Protein

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Genbank accession
QPB08777.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,72
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADLKKILFKRSNIAGSKPPAADMSEGELAMNLADSALYTKYGNDVIQLSGKGIPVIDAVDGTFKNLSAGKLFLDAGSPTSPAIIVKDTTAVGDSNLNYWIRGKTATSDYAYIAAGANSVDSGYLELGTGDNANEAIQVVQRDNTGSIKNKTVLMTPSGDADFGKNVNVQGNSLWFGQDQVGLIGTDGNGVYFKYNKTVPGVRAPTIRISPTGELTYNGAPIYHDGRRPTKAEIGLGNVDDFRQLRQFTFRTSDPSTGPRYCLIASLKTAPTGVCGLDLMVTGGYDSGERSHTIDFLTLSGRDLSGLTSSNVLQYASYRRIGGKFTSAGNPVLEVFTRYGVVKRTDADGTIWMDVYAVIPRWGGTESQVAVLSETAQTGYVNVVTSGNDKGLTQPAGFMFIPHNQIFDKVLKAHIDNDTQGTLPVSRGGTGAVNAPDARNNLGLGTAAVRDVGENNGNVLTRGAFGLGGYEGAGNIAKGSLPETMKYLATRGSSFFRVEDNIDVIKQYSPSIYVRTGSNQFVLSADHRTSKLSFVVATTTDGTGLSTGEVYTTLNKPSPSDVNAVSKTGDTMTGDLIIQKNAPLFALNSTNPNSNAVLYYRGPNSSGAIAERATIYANPSNEVRIRVRDIDTQNNFYEYSFNNTGEVSANRFKAGNAVFGNDGNITGGSLFDGNLNTYISAIKTTADNAVRRSGDTMTGRLNVYNDGGNSVDPILHIRTNAMHTPLLLERKTSANISIGFRLNDGNTYLLGVDTNRDLRYGTIANQSDNALVLTSDNLDKPYNRPSNTVRNSPLFEAMYGGAAPKPPTGTTPAANDYGYGVKMYDVSNGNTDGHPFNLGMIVSAKVNANRNLQFFGSSDDNQNNKQLWYRSIRTTTNSSDRWDRIAFSTMRNDFSALQVFRNGLNSDGPIRVNSNIGIGVNASTSIDPTITFAAGSTIREGTGAGLGALVFSSGTATGSVNYISFRPQNAGSSAVAVTIEADATVQLNSTNVEAGFFANNVRFRSGGTSKNELWLEANSADMFLRPRRGSDTNGFVISNATGSILQNAAQGTETNALTRRDFVVSQVNTRLPLAGGTMTGNITMGGSTQVINATAPTADSHLTNKAYVDKAVKGAIDGAGDTYLPLAGGTVKGTLTVDTAGAIEKKGIRTYTQDGKTVNETDGIKMNGFGDQYGVIRYTERVGDTAFIGLQTHTSASDGWFEFHNNGKFVANNIHTSTSIYANGSISGGGVTSRDGNFTCQAPQPGLNTNYWFRDSAGRERGVIWSNGSNGDMVIRNQSGRELVFGNDGWLILSHLAPNPTDTYNVVRGMSLRRGDTVLDNFNEWRANQFVRAGWHFFNSGGVDQWLTISDAGLIFDGSAADLRVGRNGSFDNVEIRSDRRSKNNIVKIENALDKVCTLTGNTYDLNHKDGTSSKSAGLIAQEVQEVLPEAVTSDNDEDALLRLNYNAVIALLVESVKELKAEVEELKSKQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1471 AA
molecular weight: 157414,53740 Da
isoelectric point:6,19644
aromaticity:0,08090
hydropathy:-0,36465

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
2–1020
DC_1942 DC_0421
IPR030392
CHP
1378–1433
IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1378–1471
IPR030392
QPB08777.1
1 1471
Architecture
ATT
STR
ATT 2-1020 | STR 1029-1471
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QPB08777.1
1 1471
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 349 349 0,0669
Central domain 350 548 200 0,2567
C-terminal 549 1471 922 0,7625
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-349
Central
350-548
C-terminal
549-1471

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage Metamorpho
[NCBI] 		2767580 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella aerogenes
