Protein

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Genbank accession
XSD93075.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVDGTTTLKDNVTISPNKAINFETTNLSGAIVRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNSGILEIGTIDDGAETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLSTNKTVKINSGSTLVLEMGVGSNDVYIKNRRGVGVLQLTSDSNLTFRNSQVYYAMDGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYTISAATASTARWVKVATIKHPGMSSSQLDLMISGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTNSLDNWVEWRRVGSPSKTNVPEYYVVKNDSATDADASFDFYAKIPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGTVIIYETNQDTGDTGPSGSILVSMKQIFDSLAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLRTAAVRDVGESNGNLMEVGAFGIGGNGKSLVDITSDVDLMTRLKALGGTVFRANKASGYTGAPYYSHGTGFYGRASDTMAALNIDYATGNVRVFAINDSGLASGRVNYNVLYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLAAPNLHASGTGTASVYVNAGSGNAHVWFRTDANERGVIWATPNTANLGQINIRAKTTGGTSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLNSIKNDIVSGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTMADFGSENSDKYSRITLARKIGSGAAVAMLKITPEGYVQFGYQDAVANPSPTKYIRVKPDGLDVEGDLVFNQTYCGTEEAVDISNKTIDLNNLVIKRTDPGTRQLYKCVSSGGGSKIANKPTSDGNFVLEVLSLRKVSDNDWTCKQTFTTKNNTTVGTYVRYCQNGSWTAWEEVVSGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGKGQTVTFGNLVTTDLTANGNARLVGRLNLGSASATGVLRANETGAVVLGSASGQNIHVRAGSAYTSAGETRFEPNGNVTVGGAITASGSLQVNGEAAMSRSLIVSQNIKNTNDNSFILMGKDSDLGFVKKSNSGAKLVFASGKSFIVAKSSATTIANPATETYTDVFKVDADGNQTVYGNSTVSRALTVSSTATVNGVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGNLDVTGSRLKTTSLWVTGDAAVNGVLTVDGKARFNQEFSVSTSVNVQNTGNSHVFFRKADGTEKGLLWADEPGNVSIRAGGASGPVWNFWTSGSCQFPGAISNYNGISSTTNYPAGQPNGTYNNTAGLVSRFSNGAYASLYFQEYVGNFHQAIINVNGFGRDDSFYFRAGGDFICTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDIEADGGLLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1477 AA
molecular weight: 155400,52340 Da
isoelectric point:6,89670
aromaticity:0,07109
hydropathy:-0,28395

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–618
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_0468
STR
483–1006
DC_0468 IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1377–1471
IPR030392
XSD93075.1
1 1477
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-618 | STR 619-1006 | RBD 1080-1477
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XSD93075.1
1 1477
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 653 653 0,1414
Central domain 654 852 200 0,3283
C-terminal 853 1477 624 0,6706
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-653
Central
654-852
C-terminal
853-1477

