Genbank accession
AXH71334.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MANSFVRYTGNGSTTAYSISYTYRDAADLIVSVNGVATTAYSLNAAGTTLTFDSAPASSSAIEIRRKTSQTTRLTDYAAGSVLTENDLDTDSTQAFFMGQEAIDDANDVIKISSTDFQFNAINKQIRNVANPTSNQDVATKHYLENTFLTTANKTALTTINANIANIIAVNNNSTNINSAVSNATNINTVATNIGSVNTVAADIAKVIEVANDLQEAVSEVETVADDLNEATSEIDTVATSITNVDTVGNNIANVNAVAGNATNINAVNSNSSNINTVAGNNTNINTVAGANANITTLAGINANITTVAGINSNVSTVAGISSDVTAVAGISSDVQAVENIKANVTTVAGISSAVSNVSGISSAVSAVNSNSSNINAVNSNSANINTVASNNSNISTVAGVSSDVTTVAGIASDVSAVENIASNVTTVAGMSTAINTVNSNATNVNAVGGAIANVNNVGGSIANVNTVATNLASVNAFGETYRIASSAPTSSLNSGDLYFNTSTNVLNVYGASGWQNAGSSVNGTSERYKFVASGTPTTLTGNDANGNTLAYDAGFIDVYLNGIKMVNGTDVTVTSGSSIVFASALTNGDIVEAVTFGTFSVANMNASNLTSGTVPDARITGTYTGITGLDLTDNSKIRLGTDQMLELLEHTQELQD
Physico‐chemical
properties
protein length:657 AA
molecular weight: 66765,76750 Da
isoelectric point:4,08953
aromaticity:0,04414
hydropathy:0,04033

Domains

Domains [InterPro]
IPR005604
ATT
3–114
DC_0265
STR
28–145
DC_0265
STR
223–299
AXH71334.1
1 657
Architecture
ATT
STR
STR
ATT 3-114 | STR 115-299 | STR 326-654 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC120P
[NCBI]
2283021 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter sp. HTCC7211
[NCBI]
439493 Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales > Candidatus Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXH71334.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH598807.1 [NCBI]
CDS location
range 31827 -> 33800
strand +
CDS
ATGGCTAATTCATTTGTAAGATATACAGGTAATGGCTCTACAACTGCTTACTCTATATCTTATACTTATAGAGACGCAGCAGATTTAATTGTTAGTGTCAACGGTGTCGCTACTACAGCTTATTCATTAAATGCTGCGGGAACTACTTTAACATTTGACTCGGCCCCTGCTAGTTCTAGTGCCATAGAAATTCGTAGAAAAACTTCTCAAACAACAAGATTAACAGATTATGCTGCGGGTTCAGTTCTTACTGAAAACGATTTAGATACAGATAGTACTCAAGCATTCTTTATGGGCCAAGAAGCCATTGATGATGCTAATGACGTAATTAAAATTTCAAGTACAGACTTTCAATTTAATGCAATTAACAAACAAATAAGAAATGTTGCTAATCCAACTTCCAATCAAGATGTTGCTACAAAACATTATTTAGAAAACACTTTTTTAACAACCGCTAACAAAACAGCTTTAACAACAATTAACGCTAACATAGCTAATATCATAGCAGTAAACAATAACTCAACTAATATTAATTCAGCAGTATCTAACGCTACAAACATTAACACAGTAGCAACCAACATTGGTTCAGTAAATACTGTTGCCGCAGATATTGCAAAAGTTATAGAAGTTGCAAACGATTTACAAGAAGCAGTTTCAGAAGTAGAAACTGTAGCAGATGACCTTAATGAGGCTACATCTGAAATAGACACAGTAGCAACTTCAATTACAAATGTAGATACAGTTGGAAATAACATTGCTAACGTAAATGCCGTTGCAGGTAATGCAACTAACATCAATGCAGTAAATTCAAATTCTAGCAACATAAATACTGTTGCAGGTAACAACACTAATATTAATACAGTTGCAGGTGCAAATGCTAACATTACTACACTTGCAGGAATAAATGCTAACATTACAACAGTAGCAGGTATCAATTCTAATGTTTCAACAGTTGCAGGAATTTCAAGTGACGTAACTGCTGTAGCAGGTATTTCAAGTGATGTTCAAGCAGTAGAAAATATTAAAGCTAATGTTACAACAGTAGCAGGTATCTCTAGTGCAGTTTCAAATGTTTCTGGTATCTCAAGTGCAGTATCAGCAGTAAATTCTAATTCATCAAATATAAATGCAGTTAATTCTAACTCAGCAAACATCAACACAGTTGCAAGTAACAACTCAAATATTTCTACAGTAGCAGGTGTATCTTCAGACGTTACAACTGTTGCAGGGATTGCTAGTGATGTATCAGCAGTAGAAAATATTGCTTCAAATGTAACTACAGTTGCAGGTATGTCTACTGCAATTAATACAGTAAATTCTAACGCAACCAATGTTAACGCAGTAGGTGGAGCAATCGCTAATGTTAATAATGTTGGTGGTTCTATTGCTAATGTTAATACAGTTGCAACAAATTTAGCTTCAGTAAATGCTTTTGGAGAAACTTACAGAATAGCTTCTTCAGCTCCAACAAGTTCTTTAAATTCAGGAGATTTATATTTTAACACATCAACTAATGTACTTAATGTTTATGGTGCTAGTGGTTGGCAAAATGCAGGTTCATCAGTTAATGGAACTTCAGAAAGATACAAATTTGTAGCTTCAGGAACACCAACTACTTTAACTGGTAATGATGCTAATGGTAATACACTTGCGTATGACGCAGGATTTATAGACGTTTATCTAAATGGAATTAAGATGGTTAATGGCACAGATGTTACAGTTACATCTGGTAGTTCAATCGTATTTGCAAGTGCTTTAACTAATGGAGACATTGTTGAAGCTGTAACTTTTGGAACTTTCTCAGTTGCCAACATGAACGCATCAAATCTAACAAGTGGTACAGTACCAGATGCTAGAATTACTGGAACATACACAGGAATTACAGGATTAGATTTAACTGATAACAGTAAAATAAGATTAGGTACTGACCAGATGCTAGAATTACTGGAACATACACAGGAATTACAGGATTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9b8df86773f6b6a50b957428f4776ecdc6eed6d2d672b79d713e6d933fe1c061
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7581
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50