Protein

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Genbank accession
XJJ34723.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,68
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDLGNIIDLGFAKGGDINGNVTHVGNYTQTGTFNLIGSQNVASGGYIEFAYKATGVGSWAGQHTAKAPIFMDISASTATSEYNPLIKQRYKDGTFSLGTLVNEGSMKMHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGNLLVANGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWRYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEIADARSGKPHEISWWTGTGAQYFQWAFDTSGRITAGKSISVGLPDNGTNGRYPLESAISIGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLMANSISTATILNNGINSTKKLTVGYSRDSGSTWDFPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNSKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDLKTGSNSLNLRADGTIASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNAFNTTGDKYRETVFEVSDGQGYHFYSQRGAPTGDETIGPVLMQVSGSLNAKGTLTATGNLYVGGLSTHEGAVTMNNGLNLTGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEASLYIIPTPKDAGESGGISNLRPLTIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGTRSWYVGLGGSGNDLSLYSQSYGHGLVISDNFVSITKPFKVGNAQLGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDAGLYPKLAAVYPSGSLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASNTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQIQGGVPASIFYDGYNSAGPNGNAKITGSVSGATASSNMAKTSSDGAHTHSWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1046 AA
molecular weight: 110030,28410 Da
isoelectric point:8,12677
aromaticity:0,07935
hydropathy:-0,35249

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1044
DC_0538
G3DSA:6.20.80.10
STR
697–756
G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
ATT
700–773
IPR048388 SSF88874 SSF88874
IPR037053
ATT
794–847
IPR037053
IPR011083
ATT
799–846
IPR011083
XJJ34723.1
1 1046
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 1-699 | ATT 700-773 | STR 774-793 | ATT 794-847 | STR 848-1045 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_VIPECOMC06
[NCBI] 		3350135 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XJJ34723.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ416618 [NCBI]
CDS location
range 108874 -> 112014
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGCCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTTAGGAAATATCATTGATCTGGGTTTTGCTAAAGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCATGTAGGTAACTATACTCAGACAGGTACATTTAATTTAATAGGCTCACAAAATGTTGCATCTGGTGGATATATCGAATTTGCTTATAAGGCCACCGGAGTTGGTTCTTGGGCTGGTCAACACACGGCAAAAGCCCCTATTTTCATGGATATTTCCGCATCAACCGCTACTTCAGAATATAACCCGTTAATTAAGCAACGTTATAAAGATGGTACTTTCTCATTAGGGACCTTAGTTAATGAAGGCTCAATGAAGATGCATTATATTGATGAAACAGGCACTTCGAAATATTGGACCTTTAACCGTAATGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAATTTATTAGTAGCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCGCTATACTCCAACCGAAACGGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAATTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACACGAAATTTCTTGGTGGACAGGGACTGGTGCTCAATATTTCCAATGGGCGTTTGATACTTCCGGGCGTATTACCGCAGGTAAATCTATTTCAGTAGGTCTTCCTGATAATGGTACAAATGGGCGTTATCCTTTAGAGTCTGCCATTTCCATTGGTATTGCAATTGGCGATAACGATACTGGTATTAAATGGGTCCGTGATGGCGTTATTGACTTAATGGCTAACAGTATTTCAACCGCTACCATTTTGAATAATGGTATTAATAGTACTAAAAAATTGACGGTTGGTTATAGTCGAGATTCCGGTTCTACTTGGGATTTTCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACCGCACGCACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGCGATGGGCAGACTCATATTGGTTATAGCAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGCGGCACGGGTCGTATGTCTGTTAGCATGGGCGATGGACTTCTTGTTGAACCAGGAATTTTAGATCTTAAAACTGGTTCAAATTCATTAAATTTACGTGCTGATGGTACCATCGCTTCTGTTCAAACATTAAAACTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGATGGCACTAAGCAAATCATGTGGGAAGGTGGTACTCGAGCAGGTCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATGCATTTAACACCACTGGTGATAAATATCGTGAAACTGTATTTGAAGTTAGTGACGGACAAGGATACCATTTTTATTCTCAACGTGGTGCGCCTACAGGTGACGAAACTATAGGCCCTGTATTAATGCAAGTTTCAGGTTCTTTAAATGCAAAAGGAACATTGACCGCCACTGGCAACCTTTATGTGGGAGGATTGAGTACACATGAAGGTGCTGTGACCATGAATAATGGGCTTAATTTAACTGGTGGTTCTTCTATTACTGGTCAAGTTAAAATCGGCGGAACAGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGGGCAATTTTCCGTCGTTCAGAAGCATCATTATATATTATCCCGACTCCTAAAGATGCTGGAGAATCAGGCGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGACAATAGAACTGAACACTGGCACAGTTAAAATGTCGCACGATGTTCATTTAGGAGATTCTGGATCTGGTACAGGATTATTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGTAATGCAGCGCTTACTCTAGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTGCAGGGTTCTAAAGCTGGAACTAGATCTTGGTATGTTGGTCTTGGTGGTTCTGGAAATGATTTATCACTTTATAGCCAATCGTATGGACACGGTCTTGTTATAAGTGATAATTTCGTGTCAATCACTAAACCCTTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACTGATGGTAATATTACTGGTGGTTCTGGTAACTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTCTCAAGTTATCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGCTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCCGCTGTGTATCCTTCCGGTTCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAACACAGATTTGGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGCAACCATAACCATACAGTGAGTGGTAATACTAGTTCCGCCGGTGCTCACCAACACGCGCGTTCAGGCCCTCAGATACAAGGCGGCGTACCCGCTAGCATATTCTATGATGGATACAATAGTGCTGGTCCAAACGGTAACGCTAAAATCACTGGATCCGTGAGCGGTGCTACTGCATCGTCGAATATGGCCAAAACTTCTTCAGACGGTGCCCACACCCATAGTTGGTCTGGTACTACTAGCGCTACGGGTAACCATGCCCACACTGTTGGTATTGGTGCTCATACCCATACGGTAGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
40e96a87ae2e5c4c54f097f1c96b7e5e59be506a6ff0eb650d39378d6b7148f4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2888
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50