Protein

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Genbank accession
QXV83445.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,66
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDRLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATAGTINLTLPSGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLKLAYIEDTVAGTRYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGTAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQKEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLSLTQQTNLSAPLVSTSTATFGGSVSANSTLTISNSGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNEFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGTLNANGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDATNTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGSKTADLYTRAPTADTVGFWSIDVNDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIVPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139356,53420 Da
isoelectric point:5,53546
aromaticity:0,07359
hydropathy:-0,30813

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–140
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1001–1277
DC_1209
QXV83445.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-140 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1277 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage PaulHMueller
[NCBI] 		2852017 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QXV83445.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ501098 [NCBI]
CDS location
range 54474 -> 58349
strand +
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACCGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAATACGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTACCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGACACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAGATTAAACCCACTATATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACAGCCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTTCCGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAAAATTAGCATATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTTCAACAAAACGTCCCAACTGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTTGCTATTACTCCGGAAACATTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCCACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCATCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGCCGAAACCGATGCCGGTCTTGATGACACAACGATTATTACACCTAAGAAATTGCAGGCACGTCAGGGCTCTGAAACACTATCTGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCTGAAACTCGTGGAACCGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATGCTCAACAAGGTGCGGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCTGGTCAATCACAAGCAGGTTATTCTCATGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGCGCAGTAACACCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGCGGTACACTTCGCGTAGCGACACAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAAAGAACCAACATGGGCTGCTACTACAGCAATTCGCGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACACAACCTTTAGAATCATATGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTGAAAGCTAAAGCCGTAGATAGTAATTTATTAGATGGCCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTATCCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCAACTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAACTCTGGAACAGCTACTCGTCTGATTTTTGAAAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGCACAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATGAATTTGGCGGTGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGCGATGAAACATCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGCCGGGAATATAACGTTTAGTATCAATGGTACTGTGATGCCAATAAATGTTAACGCTTCAGGCACGTTAAATGCGAATGGCGTTGCAACATTTGGTCGTTCAGTTACAGCCAATGGCGAATTCATTAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCGCAATGATGCTACTAACACCTATTTTATGCTTACTGCATCAGGTGACCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAACAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCTAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACAGTTAACTCAAGAATTCGTTCTCAGGGTTCTAAAACTGCTGATTTATACACTCGTGCTCCTACTGCTGATACAGTCGGATTCTGGTCAATTGACGTCAATGATTCAGCTACATATAACCAATTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAGCGCGGTGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACGCTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACGCCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAGCCGTCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTGTTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
11a69e3afbac686a05c6ca699fdfbd810c51eb49d5255ce4e90006fa59fea28a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5537
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Systematic exploration of Escherichia coli phage-host interactions with the BASEL phage collection Maffei,E., Shaidullina,A., Burkolter,M., Heyer,Y., Estermann,F., Druelle,V., Sauer,P., Willi,L., Michaelis,S., Hilbi,H., Thaler,D.S. and Harms,A. 2021 — GenBank