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage vB_Kpl_K65_evo7
[NCBI] 		3412902 Viruses >
Host Raoultella planticola K59
[NCBI] 		1212665 Ascomycota > Pichiomycetes > Serinales > Metschnikowiaceae > Clavispora >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XSD93075.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ569700.1 [NCBI]
CDS location
range 103066 -> 107499
strand -
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCGTTGAATACACATGGGCGTACTCTTGCTATCTATACCAAAGATGAAGCTGATAATGTTGTTCAGCTTGCTGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACATCTGGAACTCTTAGCGTTGATGGAACTACTACATTAAAAGACAACGTTACTATTTCTCCGAATAAAGCGATCAATTTTGAAACTACTAATTTAAGCGGAGCAATAGTGCGTCATATCGTTGGCAAATGTGCTACTAACGATGGCTGGTACATCGGTGCCGGTGGTACAAGCAACAGTGGTATTCTTGAGATCGGTACTATTGACGATGGCGCTGAAACTATTCAATTCGTACAACGCGGTGCAGGCAACGTTGAAGCCCGAAAATTGGTATTGCTTGACGGCTCGGGTAATACGACTCTTCCTGGTGATTTAAGATTATCTACCAATAAGACTGTTAAAATTAACAGTGGAAGCACTCTTGTTCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGTCTATATTAAAAACCGACGAGGCGTAGGTGTTCTTCAATTAACTAGTGATAGCAATTTAACGTTCAGAAATTCCCAAGTTTATTACGCTATGGATGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAACCGTCAGGCATGGCAATATACTATTTCTGCTGCAACTGCGTCAACTGCTCGCTGGGTAAAAGTAGCTACAATAAAGCATCCAGGAATGTCTTCTTCGCAACTGGATTTAATGATTAGCGGTGGTATTGATTCTGGGCACGGTAGACATTACGTTGATTTTATCACGTTATCAGGACGAAATTTAACATCATGGAGCACCAACAGTTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCCGGGTTGGGTCTCCTTCTAAAACGAACGTTCCAGAGTATTACGTTGTTAAAAACGATTCTGCTACTGATGCGGATGCGTCATTTGATTTTTATGCTAAGATTCCTCGTTATGGCAATGGCCTTTATGTTACAGTGCTAAACACAGCTGGATACAACGGCCAAGATTCAGGTACAGTAATTATCTATGAAACTAATCAGGACACTGGTGATACTGGACCGTCCGGAAGTATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGATAGTTTAGCAAAACCAGATTTCGGTGATACCACAGGTACTCTTCCGGTTAACCGTGGTGGTACAGGTGCTACTAATGTAGGAGATGCCCGAAACAACCTGGGCCTTAGAACTGCAGCTGTTCGCGATGTTGGTGAATCTAACGGAAACTTGATGGAAGTTGGTGCCTTTGGTATTGGCGGTAACGGAAAATCACTGGTAGATATTACTTCTGACGTTGATTTAATGACTCGCCTTAAGGCTCTTGGTGGTACAGTGTTCAGAGCCAACAAAGCGAGTGGCTATACTGGGGCTCCTTATTACTCCCATGGCACCGGGTTTTATGGAAGAGCTTCTGACACAATGGCTGCGCTTAATATAGATTATGCAACTGGTAACGTCAGAGTATTTGCTATAAACGATAGCGGTTTAGCAAGTGGAAGAGTAAATTATAATGTTCTCTACGGCACAGCAAATAAGCCATCTAAGGCTGACGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTTAAGAAAGCTGGCGACACCATGACCGGTGATTTAGCTGCACCTAACCTCCATGCTTCCGGCACCGGTACTGCATCAGTGTATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAGACGCCAATGAACGTGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACTGCTAATTTAGGACAAATTAATATTCGTGCAAAAACTACTGGTGGTACTTCTGCCGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGACGGCCGACTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGGGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGGAACATCACCTCTGGTTCAATGTTTGGCGGTAACCTTAACAACTATTTGAATTCTATTAAAAACGACATCGTTTCTGGGGATAATAAGCAAGTAAGTAAAACCGGTGACACAATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGAACAATGGCTGATTTTGGTTCAGAGAACTCAGATAAGTATAGCAGAATAACTCTTGCTCGCAAAATTGGCTCTGGCGCTGCCGTAGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAGATGCAGTTGCTAATCCGTCTCCTACTAAGTACATCCGAGTTAAACCCGATGGCCTTGATGTAGAAGGGGATTTGGTTTTTAATCAGACATATTGCGGTACTGAAGAGGCAGTTGATATTTCTAATAAGACTATTGACCTTAATAATCTTGTCATTAAAAGAACCGATCCAGGTACTCGTCAGCTGTATAAATGTGTATCTTCTGGCGGTGGTTCTAAGATAGCAAACAAACCCACATCTGACGGTAACTTTGTTCTCGAAGTTCTGTCTTTACGTAAAGTTTCTGATAACGATTGGACATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAATAACACCACTGTTGGCACATATGTTCGATACTGCCAAAATGGCTCATGGACTGCATGGGAAGAAGTTGTATCTGGTGTACAACCGATTAATCTTGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCTCGTAACAACCTCGGTGTTGGTAAAGGCCAAACTGTAACATTCGGTAATTTAGTTACAACCGATTTAACCGCAAACGGAAACGCTAGATTAGTCGGAAGACTGAACCTTGGTTCTGCTTCTGCGACTGGCGTATTACGAGCTAATGAAACGGGTGCTGTTGTTTTAGGGTCTGCAAGTGGTCAAAATATCCATGTTAGAGCAGGAAGTGCCTATACTTCTGCGGGTGAAACTCGCTTTGAACCAAATGGAAACGTCACAGTTGGTGGTGCTATTACAGCTTCCGGAAGCCTGCAAGTAAATGGCGAAGCCGCTATGAGTAGAAGCTTGATCGTTTCTCAAAATATAAAGAATACTAACGATAACAGTTTTATTCTGATGGGAAAAGATTCGGATTTAGGTTTCGTTAAAAAATCTAACTCAGGAGCTAAACTAGTATTTGCTTCAGGAAAATCGTTTATTGTCGCTAAATCGTCAGCAACTACCATAGCTAATCCAGCGACGGAAACTTACACTGATGTGTTTAAAGTTGATGCTGATGGAAACCAAACTGTTTATGGAAATTCAACAGTTTCTAGAGCTTTAACCGTTTCTAGCACAGCGACAGTTAATGGCGTTATTAATGCCAACGGCGGTATCATTGTTCCTACTACTAAGTATGTGCAAATTGCTGATGCTCCTACACAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGACAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCCGGTGATACATATCTTCCATTAGCAGGTGGTACTGTAACTGGTAACTTAGATGTTACAGGAAGCCGGTTAAAAACTACATCGCTCTGGGTTACCGGTGATGCTGCTGTTAACGGTGTTTTAACTGTTGATGGAAAGGCTAGGTTTAATCAAGAGTTCAGTGTATCAACCTCAGTTAACGTTCAGAACACCGGTAATAGCCATGTGTTCTTCCGTAAAGCAGATGGTACAGAAAAAGGTCTTCTTTGGGCTGATGAGCCTGGTAATGTTAGTATAAGAGCCGGCGGTGCTTCTGGACCAGTATGGAATTTCTGGACCAGTGGTTCATGTCAATTCCCAGGAGCCATTTCTAACTATAACGGAATTAGCAGCACTACTAATTATCCTGCAGGACAACCCAATGGCACATATAACAATACCGCTGGGTTAGTAAGCAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCCTCTCTGTATTTCCAAGAATATGTTGGTAACTTCCACCAAGCTATCATTAATGTTAATGGATTCGGTCGAGATGACAGTTTCTATTTCAGAGCTGGCGGTGACTTCATCTGTACTCGCAATGGTTCATTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAACGCTTTGGAAAAAGTAGAGACCTTAAGCGGTAATACTTATGAGCTTCATAATACTTCTGGCGGTACTACTCGTTCTGCTGGGTTGATTGCTCAAGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAAGATATTGAAGCGGACGGCGGATTATTGCGTCTGAATTACAACTCAGTAATTGCACTTCTTGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCTGAGGTTAAAGGCCTTAAAGCGGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
89a6ce3a55f56717f6954545a40645b1f2b870d9b2e70d11be311fceaeb79d12
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4940
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50