Protein

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Genbank accession
WWD12464.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNAENDARYARLEVLNTFKSRQTIVADGQALLLRSATDSPSLYVRGQDPSGTNKWYVGFNTSNVLGLSNEASGTTLTLDSAGINSNKNLNITGQVKPSDWSNLDDRYFTQTLANQRFAQLAGNNTFNGTNTFNQLSVFKKDGEAIRLQNANAAQPLYIKAIDSTGVNRWYIGNSNEGDNVALENYKTSGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNAKNTFSQGQIIKADGEGIRLQGVNDTGGLFLQGYTSDGAKKWFMGTNASGNFTIREMVLGTELSLRENYIQFNKNVTITGQVQPSDWTNLDKRYYTGSASNARYMYAGKTGEGDNDAAIAWDAKTGLYNVKTGATSSNLLLQLYQGSESSTPSAQLRFKWANGGMWYRTSRDGNGFEKSWAMVYTTAQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGNHSHSISWIGQNSQHYSGGGGGYIGTGPGYTDANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:777 AA
molecular weight: 83347,91520 Da
isoelectric point:8,90723
aromaticity:0,08752
hydropathy:-0,46422

Domains

Domains [InterPro]
DC_1566
STR
60–777
DC_1566
G3DSA:6.20.80.10
STR
157–217
G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR048388
ATT
159–246
IPR048388 IPR048388 IPR051934
WWD12464.1
1 777
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 60-158 | ATT 159-246 | STR 247-272 | ATT 273-354 | STR 355-379 | ATT 380-470 | STR 471-777
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage LinBro
[NCBI] 		3098279 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WWD12464.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR896830.1 [NCBI]
CDS location
range 20472 -> 22805
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTCCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCGTCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGCGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGTTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGCTGAGAATGATGCTAGATATGCTAGATTAGAAGTACTAAATACTTTTAAGTCTAGGCAGACAATTGTAGCAGATGGTCAAGCACTGTTGTTAAGAAGTGCAACTGATAGCCCTTCTCTCTATGTTAGAGGTCAAGACCCATCTGGAACTAATAAATGGTATGTTGGATTTAATACTTCAAATGTTCTTGGATTATCAAATGAAGCCTCTGGCACGACATTGACATTGGATTCAGCAGGTATTAATTCTAATAAGAATTTAAATATCACTGGTCAGGTTAAACCTTCAGACTGGTCTAACCTAGATGATAGATACTTTACCCAAACATTGGCTAATCAAAGATTTGCACAGTTGGCTGGTAATAACACTTTTAACGGCACTAATACATTCAACCAACTGAGTGTTTTCAAAAAAGATGGTGAAGCAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAACCATTGTACATTAAAGCAATTGATAGCACAGGTGTCAACAGATGGTACATTGGTAATAGTAACGAAGGTGATAACGTAGCTCTAGAAAACTACAAAACTAGTGGCAAGATTACTGTAGGGACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACAATTGCAAGAACTAATGCTAAGAATACTTTTTCTCAAGGTCAGATTATTAAGGCTGATGGAGAGGGTATTAGACTTCAGGGGGTAAATGATACTGGTGGTTTGTTCTTGCAAGGTTATACTTCTGATGGTGCTAAAAAGTGGTTTATGGGTACTAATGCTTCAGGAAACTTTACTATCAGGGAGATGGTGTTAGGTACTGAACTGTCTCTTAGAGAGAACTATATCCAGTTTAATAAGAATGTAACAATCACTGGGCAGGTTCAACCATCAGACTGGACTAACCTAGATAAAAGGTACTATACCGGTTCAGCATCAAACGCCAGATACATGTATGCAGGAAAAACTGGTGAAGGTGATAATGATGCTGCTATTGCTTGGGATGCTAAGACAGGGCTGTATAATGTCAAGACTGGAGCTACATCATCAAATCTTTTACTTCAGTTATATCAGGGGTCTGAGTCATCTACACCGTCTGCGCAGCTAAGATTTAAATGGGCGAATGGTGGTATGTGGTATAGGACATCAAGAGATGGTAATGGCTTTGAGAAAAGTTGGGCTATGGTGTACACAACTGCACAGAAGCCAACCCCTTCAGATATTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAATAAAATCTACCCTGTTGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAACGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTTAACAATGGTGTAGGTAGAACAATCAGGATTGCAGCAGCTAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACACACAGTTTTTCTGCTACTACTTCGTCTTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAGCCACTCTATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCACAGCACTATTCCGGTGGTGGTGGTGGTTACATTGGTACAGGGCCGGGTTACACCGATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCCGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTGAGGACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0c3353fc79363810762ee2eded910cb8416a31db654747db9d398521396bef14
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6975
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50