Protein

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Genbank accession
YP_009134676.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADRFPLIVNAISKKIEEIVSGDNLELTGNGIVVSGDTGAGKYLSSDGTTVFWDSPGDVYLDQSQVITNKIFEACVISGALNTLSDIPNSSLVNSGITVNGTTIALGGTVITPDNNTTYSISAQDGLTASEKIVRLTSGGNIGAGIDDDVTFGVAVPSSVPTGSNALSLFIDRSGEKITISGHVIDNNTITTIDAPGGTATSGAISFTSTGAATVSMTGSTVNIDALDTDTRTKIRAGSGGTYGPADTTEGRFTFLDGTGTTVSQGVDGSGDATITYTSTDTVTQIRGGSTGSYKPSTSGTATTQISIEGGTALGGNVQVTESGNIILIDSTDTNTVTKVGSDNNGSPIAPQAGDFILKQAGATTITQTTNGSGQVEVVISSINSDTGASLTANNGLILSGSDFGLKNYNNLSGNTVMKWDNGNGQFADSIITDDGSTVIIDGDLTVSGTQTIFNTSVLQVEDNIIELRKGNNLVGFDGGIQVNRTSDPSGVITSYKGFQWHESGGYWRSWDGSVEQRFVTETETQVLTNKTLTNPTFTTPTLGAATATSVNGLEIATTASAVFDLQSGKTLDVDNDLTFTSDNSTGNVNVNFRVGGDVAYKSDTLASFASTTATQLRTLISGTTGIDDLVFQTNPVILTGLTTTSTGFSLINSGAQSIQFGGAATQIEIGNTSGTTTVSGDLVVEKDLTVGGANTDLLTCNARIDVANSDILIRGGSSDPMTVGRGNSEVASNTAIGKQALLSVVSGSQNTAVGYETGLTINSGAGNTGYGYQVLRSNGVGDLNTAMGRAAMISNLSGDGNTAIGSNALQTNTTGDANVCIGYYAGFAATGSGNVLIGPADSSDPVNDATYTPPTPGGNRQLVIGSGTEFWIKGDANFDVTISNDLTVNRTITVKGDLVVNGTTTTVKSNVVEIADKNIELAKVVSTTFTCSTADGSANITSISPTLGLIPGMVVTSNTGGVSVPNGTTIVSITGNSAVLSNNVTGTGTPTFSAIGPSDTAADGGGIILAGNTQHTFLWSNANDAWQSSEDMEVAQGKTYNIIDGSGNAREMLSLTQIGPTAGSGVVAGLGTGVTSSALTSIGTLTALEVSGNVDITGTGYLQLPSGTNAEQPGASGQPTAAEGMLRWNNSSNVFEGYDGNVWGKIGGGAAVQSAAPSPANPGDLWYDTDDGRMFVYYTDSSSSQWVDASPNGMPTDLTLDGTLTVDGTTNLIGDLSVGTETTNSNAGSQTLSVGSLAAGQSGGIQIWANSTNGNSFVQFGDGTASADQYRGYINYTHSNDRLGFGTAGENRFLIDNTGNIEPGADATQDLGSATKRFANIYSADLQLSNEGAANEVDGTWGQYTIQEGEEDLFLINRRSGKKYKFMLQEVN
Physico‐chemical
properties
protein length:1373 AA
molecular weight: 140244,37270 Da
isoelectric point:4,12233
aromaticity:0,05827
hydropathy:-0,13620

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014e
[NCBI] 		1493510 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Chalconvirus > Chalconvirus acg2014e
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009134676.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_026928 [NCBI]
CDS location
range 162483 -> 166604
strand +
CDS
