Protein

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Genbank accession
WPK34986.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTTGNGAWANQHSNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWHYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLIANGVSTGTINSTGVNSTKKLTVGYSRDSGSTWDYPNTNQAMFSARTEVDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGAGRMAISMGEGLIVEPGILDIKTGSNSLNLRADGTIASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLIFKAASGIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNATGDKARETVFEVSDGQGYYFYSQRVAPTGSETTGPVVTQFNGQVNARGSLITDGSLRVNGLSTLVGNVTMNNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPQNAGESGGISNLRPFYIALSNGKVSMDHDVDIGGGRFKVEAAGTTAGQRITVNMASDAIRINAPTQESSNFIQGRKADVPKWYLGIGDGGNVVRMHSYTYSHGIALNSDSVDITKPLKVGNAQLGTDGNITGGSGNFANLNTALNRKVNSGFVTYGATAGWYKFATVTMPQSTSTVSFTVTGGKGFNTGLFTQCAITEIVLRTGNDHPIGLNAVMYTRTAAGFTDIAVVNTSGNTYDVYVESGTYANQLAYTWHAVDNATVKVIGAFGPTQDPVDSLPVDYVKGQVANMLNNLVDTGKVKRYEADSEIAINNPTGIRIRSNYDKTGSVATMLRNDGGSFYILFTDKNATDGAATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVIMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDGTRGNRLEISDETNYIAYFQKLPGGQNQVSFNSATLSGLTQCNQFGVNTTNALGGNSITFGDNDTGIKQNGDGLLDIYANNVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1257 AA
molecular weight: 135227,71530 Da
isoelectric point:6,94580
aromaticity:0,09149
hydropathy:-0,33612

Domains

Domains [InterPro]
DC_1954
STR
1–1256
DC_1954
IPR048390
ATT
514–650
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR048388
ATT
691–765
IPR048388 IPR030392 Coil
WPK34986.1
1 1257
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 1-513 | ATT 514-650 | STR 651-690 | ATT 691-765 | STR 766-1256 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WPK34986.1
1 1257
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 268 268 0,1356
Central domain 269 470 203 0,5520
C-terminal 471 1257 786 0,6638
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-268
Central
269-470
C-terminal
471-1257

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage AV114
[NCBI] 		3077259 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK34986.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR352944.1 [NCBI]
CDS location
range 59893 -> 63666
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGTGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAACTGGCGATTATTTACAAAACGGCACGTATAATCTCAATGGAAATCAGTTTGTTTACGCAGGAAAATACATTGAATTTTTACCTAAAACCACTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACATTCGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCACTGATTAAACAACGTTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGTACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCACTATACTCCAACCGAAACAGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGACGTAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGACGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGCGTTATTGATTTGATTGCTAACGGTGTTTCGACCGGTACAATAAACAGTACTGGTGTTAATAGTACAAAGAAATTAACAGTTGGGTATAGCCGTGATTCTGGATCTACTTGGGATTATCCGAATACCAACCAGGCAATGTTCAGCGCTAGAACAGAAGTTGATGGTAATAATAACGGTGATGGTCAAACTCACATTGGTTATAGTTCTAATGCTAAGATGTATCATTATTTCCGTGGCGCTGGCCGCATGGCCATCAGCATGGGTGAAGGTCTTATTGTCGAACCAGGAATTCTTGATATTAAAACCGGTTCAAATTCGTTAAATTTGCGTGCTGATGGTACCATCGCTTCTGTTCAAACGTTAAAACTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAATTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGATGGTACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGCGGTACTCGTGCAGGTCAGAACAAAAGTTATGTGACCGTGAAAGCATGGGGTAACTCATTTAATGCTACTGGTGATAAAGCTCGAGAAACCGTATTTGAGGTTTCTGATGGCCAAGGTTATTATTTCTATTCTCAACGCGTAGCTCCGACCGGTTCTGAAACTACAGGCCCTGTTGTAACTCAGTTCAATGGACAGGTTAATGCTAGAGGAAGCTTAATAACCGACGGAAGTCTTAGAGTTAACGGATTAAGCACTCTAGTTGGCAACGTTACAATGAATAATGGATTGTTTGTTCAAGGCGGTTCTTCTATTACTGGACAAGTTAAAATTGGTGGAACAGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACTCCGCAGAATGCTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTGCATTAAGTAATGGTAAAGTTTCTATGGATCATGATGTAGATATCGGCGGCGGCAGATTTAAAGTAGAAGCTGCTGGAACTACGGCTGGTCAACGCATAACAGTAAATATGGCATCAGATGCTATTAGAATAAATGCTCCAACACAAGAGTCTTCTAACTTCATTCAAGGACGTAAAGCAGATGTTCCGAAATGGTATTTAGGTATTGGCGACGGCGGCAACGTCGTTCGTATGCACAGTTACACATATTCACATGGTATTGCATTAAACTCTGATTCTGTCGATATTACTAAACCTCTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACCGATGGCAATATCACGGGCGGTTCCGGTAACTTTGCTAACCTAAATACCGCATTAAACCGCAAGGTAAATTCAGGATTTGTAACATACGGTGCAACTGCCGGATGGTATAAATTCGCCACAGTAACGATGCCACAATCTACTTCTACTGTTTCATTTACTGTAACTGGTGGTAAAGGATTTAATACTGGACTGTTTACACAGTGTGCTATAACAGAAATTGTTCTTCGTACTGGTAATGACCACCCAATAGGTTTAAACGCGGTGATGTATACCAGAACAGCTGCGGGTTTTACTGATATTGCTGTAGTTAATACCTCAGGAAATACATATGATGTCTATGTTGAATCTGGCACTTATGCCAACCAATTAGCTTATACCTGGCATGCAGTTGATAATGCTACCGTAAAAGTTATTGGTGCTTTTGGTCCGACTCAAGACCCGGTAGATTCTTTGCCGGTTGATTATGTTAAAGGCCAGGTAGCTAACATGCTTAACAACCTGGTAGACACAGGTAAAGTAAAACGTTATGAAGCCGATTCTGAAATAGCTATTAATAACCCAACCGGTATTCGTATCAGAAGTAACTATGATAAAACTGGTTCTGTGGCTACAATGTTACGAAATGATGGCGGTAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGCAGCAACTGTTAATGGTGATTGGAATAGTAAACGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACCGGCGAAGTGATAATGAATAATGGCATAGCTGTTCGCAGCGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAACGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAGTCCGGTGCGAACCCAAGAAACATGCGTATATTCCACGCAGGTGATGGTACGCGAGGAAACCGCCTTGAAATTTCTGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTCCAAAAATTACCTGGTGGTCAAAACCAAGTTTCATTCAATAGTGCTACACTTTCTGGATTAACACAGTGCAATCAATTTGGTGTTAACACAACAAACGCACTTGGTGGAAATAGTATAACGTTTGGTGATAATGACACCGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAACGTGCAAGTGTTCCGTTTCCAAAACGGCGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCCAACTTTAAGCCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTTAACGGTGTCATTTACGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCTGTCCGTGAAACAGAAGATAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
85b3fb47bb67d859ea95262b6b1f0588591a9de92eaf26e33c2b415ea9785461
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5159
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
A collection of diverse bacteriophages for biocontrol of ESBL- and AmpC-beta-lactamase-producing E. coli Vitt,A.R., Sorensen,A.N., Bojer,M.S., Bortolaia,V., Sorensen,M.C.H. and Brondsted,L. 2023 — GenBank