Protein

View in Explore
Genbank accession
QZI86692.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
Protein sequence
MATKIEVTKLNALDDNLVEGQKVIEIILGPTIGADTADLALAVAQAEAAQAAAELAEDNAKASELAALASEGAAQTAQTLAEVAEGNAKASEIAAQSSEDDAQISEDAAAASEAAALASQNAAAVSAAAALASENAAQSSEDDAQVSEDNAAASEVAAAASAAAALASENAAQSSEDDAQISEDAAAASAAAALASENAAQSSEDDAKVSEDAAAASAAAALTQANRAETEADRSETEADRAQTIADSMTTALVPRGDWDASTGAFPTPTLSPERADFYQISVAGTMTTNKPAGQDDLSVEVGDQLYWNVVIDVWYSIDNTDQVTSVDGKKGVVVIDKYTQAEADARFVNAAGDTMTGALTIEESVMLVGNTAADNYMELAQVYGSSYGFTFQHNNASTMTNLQGSTNQALVLGDVSANVTDVLLGVSLKEGAGAWTKRLELDGAGELYLGSGAAYRTFHENYHPNADKWTTSRTVTLTGDATGSFAIDGSADVSVSVVVEDDSHVHTDYLSNVATDLSNIMYGNIYASDEKPLIQLVGDDAYFGSHGRVGLQLASSSNPEWKTSTAAYKLFNESYHPNADTWTTPRTITLTGDATGSFTMDGSSDESVEVTVVNDSHTHDTRYLKLAGGYMAGEITGPYSWVLNRTFVMIENETPQYLLLCLNAGGNNVNGEFILNRTSGNYQSANLNVVVSSGSSVSPYGTIVSVQSTQDDEEYRLVTVDYAGDSWVAIKYVGNSYPVTDPGLFSGRIQSSKAGSLTAVGAASITNEAPLRDATKFELNGQAIFHQGYHPNADKWTTSRTVTFTGDATGSLSLDGSSNESVTMTVVDDSHNHSYVNGTFEIRHANEQLKLVDTTDGNKWWMLDHQNGDLNFRYNGVSVTPALVIHETGNYVSAPSFSATTYLNLPIENVRTGNQADIRYNPVKGFEGHDGVEWGAIGGGGGVEWEATTGTSVVAETGAGYLVTEAGVTVVLPPTPDQGNTVGVGDYNGLNFEVTINPNGGKIMGLTEDFTFDTKNANIVFSYVDTTVGWILTQGFGESEAPQAIANKVIVTDAVGQSVISIPNNGSQTVDVWYNGLKLLRNDDYIVDEDLDTVTLTDPIDLSDDIVEVYAWNQALVLDTTDLLYHGTQMRKTIEGDGISLTEAIEARAPQPNLLINGDFVINQRQFAISSDVPIDGEFFVDRWFARNAIGGTNLCYSDFRNNTGMYTRMTHTGAAVSAYIGQRIEVMDWRPFVNTTASVEVSHSQDCVMSGVIHLRRVSDDTVLSSVFSNEVIVTPGLKTVVFTMEGLDISMVGSTECYAEFRIIYNNGGSIATPDGQYRFYTAKLESGLLATPFVPDSPQESLAKCQRYFYTTRGRTKSQIFGTATVSSTNDGTFQAGVPIPVPMRINKPALTQFGSFAIYGVSSTSGTKNETVTFTDGGSGAGVGFIDIIIQSNTVPTLLRGAVTLRGLNSSAWFNVDAEL
Physico‐chemical
properties
protein length:1465 AA
molecular weight: 155096,25560 Da
isoelectric point:4,25652
aromaticity:0,07782
hydropathy:-0,17331

Domains

Domains [InterPro]
DC_1329
ATT
15–153
DC_1329 Coil DC_2177 DC_1152
Coil
Unmapped
39–66
Coil DC_1451
QZI86692.1
1 1465
Architecture
ATT
STR
ATT
ATT 15-153 | STR 272-686 | ATT 687-1465
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage 70E38.1
[NCBI] 		2859293 No lineage information
Host Vibrio crassostreae
[NCBI] 		246167 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Vibrionales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QZI86692.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW865341.1 [NCBI]
CDS location
range 828 -> 5225
strand +
CDS
