Protein

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Genbank accession
QBX27515.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
Protein sequence
MQITFYDKDMNETATADNALLNAIKIKKASLTSYFEEATHSVEFEFSKETGDWWGIHKNGFLAFMFKGDFYRFNIVKFKEDAKTNTINIIGDYFNLEMLNENCLPYQKQPARTIYQHLLAMEILPYANFELGVNELASSSRVLEFTGEDLKYKRLISIINAFGGECQFRIQQKPNGDFDKLMLDIFRENDGINYQGVGKDRTDFEINVDNSNNVVVSNDITAVITSLEPIGKDGLRLGNRGTVWKNKYGEVEFEQRNNRIYAVKAAQEMPRVLDTDKYLLWKQIFEIDNLEKLESEGYKWLKNNCYSKDTVEVTGSFNVGIGDTVVINHKGIGKYGLLGSLRVSKIVWDLLDETNEVTFANFKKLSSQISAIGLALQDSIKNLETYNIKFNMTSGTVFRNNYGQTRIIPRLYRNDTLVNNSSWLWHFKGNDYNQDSFTVNATDVSLNEKLEVSAILNGEIVKTDTLFFTNIMDNGQINTTDGKEYSYPLFTMAAHDDGVVRPEIKGSTVSKNGRALDTKVEIVTSHYPMYDRAVNFDTLVNLKAKIKDWSDGYFDFLQHNTSDISPLAINSLGLVGGSYITDDPKTSYTPPTTGTSEAQLLVLRGLLRQYIATQDSKWKILAEKVTNGLLNYYYPTETIPLTSDASWVPHWLVNVTEPFISREYFTDGLAIFENGIATININMINKVYSVRSKDSTLEYIWSPDSPVIGTSYEIEKTVISDDSTNATIILKDKTFNGEALFVYSSNTGITINVGDKCEAFPVWRPLNPGEIACAVDTLPWALECFQLWFEITNDTKWLNAIDCTKAAILNVSNVTNTIYYLKAGLNEEPVLKNGITNYSERQPKETYTNLDGIITIDYQAVDDQSEGSIGTWVGNKVPLNSERWIEAQIKSDKVEKLTLKIDEEETFDASKRWKCDFYTSGINVLQTLTFKHDDFYKDDKVLWGSHYGHDANSSHITSANSSVTTTEKIIGQKKITEFNFKRGDEGGWLGWSQSMLSIWGVKLPFDIKYKTNSRIYFRVNDSDGKNWSYELPKTGDVFKTITLTESLVAQGGTMSSGDYQSIILESIDENTAIQIEYFGTLDFLDKFYYSTIHLSYSGTESLQVGLKYLKPAPSRDDLPYAPYIMPFDMHYINYELSNLRGAIYSGYQAPWIYQESIFDDAQKALNTNLQFLNDSQNAYKNLTGFDGFFAPIFWWDYLDDASGHEKNTFGIKGNWGNVWGGFQYRTVSDVAKVFVKDTVNLQAYHIVIRFLRGVKKYWDNTLIDFPTAFVENSKPYNDQKDPHMVTNLMRALSYTLKYENLSTDDLTLIEDLFEKCINYLHYNWIESNGFSYSLLEGTWTPDIVNKTWFEYWGGDILDTLGLLQISDLSRLEKAFSYALNKETNKTIKFKLDSVESLSQDDRLYLDYSDEKWKFYNNKTGLTSTLSDNDQYKMNNIKTYEGGTYLYLNTDKDIRPLFKGEFKSAQWYLNYKIQNELQKQSTLSTSVKNTLVDLLLKMNKTQILSNEDLDKLLDSLV
Physico‐chemical
properties
protein length:1516 AA
molecular weight: 173389,76530 Da
isoelectric point:4,99952
aromaticity:0,12665
hydropathy:-0,41075

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage Javan394
[NCBI] 		2548147 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus parauberis KRS-02083
[NCBI] 		1207545 Bacillota > Bacilli > Lactobacillales > Streptococcaceae > Streptococcus > Streptococcus parauberis

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX27515.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448927.1 [NCBI]
CDS location
range 30427 -> 34977
strand +
CDS
