Protein

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Genbank accession
WKW87688.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,77
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIVLNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTAGNLNVDGTTTLKDNVTISPNKAINFEASDLSGALVRHITGKCANNDGWYIGAGGASDQGFLEIGTYDNGNEPIYFVQRTGGTTQAEVRRLALLDGFGDTSIPGDLRLTNKTVKISNGSTLVLEMGVGSNDAYIKNQRGVGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYVISAATAGTPRWVKVATIKHPGDASSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTSNLDNWVEWRRIGSPNKGNVPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETGQDTGATTPSGSILVSMKQIFDSISKPDFSDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLGTAAVRDVGEGAGNVLENGAYGLGGNGGKSINDIVSNADMLTRLKAYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNSGLAAGNVNYNELYGTANKPTKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLAAPNLHASGTGTASVYVNAGSGNAHVWFRTNANERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGGVSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTFVDLGSENSDKYSRLTLARKVGSGATVAMLKVTPEGYVQFGYQTAVSTPAPTKYLLVKSNGLEVEGDLVFNQTYRGTEDAVDITDKTNDLNNMVIKGSDLGTRQLYKCVSSGGGSNISNKPTSDGNFVLEVLSLRKISDNDWTCKQTFTTKNGNVEGTYVRYCQNGTWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQTVSFGNLVTNDLTVNGNARLVGRLNLGSTSATGVLRANETGAVVLGSASGQNIHIRAGSPDTSSGETRFEPNGNVLVGGAITVSGSLQVNGEAAMSRSLIVSQNIKNTNDNSFILMGKDSDLGFVKKSNSGAKLVFASGKSFIVAKSSATVIANPASETYTDVFKVDADGNQTVYGNSAVSRALTVSSTATVNGVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGNLDVTGTRLKTWKLEVDGGGAVLGGTIDVVGKANFSNELTANTSINVMNDGNSHLFFRKANGTEKGLLWADDPGNVSIRAGGASGPVWNFWASGSCQFPGAISNYNGISSTTNYPAGQPIGTYNNTAGLVSRFSNGAYASLYFQEYVGNFHQAIINVNGFGRDDSFYFRAGGDFICTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDIEADGGLLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1481 AA
molecular weight: 155645,73300 Da
isoelectric point:6,09146
aromaticity:0,07157
hydropathy:-0,28312

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–622
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_0468
STR
485–1006
DC_0468 IPR030392
IPR030392
CHP
1381–1436
IPR030392 Coil
WKW87688.1
1 1481
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-622 | STR 623-1006 | RBD 1082-1481
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WKW87688.1
1 1481
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 365 365 0,0889
Central domain 366 586 222 0,1939
C-terminal 587 1481 894 0,6763
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-365
Central
366-586
C-terminal
587-1481

