Protein

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Genbank accession
WMU07958.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
Protein sequence
MLIIADTNYAQLGVLPSAQDIKRTRDISGTDTLEFNYAMFNVVGAEEIKDDMINVIKTQNHILTADQVYVIKEVNPSSDNLIAVECEVDTEALKSLYNNAFTRTNVPITDIANNALIGSGWVVNTDVTKLRSLAMTNSTALDILKKLAETYMCDLQFDAKNKVVNFLKSMGTSKGTFFNDKLNLVALNIKQDTHDFCTRLIPVGQNNMYITDVNGGLPYVENHQYTNQVITAYWSAGQYTDANALKEDAIAKLAIMSQPQVTFDATVLDLARISEINPDFENYSELSYNIGDTVTIMDSKKEIGQTVRIVQTVEYMDKPEQNTVQFDSMYQLMEDLFEKSLHTTDTVDSITTPDGGSVNGDTVDKIDWTKVQNVQVQTAQIANLTVTTEKVADSTITTAKIGDAQITNAKIYSLSADKLTAGTIDAGVITVTNLNADNISGGTIDAHIIGVTNLNASNIVSGTLDASKIAVENLDASAITTGTLDASQISVINLDASSITTGTFSANRISGGTIDASIISVINLDASAITTGTFSANRISGGTIDASLISVIKLNASNITTGELDGTLIKAHTIVADQMVIGTITADSGIIATSAIGTAQIADGSITDAKVVNLSANSITAGTLSVDRLIIRGSDKSIVYELNNIAGATQVLSQTTINGEALTDRTITADKVVANAITANEIATNTITANSGIIASIDASKITTGTLDASQISVVNLDAGSITTGTLSGDRINGGTITGVNIIGTTIKTNNTANYLTLHDQQISIFQNSNEMISLGYMVYGSNTLPLIQMFGKHLISRTGATDDGTMTIGAIKPADITNGKVSIYNISALGAFECWGNSKFNADMEIDATLNVVGSSGSGSGTGAVSTDSLLVRTNANFLNGKVIISSSYIDMYDALWMNGNNIMMSGGNIASAGTISANNFYRIGKVPAYTSSSLSIPTGNSVTIAHNLGYHPIIRLNGTVGNLIVTTQDTDVNHTRIYCYSGGGATFNGYAYFY
Physico‐chemical
properties
protein length:996 AA
molecular weight: 105549,17430 Da
isoelectric point:4,54362
aromaticity:0,05723
hydropathy:0,04418

Domains

Domains [InterPro]
IPR044051
ENZ
2–84
IPR044051 IPR010572 DC_1258 DC_2138
DC_1274
ATT
3–512
DC_1274
IPR007119
Unmapped
20–327
IPR007119
WMU07958.1
1 996
Architecture
ATT
STR
STR
ATT 2-512 | STR 513-551 | STR 625-857 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Clostridium phage vB_CtyS-FA88
[NCBI] 		3065432 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Clostridium sp.
[NCBI] 		1506 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Clostridia > Eubacteriales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WMU07958.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR113388 [NCBI]
CDS location
range 17173 -> 20163
strand +
CDS
ATGTTAATAATTGCAGATACAAATTATGCTCAATTGGGGGTTTTACCTTCCGCTCAAGATATTAAAAGAACTAGGGATATAAGTGGCACCGATACATTGGAGTTCAATTATGCTATGTTTAATGTTGTGGGTGCAGAAGAAATAAAAGATGATATGATTAATGTTATAAAAACACAAAATCATATTTTAACAGCAGACCAAGTATATGTAATTAAAGAGGTAAACCCAAGTTCAGATAATTTAATTGCAGTTGAATGTGAGGTAGATACAGAAGCTTTAAAAAGTTTATATAACAATGCCTTTACAAGAACCAATGTACCCATTACAGATATTGCAAACAATGCTTTAATTGGAAGTGGCTGGGTAGTTAATACTGATGTAACTAAATTGAGAAGTTTAGCAATGACTAATTCTACTGCATTAGATATATTGAAAAAATTGGCAGAAACTTATATGTGTGATTTACAGTTTGATGCTAAAAATAAAGTAGTTAACTTTTTAAAAAGCATGGGTACCAGTAAGGGCACATTTTTTAATGATAAATTAAATCTTGTAGCATTAAATATTAAACAAGATACCCATGATTTTTGTACTAGACTAATACCAGTAGGTCAGAATAATATGTATATTACTGATGTAAATGGTGGTTTACCTTATGTAGAAAATCATCAATACACAAATCAAGTTATAACTGCATATTGGTCAGCAGGTCAATATACAGATGCTAATGCACTTAAAGAAGATGCTATAGCTAAATTAGCAATTATGTCACAACCACAAGTTACATTTGATGCCACAGTTTTAGATTTAGCTAGAATATCAGAAATTAATCCAGATTTTGAAAATTATTCAGAATTAAGTTATAATATAGGTGATACTGTAACTATAATGGATTCAAAGAAAGAAATTGGACAAACTGTACGTATAGTGCAAACTGTAGAATATATGGATAAGCCAGAACAAAATACGGTGCAGTTTGATAGTATGTATCAGCTAATGGAAGATTTATTTGAAAAATCTTTACACACTACTGATACTGTAGATTCAATTACTACCCCCGATGGTGGTAGTGTAAATGGTGATACTGTAGATAAAATTGATTGGACTAAAGTACAAAATGTACAGGTGCAAACTGCACAAATTGCTAACCTAACAGTAACAACCGAAAAGGTAGCAGACTCAACTATAACAACTGCAAAGATAGGGGATGCACAAATAACTAATGCTAAAATATATAGTCTATCAGCAGATAAATTAACTGCTGGTACAATTGATGCTGGGGTTATTACCGTAACTAATTTGAATGCAGATAATATTAGTGGAGGTACAATTGATGCACATATTATAGGTGTTACTAATTTAAACGCTAGTAATATTGTATCGGGTACTTTAGATGCTTCCAAAATTGCGGTCGAAAATCTGGATGCATCCGCAATAACCACTGGTACGCTAGATGCCTCCCAAATATCCGTTATTAATCTAGATGCCTCATCTATTACTACAGGAACATTTAGTGCCAATAGAATATCTGGGGGGACTATAGATGCTAGTATAATTTCTGTAATTAATTTAGATGCTAGTGCAATTACAACTGGAACGTTTAGTGCTAACAGAATAAGTGGAGGTACAATTGATGCTAGTTTAATAAGTGTAATTAAACTAAATGCTAGCAATATTACAACTGGTGAATTAGACGGTACACTTATAAAAGCACATACAATTGTAGCTGACCAAATGGTTATCGGTACAATTACAGCTGATAGTGGTATTATAGCTACTTCTGCTATAGGTACGGCACAAATTGCTGATGGTAGTATCACGGATGCTAAAGTTGTTAATTTAAGTGCTAATAGTATTACTGCTGGAACTTTAAGTGTAGATAGGTTAATTATTAGGGGTAGTGATAAAAGCATTGTTTATGAATTAAATAACATTGCTGGAGCTACACAGGTATTAAGCCAAACTACAATTAATGGTGAAGCTTTAACAGATAGAACTATTACTGCTGATAAAGTTGTAGCTAATGCAATCACTGCAAATGAGATAGCAACTAATACTATTACAGCAAATTCAGGGATTATTGCTTCAATAGATGCAAGTAAAATTACTACTGGGACATTAGATGCTTCACAAATTTCTGTGGTTAATTTAGATGCAGGTAGTATTACCACGGGGACATTAAGTGGTGATAGAATTAATGGTGGTACAATTACAGGAGTAAATATTATTGGTACTACAATAAAAACTAATAATACCGCAAATTATTTAACATTGCATGACCAACAAATATCAATATTTCAAAATTCAAATGAAATGATTAGTTTGGGGTATATGGTATATGGTTCAAATACATTACCATTAATACAAATGTTTGGTAAACATTTAATATCAAGAACTGGGGCAACTGATGATGGTACAATGACTATTGGTGCTATAAAACCTGCCGACATAACTAATGGTAAGGTATCTATTTATAACATTAGTGCATTAGGAGCTTTTGAATGTTGGGGCAATTCAAAGTTTAATGCAGATATGGAAATTGATGCAACTTTAAATGTTGTAGGCAGTAGTGGTTCCGGCAGTGGTACGGGGGCAGTAAGCACTGATTCATTATTAGTTAGAACTAACGCCAATTTCTTAAATGGTAAAGTTATAATTTCATCTAGTTATATAGATATGTATGATGCCTTATGGATGAATGGCAACAATATAATGATGAGTGGTGGAAATATTGCTAGTGCTGGAACAATATCAGCTAATAATTTTTATCGTATCGGTAAAGTACCGGCATACACATCCTCATCATTAAGTATCCCAACTGGTAATTCAGTAACTATCGCCCATAATTTAGGCTATCATCCTATAATTAGATTAAACGGAACTGTAGGAAATTTAATTGTTACCACACAAGATACTGATGTAAACCATACTAGAATTTATTGTTATAGTGGTGGTGGGGCAACATTTAATGGATACGCCTATTTTTATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a19bab384710715ebf87f3097dfcb3ceb2fb1e926b017de8da9b100e40784054
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3044
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Identification, activity and delivery of new LysFA67 endolysin to target cheese spoilage Clostridium tyrobutyricum Sanchez,C., Garde,S., Landete,J.M., Calzada,J., Baker,D.J., Evans,R., Narbad,A., Mayer,M.J. and Avila,M. 2024 37919009 GenBank