Protein

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Genbank accession
WKC55240.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MADLEKIQFLRSTVAGKTPTTSQLADGELAINMADYAIYTKNGSSVVQLAGKGIPETNTKKLTVDGPSALNDTVTVAEGKTITFTNENLSGEITRHIVGKCARNDGWYIGSGGTSNNGILEIGTIDDGTGTIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTSIPGELMLPNRKRVLIADSDGNNKFAAGVGTSDVWIRNMKSGTSAVLQLKDGGNITFNDNQVYYAMNGKGPGKDGTLLTNVENARQLEQDNFPISSGTEARWTKVALLKDPRSNQSRLQLMVTNGGNYGSTRGSIDFIDCSARNFPSTLTSANIRNHLQVRRIGDPGIDNTNQMRYSLVRTSEGLELWFMQRAFISSVKVALLSIAGDTQYYLPTGYTTSATAPEGLVESVAIRIYDEINKPNLDNGTDGILSIAKGGTGASTADAARTNLGLGTAATRDVGEGARNVLENGAYGLGGNGGKSINDIISNADMLTRLKSYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYNHGSGIFMNAGDTMSAINIDYTSAKVRVYAANNSGLAAGNVKYNELYGTANKPTKDDVGLGNLTNDAQVKKAGDTMSGDLLISKESPGLFLNATNDTGNSVIWFRNKGVETGAVWAIPNTESSGEVRIRARTTAGVTGGEFKFKSDGTFTSPGDVNITSGAFNGKSINTQYANFNNTSSTTTEQTVTISGSQHTPLLLNRSTDSNLSIGFKLSGMNMKRLGIDVNGDIHYGEAENQANNAWLLTSDTVNRWIVNFGRDINVAGVVNSTGGFAGPVAAYDLADVKLDLNDLTLTGATPGHVKVYSCPSMGGGNNITNKPSGVGGNFIVIVECLRKVSGTDYTNRQVLRASDNSRSWERWLNVSGTTKAWTPWRMNVVNGNDDDVSFKSVTTTTGNLNSGNDLIVANNARVGGNLGLGGASSTKYADKGVVIGKGSALLETTDGRVIIGSSGGGNAVELRPGGPTQTNNRIKVTATSGSGGDTAIEYEQGAKIRANNGGDLIVSAKAGQAIYLRPQGDASSTNETRIDANGSITINGNINANGTLTCTGGAVNGDLTVSGKVDITGNQLKTTSLWVTGDTAVNGALTVDGRARFNQEFIVSTSVNVQNTGNSHLVFRKADGTEKGLIWADEPGSVSIRAGGVSGPTWNFWNSGSCQFPGAISNFNGVNSTTNYPGGGSGAYLNTAGLTSRFSNGAYVSLYLQEYVGNYHQAILKVNGYGRDDNFYFRAGGDFFCTRNGSFDNVEIRSDLRAKSDVKVIENALEKVETLSGNTYVLHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDNEEDGGMLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKNLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1341 AA
molecular weight: 141516,19170 Da
isoelectric point:5,96243
aromaticity:0,06637
hydropathy:-0,33460

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
2–598
DC_1942 DC_0246
DC_1942
ATT
577–690
DC_1942 cd19958 IPR030392
IPR030392
CHP
1241–1296
IPR030392 Coil
WKC55240.1
1 1341
Architecture
ATT
RBD
STR
RBD
ATT 2-690 | RBD 691-781 | STR 782-868 | RBD 869-1341
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WKC55240.1
1 1341
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 360 360 0,0539
Central domain 361 563 204 0,3019
C-terminal 564 1341 777 0,6267
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-360
Central
361-563
C-terminal
