Protein

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Genbank accession
QLA10603.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,59
Protein sequence
MTNKFRATLGLDSAGEKVVNVGLADRTVMTDGVNVEYLIQENTLQQYDPTRRYLKDFAVIYDNRIWVSNRDIPKPAGAFSEPYWISVRVDPKWKLHQSGEFSLQPGDYISVDTDFGADMNFILPLNPQDGTTIVLKDIGGRPGYNKFQISSNPAPNSQSLLYDGLRIRTMQVTAAYSEVVLVFSNRLWNVYIGQNESVGTFVTPAAKFLAQANDRIVRRYTSPSIIEVGLPRNANHGDIIYFTDLEAKSPQYHLKVTTFDANSSLGSVGTREMEFRTAGDGFLIYDSAESLWRIWEGDLRTRLRIIRDSVNLVANEHVMVFGANNATPKTIDINLPEGPAVGDYITISLNYMRKGQIVNITATGNDTIASSLQLLQFPKRSEYPPETNWIQSKTITFNGTSAYVPVLKLSYIEDGGLEYWVVAENNPTVERVDSLNDETRKRLGVIALASQAQANANHEQNPEKELAITPETLANRTATETRRGIARLATTAEVVQDSTFAFLDDVILTPKKLNQRVATETSSGLAEIATQSETNAGTDDSTIITPKKLEARRATETMAGIAPLVVSGGTPGATRDVIGTGIYQRNEHTRQVTPKTLFENKATQTAQGGVWLATSAEVIAAPADDPAMPLAVTPQQLHTKTATETRIGFSEIATQAETNAGADDFRFVTPKKLHERKSSETLEGIARIATQSEFDAGIADNLISTPLKIKTLFNSTARTTVDSASGLRESGTLWSTYSLNIVAPTETLRGTARLATQLEADAGIDDTIVITPKKLHNKKATETAEGIVQIATQAEVVAGLVGNKVVPPKHLKYLVQTEPTWQSTPTLRGFVKMTEGALTWVGNNVDGSTKALDLYEKNGYAISPYELNKTLANYLPLMATAENSRNLGGQGPDKYIRRDIDQTVLGSLTLNSQTNTSAPIVSTNTIESKQGIVKDWLRIDGNGTTGQINFNTGTNTWSIESKNAENNIKFKYGSTGIEALRIDNTGNMALAQTFTSGNRVEANKGFSVEGGTIVINPTVSAIVLGTQSKAMALYTPDANTYNVIDPSGTYQLISTKNLVNVGSNNFVNRAGSVMSGSLGINNTLSVVLSENIAYPSLASLPSTANQSSWTAEITSAAKYNTLPGYAVPIMGQSTNDQGEVIDTGIVVDYKYFPGPGTLTQHGNGITGVYQIWAPRPAANQANHNAQTFWIRNFNKVLNKWDGFARMFTSDLPPTASDLGAVSQTGGRLNNLTIRDWFQIGNVRMRPNPDTRTLEFDWIN
Physico‐chemical
properties
protein length:1259 AA
molecular weight: 137324,34190 Da
isoelectric point:5,67864
aromaticity:0,07625
hydropathy:-0,31954

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–121
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1101–1207
IPR048391
QLA10603.1
1 1259
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-121 | STR 343-1100 | ATT 1101-1207 | STR 1208-1245 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shewanella phage Thanatos-2
[NCBI] 		2734809 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QLA10603.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT457553.1 [NCBI]
CDS location
range 33392 -> 37171
strand -
CDS