ATGGCTGACCGCTTTCCGTTAATTGTTAATGCAATTTCAAAGAAGATTGAAGAAATTGTATCAGGAGACAATTTAGAATTAACTGGCAACGGAATTGTTGTTAGTGGTGATACTGGTGCTGGTAAGTATTTGAGTAGTGATGGAACTACGGTATTTTGGGACAGTCCGGGTGATGTTTATCTAGATCAGTCTCAGGTAATAACTAATAAAATTTTTGAAGCGTGTGTTATTTCTGGTGCTCTTAATACACTTTCTGATATTCCAAATAGTTCCTTAGTTAATTCTGGAATTACTGTTAATGGAACTACTATTGCTTTGGGTGGTACTGTTATAACACCAGATAATAATACTACATATTCTATTTCTGCTCAAGATGGATTAACCGCATCTGAAAAAATTGTACGTTTAACTTCTGGTGGTAATATTGGCGCTGGTATTGACGATGATGTTACTTTTGGTGTTGCGGTTCCATCATCTGTTCCAACTGGTTCAAATGCTTTATCTTTATTCATTGACAGATCTGGTGAAAAAATTACAATATCTGGACATGTAATAGATAACAATACAATTACTACTATTGATGCTCCTGGTGGAACTGCAACTTCTGGAGCAATTAGTTTTACTTCTACTGGTGCTGCTACAGTTTCTATGACTGGAAGCACGGTTAATATTGATGCTCTTGATACAGATACAAGAACTAAAATTCGTGCAGGATCTGGTGGTACATATGGTCCTGCTGACACAACAGAAGGTAGATTCACATTTCTTGATGGAACTGGAACAACAGTATCTCAAGGTGTAGATGGCAGTGGTGATGCTACTATTACTTATACTTCTACAGATACTGTAACTCAAATTCGTGGTGGATCTACTGGAAGTTATAAACCATCTACTTCTGGAACAGCAACTACACAAATTTCTATTGAGGGTGGCACTGCTTTAGGAGGTAATGTACAAGTAACAGAATCTGGAAATATTATCTTAATTGATAGCACAGATACTAATACTGTTACGAAAGTTGGTAGTGATAACAATGGAAGTCCTATTGCACCACAGGCAGGAGACTTTATTCTCAAACAAGCTGGCGCTACAACTATTACACAGACTACAAATGGAAGTGGTCAAGTCGAAGTTGTAATTAGTTCAATTAATAGTGATACTGGTGCTAGTTTAACCGCTAATAATGGTCTTATATTATCAGGATCTGATTTTGGATTAAAGAATTATAATAATCTTAGTGGAAACACTGTGATGAAATGGGATAATGGTAATGGTCAGTTTGCTGATAGTATTATTACTGATGATGGTAGTACTGTTATTATTGATGGAGACTTAACTGTCTCAGGAACGCAAACTATTTTTAATACTAGTGTTCTTCAGGTAGAAGATAATATTATTGAATTAAGAAAAGGTAATAACTTAGTTGGATTTGATGGTGGTATTCAAGTCAATAGAACTTCTGATCCTTCTGGTGTTATTACTTCATATAAAGGATTCCAATGGCATGAAAGTGGTGGATACTGGAGATCTTGGGATGGTTCTGTTGAGCAAAGATTTGTAACAGAAACAGAGACGCAAGTTTTAACAAATAAAACTTTAACCAATCCTACATTTACAACACCAACACTTGGTGCTGCTACCGCAACTTCAGTCAATGGTTTGGAGATTGCTACTACTGCTTCTGCTGTTTTTGATCTCCAGTCTGGTAAAACACTTGATGTTGATAATGATTTAACGTTTACCTCTGATAATTCTACAGGAAATGTAAATGTAAACTTTAGAGTTGGTGGTGATGTAGCATATAAGTCAGATACTCTAGCATCATTTGCTTCTACGACAGCAACTCAATTGAGAACATTAATCAGTGGAACCACTGGTATTGATGATCTTGTTTTTCAAACTAATCCCGTTATCTTAACTGGTCTTACTACTACATCTACTGGTTTCTCACTAATTAATTCTGGTGCTCAATCTATTCAGTTTGGTGGTGCTGCAACTCAGATTGAAATTGGTAATACATCTGGTACTACAACTGTTAGTGGTGATTTAGTTGTTGAAAAAGATCTTACAGTTGGTGGTGCTAATACAGACCTCTTAACTTGTAATGCTAGAATTGATGTTGCTAACTCGGACATCTTGATTAGAGGTGGATCGAGTGATCCTATGACTGTAGGTAGAGGAAATAGTGAAGTAGCATCTAATACCGCGATTGGTAAGCAAGCATTATTATCTGTTGTTTCTGGTTCTCAAAATACTGCTGTTGGATATGAAACTGGATTAACAATAAATTCTGGAGCTGGAAATACTGGGTATGGATATCAAGTATTAAGATCCAATGGTGTTGGGGATCTTAACACTGCTATGGGTCGTGCTGCTATGATCTCCAACCTTTCTGGGGATGGCAATACGGCAATTGGTTCTAACGCACTTCAAACAAATACCACAGGAGATGCTAACGTTTGTATTGGATACTATGCTGGATTTGCTGCTACTGGATCTGGTAATGTTTTGATTGGTCCCGCTGACAGTTCAGATCCAGTTAATGATGCTACTTATACTCCGCCAACTCCTGGTGGTAATAGACAACTTGTTATTGGATCTGGTACTGAGTTCTGGATTAAAGGTGATGCAAACTTTGACGTTACTATTAGCAATGATCTAACAGTTAACCGTACTATTACAGTTAAGGGTGATTTAGTTGTCAATGGAACTACAACTACTGTAAAATCTAACGTTGTTGAAATTGCCGATAAAAATATTGAACTTGCCAAAGTTGTAAGTACTACATTTACTTGTTCTACTGCTGATGGTTCTGCAAATATTACATCAATCTCTCCAACTCTAGGATTGATTCCTGGTATGGTAGTTACATCTAATACAGGTGGAGTTAGCGTTCCTAATGGCACAACGATTGTATCTATCACTGGAAACAGTGCTGTGCTTTCCAATAATGTAACGGGAACTGGAACACCAACGTTTAGTGCTATCGGTCCTTCTGATACTGCAGCAGATGGCGGTGGTATTATTCTTGCTGGTAATACACAACACACTTTCTTATGGTCTAATGCTAATGATGCTTGGCAGTCTTCTGAAGACATGGAGGTTGCTCAAGGTAAGACTTACAACATTATTGATGGTTCTGGAAATGCTCGTGAAATGCTGAGTTTGACTCAGATCGGACCCACTGCTGGTAGTGGCGTTGTTGCTGGTCTTGGAACCGGTGTTACTAGTTCTGCTCTAACTTCTATTGGAACTTTAACTGCTCTTGAAGTATCTGGTAATGTAGACATTACTGGAACAGGATATCTACAACTACCTTCTGGAACTAATGCTGAACAACCAGGAGCTTCTGGTCAACCTACAGCAGCAGAAGGTATGCTACGTTGGAATAATAGTTCCAATGTATTTGAGGGATATGATGGTAATGTCTGGGGTAAGATTGGTGGCGGTGCTGCTGTTCAATCTGCTGCTCCTTCTCCTGCTAACCCCGGAGACCTTTGGTATGACACAGACGACGGACGCATGTTCGTATACTATACTGATAGCAGTTCAAGTCAGTGGGTTGATGCCTCACCAAACGGAATGCCAACTGATCTAACTCTTGATGGCACACTAACTGTTGATGGAACTACTAATTTGATTGGTGATCTTTCGGTTGGAACTGAAACAACAAATAGTAATGCTGGATCACAAACACTTTCTGTTGGATCACTTGCTGCTGGACAGTCTGGTGGAATTCAGATTTGGGCAAACTCAACAAATGGAAATTCTTTTGTTCAGTTTGGTGATGGAACTGCGAGTGCTGATCAATACCGTGGATATATCAATTATACACACTCCAATGACAGATTGGGATTTGGAACAGCAGGAGAAAACCGTTTCCTTATTGACAATACTGGAAACATTGAACCAGGAGCAGATGCCACACAAGATCTTGGTTCAGCAACTAAGCGTTTCGCAAACATCTACTCTGCTGACCTTCAACTATCTAACGAGGGTGCTGCTAACGAGGTAGATGGAACTTGGGGTCAGTACACTATTCAAGAGGGTGAGGAAGACCTGTTCCTGATAAATAGAAGGAGCGGTAAGAAGTACAAATTCATGCTTCAGGAGGTAAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ad39ed107aa2c9ef2fb5db8fb1d0a65509539a8b69eb58214c71aecffe683a0b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6991
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank