Protein

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Genbank accession
UGV20042.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIGTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKTVFDPTGSSEINIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQNIQGDANLLRLRNQNANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGSDEVKLYNNKYNSVLTVASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNTFSGLNTFSTSVSISSNAAAIMLKNKAVDESLFIQAKDVENNNLWYIGKGGANDNITFYDYKGDTSIVLNSSGAAFNKTVKITGQVQPSDWDNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFKSGQTIVADGQALLLRSATDSPSLYVRGQNQSGTNKWYVGFSTSNALGLSNEASGTTLTLDSAGINSNKNLNITGQVKPSDFSNLDARYFTQSASDSRYLRIRSTNFNNGNDDKWAKIATVVMPPSASTAVIEVFGGSGYNYGFPYQASKTEIVLRAGGDSPKGLNIVAWKNSENLIITDIGYVNTSGDTYDIYCRVGPFQNDTTSRVQSSSNASVQLFEAPQTFDDAPQGIVKGTIARYYTSMQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHQFGGYINSFYGDSSHTSFQPGGGAWTQAAGDHSHSVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:812 AA
molecular weight: 87306,23560 Da
isoelectric point:7,18078
aromaticity:0,09236
hydropathy:-0,37833

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–266
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 SSF88874
IPR048388
ATT
159–247
IPR048388 IPR048388 IPR048388 IPR005003 IPR005003 DC_2042
G3DSA:6.20.80.10
STR
159–218
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 DC_0387 IPR005003
UGV20042.1
1 812
Architecture
ATT
ATT
STR
RBD
ATT 1-361 | ATT 380-465 | STR 466-784 | RBD 785-812
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage ph2-2
[NCBI] 		2900271 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella paratyphi
[NCBI] 		54388 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UGV20042.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL474141.1 [NCBI]
CDS location
range 20476 -> 22914
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGGTACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACAGGTGACTTAGGAATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGACAGTATTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTAATATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTCTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTTACAAACACATTCTCTGGGACTCAGAACATTCAAGGTGATGCTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATTGAAGGTGTAAACCTAGATGGTTCGGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGTAATGGCTCTGACGAAGTAAAGCTGTACAATAACAAATACAACTCAGTCTTGACTGTTGCAAGTAATATCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAACACTTTTAGTGGTTTAAATACATTCAGTACTAGTGTTAGTATTAGCTCTAATGCTGCTGCTATCATGCTAAAAAATAAAGCTGTTGATGAGTCTTTGTTCATCCAAGCAAAAGATGTTGAAAACAATAACCTGTGGTATATTGGTAAAGGTGGTGCAAATGACAATATCACATTTTATGATTACAAGGGCGACACTTCTATTGTATTAAACTCGTCTGGTGCTGCATTCAACAAGACTGTAAAAATCACTGGTCAAGTCCAACCTTCAGATTGGGATAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAAATCTGGGCAGACAATTGTAGCAGATGGTCAAGCACTATTGTTAAGAAGTGCAACTGATAGTCCCTCTCTCTATGTTAGAGGCCAAAACCAATCTGGAACTAATAAATGGTATGTTGGATTTAGTACTTCAAATGCTCTTGGATTATCAAATGAAGCCTCTGGCACGACATTGACATTGGATTCAGCAGGTATTAATTCTAATAAGAATTTAAATATCACTGGTCAAGTTAAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAAAGTGCTAGTGATAGTAGATACCTGAGAATCAGAAGTACTAACTTCAATAATGGAAACGATGACAAGTGGGCTAAAATTGCTACTGTTGTAATGCCGCCTTCCGCATCTACTGCGGTGATTGAAGTGTTTGGTGGGTCAGGTTATAACTATGGTTTCCCTTACCAAGCTAGTAAAACGGAAATTGTTCTCAGAGCAGGGGGTGATAGCCCAAAAGGTTTAAATATTGTTGCTTGGAAAAACTCGGAGAATCTCATTATTACGGATATCGGTTATGTTAATACATCTGGTGATACTTATGACATTTACTGTAGAGTTGGTCCATTCCAAAATGACACAACATCAAGAGTTCAATCTTCTAGCAATGCAAGTGTGCAATTGTTTGAAGCCCCACAAACATTTGATGATGCTCCACAAGGTATTGTAAAGGGTACAATTGCAAGATACTACACAAGTATGCAAAAACCAACCCCTTCAGATATCGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACCGCACTTCCTGGATTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGGATTGCAGCAGCGAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACATTAGCAGTTGGAAACTTGCCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCATACTCACCAGTTCGGCGGTTATATCAACTCGTTCTATGGAGACTCCAGTCACACCTCATTTCAGCCTGGAGGTGGTGCGTGGACACAGGCCGCTGGCGACCATTCCCACTCTGTAGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTAGTACAGGCTCTGGTTCGGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a0ace64d3ba0491b324e4cd7853550c5264f527f5c688dbcb549b1fb479b82de
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6953
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Application of a broad-spectrum lytic myophage to combat against multidrug resistant Salmonella and Salmonella infections Peng,Z. 2022-07-12 — GenBank