Protein

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Genbank accession
WPJ21561.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,52
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDINAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKLQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMIIFANRLWHFWEAANEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDIIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETEWVLNDVLTFNGNISYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTTPATARDTVGTNVYNKNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQSASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQAETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLTGIARIATQVEFDAGTLDNVISTPLKIKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEGALTHSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTANITGNTILGSLEVTGNSTFKNDVSVSSGKSIKFVGPQSGAGSWDSQATNFAPIFSEINSTVDASYHPIVKQRLGQGTFSLGTLNDGSGDFKIHHISSASGALKSSYWTFNTTGDFAVNSGSISISKNANITGMTTSNGVYTTTLNASALSSLQNVTTSGTIVSTGQVSANNGLVAQKYVRSVGVKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDSATFNLFPGYWTMKTKRQVNIDTVQTKPAGVSDEIWNASGWLTETGAFSSPAIRYRNEDGSFGDEVLSTTGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1350 AA
molecular weight: 146309,15960 Da
isoelectric point:5,75059
aromaticity:0,08148
hydropathy:-0,32889

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1144–1177
IPR048391 IPR048391
WPJ21561.1
1 1350
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1143 | ATT 1144-1177 | STR 1178-1235 | ATT 1236-1298 | STR 1299-1332 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage vB_SalD_ABTNLS3
[NCBI] 		3093917 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella enteritidis
[NCBI] 		149539 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPJ21561.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR756449 [NCBI]
CDS location
range 90951 -> 95003
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCAATGCTCCAGCAGGAACCTTTGTACCTGGTTATTGGACTGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACCGTAGCATCTCCTACACGCCAACTGGCTTCTGGTGAATATATTGCAGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCGAACCCTACTGATGGTGATACCATCGTAATCAAGGATATTGGTGGCCGTGTAGGTTATAATGAAATTAAGCTCCAGTCTAGTTCTGCTCCAGGTGGTGGTAATCAGAAAATTGTCCGTTTCGGTAACCAGTTCACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCCTATAATATGATTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAAGCAGCTAATGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACACCGCCCAGTTCCAATCACAAGCGGGTGATAACGTTTTACGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGTGATATTATTAAAACCGTTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAATTCCACTTAATCGTTGAAACATTTGATGCGTCATCTTCATTAGGTAAGCCTGGCCAGCATAGCATGGAATTCCGTACTTCAGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGCGACCGACAAACTCGTTTACGTGTAATTCGTGACGATGTTGAACTCTTGGCTAACGAAAGTGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACGACACCCCAGACAATTAATATCACATTACCTACCGGTGTGGCCCAGGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACAGTAAATATTAAGGCTGCCGTAGGAGATAAGATTGCTTCATCCGTCCAGTTGCTTCAATTCCCTAAACGTTCAGAATATCCACCAGAAACCGAATGGGTATTGAATGACGTACTGACCTTTAATGGCAATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACACCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCTACTATAGAACGTGTAGATTCTAAAGATGATTTAACTCGTGCTCGTTTAGGTGTTATTGCCCTTGCGTCGCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCTGAGAAAGAACTTGCAATTACTCCACAGACTTTAGCTAATCGTGTAGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTGAACCAGGACACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACTCGCCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACTAACACGGGTACAGATGATACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCACGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCACTCCTGCGACTGCTAGAGACACTGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTCGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACAGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGTCAATCGGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCTGAAACATTACATGCTCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAGACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCAGGTACGTTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGCGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACTGCTCGCCTGGCAACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACTGATGACAAAACCATCATCACTCCTTTGAAATTACACTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCAACCAATACCGAAACAACCGCAGGAACTTCTAAAGTTTTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAGACCGAAACTACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAATTAACCGAAGGTGCTTTAACCCATTCAGGAAATAAAGTTACTGGTTCTGGTGTTAAATTCAACTCAGGTACAGGCCTTTATGAGAACGATGATACTGTTCTGAACGCAGCGAACTATCCTAAAACGGGTTATGCGGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTAGATTCACTCCAGTTCATTCGTAGAGACGTCGATCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACCCTGACCAAACAATTGAACCTGGCAGCTCCTCTAGTGTCTTCTAGTACTGCTAATATTACCGGCAATACTATTTTAGGTTCTCTGGAAGTAACAGGAAATTCTACTTTTAAAAATGATGTATCTGTTAGCTCAGGTAAATCTATTAAATTTGTAGGACCCCAGTCTGGCGCAGGTTCTTGGGATTCTCAGGCAACTAATTTTGCACCTATTTTCTCTGAGATAAATTCTACTGTTGATGCTAGTTATCACCCTATTGTTAAGCAACGATTAGGGCAGGGTACTTTCTCTTTAGGTACTTTAAATGACGGTTCCGGCGATTTTAAAATCCATCATATTAGCAGTGCTTCTGGTGCTTTAAAATCTTCCTACTGGACCTTTAATACGACCGGTGATTTTGCTGTTAATAGTGGTTCTATTAGTATTTCTAAGAATGCTAATATCACAGGTATGACCACTTCTAACGGTGTTTATACAACCACACTAAATGCTTCTGCTCTGTCTTCGTTGCAAAACGTAACTACTTCAGGTACTATCGTTTCCACCGGACAGGTATCGGCAAATAATGGTTTGGTTGCTCAAAAATACGTCCGTTCTGTTGGTGTTAAACCCACATTAGCATCCCAGGCCCCTACTGCAGAAACAGTTGGCTTCTGGTCTGTTGATATCAATGATTCGGCCACATTTAACCTGTTCCCTGGTTATTGGACGATGAAAACGAAACGCCAGGTTAATATCGATACGGTCCAAACTAAACCTGCCGGTGTTTCTGATGAGATATGGAATGCTTCTGGTTGGTTGACAGAAACAGGTGCATTTAGTTCTCCGGCTATTCGTTATCGTAACGAAGACGGTAGTTTTGGTGACGAAGTTCTCAGTACGACGGGTCAGAAATTACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAGGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGACTGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCATGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACGGCAGATAACCCTCCTTCTGCGGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCTACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCCGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a3f84c26fff2fab9e327c2e83d21e3da2fba868aefee63cfab7bc3abbfbd8683
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7442
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50