Protein

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Genbank accession
QHR71006.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKAFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVNNTFRATQNILSDNETIIVKNVTQGMPLYIRGQDADGSNRWYLGNDNKGTDNLVLKNVKSGAYVAILDSLITVNKSIQITGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLVGNNTFRGINNFVGEFNITRDNAVLVIKNASDATGLYLLGQKADGTNKFYLGTDNSDSVVNLHNYTTSTTISLSNVITTTKTVKITGQVQPSDWANIDSRYIPAATLSTIARTNGSNTFTAKQVINTNGEALVLQGKSTSALYIRGKDYDGTNRWYVGNDDGSDTVSLYNYKTGKSLSIGSEVSINANLVISGQVQPSNFTNFDARYYGKAEADSKYFWSAFRASKTEAAGGVAWDQPSGIYLETKSSGQNRLVLHMASNAKALTPSAQLRFESKNGGMWYRSARDTLGFEVEWSKVYTEAQKPTPSEIGAYTKAETDQKIAEAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVDPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHAHSVSGSTSSAGNHNHSISWIGQNSTHYSGGGGGSIGVGPGYTNANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:779 AA
molecular weight: 83563,28370 Da
isoelectric point:8,49199
aromaticity:0,08601
hydropathy:-0,39397

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–271
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246 IPR051934
G3DSA:6.20.80.10
STR
160–219
G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 IPR048388 IPR005003 IPR005003 DC_2042
IPR048388
ATT
160–248
IPR048388 DC_0026 IPR005003 IPR005003
QHR71006.1
1 779
Architecture
ATT
ATT
STR
ATT
STR
RBD
ATT 1-271 | ATT 274-356 | STR 357-381 | ATT 382-467 | STR 468-715 | RBD 716-779
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage nataliec
[NCBI] 		2696429 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus nataliec
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR71006.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850611.1 [NCBI]
CDS location
range 52266 -> 54605
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTCCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTCCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGAATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCTACAGGTTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGGCTTTTAAAATCAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGACTGGCTGTAAATAACACCTTTAGAGCCACTCAAAATATTCTATCTGATAATGAAACTATTATTGTTAAGAATGTTACACAAGGGATGCCGCTGTATATTCGCGGTCAAGATGCAGATGGCTCTAACAGGTGGTATCTAGGCAATGATAACAAAGGTACAGACAATCTTGTTTTAAAAAATGTTAAATCTGGTGCATATGTAGCTATTTTGGATAGCTTAATCACTGTGAACAAATCTATCCAGATTACTGGTCAAGTTCAGCCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCGCAGCTAGTTGGTAATAACACCTTCAGAGGTATTAATAATTTTGTAGGTGAGTTCAATATTACCAGAGATAATGCTGTGCTAGTTATTAAAAATGCCTCTGATGCAACTGGACTATACCTGCTTGGTCAGAAAGCTGATGGGACAAACAAGTTCTACTTAGGGACTGATAACTCTGATTCTGTAGTCAACCTACATAACTACACCACGAGTACAACTATCTCTTTGTCAAATGTGATTACCACTACTAAGACTGTGAAAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGGCTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGGAAGTAACACGTTCACTGCAAAGCAGGTTATTAACACTAATGGTGAAGCTCTCGTGTTACAAGGAAAATCAACCTCCGCACTTTACATTAGGGGTAAGGATTATGATGGAACGAATAGGTGGTATGTTGGCAATGACGACGGCAGTGACACTGTTAGTTTGTATAACTATAAAACTGGTAAAAGCCTAAGCATTGGTTCCGAAGTATCAATTAATGCAAACTTAGTAATTAGTGGTCAAGTACAACCTAGCAACTTCACAAACTTTGATGCAAGGTATTACGGTAAAGCCGAAGCCGATTCAAAGTATTTCTGGTCAGCATTCAGAGCTTCGAAGACCGAGGCTGCTGGTGGTGTGGCTTGGGACCAACCCTCAGGAATCTATCTTGAGACAAAATCTAGCGGGCAAAACCGTTTAGTCTTGCACATGGCCTCTAATGCGAAAGCCCTAACACCATCTGCACAATTAAGATTTGAATCGAAAAATGGTGGGATGTGGTACAGGTCAGCCAGAGACACACTTGGCTTTGAGGTTGAATGGTCTAAGGTTTACACTGAAGCTCAGAAACCTACCCCTTCAGAGATTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCAGAAGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTACCCAGTAGGCATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTGACCCTAATACAGCACTGCCTGGCCTAACTTGGACGTATCTGAATAATGGTGTTGGTAGGACTATTAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACGCACAGTTTTTCTGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACGCTCACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAACCATTCCATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCTACACACTACTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGTATTGGTGTAGGACCGGGTTACACCAATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCCGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCATACAGTTAGTGGCAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8c98eb9a2386badbdec3c53798cdca999316ba50b346e4a2af05d218d2ef069d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7000
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank