Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAH0447825.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MENMFYGAVAFNQPLAAWDVSNVTNFAQMFRDASVFNQAIPCWNVANATDMTRMLNNAVAFDQNLSAWCVGNNIATEPTDFDSGSGIAGVLAKAPQWGVACSPVAGLNGTGVLARWDVVTNDNLWADVGKTLPVGVNGIVAVIEDSSGNGNDAIVSGNVRWRNDSSGNGYLDFENGAQLTAAGITDAYDIAFVVPGVGNTYIERPADAGGAHFWGQSATGVVGSLLITSTGNGSTVGGFQCLPYQEKVTTSLSRYFRNEDLFNNDLSAWDMNGITDVSHMFEGADFFENGGQPLAWDTSTITDMSYLFRDCIAFNQDITGWVTSAVTDMSYMFNEANAFNQDIGGWDVSAVTVFTSMLQGATVFNQDLSGWTTTAATRMDNMFRDAVAFNSDVSNFDMNGVTRADYMFSGCTVFNNAGISLATWDVSTIQNFSGMFNSAEAFDQDITTWTTTSATAMANMFTNAKAFNRNITGWDVANVTSFYNMFRGATLFNNGAANDGTEGPVMNWDVTGATDNQAFRGMFQDAVAFNCEMPNWVIIGLAMDMMNGCAKFNQDISSWDLTATTYLTSFLRNCAVFDNKGAALTVNAPLCTHFNTFLAGCSVFNQDVTMVMSSATNTAGMFQDTSVFNGAISGFDMSGVTNAALMFSGAAKFNQPIGDWEVQNIQNFLSFLSGAAEFNQKLTCWDVGSATNMNNMFSGTTAFDQDISTWCTPSITAEPTDFKTGSGISAANEPNWATMGGCTPGAGSIASGSTLAILDPRDKSNLFQDVGMTNPVTTAGQTVLAATDSSGNGNDFVFVDGTVTYREDTNGNGMLEYGPSAKVRAVAITSTYDVGFIVPTVGYGYIASTAIAGGAEFGGRSGTQQVGPMIFTASGFGNTVSGTECISYASVSPFALESFFRSENNPVFASNWDLTNITSIDSIFFFSDAANASGVETWTNTGNLVSMRYAFNGNSSLNQDLSNFDTSNVQDFFSTFSGCSAFTGTGLSSWDVGSASTMASMFNGCINFNEDLSLWNVINCNNFDSTFSGCRVFNNGEAAGSSTKPLAWDINTTASGGVEMESMFKNAWVFNQDITTWNMSNVDNMLKMFQDARAFNNGNAAGVSHAVNWDTTRAETTSYMFDSAWAFNGDISSWDTSNIEDMSYMFQDAQAFNQNVDHFDFTSIIPNAGVIRVFKDAVAFNNGETALATTAPITWTNLPAGSNLTGLFENADSFNQDLAINWANVTSIYRMFYNNGGFNRDVNGWDVSGITSLEGVFYNATAFNNGSAGGVTDNPITWDTSSATTMEALFRGATSFDQDVSGFNLANVTTLRRMFRDADNFNQPVGSWDVSGVSRFDEMFEGTDAFNQSLGCWDVSGATNMDSMFEAALGFNQSISGWCTPNITVRPTSFADASPINGTANEPDWTNMGSCTPGAATLSSGSTLALFDPRDMTSLYQDTARTIPVTAPGDSVRGIADLSGNGNHGVIDGTAARYREDVDGKGFLDLFAGSSIKVATVTVAYDVGFIIPGIGNGWEGFLADAAGAEYWGKNDDCCRGPLIFTGSGFGSSMGGAECIAYAPGTVSSLDRTFSKAVSSGGNFADWNTTGVTRMEYMFEEQRTFTGTGVENWDVSAVTSFQYMFDDCDVFNADLSAWDTSSGTLFRYMFNRALAFNNGGAGNDKPMTFDTSSATDLSGMFFGNDVFNQDVAAFNTANATTLASMFNGANAFNQDVNHFDLTKCTNIASIFQNATVFNNGSSAGASDNPLSWSTPALTITSRAFASTQAFNQDLSSWTMDNVWWTEAMFNNADAFNQNLNAWNMEKMSNAYLMFWNADIFNNGGAIGAGAPGGDAPLTWTTTALSNAENMFASTGEFNQPMPNFAFAAGSTTRTSKMFQSAPKFNQDISMWDMSNVTRLSYMFQKAIAFNNGSAPGVTDNPLVWDTSKVITLQGTFAGAESFNQDIESWDTSSVTNMNQTFSYTSSGEESIFNRPLNKWNVSSVTNFEETFARNRAFNQPLACWNVSAATNMAQMFESADAMDGDLSAWCTPNITAEPTNFVFASNLDGQTAKHPDWANMASCTPGVPTASWPDAVAIFDMTDVTTLYQDAGMTTPVTAAGQSVAKIEDLSGNGNHMTCTDTTAKQDDNGNWYICRLTSGDMTIPSAAGSGDFAFAINPPSVGWITGATNFHSGDWGFTGSSRRDFAQIMIGPSGTDNTITGIDCGDGKSWSWASAASSSDRVSIGRIAEFANVNSDISNLNMRWVFDAERAFSRVTFANPNVDLSGWNMAAVEDMQYMFNQSNFAGSVENWDASSCTSFEGMFYFCADFNGDVSGWTTNTTGYSTKQMFGGCTNFNSGASVAITGPDLSNLTSATSNCYDMFRDCTSFNCQIPTVNIIGDSLDAAYMFRGCSWFQNGGVAITINGDNARSLISFFDGCTLFNQPVTVTFPTNNLQRCQRMFYGCQAMNSPVVLPQSNATTIVHTVGMFQEAINFDQDMSYWCVSHIASKPTNFATNAPIDGTAKEPQWGAAC
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2508 AA molecular weight: 269345,36210 Da isoelectric point: 4,06339 aromaticity: 0,12201 hydropathy: -0,13660
Domains
Domains [InterPro]
DC_1384
RBD
1–162
RBD
1–162
IPR005046
STR
1–72
STR
1–72
IPR011889
Unmapped
307–331
Unmapped
307–331
1
2508
Architecture
STR 1-72 | RBD 73-162 | RBD 214-249 | STR 250-504 | RBD 505-594 | STR 595-1659 | STR 1663-2024 | RBD 2025-2121 | STR 2122-2490 | RBD 2491-2508
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
2508
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 10 | 10 | 0,0092 |
| Central domain | 11 | 209 | 200 | 0,6990 |
| C-terminal | 210 | 2508 | 2298 | 0,0653 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Sequence started with non-N-terminal domain
Sequence started with non-N-terminal domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-10
1-10
Central
11-209
11-209
C-terminal
210-2508
210-2508
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Vibrio phage vB_VpaM_sm033 [NCBI] |
2893233 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAH0447825.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OV032902
[NCBI]
CDS location
range 13 -> 7539
strand +
strand +
CDS