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage pzk-kv4
[NCBI] 		3062823 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella variicola
[NCBI] 		244366 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WKW87688.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR231915.1 [NCBI]
CDS location
range 155996 -> 160441
strand -
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGTGTTGAATACACATGGGCGTACTCTTGCCATTTACACTAAAGATGAAGCCGATAACGTTGTTCAGCTTGCAGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACTGCAGGTAATCTTAATGTTGATGGAACTACTACGTTAAAAGACAACGTTACTATTTCTCCGAATAAAGCGATCAATTTTGAAGCTTCGGATTTAAGCGGAGCATTAGTACGTCATATCACCGGTAAGTGTGCTAATAATGATGGCTGGTACATTGGAGCTGGTGGTGCATCTGACCAGGGATTTCTTGAAATCGGTACGTATGATAACGGAAATGAACCTATCTATTTTGTTCAAAGAACCGGTGGAACGACTCAAGCTGAAGTTCGTCGTTTAGCATTATTAGATGGGTTTGGCGATACCTCTATACCTGGGGACCTTCGTTTAACTAATAAAACGGTAAAAATTTCAAACGGAAGCACACTTGTCCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGCTTACATTAAAAACCAACGAGGCGTAGGTGTTCTTCAATTAACTAATGACAGCAATTTAACGTTCAGAAATTCACAGGTGTATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCTGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAACCGTCAGGCATGGCAATACGTAATTTCTGCTGCAACCGCTGGAACTCCACGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGAGATGCGTCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACCGGCGGCATTGATTCTGGACACGGAAGACATTATGTTGATTTTATCACGTTATCTGGTCGCAATTTAACATCCTGGAGCACTAGCAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATTGGTTCTCCTAATAAAGGAAACGTTCCGGAATATTATGTTGTTAAAAACGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATACGGCAATGGACTTTATGTTACAGTGCTGAACACTGCTGGATACAACGGCCAAGATAGTGGTAAAGTAATTATCTATGAAACCGGCCAAGATACTGGTGCTACTACACCATCTGGAAGCATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGATAGTATCTCAAAACCAGATTTCAGCGATACTACCGGTACTCTTCCGGTTAACCGTGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGATGCTAGAAATAACTTAGGTCTTGGTACTGCGGCTGTTCGCGATGTTGGTGAAGGTGCTGGTAATGTTTTAGAAAATGGCGCTTATGGCTTAGGTGGCAACGGTGGTAAATCCATCAATGACATTGTCTCTAACGCTGATATGTTGACTCGTTTAAAAGCATACGGCGGTACTTTCTGGCGTGGTGTTACTAAATCTGGCGTTAGTGTTCAAAACGGTCTTTATAGTCATGGCTCTGGTATTTTTATGAATGCGGGTGATACCATGTCAGCTATTAATATCGACTACGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATATGCAGCTAACAACAGTGGTCTTGCCGCAGGAAATGTTAACTACAATGAACTTTATGGTACAGCAAACAAACCGACAAAGGCTGATGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTTAAGAAAGCTGGCGACACCATGACCGGTGATTTAGCTGCACCTAATTTACATGCTTCCGGCACCGGTACTGCATCAGTGTATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAAACGCCAATGAACGCGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACAGCGGATTTAGGACAAATTAATATTCGCGCAAAAACTACTGGAGGTGTTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGATGGCCGCCTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGTAATATTACCTCTGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCTATTAAAAACGATATCGTTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGCAAGACTGGTGATACCATGACTGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAACGGAACTTTTGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCAGACAAGTACAGCAGATTAACCCTTGCTCGTAAAGTTGGTAGCGGTGCTACCGTAGCAATGCTTAAAGTTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAACCGCAGTTTCTACTCCAGCTCCTACCAAGTATCTCCTGGTTAAATCTAACGGCCTTGAGGTAGAAGGGGATTTGGTTTTTAATCAGACATATCGCGGTACTGAAGACGCAGTTGATATTACTGATAAGACTAATGACCTTAACAACATGGTTATTAAAGGCAGTGATTTAGGTACTCGTCAGCTGTATAAATGTGTATCATCTGGTGGTGGTTCTAATATATCTAATAAACCTACATCTGACGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTGCGTAAAATTTCTGATAACGATTGGACGTGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAACGGTAATGTTGAAGGCACATATGTTCGATACTGCCAAAACGGCACATGGTCTGCATGGAAAGAAGTTGTTGCTGGTGTTCAACCAATTAATTTAGGCGGTACCGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCTCGTAATAACCTTGGTGTTGGTGAAGGACAAACCGTATCATTCGGTAATTTAGTTACAAACGATTTAACCGTAAATGGAAATGCTAGATTAGTTGGAAGACTGAACCTTGGTTCTACTTCTGCGACTGGCGTATTACGAGCCAATGAAACCGGCGCAGTTGTTTTAGGTTCTGCTAGTGGTCAAAACATCCACATCAGAGCAGGAAGCCCAGATACTTCTTCTGGTGAAACCCGCTTTGAGCCAAATGGAAACGTTTTAGTTGGTGGTGCGATTACAGTCTCAGGAAGCTTGCAAGTAAATGGCGAAGCCGCGATGAGCAGAAGCCTGATCGTTTCTCAAAATATAAAGAATACCAACGATAATAGTTTTATTCTGATGGGAAAAGATTCGGATTTAGGTTTCGTTAAAAAATCTAACTCTGGCGCTAAACTGGTATTTGCTTCAGGAAAATCGTTTATTGTCGCTAAATCGTCGGCAACTGTGATAGCTAATCCGGCTTCGGAAACTTACACTGATGTGTTTAAAGTTGATGCAGACGGAAACCAAACTGTTTACGGAAATTCAGCAGTTTCTAGAGCTTTGACTGTATCAAGTACAGCTACAGTTAATGGTGTTATTAATGCCAATGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTACAAATTGCTGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGATACTTATCTCCCATTAGCAGGTGGTACTGTAACTGGTAACTTAGATGTTACAGGAACTCGACTCAAAACTTGGAAGTTAGAGGTTGACGGTGGAGGCGCAGTACTCGGCGGAACTATTGATGTTGTTGGTAAAGCTAATTTTTCTAATGAGCTTACGGCTAATACTTCTATTAACGTCATGAATGATGGAAATAGTCATTTGTTCTTCCGTAAAGCAAATGGTACAGAAAAAGGACTTCTTTGGGCTGATGACCCTGGTAATGTTAGTATAAGAGCCGGCGGTGCTTCTGGACCAGTATGGAATTTCTGGGCAAGTGGTTCATGCCAATTCCCGGGTGCTATTAGTAACTATAACGGAATTAGCAGCACTACTAATTATCCTGCAGGACAACCTATTGGCACATATAACAATACCGCTGGGTTAGTAAGCAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCCTCTCTGTATTTCCAAGAATATGTTGGTAACTTCCACCAAGCTATCATTAATGTTAATGGATTCGGTCGAGATGACAGTTTCTATTTCAGAGCTGGCGGTGACTTCATCTGTACTCGCAATGGTTCATTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAACGCTTTGGAAAAAGTAGAGACCTTAAGCGGTAATACTTATGAGCTTCATAATACTTCTGGCGGTACTACTCGTTCTGCTGGGTTGATTGCTCAAGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAAGATATTGAAGCGGACGGCGGATTATTGCGTCTGAATTACAACTCAGTAATTGCACTTCTTGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCTGAGGTTAAAGGCCTTAAAGCGGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
263195713c2d63375a5047d94916a4e2a81108a8efc12a8cadaf7a3836521a3a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4909
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50