Protein

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Genbank accession
WEY17523.1 [GenBank]
Protein name
tail spike protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MMENQQLIKKDRSANSYSKIFPWTFTDLVLDRVTKESLDNILVRNNFIALPYVGSKAATRLQVPMKNRRRGIWLSYIDYAGTLTVEYYNDNNLDDNHWQDSSYWLPYNTAEFQPASVGLSALAQEVFDWINSQITTAVKLNPEDLQKNSSGQIEEANRAYDTSTFSGLGYRILRKNIQSNKNILTQSMINMPNNVYKIRYDFDLNGATINLPANSVLQFVGGSIKNGTLNGNNTVIKADSNAVIFDSVVIEGTWNVEHIYDSWFAFNTSPSYISNQIITNILALSNDDVYNTIHFDADRTYYFELPYKGRANFGDDVRPNYWKLNTEEYAFLRIFTGVTSNTHLIFNNTLQMIPTNQGAYFIFHIESKENIQISGTGTINGDAKDHLYTDPFAGNNYYGEWGHVLNFRSCNDVIIRDITVGYAFGDGISLGNASYNNNGTKAAGLATKNVTVDGVKVLYARRNGISLGGNNYSITNVYFEGNGSDTIRGTAPMAAIDFENDYVDIEPSGLCKNVSMSNCKFKDNKYDVSSTIRDDLYEVPRGELVNISDCNFTSPLRLNRTNGLTFSNCHIVGITNVDNSVAAWYSSKDLIFSNCIFDELNPYLTISAEEQDKKFINPTYPEDIRYTTTFQQNMAVGRALKFTIPKPLVGEVEFTAFCSNSNYSLIQMPINTTVYTFGPSPRLTGIRDVKIKASQDSTPRYFLYKNTPVFSYINYTEDTNNFIIYFAIGGSLINDSLAGSTSVNIFLTSKTKFITIEAPVSGRPDYAGMYGGKWSQLSSIVKESIKVSDIPETVTFPSKELYEANLLADMPDNLTSDKVGKSVFVLDDTYRRPAFWDSYSNTFRTADGNRLYERAVTSQLGLDALTAKLDGTADRGYIVYITTFDSYLTWDGARWLNEDGSLFSKVKFIKATISIDTLNILFSYNVTYKIVGNIDLDGGTLTIATGSILDFQGGSFSNGTITLSNTELKGNVKLSSITLAGSCSNDITKLSWFTDDLANDYSANLQSLVNVTKVQGTVDIDSLSFIVNTTVNITKALTIRGNGTRNYYNLNIGSIRNKITTANDIVILNITSTQVRVEGITFIGAYSTLDPTTGVRLGTQALVSFSNASNCTLRNCNFLYSHIGALFTNSGIANIEDNNFAGCNAGLRLMASPDSNLINNYFNTNSGNVTFSEDNAGTLNGVGLSINASSGNINVIGGKCEWNNKGMVIANSMGVAIIGVQFDWNKSGNVIYNQTSYSLDSSILSHSITGCRFLGTPADQHIYIRYWSAANLNVCGCTFTKNASDVTAIDTSTGANEGPESIFKVVQKQEADEYRTKIHINFKGNTIYRVVNLVNAVIQSTTPGSGQLVVVSADGQTLGKIGSCTIINNIDVAKGTSQWRETAIVTNNLSTDDAGLTYFDTDLNKLVLWNGTAWTNVDGSTLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1423 AA
molecular weight: 157050,59120 Da
isoelectric point:5,13884
aromaticity:0,10822
hydropathy:-0,20998

Domains

Domains [InterPro]
DC_0777
STR
1–701
DC_0777 IPR011050 IPR006626
IPR012334
STR
333–537
IPR012334 IPR006626 DC_0190
IPR011050
STR
338–599
IPR011050 IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626
IPR006626
Unmapped
410–432
IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626
WEY17523.1
1 1423
Architecture
STR
STR 1-1423
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WEY17523.1
1 1423
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 218 218 0,9741
Central domain 219 830 613 0,8682
C-terminal 831 1423 592 0,1064
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-218
Central
219-830
C-terminal
831-1423

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Kolpuevirus frurule
[NCBI] 		3430216 No lineage information
Host Bacteroides cellulosilyticus
[NCBI] 		246787 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > FCB group > Bacteroidota/Chlorobiota group > Bacteroidota

