Protein

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Genbank accession
CAH1089612.1 [GenBank]
Protein name
adhesin for cattle intestine colonization
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,60
Protein sequence
MGTGDVLDGTDGFVVDTLAPAPVITIDPVTNAITIDFGEAVNAVDGSPLTADALEGLLDIANGTLTGLVDNGDGSFSGTLVPAADFEGDVVVNVPAGIVTDVAGNANLTATESLTVDTLAPTLVISATDTNLSLGESTTISFTFSEAVSGFDIDDITPVGGTLSNLVQSTTNPNVWTATFTQDGTLTAPSISVADDAYTDLAGNLGKGDVFDGTDGFVVNTIDAINDNVTFDPGTFVSTIWDAPIIAQDINVLDTSIIGDTSMNVEFSVPRNSADIGTGHEGDVVIQVSQDNLIAVASGFSVLVEYFDGANWVQYTTATTTNGGLIADALGLGVLGIVDDGKTIAVHLTGVPEGQYRVVVQNDSSAIGDLLDDLTLAQLGDQGILLGADNQDAVLDAVETALNGQVLNLGTLVRNVLEPLLNIANAAGETLAVTDIVAAIVKIPLVGSLLGGVDTVLDYIADALVDNLLSVLEFTNVTINGSETYYTTPQVSGNVFDDNGSGADDRGNSDAALVTKVDGVDVPTDGTDAVIKGLYGTLYINKDGVYRYVLNGSVDSNGQVDDFTYTLSDGTHSDTAVLTISVADVIAPKAPIVSSLDETTVTGVAGAAEANSVINVYGGTDSDGDGIPDTLLGTTTANPDGSYTVTLNPAIALGDTVVVTSKDAAGNISTPTIASLHNIVALDDPNQTNYELSTTADRPNISGGIFTLANAGVLGDLIDLDLSATSAPGVTVGTNEQITLTLTASGSTGLDISAVGNLIDAILGGNIGGSLDLIIAKQTSTGSYEVYNTIANAYTLNNNVLTFTASGSQSISLDDAGVYKFILAPNSSTSSALSNLLSLNLLGNLILSSNDVVATINNTDLITGNVLSNDTAAPIGLDLSIVSIKETTAGVDETVVSGTPKVIEGMYGTLTIDSTGAYSYQMTANATALGKVEAFTYTVQDNDGHSKQATIYIRLDSNLVTLDWTGKTGLEEANKLVTQLTADNKASAGTVTTLFDQVLNGSGDSSNSIQVTGSNGVLPTSPPETGSTAIPDDSGRFTLGAGQTAYISFTSILPSNVTQDFGFLGGGNQTSAYNVVIELERDGGTLAFDTQLATWTSTTSGTKYYYKVTNTGNSSANYDLNIGYGDGSIAYNWTNTTGKTFGINNIQLDIKDTTYTASSVSGDLISNDILYSSVFKIGVAAGSTTPSNYLDANSTPIVGAYGTLTVNLDGTYSYQANGKIADLGKDDVFTYKIETLDGTVNTQTLTIKVDADNVLIGTPDAGTTGNDIAVSQSANEVFTLGDGADLLIYNVLNGSSPTGGNGTDQWLDFNMSEGDKIDVSSLLSGATTDNINNYLSVSISGNQVTLLVDRDGSSGGISTPTALLTLTNEDHATNPITSLVDLLNNNSIIY
Physico‐chemical
properties
protein length:1390 AA
molecular weight: 142716,01970 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,05899
hydropathy:0,11022

Domains

Domains [InterPro]
PTHR34677
Unmapped
19–206
PTHR34677 IPR041498 PF17963 IPR010221 IPR019960
IPR044048
STR
30–115
IPR044048 IPR044048 IPR010221
CAH1089612.1
1 1390
Architecture
STR
STR
STR
STR
STR 30-115 | STR 117-208 | STR 587-672 | STR 850-953 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage MD-2021a
[NCBI] 		2899278 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAH1089612.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
