Protein
View in Explore- Genbank accession
- AAK83248.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein and host specificity
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MQIWIHDKSMRKVCALNNEIPGMLPYTNSQWHQYLEYSTSTLDFTIPKFVNGKLHDDIKYINDQMYVSFYYDNSYHVFYVSQLVENDFSFQVTCNNTNLELAAEIERPLASVDGAKTLEWYLQTLDLLGFAGLEVGFNEIPDRTRTITFESQNGTKLEQLHSLMNQFDAEFVFRTDLNRDGTLKKFVIDIYQRPDENHHGIGKVRGDVTLYYQTGLKGVQVTSDKTQLFNAGYFVGKDGLTLGSVVFEEKNELGQVEFYSFKDSPMVYAPLSADKYPSHMNTTNEDRWTRRDFQTEYSDVDSLKAYALRTIKQYAYPLMTYTVSVQSSFIENYKDINLGDTVKIIDNNFRGGLALEARVSEMIISFDNPTNNSVVFTNFRKLDNKPSSELQQRIDEIVSKSLPYHVEIRTTNGTVFKNGIGRSTVKPVLKQGDKIVDATYRFVIDGTIKYSGMTYDMVASEINQPTTLTISAWVDNKEVASEEVTFVNVSDGKQGPKGADGKTPYVHFAYADSADGQKGFSLTQTGSKRYLGVYTDFNQAGSTNPADYTWSDTAGSVSVGGDNLITNSSFPKNLDGWGYYEEGEPNSNLHISTHEFYYNGARKLFRLNNNGKEEVPAASRRFKVKRNTDYSFNILIFATWNIHSVDIYFLGRKANETKTFTKVVNLKTHTGSPSVTQAVKWHLTFNSGECDEGFIRIDNNGTTDGKTSMLFFAELDCYEGTTDRSWQASPEDLKDEIDTKADNALTQAQLNKLSEINSVMKAELEAKASLATVNQWIKAYQDFVNANSADRAQAQKALADASARVVKLENNLNDMSERWNFIDNYMAASNDGLVIGKKDNSSSIMFNPNGRISMFSAGNEVMYISQGVIHIENGIFSKTIQIGRFREEQDFINPDRNVIRYAGGI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 905 AA molecular weight: 102247,76130 Da isoelectric point: 5,29804 aromaticity: 0,11492 hydropathy: -0,49558
Domains
Domains [InterPro]
DC_0002
STR
1–905
STR
1–905
IPR010572
ENZ
141–381
ENZ
141–381
1
905
Architecture
STR 1-905
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Streptococcus phage DT1.3 [NCBI] |
152558 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAK83248.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
AF348742.1
[NCBI]
CDS location
range 172 -> 2889
strand +
strand +
CDS
ATGCAAATCTGGATTCATGATAAAAGTATGCGTAAAGTGTGTGCTTTGAATAATGAAATTCCCGGAATGTTGCCATATACGAACAGTCAATGGCATCAATATCTTGAATACTCAACAAGCACGCTTGACTTCACAATTCCTAAGTTTGTAAATGGAAAACTTCACGATGATATTAAATACATCAATGATCAAATGTATGTGTCGTTTTATTATGATAATTCCTACCACGTTTTCTATGTATCGCAACTCGTTGAAAATGATTTTAGTTTTCAAGTGACTTGTAACAATACCAACTTGGAACTAGCAGCAGAAATAGAGCGGCCGTTAGCTAGTGTTGACGGTGCTAAAACACTTGAGTGGTATCTTCAAACCCTTGATTTACTTGGTTTTGCTGGCCTTGAAGTTGGTTTCAATGAGATTCCTGATAGGACAAGAACTATCACGTTTGAATCACAAAATGGTACAAAACTAGAACAGCTTCATAGCTTGATGAATCAATTCGATGCAGAGTTTGTTTTTCGTACAGATTTAAACCGAGATGGTACTTTAAAAAAATTTGTCATTGACATTTACCAACGACCAGATGAAAACCATCACGGCATTGGAAAGGTTCGAGGGGATGTAACTCTTTACTATCAAACAGGTTTGAAAGGCGTTCAAGTTACTAGTGATAAAACGCAACTATTTAACGCTGGATATTTTGTTGGAAAAGACGGACTAACGCTAGGAAGCGTTGTGTTTGAGGAAAAGAATGAGCTAGGACAAGTAGAGTTCTACTCATTTAAAGACAGTCCGATGGTTTACGCACCTTTATCAGCAGATAAATATCCATCACACATGAATACTACCAATGAAGATAGATGGACACGTAGGGACTTTCAAACAGAATACAGTGATGTTGATTCCCTCAAAGCTTATGCCTTACGTACTATCAAGCAGTATGCTTATCCACTAATGACTTATACTGTCAGCGTTCAATCTAGTTTCATTGAAAACTACAAGGATATTAATCTAGGTGACACTGTTAAAATCATCGATAATAATTTTAGAGGTGGTTTAGCCCTCGAAGCGCGTGTATCTGAAATGATTATCAGCTTTGACAATCCCACAAACAACTCGGTTGTTTTTACTAATTTCAGAAAATTGGATAATAAACCGTCTAGCGAATTACAACAACGTATCGATGAGATTGTTTCTAAGTCATTGCCATATCATGTTGAGATAAGGACCACGAATGGTACAGTATTTAAGAATGGTATTGGTCGTTCTACTGTTAAACCAGTTTTGAAACAAGGCGATAAAATTGTTGATGCAACTTATCGATTTGTGATTGACGGTACTATTAAATATTCAGGTATGACCTATGATATGGTAGCATCAGAGATTAACCAACCAACCACGCTTACTATCTCAGCTTGGGTAGATAATAAAGAAGTAGCTTCAGAAGAAGTTACTTTTGTAAATGTATCAGATGGTAAACAAGGACCTAAAGGTGCTGACGGGAAAACACCTTATGTTCACTTTGCTTATGCCGATAGTGCCGATGGTCAAAAGGGTTTCAGTTTGACACAGACTGGAAGTAAACGCTATTTAGGTGTGTACACCGATTTCAATCAGGCGGGCAGCACTAACCCAGCTGATTATACTTGGAGTGACACGGCTGGCAGTGTTTCGGTTGGTGGTGATAATTTAATCACTAACTCATCTTTCCCAAAAAATCTTGACGGATGGGGTTATTATGAAGAAGGAGAGCCTAATAGCAATCTTCATATAAGTACACATGAATTTTATTACAACGGTGCAAGAAAACTATTTAGACTAAATAATAACGGCAAGGAGGAAGTTCCTGCTGCATCAAGACGTTTTAAAGTTAAACGCAATACAGATTATTCGTTTAATATTCTGATATTTGCAACCTGGAACATCCATAGTGTTGATATCTATTTTTTGGGTCGGAAGGCGAATGAAACTAAGACATTTACTAAAGTGGTCAACTTAAAGACACATACAGGTTCACCATCGGTTACACAAGCTGTTAAATGGCATCTAACATTTAACTCTGGAGAGTGTGATGAAGGGTTCATTCGTATTGATAACAATGGCACTACTGACGGTAAAACTTCTATGCTATTTTTCGCAGAACTAGACTGCTATGAGGGTACTACTGATAGATCGTGGCAAGCGTCACCGGAAGACTTAAAGGACGAGATAGACACTAAAGCTGACAATGCATTAACGCAGGCTCAGCTTAATAAATTAAGTGAAATTAATTCGGTGATGAAAGCAGAGCTCGAAGCAAAAGCATCCCTTGCCACTGTTAATCAATGGATTAAGGCTTATCAAGATTTTGTTAATGCAAACAGCGCAGATCGTGCGCAGGCTCAAAAGGCTTTGGCAGATGCCAGTGCACGAGTAGTGAAACTAGAAAATAACTTAAACGATATGTCAGAGCGTTGGAATTTTATCGATAACTACATGGCAGCATCAAATGATGGTTTGGTTATCGGGAAGAAAGATAACTCCAGCTCTATTATGTTCAATCCAAATGGGCGTATATCAATGTTTTCAGCTGGTAATGAGGTAATGTATATCTCTCAGGGTGTGATTCACATTGAGAACGGTATTTTTTCTAAGACTATTCAAATTGGACGATTCCGAGAAGAACAAGATTTTATTAATCCGGATCGCAACGTCATCCGCTATGCAGGAGGTATTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
ef8fdde18a72645218c2c7cef0007da8c7451689d728280439a4c728d95cc005
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50