ATGGAAAACATGTTCTATGGTGCAGTAGCGTTTAACCAGCCTCTAGCGGCTTGGGATGTTTCAAACGTAACTAACTTTGCTCAGATGTTCCGTGATGCTTCTGTGTTTAATCAAGCGATTCCATGTTGGAACGTTGCTAATGCAACAGACATGACTCGTATGCTTAACAATGCAGTAGCGTTCGATCAGAATCTAAGTGCATGGTGTGTGGGCAATAACATTGCTACAGAGCCAACTGACTTTGACTCTGGTTCTGGCATTGCAGGTGTACTAGCTAAAGCTCCTCAATGGGGTGTTGCATGTTCTCCTGTTGCTGGTCTGAATGGTACAGGCGTACTAGCACGTTGGGATGTTGTTACTAACGACAACCTTTGGGCTGACGTAGGTAAGACTCTTCCTGTTGGTGTAAACGGTATCGTTGCAGTGATTGAAGATAGTTCAGGTAACGGTAACGATGCAATTGTTTCAGGTAATGTTCGTTGGAGAAACGACAGTTCCGGTAACGGTTACTTGGATTTCGAAAACGGTGCTCAGTTAACAGCAGCTGGAATCACAGATGCTTATGACATTGCATTCGTAGTACCTGGTGTAGGTAACACTTACATCGAGCGTCCTGCTGATGCTGGCGGTGCACACTTCTGGGGACAATCAGCAACCGGTGTAGTAGGCAGTCTATTGATTACTTCAACTGGTAATGGTTCAACTGTAGGTGGCTTCCAATGTCTACCATACCAAGAGAAAGTTACAACGTCACTATCTCGTTACTTCCGCAATGAAGACCTATTTAACAATGACCTAAGTGCTTGGGACATGAATGGCATCACAGATGTTTCACACATGTTCGAAGGCGCTGACTTCTTTGAAAATGGTGGTCAACCATTAGCGTGGGATACGTCGACTATTACTGACATGTCTTACTTGTTCCGTGACTGTATTGCATTCAATCAGGATATCACTGGTTGGGTAACATCAGCAGTTACAGATATGAGTTACATGTTTAATGAGGCAAATGCATTCAACCAAGATATTGGTGGTTGGGACGTGTCTGCGGTAACTGTGTTTACATCTATGCTGCAAGGTGCAACTGTGTTTAACCAAGACTTGTCTGGTTGGACTACAACGGCTGCAACTCGCATGGATAACATGTTCCGTGACGCAGTAGCGTTTAACTCTGATGTAAGTAACTTTGACATGAACGGCGTAACACGTGCTGATTACATGTTCTCTGGTTGTACGGTCTTTAACAATGCTGGTATCTCACTAGCTACTTGGGACGTAAGTACGATTCAGAACTTCTCAGGTATGTTTAATAGTGCTGAAGCATTCGACCAAGACATTACGACATGGACAACGACAAGCGCAACAGCAATGGCTAACATGTTTACCAATGCTAAAGCGTTTAACCGTAACATCACAGGCTGGGATGTTGCTAATGTAACTAGCTTCTACAACATGTTCCGTGGAGCAACACTGTTTAACAATGGTGCGGCAAACGACGGTACTGAAGGTCCAGTGATGAACTGGGATGTTACAGGTGCAACTGATAACCAAGCGTTCCGTGGTATGTTCCAAGATGCGGTAGCGTTTAACTGTGAAATGCCTAACTGGGTAATCATTGGTCTAGCAATGGACATGATGAATGGTTGTGCTAAGTTTAACCAAGATATCTCTTCTTGGGACTTAACGGCAACTACTTACCTGACTTCATTCTTGCGCAACTGTGCAGTGTTTGACAACAAGGGTGCAGCGTTAACTGTTAATGCTCCTCTATGTACTCACTTCAATACGTTCCTTGCTGGATGTTCAGTATTCAATCAAGACGTAACGATGGTGATGTCGTCAGCTACTAACACAGCTGGTATGTTCCAAGATACTTCGGTATTTAATGGCGCTATCAGTGGCTTCGATATGAGCGGCGTTACAAACGCAGCGTTGATGTTTAGCGGTGCAGCTAAGTTCAATCAGCCTATTGGTGATTGGGAAGTACAAAACATTCAGAACTTCTTAAGCTTCTTGAGTGGTGCGGCCGAGTTTAACCAAAAGCTGACATGTTGGGATGTAGGTTCTGCAACTAACATGAATAACATGTTCTCAGGAACTACAGCGTTTGATCAAGACATCTCTACATGGTGTACTCCAAGCATCACTGCTGAACCAACTGACTTTAAGACTGGTTCAGGTATCAGTGCAGCTAACGAGCCAAACTGGGCGACTATGGGCGGATGTACTCCAGGAGCAGGTTCAATTGCATCTGGCTCTACATTGGCTATTCTTGACCCGCGTGACAAGTCTAACTTGTTCCAAGACGTTGGTATGACTAACCCAGTAACAACAGCAGGTCAAACTGTATTAGCGGCTACTGATAGTTCAGGCAATGGCAATGACTTTGTCTTTGTGGACGGAACGGTAACATACCGTGAAGATACTAACGGCAACGGCATGCTAGAATATGGCCCAAGTGCTAAAGTGCGTGCTGTAGCGATTACGTCTACATATGACGTTGGCTTTATCGTACCTACTGTTGGTTACGGTTACATAGCTTCAACGGCAATTGCAGGCGGCGCTGAGTTTGGCGGTCGTTCGGGTACACAGCAAGTAGGTCCTATGATCTTTACTGCGAGTGGCTTTGGTAACACCGTTAGCGGAACAGAATGTATCAGTTATGCAAGCGTTAGTCCATTTGCACTAGAGAGCTTCTTCCGTAGTGAAAACAACCCTGTATTTGCAAGCAACTGGGATTTGACGAATATTACTTCTATTGATAGTATCTTCTTCTTCTCCGATGCAGCTAATGCAAGTGGCGTGGAAACATGGACTAATACGGGCAATCTAGTTAGTATGCGTTATGCCTTTAATGGCAATAGCAGCCTAAACCAAGACTTATCAAACTTTGATACTTCTAATGTACAAGACTTCTTTAGTACGTTCTCTGGCTGTAGTGCGTTTACTGGTACTGGACTAAGCAGTTGGGATGTCGGTTCAGCATCAACAATGGCTTCAATGTTTAACGGCTGCATTAACTTCAACGAAGATCTTTCTTTGTGGAATGTAATCAACTGTAACAACTTTGATAGTACGTTCTCTGGCTGTCGTGTATTTAACAACGGCGAAGCAGCAGGTTCAAGTACTAAGCCACTAGCATGGGACATCAATACTACTGCTTCTGGCGGTGTTGAGATGGAATCAATGTTTAAGAACGCGTGGGTGTTTAACCAAGACATTACTACGTGGAATATGTCTAACGTTGATAACATGCTGAAGATGTTCCAAGACGCGCGCGCATTTAACAATGGTAATGCGGCAGGTGTTTCTCATGCTGTAAACTGGGACACAACTCGTGCTGAAACCACAAGTTACATGTTTGACAGTGCTTGGGCATTTAATGGCGATATCTCTTCATGGGATACTTCTAACATTGAAGACATGAGCTACATGTTCCAAGATGCACAGGCGTTTAACCAGAATGTTGACCACTTTGACTTTACGTCAATTATCCCTAATGCTGGTGTCATTCGTGTGTTTAAAGACGCAGTAGCATTTAACAATGGTGAAACTGCCCTAGCAACAACTGCACCTATTACTTGGACTAACTTACCTGCTGGTTCAAACCTAACTGGTTTGTTCGAGAATGCAGATTCGTTTAACCAAGACCTGGCAATTAACTGGGCTAACGTAACTTCAATTTACCGCATGTTCTACAATAACGGTGGATTCAACCGTGACGTAAACGGATGGGATGTATCTGGCATTACAAGTCTAGAAGGCGTGTTCTATAATGCTACGGCATTTAACAACGGGTCTGCTGGCGGCGTAACAGATAACCCTATCACTTGGGATACAAGTTCAGCTACTACAATGGAAGCATTGTTCCGTGGCGCTACGAGCTTTGACCAAGATGTGAGTGGATTTAACCTTGCTAATGTAACAACGTTACGTCGTATGTTCCGTGATGCTGATAACTTTAATCAGCCGGTTGGTTCATGGGATGTTTCAGGTGTATCGCGCTTCGATGAAATGTTTGAAGGCACAGACGCATTCAATCAATCTCTAGGTTGTTGGGATGTTTCAGGTGCTACAAACATGGATAGTATGTTTGAAGCTGCTTTAGGTTTCAATCAAAGTATCTCTGGATGGTGTACGCCAAACATTACGGTTCGTCCGACTTCGTTTGCCGATGCATCGCCAATTAATGGTACTGCGAATGAACCTGATTGGACTAACATGGGTTCTTGTACTCCAGGTGCGGCAACGCTTTCCTCTGGAAGTACTTTGGCACTATTCGACCCACGAGACATGACGTCGCTTTACCAGGATACTGCAAGGACGATTCCTGTAACAGCACCTGGAGACAGCGTACGCGGTATTGCTGATTTGTCAGGAAATGGCAACCATGGTGTCATTGATGGCACTGCTGCCCGCTATCGTGAAGATGTTGATGGTAAAGGATTCTTGGATTTATTTGCAGGGTCTTCAATCAAAGTCGCTACTGTTACAGTTGCATACGATGTAGGCTTTATTATCCCGGGTATCGGTAATGGCTGGGAAGGATTCCTGGCAGATGCTGCCGGTGCAGAATACTGGGGCAAGAATGATGACTGCTGTCGTGGACCGTTGATATTCACAGGAAGTGGATTTGGCTCTTCAATGGGCGGCGCAGAATGTATCGCATATGCTCCTGGTACAGTCTCGTCACTAGACCGTACGTTCTCTAAGGCCGTTTCTTCTGGCGGTAACTTCGCAGATTGGAATACCACTGGTGTAACGCGCATGGAATACATGTTCGAAGAACAGCGTACCTTCACGGGTACTGGAGTTGAGAACTGGGATGTAAGTGCAGTAACATCTTTCCAATATATGTTTGATGATTGTGATGTCTTTAATGCCGACCTTTCAGCATGGGATACGTCATCGGGTACATTGTTCCGTTATATGTTTAACAGAGCCCTCGCATTTAACAATGGCGGCGCTGGTAACGATAAGCCTATGACGTTTGACACCTCTTCGGCTACAGATCTATCCGGTATGTTCTTCGGTAACGATGTGTTTAACCAAGATGTGGCAGCGTTCAATACGGCCAATGCAACTACCTTGGCATCCATGTTTAATGGTGCGAATGCGTTTAACCAAGATGTGAATCATTTCGACTTGACTAAATGTACAAACATAGCAAGTATTTTCCAAAATGCTACGGTGTTTAATAATGGTTCTTCAGCAGGAGCTTCTGACAATCCGTTGTCTTGGAGTACGCCGGCACTGACCATTACTTCGCGTGCCTTTGCTAGTACTCAAGCATTTAACCAGGACTTAAGTTCTTGGACCATGGATAATGTCTGGTGGACAGAAGCCATGTTTAACAACGCCGATGCGTTTAACCAAAACTTGAATGCCTGGAACATGGAGAAGATGAGCAATGCTTATCTAATGTTCTGGAATGCCGATATCTTTAATAATGGCGGTGCTATAGGTGCTGGTGCCCCAGGTGGTGATGCTCCATTGACTTGGACTACAACTGCCTTGAGTAATGCTGAGAATATGTTCGCAAGTACAGGTGAGTTTAACCAACCAATGCCAAACTTCGCGTTTGCGGCAGGTTCGACAACACGCACGAGCAAGATGTTCCAGTCAGCACCGAAGTTTAACCAAGATATCTCTATGTGGGATATGTCTAATGTGACTCGTCTGAGCTACATGTTCCAGAAAGCAATAGCATTTAACAACGGCTCTGCTCCTGGGGTAACTGACAATCCATTAGTATGGGATACATCAAAAGTTATTACGCTTCAAGGCACATTTGCTGGCGCTGAGTCATTCAACCAGGATATCGAATCTTGGGATACGTCCAGTGTTACTAATATGAATCAAACATTTAGCTATACTTCTTCTGGAGAAGAATCCATCTTTAACCGACCATTAAACAAATGGAACGTTTCAAGTGTGACTAACTTCGAAGAAACGTTTGCCCGTAACCGTGCGTTTAATCAGCCACTGGCTTGTTGGAACGTAAGTGCTGCTACAAACATGGCTCAAATGTTTGAATCTGCCGACGCAATGGATGGAGACTTAAGTGCATGGTGTACGCCAAACATCACTGCCGAGCCTACCAACTTTGTATTTGCATCTAACCTAGATGGACAGACGGCTAAGCACCCTGACTGGGCTAACATGGCTTCTTGTACTCCTGGAGTACCTACGGCTAGCTGGCCTGATGCTGTAGCTATCTTTGATATGACTGATGTAACTACGTTGTATCAAGATGCAGGTATGACTACGCCGGTAACGGCAGCTGGTCAATCTGTTGCTAAGATCGAAGACTTGTCAGGTAACGGCAACCACATGACGTGTACAGACACAACAGCTAAGCAAGACGATAACGGTAACTGGTACATCTGTCGTTTAACTTCAGGTGACATGACCATACCTTCGGCTGCTGGTTCAGGTGACTTTGCATTCGCGATTAACCCGCCGTCTGTAGGTTGGATTACCGGTGCAACAAACTTCCATAGTGGAGATTGGGGCTTTACTGGTAGTTCGCGTCGTGACTTTGCACAAATCATGATTGGCCCATCTGGTACAGACAATACTATCACAGGCATTGACTGTGGCGATGGGAAGAGCTGGTCTTGGGCTTCGGCTGCTTCGTCTTCAGACCGCGTGTCGATTGGACGTATTGCCGAGTTTGCTAATGTAAACAGTGACATCTCTAACTTGAACATGAGATGGGTATTCGATGCGGAGCGCGCATTTAGCCGTGTAACCTTTGCTAACCCTAACGTGGACTTGTCAGGATGGAACATGGCAGCGGTAGAGGACATGCAGTACATGTTCAATCAATCTAACTTCGCAGGTAGTGTGGAAAACTGGGATGCTTCTAGCTGTACTAGCTTTGAAGGCATGTTCTACTTCTGTGCGGACTTTAACGGCGATGTGAGTGGTTGGACAACAAACACTACTGGTTACAGTACCAAGCAAATGTTTGGCGGTTGTACCAATTTCAACTCTGGTGCATCTGTAGCGATTACCGGTCCAGATCTTTCAAACTTGACGAGTGCGACTTCGAACTGTTACGACATGTTCCGAGACTGTACGTCATTTAACTGTCAGATTCCAACTGTTAACATCATTGGCGATAGCCTGGATGCAGCATACATGTTCCGTGGTTGTTCATGGTTCCAGAATGGCGGCGTAGCGATTACGATTAATGGTGACAATGCACGTTCATTGATTAGTTTCTTTGACGGCTGTACGTTGTTCAACCAGCCTGTGACTGTTACATTCCCTACCAACAATCTACAACGTTGTCAGAGAATGTTCTATGGTTGTCAAGCCATGAATAGTCCTGTAGTTCTACCGCAGTCTAATGCTACTACCATCGTACATACAGTGGGTATGTTCCAAGAGGCGATTAACTTCGACCAAGATATGTCTTACTGGTGTGTATCGCATATAGCTTCTAAACCAACTAACTTTGCAACCAATGCTCCAATTGATGGAACCGCTAAGGAACCACAATGGGGTGCTGCTTGTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
1c7cc684f980f76dedc51b638d5ee5d9715794bcba029720d87438dcd8825059
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50