGTGTTATCGGTATTGAACTCCTTAATGGTGGTAGCGGATATGACGAGATCCCTTCGGTCTATATCGTTGATACTCGCACTGATGCTCAAGGTAACTACTCTGGAGGAACTGGTGCTAAGGCAGTAGCATCGATCTTTAATGGTCAGATTACTGATATTAACGTAACTGAGTTTGGTACTGGTTATAGCGCCACACAACCTCCAAAGATCGTCATTCAAGATCCTCCTTCTGCTCAGGCATCAGTTGAAATCGGTCTTAATGAGGTAACTGGTTTTGCAGTTCAAAAATCAGGAACGGAATATGATAAAGCAGCATTTAATGGATGTGCCAGAGCTGCAAGTGGCATAACCTCTTACACCGAAACTGGTAATGCTGAGTTTTCCAACAATACTTTAGCAGCAGCTGCTTCAGTAGACACTGAAGTCAAGTGTTTGGATGCTTTGTTCATTAAGAGACTGCTTGACAAGTATACTGAGCAGTTCTTACCCGATGTTCCTCAATTAGACTATAAAAAGATTGACGTTCGTAACGCAATCAAGTCAATTAAAGATTTTTATTCGGCAAAAGGAACTTCCTTTAGTATTGCATATCTTTTCAAACTACTTTATGGTGAAACGGTCTCTATTTCGTATCCGAAAGACCAAATCATCAAACCTTCTGCTGCAACTTGGTCTGTTGATACAATTCTTCGTGCTACTTTGGTTAGTGGTAATCCTGTAGACATTAGAGACGCTCTGATTACTCAAGAAGCAGATATTGCAGACTCTAATGTTCAAGCAGCGAGTGCTTTGGTTGAAAACTATATTTCAATTAAAACTTCTGATGTAGAAATTTTTGAACTTGTTCTTTCCGAAGAAACCATTACAGGAACTTTTACTGTTCCTTACAAAACACGTCTTGCAGAGCCTCTCAACACCACTGATAGTATTATCACTGTTGACTCTACGATTGGTTGGCCAGAAAGAAACGGAGAATTTGTAATTGGTAGTGGACTTGGCAAAGAAGTTATCCAATACAAAGAAAAATCACTAAACCAGTTCATTGAGTGTACTCGTTCTGTAAATGGAACTGTAGAAGACTGGGATTCTGCTACAGAAGTCTCTTCTAACTTTACAATCTTCTTAAACAAGGGAACTGCTCAGGAAGTTGTAATGAACATCGTTGGTATTGTTGATGCTCAACAAACCACTCTTACCGATACTGGTTCTTACTATCTTCCTGGTGATAAACTGTCAGTTTCTAAACTGGGCGGCACAGGAACGTCTTCTCAGTTAACAACTTGGTTGTACAACGTTAAAAAACTAGTTGAAGTATCTGGTATCACTTTTGGTGGTGTAAATGACCAGTCTGCAACTGTTACTTGTGCTAATCCCCACGGTCTTCTGGTTGGAGACCAAGTTACAGTCTATGGTGCAAACCCAATCATCTATAACGGAACGTTCCTGGTAACTTCTAGAGATAGTGCTACGGTCTTCCAGTATCAATTACCTCAACCTGCAACTACAGTTCCTCAAGGTAATATTCTGGTTTCTATTGACTTGAACAAAGGTAAATCTGATAGTCAGATTGTTCTTAATGCTATTGGACCTTACACCACTAACATTCAGAATACTTTCTTTAATGACAACTATGTCTACGTTGCATCCACGGGTATTCCGAACTATAATATTGGTCCTTTCCCTGGATCTGCTCTTTTACCTGGTAACCAGCGTAAACTGAATAGATTCCCAACAACTCCTGTAACTATTTCGACTAAGAATACAATTGCTTCTGGTCCTATCGGAACATGGGTAAATGGTGTCTCTGTATGGTCCTACAAGTCTACTGTCACAAAAACTTTTGGTGCAGTTACTTCAATTGACATTCCTAACAAAGGTGAGGGATATGATGCAGCAAATCCTCCTGTTATTACTATCGATGGTGGCGGAGGAACTGGTGCTACTGCAGATGTAGTTGTTGATGGTGCTATTAGCGAAGTCACCGTCGATTCTGGTGGAACTGGGTATACATCCTCCCCTCTTGTCTCTATCGTTGGTGGAGGCGGTTCTGGTGCGTTTGCAACGGCAATTATCACCAAGGGTGTAGTTTCTAGAATCCTTATTAATGAAGGCGGAACTGGATATACATCACAACCTTCTATTACGATTGTTGGTGGAGGCGGCACAGGTGCTACTGGTACTGCATCTGTCAGAGGTCCTATCAAATCTGTTAATATTACTAATGGTGGTGCTTCTTATACTTCAAATCCCTCTGTTACACTGAGTTCTGGTTCTGGTGCAGTTGCTCAAGCAATTGTTAATAACGGTAGAATTATTTCTATTGCTATTATTTCTGCTGGTTCTGGATACACTACTGCACCAGAGATTCAAATTCAAGGTGATGGTTTTGGTGCTGTAGCGAGAGCAACTATTGATACTGACGGTGAAAATGCTGGTAGAGTTACTGGTATCACTATTGTTAACAAGGGTATTGGATATACTCAAGGACAAACTGTTATCAATCTGAATTCTATTGGTCAGGGTGCTCAATTCTCAGCACAAGTATTTAAGTGGACTTATAACTTACAAGAAACCTCCACAATTGATAGCGCAAAAGGATTTGTTGCTGAAGGATTCAATAATCAGTATGGTGGAGAATATGCACACATCTCCAATCCACAAAGATTGAGATATATCCTTGGTGATAACCTTTTCCAAAATACTTCTGGTAGTATTCTTGAGCAAGAGGATCAACTCGTTCACTCTCCTATCATTGGTTGGGCGTTTGATGGTAACCCGATCTATGGTCCTTATGCATACACCGATCCCACCGATCAGGGTTCTTCGATTACAAGAATGCGTACTTCGTATAGTCTCAAGACCGAATTGGTATATAACGTTGATACTAATCCAACTCCTGTAAGAACTGCTGGTCCTTTACTCTCTGAAGAAGCGGCAGGTAACTTTGTTGAAGATTATCAATATGTTTTCAACTCAGGTGACCTAGACCAATATAACGGTCGTTTCTGTAAGACACCTGATTTCCCTGAAGGTAGATATTGCTATTTTGTCACTATTGATGCTGCAGAAGCAGGTAATCCTGTATTCCCATATGTTCTTGGTCCTAGTTTCAACTCCGTTGTTGATAAGTGGAACTTGAGCACCGATGCAGTTCAACAGAATATTCCAACTGGTGTTGTTCGTTATCGCGATCCATATGAAAATGTTGATATTGATGTTGAGCGTGCTCCTAACGCATCTACAAATGCATTGACATTAGAAAATGGTGATGTTCTTCTGTTTGAAGTAGAAGACGAAGATAGAAGTGGTGTTATTGAACAAGATGAACTCGATGATCCCGATCAGGTCTTTGAAGAGTCTCCTCTGCAACTTTATGATTATTTCCCGAAGGTAAAACTTGATTCTAAGGTTGACATTGAAGTTGAAACGACTACTAAGTTTGAAGATGCTTCTGTAACTGG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Genome Context
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