Protein

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Genbank accession
QOI71162.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MYSIKTDLDVSGNQTISKDLLVKGSAVITNNLTVGGTINFANATFTQITVTGTANLADVNSTGTAALNNVQVSGNTTLGDSDADSVTVNGTSTFNAPITAKSNVSIEGNTVVGNASTDTLTVNATSTFAAPATFNNNVTVGDAAADALTVNSTSTFKNNVTVGEDATDTLTINSTTNLKNNVTVGEDSTDNLVVNSTSDFKNNVTLGDASTDVLTVNATSNFNNNVVIGSDSADNLTIKSTTQITGDVQITGETELEGLTVNGASNFLSNLSMPTGTTATFQDVVINGTLSGDYTIANGNFTTLTVTGQSNLNSVILSGNVTGTTRSATFQTYNVAGASGVVQFTYNDPSRPSDIKSSIEPYKVSSNEFQGQKATVGHVIFGDVTYADYGLTALGKASIDYLDIKGNSTTGTTRAQLTVAGKSVLNDVEFTGSVTGLTVDVTGQDITPNSVIADAMVQGAQVKSTGQLTGESLQINGISTFQGDGSFNETLQVKDLVVTGTTTGVTAEANVDGLDIAPKSVNATTSIKGATVESTGSLTVNGSITSTNTNVAIGKNTVISGTLNSGSISSTGDVSATGNFLGAGASLTGPNTALAVTNNAVIGGRLTVDGNTSFGGSTGTTTIHDLVVTGTTTGVAVVADVDGLDIAPNKVTVSTTLGVTGQSTLGAVSASTLSTSGLATLASATVTGVATAGSLVTSSIGNSTNAVNFTSPVTTSGNLTVGGTLILAGGLDLSDVDIEAKSIHTTEQATFDGDVIVGGQISLSSASVAALTFTATDNVNTNTLPILQSVTATINTADITTLNATGTSTLATASIGTLTGTGTATFAAATVTGAATFNGNITSTNATVAIAKNTAITGNLSVSGTLTPGAVDLSTADVTVKSLTSSGNAHVVGDLTVDGAFDLSATNLVAATLESTGKTTVGADLILTTGVITGAPKISGNTTIAGTLGVTGNTSVSTLSTTGVATLNSAAVTTTLGVSGATTLSTLTTNGLATLNSATVSGALIANGNITLGNASSDTLTVNATSTFAGDVTVNGSFTPAGGLNLGSAALNVASVTTTGAISVGTTLGVTGVTTLAAVNSGNHAITGTLSTSGLATLNSASITTTLGVTGNSTMTGTLTVNGSGTSKIQALQVGTGTADTDKVLNVFGDTIITGDLDVTGIINAQIDLTSRDISPRNVTASGNISSAGSLTAATSLTAATAIIGAPSSTNNNLQVNGNVVTNGDFTVTGVINGTLNQTNSDVTFKSVTTSAGVTVGTTLGVTGLSTLAGLNAGNTAITGTLSTSGLATLNSASITTTLGVTGATTLAATSATTLSTSGLATLNSATITGALTANGNTVIGDAAADTLTVNATSNFIGDTTVKNITITGTLTADLSNLTTTSFKTGTYFVAQHAAETVSTATWTPDGTSNVYNVNVTANTSIQPITGVNGAGSWFIYVTQDATGGHTVTWDTAYAIIGGEVNTDPNAVSICQVVYCGIGSKYDVFIAQRP
Physico‐chemical
properties
protein length:1490 AA
molecular weight: 147080,70560 Da
isoelectric point:4,09834
aromaticity:0,03557
hydropathy:0,20523

Domains

Domains [InterPro]
DC_0092
STR
179–490
DC_0092 DC_0062 DC_0931
DC_0092
STR
780–985
DC_0092 IPR058970
QOI71162.1
1 1490
Architecture
STR
STR
RBD
STR 179-490 | STR 582-985 | RBD 1134-1490
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Erwinia phage pEa_SNUABM_12
[NCBI] 		2768773 Uroviricota > Caudoviricetes > Eneladusvirus >
Host Erwinia amylovora
[NCBI] 		552 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QOI71162.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT939486.1 [NCBI]
CDS location
range 134363 -> 138835
strand -
CDS