GTGCAGATAACATTTTATGATAAAGATATGAATGAGACGGCGACTGCTGACAATGCATTATTAAATGCTATAAAAATAAAAAAAGCATCATTAACATCATATTTTGAAGAGGCAACTCACAGTGTTGAATTTGAGTTCTCAAAAGAAACTGGTGATTGGTGGGGAATTCATAAAAATGGTTTTCTTGCCTTTATGTTTAAGGGAGATTTTTATAGATTTAACATCGTTAAATTTAAAGAAGATGCTAAGACAAATACAATTAATATTATAGGTGATTACTTTAACCTAGAAATGTTAAATGAAAACTGCTTGCCATATCAAAAACAGCCAGCTAGAACAATATACCAACATTTGTTAGCGATGGAGATTTTACCATATGCTAACTTTGAACTTGGTGTTAACGAATTAGCATCAAGTAGCAGAGTTCTTGAATTTACTGGTGAGGATCTTAAATATAAACGGTTAATTTCGATTATCAATGCTTTTGGTGGAGAGTGTCAATTTAGAATTCAGCAAAAGCCCAATGGTGATTTTGATAAGTTAATGTTAGATATATTTAGAGAAAATGATGGTATAAATTATCAAGGAGTCGGAAAAGATAGAACAGATTTTGAAATTAATGTTGATAATTCTAACAATGTTGTAGTATCAAATGATATCACAGCAGTCATAACATCTTTAGAGCCTATTGGTAAAGATGGTTTAAGACTCGGTAATAGAGGAACAGTTTGGAAAAATAAATATGGTGAGGTTGAATTTGAACAAAGAAATAACCGAATATATGCCGTGAAAGCAGCTCAAGAAATGCCAAGAGTGCTAGATACAGATAAGTATTTACTTTGGAAACAGATTTTTGAAATTGATAATTTAGAGAAACTTGAATCTGAAGGGTACAAGTGGCTAAAAAACAATTGTTATTCTAAAGATACTGTGGAAGTAACAGGATCATTTAATGTAGGTATAGGAGATACAGTTGTTATTAATCATAAAGGTATTGGTAAATATGGATTATTGGGGTCATTGAGGGTTTCAAAAATTGTTTGGGATTTATTGGATGAAACAAATGAAGTAACATTTGCAAATTTTAAAAAATTATCATCTCAAATATCAGCAATTGGTTTAGCTTTACAAGATAGCATAAAAAATCTTGAAACCTATAATATTAAATTCAATATGACCTCAGGGACTGTTTTTAGAAATAATTATGGTCAAACAAGGATTATTCCAAGATTGTATAGAAATGATACGCTAGTAAATAATTCAAGTTGGTTATGGCATTTCAAAGGTAATGATTATAATCAGGATTCATTCACAGTAAATGCTACCGATGTAAGTTTAAATGAAAAACTAGAAGTTTCTGCTATTTTAAATGGGGAAATTGTAAAAACTGATACACTGTTTTTCACTAACATTATGGATAATGGACAAATTAATACTACCGATGGTAAAGAATATTCATACCCCTTATTCACAATGGCAGCTCATGATGATGGGGTAGTAAGACCTGAAATTAAAGGGAGTACAGTTAGTAAAAATGGAAGAGCGCTAGATACAAAAGTAGAAATAGTAACCTCTCATTATCCAATGTATGATAGAGCAGTTAATTTTGATACTTTGGTAAATTTAAAAGCCAAAATTAAAGATTGGTCAGATGGTTATTTTGACTTTTTGCAACACAACACATCTGATATTTCTCCTCTTGCAATAAATTCATTAGGACTTGTTGGCGGTTCCTATATAACGGATGATCCAAAGACATCATATACACCTCCAACAACAGGAACATCTGAGGCTCAATTACTGGTATTACGTGGACTATTGAGACAGTATATTGCTACACAAGATAGTAAATGGAAAATATTGGCAGAAAAAGTCACAAATGGGTTGCTGAATTATTATTATCCAACAGAAACTATACCTTTAACTAGTGATGCTAGCTGGGTTCCTCATTGGTTGGTCAATGTAACAGAACCATTTATATCAAGAGAATATTTCACAGATGGTTTGGCAATCTTTGAAAATGGAATAGCAACTATTAATATCAATATGATAAATAAAGTCTATTCTGTACGTTCAAAAGATTCAACTCTTGAATATATTTGGTCGCCTGACTCACCTGTTATTGGTACTAGTTATGAAATAGAAAAAACAGTAATTTCAGATGACAGTACAAATGCAACAATTATATTAAAAGATAAAACTTTTAATGGTGAGGCTTTGTTTGTGTATTCATCAAATACAGGTATAACAATCAATGTAGGGGATAAATGTGAGGCTTTCCCAGTTTGGCGCCCATTAAACCCGGGAGAAATTGCATGTGCGGTTGATACTTTACCTTGGGCATTGGAATGTTTCCAATTATGGTTTGAAATTACTAATGATACTAAGTGGTTAAATGCAATAGATTGTACAAAAGCTGCTATCTTAAATGTATCTAATGTCACAAATACAATATATTACTTAAAAGCAGGTTTGAATGAAGAACCAGTATTAAAAAATGGAATAACAAATTATTCAGAACGACAACCAAAAGAGACTTACACAAACCTAGATGGTATTATTACGATTGATTATCAAGCGGTTGATGATCAAAGTGAGGGGAGTATAGGTACATGGGTAGGAAACAAGGTGCCTCTGAATTCTGAAAGATGGATTGAGGCTCAAATTAAATCAGATAAAGTTGAAAAATTGACTTTGAAAATTGATGAAGAAGAAACTTTTGATGCAAGTAAACGCTGGAAGTGTGATTTTTACACAAGTGGAATTAATGTGTTACAAACATTGACATTCAAACATGACGACTTTTACAAAGATGATAAGGTTTTGTGGGGGTCACATTATGGACATGATGCTAATAGTTCCCATATAACTAGTGCTAATAGTAGTGTTACTACCACTGAAAAAATTATTGGTCAGAAAAAGATAACTGAGTTTAATTTTAAGCGTGGAGACGAGGGAGGCTGGCTTGGATGGTCGCAAAGTATGCTATCAATTTGGGGAGTCAAACTACCATTTGATATAAAGTACAAAACTAATTCAAGAATATATTTTAGAGTTAATGATTCTGATGGTAAAAATTGGAGTTATGAGCTGCCTAAGACAGGTGATGTTTTCAAAACAATTACACTAACAGAAAGCTTAGTTGCTCAGGGAGGAACAATGAGTAGTGGTGACTATCAATCAATTATTTTAGAGTCAATTGATGAAAATACTGCGATTCAAATAGAGTATTTTGGAACTCTGGATTTTTTAGATAAATTCTATTATTCAACAATACATCTTTCTTATTCGGGCACAGAATCGTTACAAGTGGGATTGAAATATCTAAAGCCTGCACCATCTAGAGATGATTTGCCATATGCACCATATATCATGCCTTTTGATATGCATTACATAAATTATGAACTTTCAAATTTAAGAGGTGCAATTTATTCAGGATATCAAGCACCATGGATATATCAGGAAAGCATATTCGATGATGCTCAGAAAGCATTAAATACAAACTTACAATTTTTAAATGACTCTCAAAATGCATATAAAAATTTAACTGGATTTGATGGTTTCTTTGCCCCAATTTTTTGGTGGGATTATTTAGATGATGCTAGTGGTCATGAAAAAAATACCTTTGGAATAAAAGGTAATTGGGGTAATGTTTGGGGTGGCTTTCAATATAGAACAGTGAGTGATGTGGCAAAAGTATTTGTAAAAGATACTGTAAATTTACAAGCTTATCATATTGTTATTAGATTTTTAAGAGGTGTCAAAAAATATTGGGATAACACTTTAATTGATTTTCCAACAGCATTTGTAGAAAATTCAAAACCCTATAATGATCAGAAAGATCCGCATATGGTAACAAATCTAATGAGGGCTTTGTCTTATACTTTGAAATATGAAAATTTATCAACTGATGATTTAACACTAATTGAAGATCTATTTGAAAAGTGCATTAATTACTTACATTATAACTGGATAGAATCCAACGGCTTTAGTTACTCATTATTAGAGGGTACTTGGACACCTGATATAGTTAATAAAACATGGTTTGAATATTGGGGTGGGGATATACTAGATACATTAGGATTATTACAAATATCTGATTTGTCACGCTTAGAAAAAGCATTCTCATATGCTTTGAACAAAGAAACCAATAAAACCATCAAGTTTAAATTAGACAGTGTTGAGTCATTATCCCAAGATGATAGATTATACCTTGATTATAGTGATGAAAAATGGAAATTTTATAACAATAAAACTGGTTTAACAAGTACTTTAAGTGATAATGATCAGTATAAAATGAATAATATCAAAACTTATGAGGGTGGAACATATCTATATCTAAATACAGATAAGGATATTAGGCCGCTGTTCAAGGGAGAATTCAAAAGTGCACAGTGGTATTTGAATTATAAAATTCAAAACGAGTTGCAAAAACAATCAACATTATCAACTAGTGTAAAAAATACTTTAGTTGATTTATTGCTAAAAATGAATAAAACTCAGATATTATCAAATGAAGACTTAGATAAATTACTTGATAGCCTTGTCTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
72d2b1838ae52fe3b79c68f5368626378dcd43b2d0a0f1279942a579d93a5ee0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8115
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Prophages and satellite prophages are widespread among Streptococcus species and may play a role in pneumococcal pathogenesis Rezaei Javan,R., Ramos-Sevillano,E., Akter,A., Brown,J. and Brueggemann,A.B. 2018-12-20 — GenBank