Protein

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Genbank accession
AIS74006.1 [GenBank]
Protein name
endopeptidase
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MIYIFDKTQAIIKVLTNDDFTAAHLNFKINTATTFEFSLPASKALPSGSKYVATPHPLNDSKFIMLRLTERVDNTETIDYSAYELAYQELATDGYIEDKRPHNQSALNLMKIALDGSNWELNNVNVSGTATTNFYYVDRLSAISKVVDLLGGEIVFYIEIQGNAISGRYMDYLARQGADTSKVFASGSNLLTVERQSDTSNIYTAILPRGKGKEIDNGDADTPDGYGRRINIADVEWKKSAGKPLDKPKGSIILSDPDATAEWGQINGNARLLPQTYDDIDDVNVLINSAYKTLQSVNHPQIQYSATVADVGGLSLGDTVLIMHGDRDLSYKTRVFEVKYDLLSPDQTELSLGDDLSSNSITSQINSLNAVADTISSQTQWTINQIGRPGTTFGNTEPANPKVGDVFFKELPDGGTEIHRWNGNIWELLASPTTADDIAKAVNDAVSQAKSHTDEVKQGLSSDIATAKSQAASLASTAQQNAIDVASKSLGTYLVRLLPGTNIFKTTNSTTIQAQVWKAGQDITSTLDNASFSWKIAKDGAAAISLTNNVKNVTAKPSDFNSTGTYIVNVIIPVTDTTGTTRNQTFSDSTTIAKVADGVNGANGNGISKTTITYQLGTSATTAPTGTWTSTVPTLVKGQYLWTRTVWSYTDRTTETGYSVAYVAKDGNNGTDGVAGKDGVGITSTIITYAGSTSGTVAPTTGYTSAVPTVTAGNFLWTKTVWNYSDNTTETGYSVAKMGEKGADGKDGIPGKDGNGIASTSITYATSTSGITAPAIGYTSTIPSVAKGSYLWQRTIYTFTNGTTKTSDIVTYFAKDGLKGADGMDGGQGMIAQPTKPTTGLVDGFLWLDTSQNYPIYYIYDSSIKEFKIYQFNAKNINADQIKAKFVGTDRLSASEIIADDLHVKSANIDGKMTASQITVSSTNGSQTSLANFNLGEMSQTISDTKNAVNNLGQVNQLMNTEFTPDFAGWYDRGFHGKGIKVSLGTPRNGSNVIAKIDGSPIRLQSEPIAVTPGMKVSYWVNKLTTTGLWSYLNASDKDGNIINVPNTTSNEIAGSSKAWIGAGRVENITIPDGVAYISLGFLVYSAIPNGDVFQQPMLVFSDHVGAYVQGNYNNNAALAQVKITAEGISNFVRDSSGNLSSDFQTALSKTSIITGSTLATSIQKQTATQITSALTDNNGKIISLINQDSSGVQIAGKNIVLDGNTTVTGDFYAKGGNFKNLNASNLTVGTLNGTQVNITNINANNIVSGAISGANLNINLNTGSVVFQKGRINSSDYTTDINIDKGYISTANSDTRAILKNGQLQLTSPNYYDLQTNPYLSIYNDQRAFDSTGKFNSAVISARDRVIIGNKDGINDMLWFGDTFYFGKSNFYGLSSGTNTGKATPTTVGGGKTGVVLVGGSTYTNVIGGNDSPSIIVGWSPDNIYSGNRIRIEADYFHVGAVYNRTTSSSSNVFVAADGALVRSSSARKYKLDIKNNIPISDSLKLIDVPLSTWVDKREHEENGSNERYFGMIAEDLRDAGLEYLVQYGEDNEVEGINYDRVALLLIPLVKELKERIEKLESKGK
Physico‐chemical
properties
protein length:1566 AA
molecular weight: 168010,58200 Da
isoelectric point:5,20721
aromaticity:0,08365
hydropathy:-0,29304

Domains

Domains [InterPro]
DC_1956
STR
1–497
DC_1956 DC_1328 DC_0469
IPR007119
Unmapped
61–352
IPR007119 DC_1328 DC_1328 IPR030392
IPR010572
ENZ
90–353
IPR010572 IPR012892
AIS74006.1
1 1566
Architecture
STR
RBD
CHP
STR 1-1201 | RBD 1202-1547 | CHP 1548-1565 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Leuconostoc phage LLC-1
[NCBI] 		1486429 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactococcus lactis
[NCBI] 		1358 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIS74006.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ608189 [NCBI]
CDS location
range 6992 -> 11692