ATGGCAACAAAAATAGAAGTAACCAAGCTTAATGCCTTAGATGACAATCTAGTAGAGGGTCAGAAGGTAATTGAGATCATACTTGGTCCGACTATCGGGGCAGACACAGCAGATCTAGCCCTTGCTGTTGCGCAAGCAGAAGCAGCACAGGCAGCTGCAGAGTTAGCGGAAGATAACGCTAAGGCCTCTGAACTTGCAGCGCTAGCATCAGAAGGTGCGGCACAAACAGCACAAACACTTGCAGAAGTGGCAGAAGGCAATGCTAAGGCATCCGAAATAGCTGCACAGAGCTCAGAAGATGATGCTCAAATATCAGAAGATGCGGCAGCAGCCTCTGAAGCGGCAGCGCTTGCGTCTCAAAACGCAGCAGCAGTATCAGCAGCAGCAGCCCTTGCTTCAGAAAACGCAGCACAAAGCTCAGAAGACGATGCTCAGGTGTCAGAAGACAACGCGGCAGCCTCAGAAGTAGCGGCAGCGGCATCAGCAGCTGCGGCACTTGCGTCAGAAAACGCAGCACAGAGCTCTGAGGATGATGCACAGATCTCCGAGGATGCAGCGGCAGCCTCAGCAGCAGCAGCACTTGCATCTGAGAATGCAGCGCAAAGCTCAGAAGACGATGCTAAAGTATCAGAAGATGCAGCAGCGGCATCCGCAGCGGCAGCACTAACTCAGGCAAACCGCGCAGAGACAGAAGCAGATCGCTCAGAAACAGAAGCGGATCGTGCTCAAACCATCGCAGATTCTATGACAACAGCTCTAGTTCCTCGCGGTGACTGGGATGCATCTACAGGAGCATTCCCTACACCTACACTATCTCCTGAACGAGCAGACTTCTATCAGATCTCCGTAGCAGGTACAATGACAACTAACAAGCCTGCTGGACAGGATGATCTATCAGTTGAAGTAGGTGACCAATTATACTGGAACGTTGTAATCGACGTTTGGTACTCAATAGACAACACAGACCAAGTTACTAGCGTAGATGGTAAGAAAGGTGTTGTTGTAATTGATAAATACACACAGGCTGAAGCAGACGCTCGCTTTGTAAACGCTGCAGGCGATACGATGACTGGCGCTTTAACTATCGAAGAAAGCGTAATGTTAGTGGGAAATACCGCGGCGGATAACTACATGGAACTTGCCCAAGTTTATGGTAGCTCTTACGGGTTTACTTTCCAACATAATAACGCATCCACTATGACTAACTTGCAGGGTTCAACCAACCAAGCACTAGTTCTAGGTGATGTTAGTGCAAATGTTACAGACGTGCTATTGGGGGTGTCCCTAAAAGAAGGTGCGGGTGCATGGACTAAGCGTCTTGAACTCGACGGAGCAGGTGAATTATACCTCGGCTCTGGTGCAGCATATAGAACTTTCCATGAAAACTACCACCCTAACGCAGACAAGTGGACAACCTCTCGTACAGTAACCCTTACAGGTGATGCTACTGGTAGCTTTGCTATTGATGGATCGGCAGATGTCTCAGTCTCCGTTGTTGTTGAGGACGACAGTCACGTCCACACGGATTACTTGAGTAATGTAGCAACCGACCTAAGTAACATTATGTATGGTAACATATATGCCTCCGACGAGAAGCCCCTAATACAACTAGTCGGGGATGACGCATATTTTGGGTCTCACGGCCGAGTAGGATTGCAACTGGCATCCTCGTCAAACCCAGAGTGGAAGACTTCAACAGCCGCCTACAAACTATTTAATGAGTCCTACCACCCTAACGCAGATACTTGGACTACTCCTAGAACAATTACTCTTACTGGTGATGCTACAGGTTCATTTACTATGGACGGTTCCTCTGATGAATCGGTAGAAGTTACAGTCGTTAATGACTCCCATACCCATGATACGCGTTACTTAAAACTAGCTGGTGGGTACATGGCCGGTGAGATTACAGGGCCTTACAGCTGGGTACTAAATCGCACTTTCGTTATGATTGAGAACGAGACTCCTCAGTACCTATTGCTATGTCTCAACGCGGGAGGCAACAATGTGAACGGTGAGTTCATACTGAATAGGACGTCTGGTAATTACCAGTCTGCTAACCTTAATGTTGTAGTCTCTTCTGGTTCTTCTGTATCGCCGTACGGTACTATAGTGTCCGTGCAATCTACCCAAGATGATGAAGAGTACAGGCTAGTAACAGTGGACTATGCAGGCGATAGTTGGGTAGCTATTAAGTACGTAGGCAACTCGTATCCTGTAACAGACCCTGGTCTATTCTCAGGGCGTATACAGTCTTCTAAAGCTGGTTCACTTACTGCTGTAGGTGCCGCGAGCATAACCAATGAAGCACCCCTAAGAGACGCTACTAAGTTCGAGTTAAATGGGCAGGCTATATTCCATCAAGGATACCACCCTAATGCAGATAAGTGGACTACATCTAGAACAGTTACATTCACCGGTGATGCAACAGGCTCACTGAGTTTAGATGGCTCTTCAAACGAATCTGTTACTATGACAGTTGTAGATGACTCACATAATCACAGCTATGTTAACGGTACATTTGAGATTCGCCACGCTAATGAGCAACTTAAGTTAGTGGATACTACAGATGGTAATAAATGGTGGATGCTAGATCACCAGAATGGTGACCTTAACTTCCGCTATAACGGAGTGTCAGTAACCCCTGCCCTAGTAATACATGAAACAGGTAATTACGTTAGTGCCCCTAGCTTTAGTGCTACAACCTACTTAAACCTACCTATAGAGAATGTCCGTACTGGTAATCAGGCAGATATTCGATACAACCCAGTCAAAGGCTTCGAAGGACACGACGGAGTAGAGTGGGGAGCTATTGGTGGTGGTGGTGGTGTTGAGTGGGAAGCAACCACAGGAACATCTGTAGTTGCAGAAACTGGCGCAGGCTATTTAGTTACAGAAGCCGGAGTTACAGTTGTACTTCCACCAACCCCAGATCAAGGTAATACTGTAGGTGTAGGTGATTACAACGGTCTTAACTTCGAAGTAACTATTAACCCTAACGGTGGTAAGATCATGGGGCTTACTGAAGATTTTACCTTTGATACCAAGAACGCTAACATAGTATTCTCTTACGTAGATACAACGGTTGGTTGGATCCTTACACAAGGTTTTGGTGAATCTGAAGCGCCACAGGCTATTGCTAACAAGGTTATAGTAACAGATGCAGTCGGACAGTCCGTTATCTCTATCCCAAATAATGGATCTCAGACGGTAGATGTATGGTATAATGGTCTTAAACTCCTACGCAACGACGACTACATCGTAGATGAGGACTTAGATACTGTTACGCTAACAGACCCTATAGACTTAAGTGATGATATAGTTGAGGTATACGCTTGGAATCAGGCTCTAGTACTAGATACTACTGATTTACTGTACCACGGTACGCAGATGCGTAAAACAATCGAGGGTGACGGTATTTCTCTTACAGAAGCTATTGAAGCCCGTGCTCCGCAACCAAATCTATTGATTAATGGTGACTTTGTTATCAACCAGCGTCAGTTTGCTATAAGTAGTGATGTTCCAATTGATGGGGAGTTCTTTGTTGACCGTTGGTTCGCTCGTAACGCAATAGGCGGTACTAACCTTTGTTACTCTGATTTCCGTAATAACACAGGTATGTATACTCGTATGACTCACACAGGAGCTGCAGTTAGCGCATACATTGGTCAAAGAATTGAAGTTATGGACTGGCGTCCGTTCGTAAATACAACAGCGTCTGTGGAAGTTAGTCACTCGCAAGATTGTGTCATGAGTGGTGTTATTCATCTTCGTCGGGTTTCTGATGATACTGTCCTTTCTTCTGTATTTAGTAATGAAGTTATCGTTACACCAGGGTTAAAGACAGTAGTGTTTACTATGGAAGGTTTAGACATCTCTATGGTGGGGTCTACAGAATGTTACGCAGAGTTCCGAATCATCTATAACAACGGAGGTAGCATCGCTACACCGGATGGTCAGTATCGTTTCTATACTGCTAAGTTGGAATCTGGTTTATTAGCTACACCATTTGTTCCGGACTCTCCTCAAGAGAGCCTGGCTAAGTGTCAGCGCTACTTCTACACAACTAGGGGCAGAACAAAGTCTCAAATATTCGGAACAGCTACCGTATCCAGTACTAACGATGGCACATTCCAAGCAGGCGTACCGATTCCTGTACCTATGCGAATTAATAAACCAGCACTTACTCAGTTTGGTTCTTTCGCTATTTACGGGGTTTCTTCTACGTCAGGTACTAAGAATGAGACAGTAACCTTTACAGACGGAGGCTCTGGGGCAGGTGTAGGTTTCATTGACATCATAATACAGTCTAATACAGTGCCTACCTTGTTAAGAGGTGCGGTAACGCTTAGGGGACTTAACTCAAGTGCGTGGTTTAATGTAGACGCGGAACTGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4a6623eb85e25dfccb1b50ed3c5cbfe706e4e682d223e5e8cc2545754e5b5130
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5742
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Rapid evolution of virus immunity in the wild Piel,D., Bruto,M., Labreuche,Y., Blanquart,F., Chenivesse,S., Lepanse,S., James,A., Garcia Cruz,R., Dubert,J., Petton,B., Lieberman,E., Wegner,M.K., Hussain,F.A., Kauffman,K.K., Polz,M.F., Gandon,S., Bikard,D. and Le Roux,F. 2024-02-09 — GenBank