CAKLQF020000019 [NCBI]
CDS location
range 14 -> 4186
strand +
CDS
TTGGGTACAGGCGATGTACTCGATGGTACGGACGGCTTTGTGGTTGATACGCTAGCTCCGGCACCGGTGATTACGATTGATCCTGTAACGAATGCAATCACGATTGACTTTGGTGAAGCAGTCAATGCGGTTGATGGCAGCCCGCTTACGGCAGATGCGCTTGAGGGATTGCTGGACATTGCTAACGGCACATTGACCGGCCTTGTAGACAACGGCGATGGCAGCTTCAGCGGTACGCTGGTACCGGCTGCGGACTTTGAAGGCGATGTGGTTGTGAACGTACCGGCAGGTATTGTTACGGACGTGGCAGGTAATGCCAACCTGACTGCAACAGAGAGCCTTACGGTCGATACATTGGCGCCGACACTTGTAATCAGCGCAACTGATACGAATCTATCCTTGGGTGAATCGACAACAATCAGCTTTACGTTTAGCGAGGCGGTCAGTGGCTTTGATATTGATGACATCACGCCCGTAGGCGGTACGCTGAGCAATCTGGTCCAAAGTACAACCAACCCGAATGTCTGGACAGCTACGTTTACTCAAGACGGTACTCTAACTGCACCAAGCATCAGTGTTGCAGATGATGCCTACACGGACCTTGCAGGTAACTTGGGTAAAGGCGATGTATTCGATGGTACGGACGGCTTTGTGGTTAATACCATTGATGCTATTAATGATAATGTAACGTTTGATCCAGGTACGTTTGTAAGTACTATTTGGGACGCACCAATAATAGCTCAAGATATTAATGTTCTTGATACCTCTATTATTGGTGATACTTCAATGAATGTTGAGTTTTCTGTCCCTAGAAATAGCGCAGATATTGGTACAGGTCATGAAGGTGATGTTGTTATTCAAGTAAGCCAAGACAATTTGATAGCAGTTGCTTCCGGGTTTAGTGTATTAGTCGAATATTTTGATGGGGCTAATTGGGTACAATACACCACGGCTACAACTACAAATGGAGGTTTAATTGCTGATGCGCTTGGTTTAGGGGTTTTAGGTATTGTAGATGATGGCAAAACAATAGCTGTGCATCTAACAGGTGTACCAGAAGGTCAATATCGTGTTGTAGTGCAGAACGATAGTAGTGCTATTGGTGATTTATTAGATGATTTAACATTAGCACAACTAGGTGACCAAGGTATTTTATTAGGAGCTGACAATCAGGATGCTGTATTAGATGCGGTAGAAACTGCCTTAAATGGTCAAGTATTAAATTTAGGAACTCTAGTAAGAAATGTTTTAGAACCACTGTTAAATATTGCTAATGCTGCTGGTGAAACATTAGCTGTGACTGATATTGTCGCAGCAATTGTGAAAATACCATTAGTTGGTAGTCTTTTAGGTGGTGTTGATACTGTTTTAGATTATATTGCAGACGCATTGGTTGATAATTTACTTAGTGTACTTGAGTTTACCAATGTAACCATCAATGGTTCAGAAACTTATTACACTACACCACAAGTATCAGGTAATGTTTTTGATGACAATGGATCTGGAGCAGATGATCGTGGTAATAGTGATGCAGCACTTGTGACCAAAGTAGATGGAGTTGATGTCCCTACTGATGGTACAGATGCCGTGATTAAAGGTTTGTATGGTACCTTGTATATTAATAAAGATGGTGTTTATCGTTATGTGCTGAATGGTAGTGTAGATTCTAATGGTCAGGTAGATGATTTTACTTACACTTTATCAGACGGTACTCACTCAGATACAGCCGTTTTAACTATAAGTGTGGCAGATGTTATTGCACCAAAAGCACCAATTGTTTCTTCATTGGATGAAACCACCGTTACTGGTGTTGCTGGAGCTGCGGAAGCTAATAGTGTTATTAATGTCTATGGTGGTACAGACAGTGATGGCGATGGTATTCCGGATACATTACTTGGTACAACTACAGCTAATCCTGATGGTAGTTATACAGTCACGTTGAACCCTGCAATCGCTTTAGGGGACACAGTGGTTGTTACTTCAAAAGATGCGGCTGGCAATATTTCTACACCAACAATTGCAAGTCTGCATAATATTGTCGCGCTTGATGATCCTAACCAAACTAACTATGAGTTATCTACTACAGCAGATCGTCCAAATATTAGTGGTGGTATTTTTACTTTAGCTAATGCTGGTGTTCTTGGAGATTTAATTGATTTAGATCTGAGTGCTACATCCGCTCCTGGTGTGACTGTCGGTACAAATGAACAAATCACTTTAACATTAACGGCAAGTGGGTCTACTGGTTTAGATATAAGTGCAGTTGGGAATTTAATTGATGCTATTTTAGGTGGAAATATTGGTGGTAGTCTTGATTTGATTATTGCTAAACAAACATCAACAGGTAGCTATGAAGTTTATAATACTATTGCTAATGCATATACGTTAAACAATAATGTTTTAACTTTTACCGCGTCTGGTTCGCAATCCATATCTTTGGATGATGCTGGTGTCTATAAATTTATTCTTGCTCCAAATTCCTCAACCTCGAGTGCTTTAAGTAACTTATTATCTCTGAACTTATTAGGTAATTTAATATTATCGTCTAACGATGTAGTAGCAACCATTAACAATACAGATCTTATTACTGGTAATGTTTTATCTAATGATACTGCTGCACCGATAGGTTTAGATTTGTCAATTGTTTCCATTAAAGAAACTACAGCAGGTGTAGATGAAACTGTAGTGTCTGGTACTCCTAAAGTCATTGAAGGGATGTATGGTACTTTAACTATAGATTCAACTGGTGCATATAGTTATCAAATGACGGCTAATGCAACTGCCTTAGGTAAGGTTGAAGCATTTACTTATACCGTACAAGATAATGATGGTCATTCAAAACAGGCAACTATTTATATTCGTTTGGACTCTAATTTAGTTACATTAGATTGGACGGGTAAAACAGGACTAGAAGAAGCTAATAAGTTAGTAACGCAACTGACCGCTGATAATAAGGCTTCCGCAGGTACAGTTACTACTTTATTCGATCAGGTATTAAATGGTTCTGGTGATTCTTCAAATAGTATTCAGGTAACTGGAAGTAACGGTGTATTACCTACTTCACCTCCTGAGACAGGTAGTACGGCAATACCAGATGATTCTGGGCGTTTTACCCTAGGTGCAGGGCAAACAGCATATATTTCTTTCACATCAATATTACCATCAAATGTGACTCAAGACTTTGGCTTCTTAGGAGGAGGAAACCAAACCAGTGCTTATAATGTGGTTATTGAATTAGAGAGAGATGGAGGAACACTAGCATTCGATACTCAATTGGCCACTTGGACATCAACCACCAGTGGTACGAAGTATTATTATAAAGTGACTAATACAGGAAATTCGTCGGCTAACTATGATCTAAATATTGGTTATGGTGATGGTTCAATAGCGTATAACTGGACGAATACTACTGGTAAGACATTTGGTATTAATAATATTCAATTAGATATTAAAGATACAACATATACAGCATCTTCTGTATCAGGTGACCTAATTTCTAATGATATATTATATTCAAGTGTCTTTAAAATTGGTGTTGCGGCTGGATCGACTACGCCTAGCAATTATTTGGATGCAAATTCAACACCAATAGTAGGAGCGTATGGAACTTTAACTGTTAATTTAGATGGAACCTATAGTTATCAAGCTAATGGTAAAATTGCTGACCTTGGTAAAGATGATGTCTTTACATATAAAATTGAGACATTGGATGGTACTGTAAACACACAAACTTTAACAATTAAAGTAGATGCTGATAATGTTCTGATTGGTACGCCAGATGCTGGTACAACAGGGAACGATATCGCTGTTAGTCAATCCGCAAATGAAGTCTTCACATTAGGTGATGGCGCTGATTTGTTAATTTACAATGTACTTAACGGTTCAAGCCCAACAGGTGGGAATGGAACTGATCAGTGGTTAGATTTTAATATGTCTGAAGGCGATAAAATCGATGTTTCATCTTTATTATCAGGCGCTACCACAGATAATATTAATAATTATCTTAGTGTGAGTATTAGTGGGAATCAGGTTACTTTATTGGTTGACCGAGATGGTAGTAGTGGGGGTATTTCAACTCCTACCGCATTGTTAACTTTAACTAATGAAGACCACGCAACAAATCCTATTACTAGTTTAGTAGATTTGTTAAATAATAATTCAATTATCTATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
bcedcfaed350d29e2c5c9bdc97b7ce4b879f6d8d20de6b2e2157484e79e99fff
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7155
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50