ATGACTAATAAATTCAGAGCTACGCTGGGCCTTGACTCGGCTGGAGAAAAGGTAGTAAACGTAGGTCTAGCTGACCGTACAGTAATGACTGACGGTGTTAACGTTGAATATCTTATCCAAGAAAATACTTTACAGCAATACGACCCAACACGCAGATATTTAAAAGATTTTGCGGTAATTTATGATAACCGTATTTGGGTATCTAACAGGGATATCCCTAAACCAGCAGGGGCATTTTCTGAGCCATACTGGATTTCTGTACGTGTAGACCCTAAATGGAAATTACATCAAAGTGGAGAATTTTCATTACAGCCAGGTGACTATATTTCGGTAGACACAGATTTTGGTGCTGATATGAATTTCATTCTACCTTTAAATCCACAAGACGGCACTACAATTGTTCTTAAGGATATTGGTGGAAGACCAGGCTATAATAAGTTCCAGATTTCTAGTAATCCTGCACCAAACAGTCAATCTTTATTATACGATGGTCTGCGTATACGTACCATGCAAGTTACAGCAGCGTATTCTGAGGTTGTTCTTGTTTTTTCTAATAGATTGTGGAACGTTTACATCGGTCAAAATGAATCAGTAGGGACTTTTGTAACCCCTGCTGCTAAATTCTTAGCTCAAGCAAATGATAGGATTGTCCGTAGATATACTTCGCCATCTATCATTGAAGTAGGGTTACCACGAAATGCAAATCACGGTGATATTATCTACTTTACTGATTTAGAAGCAAAGAGCCCTCAATATCATTTAAAAGTTACTACATTCGATGCCAATTCTTCATTAGGCTCTGTAGGAACACGTGAAATGGAATTCCGTACGGCAGGTGACGGATTTTTGATTTATGATTCTGCGGAAAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGATTTAAGAACCCGTCTGCGCATTATCCGTGATTCTGTCAATTTGGTAGCCAACGAGCATGTAATGGTTTTCGGTGCTAATAATGCTACACCAAAAACAATCGACATTAATTTACCTGAAGGTCCTGCTGTAGGTGACTATATAACAATTTCACTTAATTATATGCGTAAGGGCCAAATTGTTAATATTACTGCTACAGGGAATGATACTATTGCGTCATCATTGCAACTATTGCAATTTCCTAAGCGCTCTGAATATCCACCAGAAACAAATTGGATACAAAGTAAAACTATTACATTTAACGGTACTAGTGCTTATGTTCCAGTATTAAAATTATCTTATATCGAAGACGGTGGATTAGAATATTGGGTGGTAGCAGAAAATAATCCTACTGTTGAACGCGTGGATTCGTTGAATGATGAGACTCGTAAAAGACTAGGTGTTATTGCATTGGCATCTCAAGCACAAGCAAATGCTAATCATGAACAAAACCCAGAAAAAGAGTTAGCTATTACTCCTGAGACTTTAGCTAATAGAACAGCAACAGAAACACGTCGTGGTATTGCTAGATTAGCTACTACAGCAGAAGTTGTACAAGATTCTACATTTGCTTTCTTGGATGATGTTATTCTTACACCTAAGAAACTTAATCAACGAGTAGCTACTGAAACTTCCAGTGGTTTAGCTGAAATTGCAACCCAATCTGAAACTAACGCCGGAACCGACGATTCTACTATTATTACACCAAAGAAACTTGAAGCAAGACGTGCAACTGAAACTATGGCAGGTATAGCACCACTTGTCGTTTCAGGAGGAACACCTGGCGCCACTCGGGATGTTATCGGTACTGGTATCTATCAACGTAATGAACATACCCGTCAGGTCACTCCTAAAACTCTATTTGAGAACAAAGCTACACAAACTGCTCAAGGTGGTGTATGGTTAGCTACATCCGCAGAGGTGATTGCAGCCCCGGCCGATGATCCTGCTATGCCTTTAGCTGTTACACCACAACAATTGCACACTAAAACTGCCACTGAAACACGTATAGGATTTAGTGAAATTGCCACCCAAGCAGAAACCAATGCAGGTGCGGATGATTTTAGATTTGTAACACCTAAAAAGCTACATGAACGTAAATCTTCAGAGACTTTAGAAGGTATTGCTAGAATAGCCACTCAGTCTGAATTTGATGCTGGTATAGCAGATAATTTGATTTCTACTCCATTGAAAATCAAAACATTATTTAATTCTACTGCTCGTACTACAGTAGATTCTGCTTCAGGATTAAGAGAATCAGGTACATTATGGTCTACCTATTCTTTGAATATTGTAGCACCCACTGAGACTTTACGTGGTACAGCTCGTTTAGCTACTCAATTGGAGGCCGATGCAGGTATTGATGATACGATTGTTATTACTCCTAAAAAGCTCCATAATAAAAAAGCAACAGAAACAGCAGAAGGCATTGTCCAAATTGCTACTCAAGCTGAAGTTGTTGCCGGTTTGGTAGGAAATAAAGTAGTTCCTCCAAAGCATTTGAAATACTTAGTCCAGACAGAACCAACGTGGCAGAGTACACCTACTCTACGTGGATTTGTCAAAATGACAGAAGGTGCTTTGACTTGGGTCGGCAATAATGTAGACGGTTCTACTAAGGCTTTGGATTTATATGAGAAAAATGGCTATGCTATTTCACCTTATGAATTAAATAAAACATTAGCTAATTATTTACCGTTAATGGCTACTGCAGAGAACAGTCGCAATTTAGGTGGCCAAGGCCCAGACAAATACATTAGACGTGATATTGACCAAACAGTATTAGGTTCATTGACTTTAAACAGCCAGACCAATACAAGTGCCCCTATTGTTTCTACCAATACTATAGAATCTAAGCAAGGAATTGTCAAAGATTGGCTAAGAATTGACGGTAATGGAACTACAGGCCAAATCAATTTTAATACTGGAACTAATACCTGGTCTATAGAGTCAAAAAATGCTGAAAACAATATTAAATTCAAATATGGTTCTACAGGCATAGAAGCTCTTAGGATAGATAACACAGGCAATATGGCTCTTGCTCAAACATTTACCTCAGGTAATAGAGTAGAAGCTAATAAAGGATTTAGTGTTGAAGGTGGTACAATTGTTATTAATCCTACAGTGTCTGCTATTGTATTAGGAACTCAATCTAAAGCTATGGCTTTATATACTCCTGATGCAAATACTTATAATGTTATTGACCCTAGTGGAACATATCAACTAATTTCTACTAAGAACTTAGTTAACGTGGGAAGTAATAATTTTGTTAATAGAGCCGGCTCCGTTATGTCAGGGTCTTTAGGAATCAATAACACTCTGAGTGTAGTTCTTTCAGAGAATATTGCTTATCCTTCATTAGCCTCTTTGCCTAGCACGGCAAATCAAAGCTCATGGACAGCAGAAATTACTTCAGCAGCAAAATACAATACTTTGCCTGGTTATGCTGTTCCTATAATGGGTCAGTCTACCAATGACCAAGGTGAAGTTATTGATACAGGTATAGTGGTAGATTACAAGTATTTCCCTGGTCCTGGAACTCTTACTCAACACGGTAATGGTATTACAGGGGTTTATCAGATTTGGGCTCCTCGTCCTGCTGCTAATCAGGCAAACCATAATGCTCAAACATTCTGGATTCGTAACTTTAACAAAGTTCTGAATAAGTGGGATGGTTTTGCTCGTATGTTTACCAGTGATTTACCGCCTACTGCTAGTGATTTAGGTGCAGTGTCCCAAACAGGTGGTCGTTTAAATAACTTGACTATTCGTGACTGGTTCCAAATAGGTAATGTTAGAATGAGACCAAACCCAGATACTCGTACTTTAGAGTTTGACTGGATTAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7a1993b61bdd9f5c068e58c58cbb435d35b8bfde95beaf831dcffb6e74e7642d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5525
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterization of phage Thanatos infecting and lysing Shewanella oneidensis and promoting nascent biofilm formation Kreienbaum,M., Doerrich,A.K., Brandt,D., Leonhard,T., Hager,F., Brenzinger,S., Hahn,J., Ruwe,M., Briegel,A., Kalinowski,J. and Thormann,K.M. 2020-09-18 — GenBank