[NCBI] 		548 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPB08777.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT701588 [NCBI]
CDS location
range 11937 -> 16352
strand -
CDS
ATGGCTGATTTAAAGAAAATTTTATTTAAAAGAAGCAATATTGCTGGTTCTAAACCACCGGCAGCTGATATGTCAGAAGGTGAATTGGCCATGAACTTGGCCGATTCAGCTCTGTACACAAAATATGGAAATGATGTAATCCAATTATCAGGTAAAGGAATTCCTGTTATTGATGCAGTAGACGGAACATTTAAAAATTTATCAGCAGGTAAATTATTTCTTGACGCAGGATCTCCTACTAGCCCAGCAATTATAGTCAAAGACACTACTGCAGTTGGAGATTCCAATTTAAACTACTGGATTCGTGGTAAAACTGCAACTAGCGATTACGCTTACATTGCCGCCGGCGCCAATTCCGTAGACTCTGGATATTTAGAATTAGGTACAGGCGATAACGCTAACGAAGCTATTCAAGTAGTCCAACGTGATAATACAGGTTCAATTAAAAACAAAACTGTATTAATGACTCCTTCTGGCGATGCCGACTTTGGCAAAAACGTTAATGTCCAGGGAAATAGCCTGTGGTTTGGTCAGGACCAAGTAGGTTTAATCGGAACTGATGGAAATGGTGTTTATTTCAAATATAACAAGACAGTTCCAGGTGTCCGTGCTCCTACTATTCGTATTTCTCCTACTGGAGAATTAACTTATAATGGTGCTCCAATTTATCATGACGGCCGCCGTCCAACTAAAGCTGAAATTGGCTTAGGTAATGTTGATGATTTTCGTCAATTAAGACAGTTTACTTTTAGAACATCTGATCCATCTACTGGCCCACGCTATTGTCTGATTGCGTCACTTAAAACTGCTCCTACTGGTGTTTGCGGCTTAGATTTGATGGTAACCGGAGGTTATGATTCTGGTGAAAGATCTCACACAATTGATTTTCTGACATTATCTGGTCGCGATTTAAGTGGATTAACTTCATCAAACGTTTTACAATACGCTTCTTATCGTCGTATCGGCGGAAAATTCACATCAGCGGGAAACCCAGTACTAGAAGTTTTTACTCGGTATGGTGTAGTTAAGCGTACTGATGCTGATGGCACTATTTGGATGGATGTGTATGCAGTTATTCCTAGATGGGGTGGAACTGAATCGCAAGTAGCAGTATTAAGCGAAACTGCTCAAACCGGATATGTTAATGTAGTGACATCTGGTAACGATAAAGGACTTACTCAACCTGCTGGATTTATGTTTATTCCCCATAACCAGATTTTTGATAAAGTTCTTAAAGCTCATATTGATAATGATACTCAAGGAACACTTCCAGTCTCACGTGGTGGTACTGGTGCAGTTAATGCTCCTGACGCGAGAAATAACCTTGGACTTGGAACAGCTGCTGTTCGTGATGTCGGCGAAAATAACGGTAACGTTCTTACCCGTGGCGCTTTTGGTTTAGGCGGATATGAAGGTGCTGGTAATATTGCTAAAGGTAGTTTACCTGAAACAATGAAGTATCTTGCTACTAGAGGAAGTTCTTTCTTTAGAGTTGAAGATAATATCGATGTTATCAAACAATACTCTCCTAGCATTTATGTTCGTACCGGTTCTAACCAATTTGTGCTTTCAGCTGATCATCGTACTTCAAAACTTTCATTTGTTGTAGCTACTACTACTGATGGAACTGGATTGAGCACTGGTGAAGTCTATACTACGCTGAATAAACCATCGCCATCTGATGTAAACGCAGTTTCTAAAACTGGCGATACCATGACCGGTGATTTAATCATTCAGAAAAACGCTCCATTATTTGCTCTTAATAGCACGAACCCTAATAGTAATGCTGTTCTTTATTACAGAGGACCAAACTCTTCTGGAGCAATAGCTGAACGCGCTACAATATATGCTAATCCATCTAACGAAGTTCGCATTCGTGTTAGAGATATTGATACCCAAAATAATTTTTATGAATATTCATTTAATAATACAGGTGAAGTGTCTGCCAACAGATTTAAAGCTGGAAACGCTGTATTTGGTAATGATGGCAACATCACCGGCGGATCGTTGTTTGATGGTAATCTAAACACGTATATCAGCGCAATTAAAACAACTGCTGATAATGCTGTACGACGTTCTGGCGATACCATGACTGGTCGTCTTAATGTTTATAATGATGGCGGTAACTCGGTTGATCCTATTCTTCATATTAGAACTAATGCAATGCACACTCCTCTTCTGTTAGAAAGAAAGACTAGTGCTAACATTTCTATTGGGTTTAGATTGAATGATGGAAACACTTATCTATTAGGTGTTGATACAAACCGCGATTTAAGATATGGAACTATTGCGAATCAGTCTGATAATGCTTTGGTATTAACTAGCGATAATTTAGATAAGCCATATAACCGTCCATCAAATACAGTAAGAAATTCGCCATTGTTTGAAGCTATGTACGGCGGTGCTGCTCCTAAGCCGCCAACTGGAACTACACCAGCAGCGAATGATTATGGCTATGGCGTTAAGATGTATGACGTATCAAACGGAAACACTGATGGTCATCCTTTTAATTTAGGAATGATAGTAAGTGCTAAAGTTAACGCTAACCGTAACCTGCAATTCTTTGGTTCATCTGACGATAACCAAAATAATAAGCAGCTGTGGTATCGTTCAATTCGTACTACTACAAATTCATCTGACCGTTGGGATAGAATAGCTTTCTCTACAATGAGAAACGATTTTTCTGCCTTACAGGTGTTTAGAAATGGATTGAATTCAGATGGACCGATTAGAGTAAACAGCAATATTGGTATTGGTGTAAACGCTTCTACTAGTATTGATCCTACTATTACCTTTGCCGCTGGCTCGACAATCAGAGAAGGTACTGGTGCTGGATTAGGCGCTCTTGTTTTTTCTTCTGGCACAGCAACTGGATCAGTTAATTATATTTCATTCCGTCCGCAGAATGCAGGTTCTTCTGCCGTGGCTGTAACTATTGAAGCAGATGCTACTGTTCAGTTGAATTCTACTAACGTTGAAGCAGGATTTTTTGCTAATAACGTAAGATTCCGTTCTGGTGGAACTAGTAAAAACGAACTGTGGCTTGAAGCTAACAGTGCTGATATGTTCTTAAGACCTCGTAGAGGATCAGATACTAACGGTTTTGTTATTTCCAATGCAACAGGCTCTATTCTGCAAAATGCTGCACAAGGAACTGAAACAAACGCACTGACTCGCCGTGATTTCGTGGTTTCTCAAGTCAATACTCGCTTGCCTCTGGCAGGTGGTACGATGACCGGAAACATTACGATGGGCGGTTCTACTCAAGTTATTAATGCTACTGCTCCTACTGCAGATAGTCATTTAACTAATAAAGCGTATGTTGATAAAGCAGTTAAAGGCGCTATTGATGGAGCTGGAGATACTTATCTTCCATTGGCTGGCGGTACGGTTAAAGGTACTCTTACTGTTGACACTGCCGGTGCAATAGAGAAAAAAGGAATTAGAACTTACACCCAAGATGGAAAAACCGTCAATGAAACCGACGGAATAAAAATGAATGGATTTGGTGATCAATATGGTGTTATTCGTTATACTGAGCGTGTTGGTGATACTGCATTTATTGGTTTACAGACCCATACATCTGCTTCCGACGGATGGTTTGAATTCCATAACAACGGTAAGTTTGTTGCCAATAATATTCATACAAGCACTAGTATCTATGCAAACGGTAGCATTTCTGGCGGTGGTGTAACTTCACGCGACGGAAACTTTACTTGCCAAGCACCTCAACCTGGTCTTAACACAAACTATTGGTTTAGAGACTCAGCAGGTAGAGAGCGCGGCGTAATTTGGTCTAACGGTAGTAATGGCGATATGGTTATTCGTAACCAAAGCGGAAGAGAACTCGTTTTTGGTAATGATGGCTGGCTTATTTTAAGTCACTTAGCACCTAATCCAACCGATACATACAACGTAGTCCGTGGTATGTCTTTACGTCGTGGTGATACTGTTCTTGATAACTTCAATGAATGGAGAGCTAACCAATTTGTTCGTGCTGGATGGCATTTCTTTAACAGCGGCGGTGTTGATCAGTGGTTAACTATTAGTGATGCTGGATTAATATTTGACGGTTCTGCTGCAGATCTGAGAGTTGGTCGTAATGGTTCGTTTGATAACGTTGAAATTCGTTCTGACCGTAGATCTAAAAACAATATCGTTAAAATTGAAAATGCTTTAGATAAAGTATGCACATTAACTGGTAATACTTATGATCTTAATCATAAAGATGGAACTTCATCAAAATCAGCAGGATTAATTGCGCAGGAAGTTCAGGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTAACTTCTGATAATGATGAAGATGCATTACTGCGTCTAAATTATAACGCTGTTATAGCTTTATTGGTAGAATCAGTTAAAGAACTTAAAGCAGAAGTTGAAGAACTTAAATCTAAACAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
741d12d3384674a7a9859a15cb7a021b6b11a9211ee5644c8fdb07f707928cdc
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5004
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Klebsiella aerogenes myophage Metamorpho Groover,K.E., Garza,K., Clark,J., Hernandez,I., Gill,J. and Liu,M. — — GenBank