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WEY17523.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ198718.1 [NCBI]
CDS location
range 7819 -> 12090
strand +
CDS
ATGATGGAAAATCAGCAATTAATTAAAAAGGATAGGAGTGCAAACTCCTATTCTAAAATATTTCCTTGGACCTTTACAGACTTAGTTCTTGATAGAGTTACCAAGGAATCTCTTGATAATATTCTTGTAAGGAATAACTTTATAGCCTTGCCCTATGTAGGTAGTAAGGCTGCAACCAGATTACAGGTTCCTATGAAGAATAGGAGAAGAGGTATTTGGTTAAGTTACATAGATTATGCAGGAACTTTAACAGTTGAGTACTATAATGACAATAACTTAGATGATAATCATTGGCAGGATAGTTCTTACTGGTTACCTTATAATACAGCAGAGTTTCAACCTGCATCTGTTGGTTTATCTGCATTAGCTCAAGAAGTATTTGATTGGATTAACAGTCAGATTACAACAGCAGTTAAGTTAAATCCTGAAGATTTACAGAAGAATAGTTCTGGTCAGATTGAAGAAGCTAATAGAGCTTATGACACTTCAACCTTTAGTGGTTTAGGTTATAGAATATTAAGAAAGAATATTCAAAGCAATAAGAATATTCTTACTCAATCTATGATCAACATGCCTAATAATGTCTATAAGATTAGGTATGACTTTGACTTAAATGGTGCTACTATCAATCTTCCTGCTAATAGCGTATTACAGTTTGTAGGTGGTTCCATTAAAAATGGAACACTTAATGGTAATAATACTGTTATTAAGGCTGATTCTAATGCTGTTATATTTGACAGTGTAGTTATTGAGGGTACTTGGAATGTTGAACATATCTATGATTCATGGTTTGCTTTTAACACCTCTCCTTCTTATATATCTAATCAAATTATAACTAATATATTAGCTCTTTCAAATGATGATGTATATAATACTATTCATTTTGATGCTGATAGAACTTATTATTTTGAATTACCATATAAAGGAAGAGCTAATTTTGGAGATGATGTAAGACCAAATTATTGGAAACTTAATACAGAAGAATATGCTTTCTTAAGAATATTTACTGGTGTTACTTCTAATACTCATCTTATATTTAATAATACTCTCCAAATGATTCCTACTAATCAAGGAGCTTATTTTATCTTTCATATAGAAAGTAAAGAGAATATTCAGATTAGTGGTACAGGTACTATTAATGGCGACGCTAAAGATCATCTATATACTGATCCATTTGCTGGTAATAATTATTATGGTGAATGGGGACATGTTCTTAATTTCAGAAGTTGTAATGATGTAATAATTAGAGATATTACTGTAGGATATGCATTTGGTGATGGAATATCATTAGGAAATGCTTCTTATAACAATAATGGAACAAAAGCAGCTGGATTAGCTACAAAAAATGTTACAGTTGATGGAGTAAAAGTATTATATGCAAGACGTAATGGTATATCTTTAGGGGGTAATAATTATAGTATAACTAATGTCTATTTTGAAGGAAACGGTAGTGATACTATTAGAGGTACTGCTCCTATGGCTGCAATTGATTTTGAGAATGATTATGTAGATATAGAGCCTTCTGGTTTATGTAAGAATGTCTCTATGAGTAATTGTAAGTTTAAAGATAATAAATATGATGTTTCCTCTACTATAAGAGATGATTTGTATGAAGTTCCAAGAGGCGAATTAGTTAATATTAGTGATTGTAATTTTACTTCTCCACTTCGTTTAAATAGAACTAATGGACTTACATTTAGTAATTGTCATATAGTAGGCATAACTAATGTTGATAATTCTGTTGCAGCTTGGTATTCGAGTAAAGACTTAATATTTAGTAATTGTATCTTTGATGAACTTAATCCTTATCTTACTATTAGTGCAGAAGAACAAGATAAAAAGTTTATTAATCCTACATATCCTGAGGATATTAGATATACTACTACTTTTCAACAGAATATGGCTGTAGGTAGAGCTTTGAAATTTACTATACCTAAACCATTAGTAGGAGAAGTAGAATTTACGGCATTTTGTAGTAATTCTAATTATTCTCTTATACAAATGCCTATAAATACTACAGTTTATACTTTTGGTCCAAGTCCAAGATTAACTGGTATTAGAGATGTAAAAATAAAAGCATCACAAGATAGTACTCCAAGATATTTTCTATATAAAAATACTCCTGTATTCTCTTATATAAATTATACAGAAGATACTAATAATTTTATTATATATTTTGCTATAGGTGGTAGTTTAATTAATGATTCTTTAGCTGGAAGTACTTCTGTTAATATATTCTTAACTTCTAAAACTAAATTTATAACAATAGAAGCTCCTGTAAGTGGAAGACCTGATTATGCTGGAATGTATGGAGGTAAATGGTCTCAATTATCTTCTATTGTAAAAGAAAGTATTAAGGTATCTGATATACCAGAAACTGTTACTTTTCCATCTAAAGAATTATATGAAGCTAATTTATTAGCTGATATGCCTGATAACCTTACGTCTGATAAAGTAGGTAAAAGTGTATTTGTTTTAGATGATACTTATAGACGTCCAGCTTTTTGGGATAGTTATAGTAATACATTTAGAACAGCTGATGGTAATAGATTATACGAAAGAGCAGTAACTTCGCAATTAGGATTAGACGCTTTAACAGCTAAATTAGATGGTACTGCTGACAGAGGATATATAGTATATATTACTACTTTTGATAGTTATCTTACTTGGGATGGAGCTCGATGGTTAAATGAAGATGGTAGTTTATTTTCTAAAGTAAAGTTTATTAAGGCAACTATTTCTATTGATACATTAAATATTTTGTTTAGTTATAATGTAACTTATAAAATAGTAGGAAATATAGATTTAGATGGCGGAACATTAACTATTGCTACTGGTTCTATTCTTGATTTTCAGGGAGGTAGTTTTAGTAATGGTACTATTACTCTTAGTAATACTGAATTAAAAGGTAATGTGAAATTATCTTCTATTACTTTAGCTGGAAGTTGTAGCAATGATATAACTAAATTAAGCTGGTTTACAGATGATTTAGCTAATGATTATTCAGCTAATTTACAATCTTTAGTTAATGTTACTAAAGTTCAAGGTACTGTTGATATAGATAGTCTGTCTTTTATAGTTAATACTACTGTTAATATTACAAAAGCTCTTACTATAAGAGGCAATGGTACAAGAAACTATTATAATCTTAATATAGGAAGTATTCGTAATAAGATAACTACTGCAAATGATATAGTAATTCTTAATATAACTTCAACTCAAGTTAGAGTAGAAGGTATTACTTTTATAGGTGCTTATTCTACTTTAGACCCTACTACAGGAGTTAGATTAGGAACACAAGCTTTAGTTTCTTTTTCAAATGCTTCTAATTGTACTCTTAGAAATTGCAATTTCTTATATTCACATATAGGTGCCTTATTCACAAATTCAGGTATTGCTAATATTGAAGATAATAATTTTGCAGGATGTAATGCAGGACTTAGACTAATGGCTTCTCCTGATAGTAATCTTATTAATAATTATTTTAATACTAATAGTGGAAATGTTACTTTTAGTGAAGATAATGCAGGTACTTTAAATGGAGTAGGTCTTTCTATAAATGCATCTTCTGGTAATATTAATGTTATTGGAGGTAAGTGTGAATGGAATAACAAAGGAATGGTTATTGCAAACTCTATGGGTGTTGCTATTATAGGAGTGCAATTTGATTGGAATAAATCAGGAAATGTAATTTATAATCAAACAAGTTATTCTCTTGATAGTTCTATATTAAGTCATTCTATTACAGGATGTAGATTCTTAGGAACACCTGCTGATCAACATATCTATATTAGATATTGGAGTGCTGCTAATCTAAATGTATGTGGTTGTACATTTACTAAAAATGCAAGTGATGTAACTGCAATAGATACTTCTACTGGTGCTAATGAAGGTCCTGAAAGTATATTTAAAGTTGTTCAGAAACAAGAAGCAGATGAATATAGAACTAAAATACACATTAACTTTAAAGGTAACACTATTTATAGAGTAGTTAATCTTGTTAATGCTGTTATACAAAGTACTACTCCTGGATCAGGTCAATTAGTAGTTGTTAGTGCAGATGGTCAGACTTTAGGTAAGATAGGAAGCTGTACTATAATTAATAATATTGATGTAGCCAAAGGTACTTCTCAATGGAGAGAAACTGCTATTGTTACTAATAATTTAAGTACTGATGATGCAGGACTTACTTATTTTGACACTGATTTGAATAAGCTAGTACTGTGGAATGGTACTGCGTGGACCAATGTTGATGGTAGTACATTAGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5a584f58445f46a7b00e0997449d08dc4ecd79dee01ef51e09995f403ecf7b44
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6143
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Host interactions of novel Crassvirales species belonging to multiple families infecting bacterial host, Bacteroides cellulosilyticus WH2 Papudeshi,B., Vega,A.A., Souza,C., Giles,S.K., Mallawaarachchi,V., Roach,M.J., An,M., Jacobson,N., McNair,K., Mora,M.F., Pastrana,K., Boling,L., Leigh,C., Cram,C., Plewa,W.S., Grigson,S.R., Bouras,G., Decewicz,P., Luque,A., Droit,L., Handley,S.A., Wang,D., Segall,A., Dinsdale,E.A. and Edwards,R.A. 2023 — GenBank