Protein

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Genbank accession
WPJ50490.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MAFKFKGSLSAVDASLKGGVIFDNEKLSDSKIMPKGKFTINEIDESTTDLAGNTLVTNFGKQENIAGMFSFNTGDWKDTDSAPVKLMMRVVNDVNDSDWVTIFDSSKTTVTWSSIATAGQTQFTVPNLDFKKAIIYVNGVLQYPGLSYQTFGGTVTFNSKLSTGDTIYVVVGEDTINTDNEEFTATATEDQTDIALPFTKKTNFVFINGILQYPDSYTVSGSTITLGDKLYLNDDILVLGNETDLVSFTALATQDQTDFTLPGEFDDGLVYINGVLQYDNAYSVSGTTLSFISSLDENDNVFVTLNDPKFIDSVNASYTSTITDESNNKLNIPYFNFSELQVFINGVLQNPDSGAYILNGTEVTLSSPLQLGDDIHVIVYNSPVQNSNLVTKADLTSYATEEELQELKNSLKNEGINLKWQPHLPSIEVAFGLPRRSLKIWTVGSTSTVNQYWLYPVDGTVWTGTGTLGTVPSVPFYKLDSNKDVITWTYTATSDNVTRIFVPYNFGSINIFINGVLQSINLNHYTLDGQYVNLNGALQTGDNLIAILGKLVLNTNPYLTMAESSNIFINKAELKSNTGANMVGSVNGTVQNDLINYYNYKADLLSNDENKGSSLIGLKYSGVVSDAFSEIYVDSLGKFNNAEDGCTEAIIERITLITGMADSKYVIGQNSFIRVIFGRGTYKIKDLPLYSGVFYEGQSGYATKLIPHASASWIFTTIGTKPFDLNGVRVWERLMYFGIENLIIGDYWADENDIPSGIGGIQLKFASYGYLRNVRFRRIKACAIYGDELFDTTFDNISIMYCGNNSENTPCMKFDNIGSDDATNACYFNRLHLEANYVGMTLNKCRHLNFNFPKFERDDTSHLLEGCQGVTFTTPEMTWNSTTSPQFDIYPVSGSDSWGVKFIAPVMISSSGSGWYFRHTGTAGPLELLSPSARGISKLFHGGYCDILGGDFYDCGKNLIYATSNVNVDNVVWRALKPVTVSDGTEDAIIITGSNCSVRNCYFSSQPGSITDSGAFINTLSSTDTTITGNTFGGYRQYGFKAALSQRIRDNKIDISNNHIGTLSTQSTTYNTLVNNNINGLGVGSINSGVYSNIAVNGTVSPNTVVGCSMYLVRVIVNGEASSGVILVDSSNNTLVSFGITNTSLLSFTSGTAGDGMVHITKTTTGNSITITNYTSYTATVVLMNINGHG
Physico‐chemical
properties
protein length:1190 AA
molecular weight: 129872,53280 Da
isoelectric point:4,63968
aromaticity:0,10840
hydropathy:-0,10899

Domains

Domains [InterPro]
DC_0116
ATT
43–185
DC_0116 DC_1041 DC_1709
DC_0116
ATT
175–253
DC_0116 DC_1041 IPR011050
WPJ50490.1
1 1190
Architecture
ATT
STR
STR
ATT 43-253 | STR 254-471 | STR 595-1188 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WPJ50490.1
1 1190
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 643 643 0,9783
Central domain 644 1082 440 0,9925
C-terminal 1083 1190 107 0,9846
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-643
Central
644-1082
C-terminal
1083-1190