ATGTATTCTATAAAAACGGATCTTGACGTATCTGGTAATCAAACGATTTCTAAAGATCTTTTGGTTAAAGGTAGTGCAGTCATTACAAATAATCTTACTGTAGGTGGTACGATTAATTTTGCTAATGCTACATTTACACAGATTACAGTCACAGGTACTGCTAATCTAGCTGATGTTAACTCTACTGGTACTGCTGCATTGAACAATGTTCAAGTTTCTGGTAACACAACTCTTGGTGATTCCGACGCCGATTCTGTTACTGTAAATGGAACATCAACATTTAATGCTCCAATTACTGCAAAAAGTAATGTATCAATTGAAGGAAACACAGTAGTAGGTAATGCTAGTACTGACACATTAACTGTCAATGCAACTTCAACATTTGCTGCACCAGCTACATTCAATAATAATGTAACTGTGGGTGACGCTGCTGCTGACGCATTAACCGTTAACTCTACTTCTACATTTAAAAATAATGTAACAGTTGGTGAAGATGCTACTGATACACTAACAATTAATTCAACAACTAACTTAAAAAATAACGTTACCGTTGGTGAAGATTCTACTGATAATCTAGTTGTTAATTCAACTTCAGATTTCAAAAATAACGTTACTTTAGGTGACGCTAGTACTGATGTTCTAACTGTAAATGCTACATCCAATTTTAATAACAATGTAGTAATTGGGTCAGACAGTGCTGATAATTTAACAATAAAGTCAACGACTCAAATTACTGGAGATGTTCAAATAACGGGCGAAACTGAACTTGAAGGTTTAACTGTTAATGGAGCTTCTAATTTCCTTAGTAATCTTTCAATGCCTACTGGTACAACTGCAACTTTCCAAGATGTAGTTATTAATGGTACTTTAAGTGGTGATTATACTATTGCAAATGGCAATTTTACAACCTTAACAGTAACTGGTCAAAGTAATCTAAACAGTGTTATTCTCAGTGGTAACGTAACTGGTACAACTCGTTCTGCTACTTTCCAAACTTATAATGTTGCAGGTGCTTCTGGTGTTGTTCAATTTACATACAATGACCCATCACGTCCATCAGATATTAAATCAAGTATTGAACCTTATAAAGTAAGTTCTAACGAATTCCAAGGTCAAAAAGCTACTGTAGGTCACGTAATTTTTGGTGATGTTACATATGCTGACTATGGTCTAACTGCACTTGGTAAAGCAAGTATTGATTATCTTGATATTAAAGGTAACAGCACTACTGGTACAACTCGTGCACAACTTACTGTTGCAGGAAAATCAGTACTTAATGATGTGGAGTTTACTGGTTCAGTGACTGGTTTAACAGTTGATGTAACTGGTCAAGATATTACACCAAACTCTGTAATTGCCGATGCAATGGTGCAAGGTGCACAAGTAAAATCAACTGGTCAACTTACTGGTGAAAGTTTACAAATTAATGGAATTTCAACATTCCAAGGTGATGGTAGTTTCAACGAAACTTTACAAGTAAAAGATTTAGTAGTAACTGGTACAACAACTGGTGTAACGGCTGAAGCAAATGTTGATGGTTTAGATATTGCTCCAAAATCTGTAAATGCAACAACATCAATTAAGGGTGCTACCGTAGAAAGTACTGGTTCTCTAACTGTAAACGGATCTATCACTTCTACTAACACAAATGTTGCAATTGGTAAAAATACCGTAATTAGTGGAACACTAAACTCTGGTTCTATATCTTCTACTGGTGATGTTAGTGCGACAGGTAATTTCTTAGGTGCTGGAGCATCATTAACTGGTCCAAATACTGCATTAGCAGTAACAAATAACGCAGTTATTGGTGGACGATTAACAGTTGATGGTAATACTTCATTCGGTGGAAGCACAGGAACAACAACTATTCACGATCTTGTAGTAACTGGTACAACAACTGGCGTTGCTGTAGTTGCTGATGTGGATGGTTTAGATATTGCTCCTAATAAAGTTACAGTTTCAACCACTTTAGGCGTAACTGGTCAAAGTACATTAGGTGCTGTTTCCGCTTCTACATTAAGTACTTCTGGATTAGCAACATTAGCATCTGCAACAGTAACTGGTGTAGCTACTGCGGGTTCTTTAGTAACTTCAAGTATCGGAAATAGTACTAATGCAGTAAACTTTACTTCTCCAGTGACTACTTCTGGTAATTTAACAGTTGGTGGAACATTAATTCTTGCTGGTGGTTTAGATCTATCAGATGTAGATATTGAAGCTAAATCTATTCATACTACAGAACAAGCAACTTTTGATGGTGACGTAATTGTTGGTGGACAAATTAGTTTAAGTTCAGCCAGTGTTGCGGCTCTTACATTCACAGCTACTGATAATGTTAATACAAACACATTACCAATATTGCAAAGTGTTACTGCAACAATCAATACTGCTGATATAACTACATTAAATGCTACTGGTACAAGTACTCTTGCAACTGCTAGTATCGGTACACTAACGGGAACCGGTACAGCGACTTTCGCTGCTGCAACAGTAACTGGTGCTGCAACATTTAACGGAAATATTACTTCAACGAATGCAACTGTAGCAATCGCTAAGAATACTGCAATTACTGGTAACTTATCAGTATCTGGTACTCTAACCCCTGGTGCTGTGGATTTAAGTACTGCTGATGTAACTGTTAAATCATTAACATCTTCTGGTAATGCTCATGTTGTTGGTGACCTAACTGTTGATGGTGCATTTGATTTAAGTGCCACAAATCTAGTAGCTGCAACATTAGAAAGTACTGGTAAAACTACCGTTGGTGCAGATTTAATTCTAACTACTGGTGTTATCACAGGTGCTCCAAAAATCTCTGGAAATACAACAATTGCCGGAACATTAGGTGTAACTGGAAATACTTCTGTAAGTACTCTAAGTACTACTGGTGTGGCTACTTTAAATAGTGCTGCGGTAACTACCACTTTAGGTGTATCTGGAGCAACAACTCTAAGTACTTTAACTACTAATGGGTTAGCTACTTTAAATAGTGCTACTGTATCTGGTGCATTAATTGCAAATGGTAATATTACTCTAGGTAATGCAAGCTCTGATACTTTAACTGTTAATGCTACAAGTACTTTTGCTGGAGATGTAACTGTTAATGGTTCATTCACCCCTGCTGGTGGATTAAACTTAGGTTCTGCTGCGTTGAATGTTGCTTCAGTAACCACAACTGGTGCAATTTCTGTAGGAACTACTTTAGGTGTAACTGGTGTTACAACACTTGCTGCTGTAAATTCTGGTAACCATGCAATCACTGGTACTCTAAGTACTTCTGGTCTAGCTACATTGAATAGTGCCTCTATTACAACTACTTTAGGTGTAACTGGTAATAGTACAATGACTGGTACTCTAACTGTTAATGGATCTGGTACTTCTAAGATTCAAGCATTACAAGTTGGTACTGGTACTGCTGATACTGATAAAGTTCTAAATGTATTTGGTGATACAATCATCACTGGTGATTTAGATGTAACTGGTATTATAAACGCACAGATTGACTTAACATCACGTGATATTTCACCACGTAACGTAACTGCTTCAGGAAATATTAGTTCTGCTGGTTCATTGACCGCCGCAACTTCTCTAACTGCTGCAACAGCAATCATTGGTGCACCATCAAGTACAAATAACAACCTACAAGTTAACGGTAACGTAGTAACTAATGGTGACTTTACAGTAACTGGTGTAATTAATGGTACATTGAATCAAACTAACTCTGATGTAACTTTCAAATCTGTAACTACATCTGCTGGTGTAACCGTAGGGACTACATTAGGTGTAACTGGTTTAAGTACATTAGCTGGATTGAATGCTGGAAATACTGCAATCACTGGTACTCTAAGTACTTCAGGATTAGCAACACTAAACAGTGCTTCAATCACCACTACATTAGGTGTAACTGGTGCAACCACATTAGCTGCAACATCTGCAACCACTTTGAGTACTTCTGGTCTAGCTACATTGAATAGTGCTACAATTACTGGTGCATTAACCGCTAATGGTAACACTGTTATTGGTGATGCGGCGGCAGATACATTAACTGTTAATGCTACAAGTAACTTTATTGGTGATACTACTGTTAAGAATATTACAATCACTGGTACTTTAACTGCTGATTTATCTAACTTAACAACAACATCATTCAAAACTGGAACATACTTTGTTGCTCAACATGCTGCTGAAACAGTAAGTACTGCAACTTGGACTCCAGATGGTACTTCAAACGTTTATAACGTAAACGTTACTGCAAATACCTCAATTCAACCAATTACTGGTGTGAATGGTGCAGGTTCATGGTTCATCTATGTAACACAAGATGCTACTGGTGGACATACTGTAACATGGGATACTGCTTATGCAATCATTGGTGGTGAAGTTAATACTGATCCAAACGCTGTAAGCATCTGTCAAGTAGTGTACTGTGGTATTGGTTCTAAATATGATGTGTTCATTGCACAACGTCCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4d482e4a0f6cde2a9f30d3c683bf9cb42b8c703791ce1f7d8029e4bcdbff6c3d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6224
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Erwinia phage pEa_SNUABM_12 Kim,S.G., Lee,S.B. and Park,S.C. 2021-01-07 — GenBank