strand +
CDS
ATGATTTATATTTTTGATAAAACACAAGCAATTATAAAGGTGCTGACCAATGATGATTTCACGGCAGCACATCTAAACTTTAAAATTAATACGGCAACAACGTTTGAGTTCTCACTACCTGCAAGCAAGGCGTTGCCAAGCGGTTCAAAGTATGTGGCGACACCTCACCCATTAAACGACAGCAAGTTTATTATGTTGCGTTTGACCGAACGTGTTGATAACACAGAAACAATTGACTATTCAGCCTATGAGTTGGCTTATCAAGAGCTGGCTACTGATGGTTATATTGAAGATAAGCGACCACATAATCAGAGTGCATTGAATCTGATGAAAATTGCACTCGATGGGTCTAATTGGGAGCTTAACAACGTCAACGTTTCTGGCACAGCGACAACTAATTTCTATTACGTTGACCGATTAAGCGCCATCAGCAAAGTTGTAGACCTGTTAGGCGGTGAGATTGTATTTTATATTGAGATACAAGGAAACGCCATCAGCGGTCGTTATATGGACTATCTAGCACGTCAGGGGGCAGATACATCAAAGGTATTTGCAAGTGGTTCAAACTTACTAACGGTTGAGCGTCAAAGTGATACATCAAACATCTACACGGCTATCCTGCCACGCGGTAAGGGTAAAGAAATTGACAACGGAGACGCTGACACACCAGACGGCTACGGTCGCAGAATTAACATTGCTGACGTTGAATGGAAAAAGTCAGCAGGTAAACCATTAGATAAGCCAAAAGGCTCAATCATTCTATCAGACCCAGATGCTACGGCTGAATGGGGACAGATTAACGGTAATGCTAGGCTGTTACCACAAACGTATGATGATATTGATGATGTCAATGTTTTAATCAATTCGGCATATAAAACCCTGCAATCTGTTAATCACCCACAAATTCAGTATTCGGCTACGGTTGCTGATGTTGGTGGGCTATCACTTGGTGATACAGTCTTAATCATGCACGGTGATAGAGACTTGAGTTATAAGACACGTGTGTTTGAGGTTAAGTATGATCTGTTATCACCAGACCAAACAGAATTGTCACTTGGTGATGATTTAAGTTCAAATAGTATCACTTCACAAATTAACAGCTTGAATGCTGTTGCAGACACCATTAGTAGTCAAACACAGTGGACGATTAACCAGATTGGTAGACCGGGAACAACGTTTGGTAACACAGAGCCTGCTAATCCCAAGGTTGGAGATGTATTTTTCAAAGAGTTACCTGATGGTGGTACTGAAATACACCGTTGGAATGGTAATATATGGGAGTTGCTTGCTTCACCGACCACCGCTGATGATATAGCTAAAGCTGTTAATGACGCGGTCTCACAAGCCAAATCACACACTGATGAAGTTAAGCAAGGTCTGTCAAGTGATATTGCAACAGCAAAGTCACAGGCAGCTTCACTAGCTAGTACAGCACAACAAAACGCAATAGATGTCGCTAGTAAATCTCTAGGAACATACTTAGTTAGACTTTTACCGGGAACAAATATATTTAAGACAACAAACTCTACGACAATTCAGGCGCAAGTCTGGAAAGCAGGGCAAGACATAACGAGTACATTAGACAACGCCTCTTTCTCTTGGAAAATAGCAAAAGATGGTGCCGCTGCAATTAGTCTAACTAATAATGTAAAAAACGTTACTGCTAAACCTAGTGATTTTAATAGTACTGGAACTTATATTGTAAACGTCATAATCCCTGTTACAGATACAACTGGTACGACTAGGAATCAAACATTTTCAGATAGTACGACTATTGCAAAAGTTGCTGATGGGGTTAATGGTGCTAACGGTAACGGAATATCAAAAACTACTATCACTTATCAGTTAGGAACGTCTGCAACGACAGCACCAACAGGTACATGGACGTCAACAGTACCAACATTAGTTAAAGGTCAATATTTGTGGACTCGTACCGTTTGGAGTTATACAGACAGAACAACGGAGACAGGGTATTCAGTTGCTTATGTAGCAAAAGACGGAAACAATGGAACGGACGGGGTTGCAGGTAAGGACGGTGTCGGGATAACATCGACAATAATCACTTATGCCGGATCAACGTCAGGAACAGTAGCGCCGACAACAGGGTACACAAGCGCTGTTCCAACAGTCACAGCAGGAAACTTCTTATGGACAAAGACAGTTTGGAATTACTCTGATAACACTACTGAAACTGGTTATTCAGTTGCTAAAATGGGAGAAAAAGGGGCTGACGGTAAAGACGGAATTCCCGGTAAAGATGGTAATGGTATCGCTTCAACTTCAATCACTTATGCGACAAGTACAAGTGGAATAACAGCACCAGCAATAGGGTACACGTCAACTATTCCATCTGTTGCTAAGGGATCTTACCTCTGGCAAAGAACGATTTACACATTCACAAACGGAACAACCAAGACGTCTGACATTGTTACTTACTTTGCTAAAGACGGTTTAAAGGGAGCTGACGGGATGGATGGCGGACAAGGCATGATAGCCCAACCAACAAAACCAACAACTGGTTTGGTAGACGGTTTCCTATGGTTAGATACGTCTCAAAATTATCCAATTTATTATATTTACGATAGCTCAATTAAAGAATTTAAAATATATCAGTTTAATGCAAAAAACATAAACGCAGACCAGATAAAAGCAAAATTTGTGGGAACAGATAGGCTATCAGCTTCAGAAATTATTGCTGATGACTTACATGTAAAGTCAGCAAACATAGATGGTAAGATGACAGCCTCGCAAATAACAGTCTCTAGCACAAATGGATCACAAACTTCTTTAGCTAATTTTAATCTGGGAGAAATGTCACAGACTATTTCCGACACTAAAAACGCTGTTAACAACCTTGGTCAAGTCAACCAGTTAATGAACACCGAGTTCACTCCTGATTTTGCTGGTTGGTATGATAGAGGTTTTCATGGTAAGGGTATAAAGGTTTCCTTAGGAACACCTAGGAATGGTTCAAATGTTATTGCTAAAATAGATGGTTCACCTATAAGGTTACAATCAGAGCCAATAGCTGTTACACCTGGAATGAAAGTATCTTACTGGGTTAATAAGTTGACAACTACAGGTTTATGGTCATATTTAAATGCTTCTGACAAAGACGGCAATATTATAAACGTACCAAATACAACATCTAATGAAATAGCAGGGAGTAGTAAAGCATGGATTGGCGCTGGTAGGGTAGAAAATATTACCATACCTGATGGAGTAGCATATATATCACTTGGATTCCTTGTGTATAGTGCTATACCAAATGGTGATGTATTCCAACAACCCATGCTAGTATTTTCAGACCACGTCGGCGCATACGTACAAGGTAACTACAACAACAACGCAGCCCTTGCACAAGTGAAAATCACCGCAGAAGGTATTTCTAACTTTGTGCGTGATTCAAGTGGTAACCTATCGTCTGACTTCCAAACAGCGTTGAGTAAAACGTCTATCATCACAGGTAGCACGTTAGCCACAAGTATTCAGAAACAGACGGCGACACAGATAACATCTGCTTTAACCGACAACAACGGCAAGATTATTAGTTTAATCAATCAGGATAGTTCTGGTGTTCAAATTGCTGGCAAGAATATTGTATTAGATGGTAATACAACGGTTACTGGAGACTTTTACGCTAAAGGTGGTAACTTCAAAAATCTTAACGCTTCAAATTTAACTGTTGGGACGCTTAATGGTACTCAAGTTAATATCACGAACATCAATGCTAATAACATTGTATCTGGCGCTATTTCTGGTGCTAACTTGAACATCAATCTGAATACTGGTTCTGTCGTGTTCCAAAAAGGTAGAATTAACAGCTCTGATTACACCACAGACATTAATATCGACAAAGGATATATTTCAACAGCGAATAGTGATACTAGGGCAATTTTAAAAAATGGTCAGTTACAACTAACCTCTCCTAATTATTATGATTTGCAAACAAATCCCTATTTATCAATTTATAATGACCAGAGAGCATTTGATAGTACAGGCAAATTTAACAGTGCTGTTATTTCGGCAAGAGATAGAGTTATTATTGGTAACAAAGATGGAATCAACGACATGCTTTGGTTCGGAGATACATTTTATTTTGGAAAAAGCAACTTTTATGGTCTATCTTCTGGCACAAATACTGGAAAAGCAACACCAACTACTGTTGGTGGTGGTAAAACTGGAGTTGTTTTAGTTGGCGGAAGCACCTATACCAACGTGATAGGTGGTAATGATTCACCATCGATAATTGTGGGTTGGTCACCTGATAATATTTATTCTGGTAACAGAATTAGAATTGAAGCAGATTATTTTCATGTAGGAGCAGTTTACAATAGAACAACATCATCATCATCAAACGTGTTTGTGGCGGCAGATGGCGCATTAGTTAGGTCATCATCAGCACGTAAGTACAAGCTGGATATCAAAAATAATATCCCAATATCTGACTCATTAAAGTTAATTGATGTACCACTATCAACTTGGGTTGATAAGCGTGAACATGAAGAAAATGGTTCTAATGAACGTTACTTCGGTATGATTGCCGAAGATTTACGTGACGCAGGTTTAGAATACTTAGTTCAGTATGGTGAGGATAACGAAGTTGAGGGAATTAACTATGACCGTGTCGCTTTATTATTGATACCGCTAGTTAAAGAATTGAAAGAACGCATTGAAAAATTAGAAAGCAAAGGTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ed5258f1188a87b68cc475c381200d1db03e5b5f283d90171fdd56ff60c694a3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6856
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genomic sequence of LLC-1 Yoon,B. and Chang,H.-I. 2011-08-03 — GenBank