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage RCIP0023
[NCBI] 		3094191 No lineage information
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPJ50490.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR532817.1 [NCBI]
CDS location
range 233497 -> 237069
strand -
CDS
ATGGCATTTAAATTTAAAGGATCACTATCAGCAGTTGATGCATCCCTTAAAGGTGGAGTGATATTTGATAATGAAAAGTTATCAGATTCTAAAATTATGCCTAAAGGAAAATTCACAATAAATGAAATTGATGAAAGCACTACAGATTTAGCAGGTAATACTTTAGTAACAAATTTTGGTAAACAAGAAAATATCGCTGGTATGTTTTCTTTTAATACTGGAGATTGGAAAGACACCGATTCGGCACCAGTGAAATTGATGATGAGAGTTGTTAATGATGTTAATGATTCAGATTGGGTTACAATCTTTGATTCATCCAAAACTACAGTAACATGGAGTTCTATTGCTACCGCCGGACAAACTCAATTTACCGTTCCTAATCTAGATTTCAAAAAAGCAATTATCTATGTTAACGGTGTACTACAATATCCAGGTTTATCTTACCAAACATTTGGTGGTACTGTAACTTTTAATTCCAAATTAAGTACAGGTGATACCATTTATGTTGTTGTTGGTGAAGACACAATCAACACTGATAATGAAGAATTCACTGCAACTGCAACTGAAGATCAAACTGATATCGCGTTACCATTTACTAAAAAAACTAATTTTGTTTTTATTAATGGTATTTTACAATATCCAGATTCATATACCGTATCCGGTAGTACTATCACTCTTGGTGATAAATTGTATTTAAATGATGATATTCTTGTTCTTGGTAATGAGACTGACTTGGTTTCATTTACCGCTCTCGCAACCCAAGATCAAACTGATTTTACTTTACCCGGTGAATTTGATGATGGTCTTGTTTATATCAATGGTGTTTTACAGTACGATAATGCATATAGTGTATCAGGTACAACTTTATCATTTATTTCATCTTTGGATGAAAATGATAATGTTTTTGTTACATTGAATGATCCAAAATTCATTGATAGTGTTAATGCCAGTTATACCAGTACTATAACCGATGAATCGAATAATAAACTAAATATACCTTATTTTAATTTTAGTGAATTGCAAGTTTTTATCAATGGTGTTTTACAAAATCCAGACAGCGGTGCTTATATATTAAACGGTACTGAAGTTACGTTAAGTTCTCCTTTACAATTAGGAGATGATATTCATGTTATTGTTTATAACTCTCCAGTACAGAACAGTAATTTAGTAACCAAGGCAGATTTGACCTCCTATGCAACCGAAGAAGAACTACAGGAATTAAAAAATTCATTAAAAAATGAAGGTATAAATTTAAAATGGCAACCACATTTACCGAGTATTGAAGTAGCATTTGGTTTACCACGAAGATCATTGAAAATATGGACAGTTGGTAGTACATCAACTGTGAACCAGTACTGGTTATATCCAGTGGACGGTACTGTCTGGACTGGTACAGGAACGCTTGGTACTGTACCCAGTGTACCATTTTATAAATTAGATTCAAACAAAGACGTAATTACTTGGACTTATACTGCAACCTCTGATAATGTAACCAGAATTTTCGTTCCGTATAATTTTGGTAGCATTAATATTTTTATTAATGGTGTTTTACAAAGTATTAATTTAAATCACTACACACTTGATGGACAGTACGTTAATTTAAATGGTGCATTACAAACTGGGGATAATTTAATTGCAATTCTTGGTAAATTAGTTTTAAATACAAATCCATATTTGACTATGGCTGAATCTTCTAATATTTTTATTAATAAAGCTGAACTAAAGTCAAATACTGGTGCAAATATGGTTGGTAGTGTTAATGGTACTGTACAAAATGACTTAATCAATTACTATAATTATAAAGCTGATTTGTTATCAAATGATGAAAATAAGGGTTCATCTTTAATTGGCTTAAAATATTCTGGTGTAGTTTCTGATGCATTTAGTGAAATTTATGTAGATTCATTGGGAAAATTCAATAATGCAGAGGATGGTTGTACTGAAGCTATAATTGAAAGAATAACACTAATAACTGGGATGGCTGATAGCAAATATGTAATAGGTCAAAATTCTTTTATAAGAGTGATATTTGGTAGAGGGACATATAAAATAAAAGATTTGCCATTATATTCTGGGGTTTTTTATGAAGGTCAATCTGGTTATGCTACCAAATTAATACCACATGCATCTGCAAGTTGGATATTCACTACAATTGGGACAAAACCATTTGATTTAAATGGTGTTAGGGTGTGGGAAAGATTAATGTACTTCGGTATTGAAAATCTGATCATTGGTGACTATTGGGCTGATGAAAATGATATACCGAGTGGTATTGGTGGAATACAACTTAAATTTGCATCATATGGATATTTGAGAAATGTTAGATTTCGTAGAATTAAAGCATGTGCAATTTATGGCGATGAATTATTTGATACAACATTTGATAATATTAGTATTATGTATTGTGGAAATAATTCAGAAAACACACCATGTATGAAATTTGATAATATTGGAAGTGATGATGCAACTAATGCTTGTTATTTCAATAGATTGCATTTAGAGGCAAATTATGTTGGTATGACTTTAAATAAATGCCGCCATCTTAATTTTAATTTTCCAAAATTTGAAAGGGATGATACATCACATTTATTGGAAGGGTGTCAAGGTGTAACATTCACCACACCAGAAATGACGTGGAATTCAACTACATCACCACAATTTGATATTTATCCGGTTTCAGGATCTGATAGTTGGGGTGTGAAGTTTATAGCTCCGGTGATGATCTCAAGCTCTGGTTCAGGATGGTATTTTAGACACACAGGAACTGCCGGACCATTAGAATTGCTTTCTCCATCAGCACGTGGAATAAGTAAGTTATTTCATGGTGGATATTGTGATATTTTAGGAGGTGATTTTTATGATTGTGGAAAAAATTTAATTTATGCAACATCCAATGTTAATGTTGATAATGTTGTGTGGAGAGCATTAAAACCTGTTACAGTCTCCGATGGTACTGAGGATGCAATAATAATAACTGGTTCTAATTGTTCTGTGAGAAATTGTTATTTTTCTTCGCAGCCAGGTAGTATAACAGATTCTGGTGCATTTATTAATACTTTATCATCAACTGATACCACAATTACTGGAAATACATTTGGTGGTTATCGTCAATATGGATTTAAAGCTGCATTATCTCAAAGAATACGAGATAATAAAATTGATATATCAAATAATCATATTGGAACTTTATCAACACAATCAACTACCTATAATACATTAGTTAATAATAATATCAATGGATTAGGTGTAGGTTCAATAAATTCAGGAGTTTATAGTAATATAGCAGTCAATGGAACTGTTTCACCAAACACGGTTGTGGGTTGTTCTATGTATTTGGTTAGGGTGATTGTAAATGGGGAAGCTTCCAGTGGTGTTATATTAGTTGATTCATCAAATAATACATTAGTTTCTTTTGGTATAACGAATACATCATTATTATCATTTACCTCTGGAACTGCTGGTGATGGTATGGTACATATCACAAAAACAACAACTGGTAATTCTATAACAATTACAAATTATACTTCTTACACAGCTACTGTTGTTCTGATGAATATAAACGGTCACGGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
d720b1ce1de738b336ad2d7e320d69373d50c3fdc7b450fa984a1d8f82fdaf64
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6171
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50