564-1341

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage R2_1
[NCBI] 		3059687 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WKC55240.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR138016.1 [NCBI]
CDS location
range 55966 -> 59991
strand +
CDS
ATGGCTGATTTAGAAAAAATTCAATTCCTACGTAGCACAGTTGCGGGGAAAACACCTACTACAAGTCAGCTTGCAGATGGTGAACTGGCGATCAACATGGCTGATTATGCCATTTACACGAAAAATGGTTCTTCGGTCGTTCAGTTAGCGGGTAAAGGTATCCCAGAAACAAATACCAAAAAATTAACAGTTGATGGGCCTAGTGCTCTTAATGATACCGTTACCGTAGCGGAAGGTAAAACTATTACTTTCACCAACGAGAATTTAAGTGGTGAAATAACTCGTCATATCGTCGGTAAATGTGCCCGCAATGATGGATGGTACATCGGTTCCGGTGGTACAAGCAATAACGGCATTCTTGAAATCGGTACTATTGACGATGGTACTGGAACAATCCAGTTTGTACAACGCGGTGCAGGCAACGTTGAAGCCCGAAAACTGGTCTTGCTTGACGGCTCGGGTAATACTTCTATTCCGGGAGAGTTAATGCTTCCTAACAGAAAGCGTGTATTAATTGCTGATAGTGACGGTAATAATAAATTTGCTGCGGGCGTAGGAACTTCTGATGTCTGGATCAGAAATATGAAGAGTGGTACTTCTGCTGTTCTTCAATTGAAAGATGGTGGAAATATCACATTTAATGATAACCAAGTTTATTACGCTATGAATGGAAAAGGCCCTGGTAAAGATGGTACTCTTCTGACTAATGTAGAAAACGCGCGTCAGCTTGAGCAAGATAATTTCCCTATATCTTCAGGCACCGAAGCTCGGTGGACTAAAGTTGCTCTTTTAAAAGATCCTAGATCAAACCAGAGTCGCCTGCAACTGATGGTGACTAACGGCGGTAACTATGGTTCTACGCGTGGATCTATCGACTTTATCGATTGTAGCGCTAGAAACTTTCCATCCACTTTAACAAGCGCTAATATTCGTAATCATCTACAGGTTCGTCGAATCGGTGATCCTGGAATTGATAACACTAACCAAATGCGTTATAGTCTGGTTCGTACCTCTGAGGGTTTAGAACTGTGGTTTATGCAACGCGCATTCATTAGTAGTGTTAAAGTTGCTCTGCTGTCTATTGCTGGCGATACTCAGTATTATCTGCCTACTGGTTACACAACTTCTGCAACTGCTCCGGAAGGTTTAGTTGAGAGTGTGGCTATTCGTATCTATGACGAAATTAATAAACCTAACCTTGACAATGGTACTGATGGTATTCTGTCTATTGCTAAAGGTGGTACAGGCGCAAGTACAGCGGATGCTGCTCGTACAAACTTAGGGTTGGGTACTGCTGCAACCCGCGATGTCGGCGAAGGTGCTCGTAATGTTTTAGAAAATGGCGCTTATGGCTTAGGCGGTAATGGTGGTAAATCCATTAACGACATTATCTCTAATGCGGATATGTTGACCCGCTTAAAATCATACGGCGGTACTTTCTGGCGTGGTGTTACTAAATCTGGCGTTAGTGTTCAAAACGGCCTTTATAACCACGGCTCCGGTATTTTTATGAATGCTGGTGATACCATGTCAGCCATTAATATCGACTACACTAGTGCTAAAGTTCGCGTATACGCAGCTAACAACAGTGGTCTTGCCGCAGGAAATGTTAAGTACAATGAACTTTACGGCACAGCAAACAAACCGACAAAGGACGACGTAGGGCTTGGTAATCTGACAAATGACGCTCAGGTTAAAAAAGCCGGTGATACAATGTCTGGTGATTTGCTTATCAGTAAAGAGTCACCTGGGTTATTTTTGAATGCCACTAATGATACCGGAAACTCTGTAATTTGGTTTAGAAACAAAGGAGTTGAGACAGGTGCTGTATGGGCAATACCTAACACAGAGTCTTCGGGTGAGGTTCGAATTCGTGCTAGAACGACTGCTGGGGTCACAGGCGGCGAGTTCAAATTTAAATCTGACGGTACATTTACATCACCAGGTGATGTAAATATCACCAGCGGTGCTTTCAACGGCAAAAGTATCAACACTCAGTATGCGAACTTTAATAACACAAGTTCAACCACAACCGAACAAACCGTTACTATTAGTGGTTCGCAGCACACTCCGCTGTTACTGAATAGATCGACTGACTCGAACTTGTCTATCGGATTCAAACTTTCCGGAATGAACATGAAACGTTTGGGTATTGATGTAAACGGTGATATTCATTACGGTGAAGCAGAAAACCAGGCAAACAACGCATGGCTGTTGACTTCGGATACAGTAAACAGATGGATTGTTAACTTTGGTCGTGATATTAACGTTGCTGGTGTGGTTAATTCGACTGGTGGATTTGCTGGCCCTGTCGCAGCGTATGATTTGGCTGATGTTAAACTAGATCTTAATGATTTAACGCTAACTGGCGCTACCCCAGGCCATGTTAAAGTTTATTCATGCCCTAGTATGGGTGGCGGTAATAACATCACCAATAAACCTTCTGGCGTCGGTGGTAACTTTATTGTTATCGTTGAATGTCTCCGTAAAGTGAGCGGTACTGATTACACTAACCGTCAAGTATTACGCGCATCGGACAATAGCCGCAGTTGGGAACGTTGGTTAAATGTTAGCGGTACTACTAAAGCCTGGACACCGTGGAGAATGAACGTTGTTAACGGAAACGATGATGATGTATCATTTAAATCTGTTACCACGACTACAGGAAACCTGAACAGCGGAAATGATTTGATTGTTGCTAACAACGCTCGCGTAGGTGGTAACTTAGGGTTAGGTGGTGCTTCTTCCACGAAATACGCTGATAAAGGTGTTGTGATTGGCAAAGGTAGTGCTCTGTTAGAAACTACTGATGGTCGTGTGATTATTGGTAGTTCTGGTGGTGGTAATGCTGTTGAATTGCGTCCTGGTGGCCCAACTCAAACCAACAACAGGATCAAAGTAACTGCTACCTCTGGAAGTGGTGGTGATACTGCGATCGAGTATGAACAAGGCGCTAAAATTCGTGCTAATAATGGTGGTGATTTGATTGTTTCTGCTAAAGCAGGTCAAGCAATTTATCTGCGACCGCAAGGTGATGCATCCAGCACAAACGAAACCCGTATTGATGCAAACGGTAGTATCACGATTAACGGCAATATTAACGCCAACGGTACATTAACTTGTACTGGTGGTGCTGTTAACGGAGACTTGACTGTATCAGGAAAAGTAGATATCACTGGAAACCAGTTAAAGACTACATCGCTCTGGGTTACTGGAGATACTGCTGTTAATGGTGCTTTAACTGTTGATGGAAGGGCTAGGTTTAATCAAGAGTTCATTGTATCAACTTCGGTTAACGTCCAGAACACTGGTAACAGTCATTTGGTCTTCCGTAAAGCTGATGGTACAGAAAAAGGACTTATTTGGGCTGATGAGCCTGGTAGCGTTAGTATAAGAGCAGGTGGTGTCTCTGGGCCAACGTGGAATTTCTGGAACAGTGGTTCTTGCCAATTCCCAGGTGCTATTAGTAACTTTAATGGTGTTAATAGTACTACTAATTACCCTGGCGGCGGAAGTGGCGCGTATTTAAATACCGCTGGCTTAACAAGTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGTTTCCTTATACTTACAAGAATATGTAGGAAATTATCACCAGGCTATTCTTAAAGTTAACGGCTATGGTCGAGATGACAATTTCTATTTCAGGGCCGGCGGTGACTTCTTCTGTACTCGTAACGGTTCTTTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCTTAGAGCTAAATCCGATGTTAAAGTTATCGAAAACGCTTTGGAAAAAGTAGAAACCTTATCTGGTAATACTTACGTTCTTCATAACACTTCTGGCGGTACTACTCGTTCTGCGGGTTTGATCGCGCAGGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAAGATAATGAAGAAGATGGCGGTATGCTTCGTCTGAATTATAACTCAGTAATTGCACTTCTCGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCCGAAGTTAAAAATCTTAAAGCAGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0e39935f58bbd7b8b083e3f64b7704cd725de103aa3d4235a67cdb8a8a635b53
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5270
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50