Protein

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Genbank accession
YP_010082833.1 [GenBank]
Protein name
DUF1983 domain-containing protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,68
Protein sequence
MNRKLAESNDITLNNLIALSNINIKIKPLDTVVHSLIGTDTLVIPIRLEEPITQYKNQYLVVGDEIVKIFSIDNTTKDTIDGKQKDSCHINIIRQQFHTQATETLIGKHCRLVTILTYENQGSDVLSYSFTDSATNTSSDLFSVDLSNGSLVFTDNFQRWSPLSTIQEYQVHNKKTIVYFFKGQNNDMILKNLSIVEKISFATGTSSDIKRITISLKNYLYKWYNQDVSSIKVLKNMQPKEFFKTIFKLKDNEVYYVTGVDPNKAITVNRVALKSFKKVNELLKSYCKHSAIRFTFDKFERIKIFTDYFIDNLQVDDHFSTNISDIMVNDENKLIFNTVKGDIYSNLPMYNFDDLDRCYVNFKKKIPNAFMSNEMLGFSGQTYYPLEITIPNNDLFTSSTIGDYVLAKCTFAPYTEFYGRVIIKEAPNKVKLTFFAWDKDYRLLVQGKEKYINNLLNTVSKPMDLYYVRFELPDIFRFNRNIGGHSREFALDYPILPRVNGEPLYKETIDITFGSASNLKVGSYSGTVEDINKIFGVWDNQNLKYNMEYAQSHSSTTYPPIYMLSNHITEKKFEEGWVAEYTTFDNSDIQLTVEENLNSDKNIDATLILINTRNIPKNQLFVDQELDRKGNQFLRVSDISLYHIGDVLIVNKPEDNPTQQELEEYNNTLKGIRWTIKGKYSETVGRETHHYILVDSPFAKRNYGKKYKFTKFPNESVVFLQELYIKGNPIIQHKQSFVGVSSDRTKTGESSKSLYEEKDYDIGSQGLLEKTELEKLLGYILNNYNATSNETTKYKLPLKLFNALHIEPLDIITIDDPIFTNINKDTYKWIVLSVKISSDTNNVELDCLNINKKNTKPYSLDIKNVLEYKPIEIPKYSNTGTENLGNGQSDSIKDDDVGQVWVAKIDEKEFSAIVEKYNNGYIWFKGFDGTKQAEYKDKLFGKGIEFVVDINGEMILVNSDLQYRAMIRKRQMYATNYNEILAGQKVKFLAITIHTDVDGTLYGRRIHIGDNKNYFHYDMINGATFKGNFQVGEANQNSDNDLYNALQNNRVFRDSSKPINSATVRLKKGDIWYDTANGNRPYVYDGANWLSTRDGSLENNIEFSKIIYSNEPQVIGIQDNDFWVDTDDNNNIYIRKNNTWVSFYSAPTFAKTGQKVFHQTNEPVSDFNYQLKEGDIWFNADEGLIRKSFRHNRWEDVREPYVISTLNGRYIFIGANTPTVWRNKDIFINVVDKHTYINNNGNSEILGNNVLEVENNNKIHFVDSYPKGIAKTGDLWVDIDNNYIIYFYHNGNWEGKLFN
Physico‐chemical
properties
protein length:1299 AA
molecular weight: 150198,37320 Da
isoelectric point:6,00557
aromaticity:0,12317
hydropathy:-0,51147

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Fusobacterium phage Fnu1
[NCBI] 		2530024 Uroviricota > Caudoviricetes > Latrobevirus >
Host Fusobacterium nucleatum ATCC 10953
[NCBI] 		76857 Fusobacteriota > Fusobacteriia > Fusobacteriales > Fusobacteriaceae > Fusobacterium >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010082833.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_055035 [NCBI]
CDS location
range 28677 -> 32576
strand +
CDS
TTGAATAGAAAATTAGCAGAAAGTAATGATATAACTTTAAATAATCTTATAGCATTATCTAATATAAATATTAAAATAAAGCCATTAGACACTGTTGTACACTCTTTAATAGGTACAGACACATTAGTTATACCTATTAGACTTGAAGAGCCTATAACACAGTATAAGAACCAATATTTAGTAGTTGGAGATGAAATAGTTAAAATATTTAGTATAGATAATACTACAAAAGATACAATAGATGGAAAACAAAAAGATAGTTGCCATATAAATATAATTAGACAACAGTTTCACACACAAGCAACTGAAACTTTGATAGGAAAACATTGTAGATTAGTAACAATACTTACATATGAAAATCAAGGTTCAGATGTACTCTCTTATTCATTCACTGACAGTGCTACTAATACAAGTTCAGATTTATTTTCAGTAGATTTATCTAATGGAAGTTTAGTATTTACAGATAATTTTCAAAGATGGAGTCCTTTATCTACTATACAAGAATACCAAGTGCATAATAAGAAAACTATTGTATATTTCTTTAAAGGACAAAATAATGATATGATACTAAAAAATTTAAGTATTGTAGAAAAGATTAGTTTTGCCACAGGAACATCATCAGACATTAAAAGAATTACAATATCATTAAAAAATTATTTATATAAATGGTATAATCAAGATGTATCTAGTATTAAAGTTTTAAAGAATATGCAACCAAAAGAGTTCTTTAAGACTATTTTTAAGTTAAAAGATAATGAGGTATATTATGTTACTGGTGTAGACCCTAATAAAGCTATAACAGTTAATAGAGTAGCTTTAAAGAGTTTTAAAAAGGTTAATGAGTTATTAAAATCTTACTGTAAACATAGTGCTATTAGATTTACTTTTGATAAATTTGAGAGAATAAAGATATTTACTGACTATTTTATAGATAATTTACAAGTAGATGACCATTTTAGCACAAATATAAGTGATATTATGGTAAATGATGAAAACAAACTTATATTTAATACTGTCAAAGGAGATATATATTCTAATCTACCTATGTATAATTTTGATGACTTAGATAGATGTTATGTAAATTTCAAAAAGAAAATACCTAATGCTTTTATGTCAAATGAAATGTTAGGATTTAGTGGACAAACTTATTATCCTTTGGAAATAACAATACCTAATAATGATTTATTTACAAGTAGTACAATAGGGGATTATGTACTTGCTAAATGTACTTTTGCACCTTATACAGAATTTTATGGTAGAGTTATTATTAAAGAAGCACCTAATAAAGTTAAATTAACCTTCTTTGCTTGGGATAAAGATTATAGATTATTAGTTCAAGGTAAAGAAAAATATATCAATAATTTATTAAATACAGTATCTAAACCTATGGATTTATACTATGTAAGATTTGAATTACCTGATATATTTAGATTTAATAGAAATATAGGGGGACATTCAAGAGAATTTGCATTAGATTATCCTATATTACCTAGAGTAAATGGAGAACCTTTATATAAAGAAACAATAGATATTACTTTTGGTAGTGCTAGTAATCTTAAAGTAGGTAGTTATAGTGGTACAGTAGAAGATATAAATAAAATATTTGGAGTATGGGATAATCAAAATCTTAAATATAATATGGAGTATGCACAATCACACAGTTCTACTACATATCCACCTATATATATGCTGTCTAATCATATTACAGAAAAGAAATTTGAAGAGGGTTGGGTAGCTGAATATACTACTTTTGATAATTCTGACATTCAATTAACAGTAGAAGAAAATTTAAACAGTGATAAGAATATTGATGCTACTCTTATACTAATAAATACAAGAAATATACCTAAAAATCAATTATTTGTAGACCAAGAATTAGATAGAAAAGGTAATCAATTTTTAAGAGTATCAGATATTAGTTTATATCATATTGGAGATGTATTAATAGTAAATAAACCTGAAGATAATCCTACACAACAGGAATTAGAGGAATATAATAATACTTTAAAAGGTATTAGATGGACAATTAAAGGTAAATATTCAGAAACTGTAGGTAGAGAAACACATCATTATATTCTTGTAGATAGTCCTTTTGCTAAGAGAAATTATGGTAAGAAATATAAATTTACTAAATTTCCTAATGAAAGTGTAGTATTTTTACAAGAATTATATATTAAAGGTAATCCTATTATTCAACATAAACAATCTTTTGTAGGTGTTTCTAGTGATAGAACTAAAACTGGAGAAAGTTCAAAATCTTTATATGAAGAAAAAGATTATGATATAGGTAGTCAAGGTTTATTAGAAAAGACAGAATTAGAAAAATTATTAGGATATATATTAAATAACTATAATGCAACTTCTAATGAAACTACCAAATATAAATTGCCTTTAAAACTCTTTAATGCTTTACATATAGAGCCTTTGGATATAATAACTATTGATGACCCAATATTTACTAATATAAATAAAGATACTTATAAATGGATAGTGTTATCAGTCAAAATTAGTTCAGATACAAATAATGTAGAATTAGATTGTTTAAATATAAATAAAAAGAATACTAAACCTTATTCTTTAGATATTAAGAATGTACTTGAATATAAACCTATTGAAATACCTAAATATTCAAATACAGGTACAGAAAATTTAGGTAACGGACAATCTGATTCAATAAAAGATGATGATGTAGGTCAAGTATGGGTAGCTAAAATAGATGAAAAAGAATTTTCTGCAATAGTAGAAAAATATAATAATGGTTATATTTGGTTTAAAGGTTTTGATGGTACTAAACAAGCTGAATATAAAGATAAATTGTTTGGTAAAGGTATAGAATTTGTAGTAGATATTAACGGAGAGATGATATTAGTAAATTCAGATTTACAATATCGTGCTATGATTAGAAAAAGACAAATGTATGCTACAAATTATAATGAGATATTGGCAGGACAAAAAGTAAAATTCTTAGCTATAACAATACATACAGATGTAGATGGTACTTTATATGGTAGAAGAATACATATAGGGGATAATAAAAACTATTTCCACTACGATATGATAAATGGTGCTACTTTTAAAGGTAATTTCCAAGTAGGAGAAGCTAACCAAAACAGTGATAATGACCTTTATAATGCTTTGCAAAATAATAGAGTATTTAGAGATAGTAGTAAACCTATAAATAGTGCTACTGTTAGACTTAAAAAGGGAGATATTTGGTATGACACTGCTAATGGAAATAGACCTTATGTATATGATGGTGCAAATTGGCTATCTACAAGAGATGGTAGTTTAGAAAATAATATTGAGTTCTCTAAAATAATATATTCAAATGAACCTCAAGTTATAGGTATTCAAGATAATGATTTTTGGGTAGATACAGATGATAATAATAACATATACATAAGAAAAAATAATACTTGGGTATCTTTTTATTCTGCACCTACTTTTGCTAAAACAGGACAAAAAGTATTTCATCAAACTAACGAACCTGTATCAGATTTTAATTATCAACTTAAAGAGGGAGATATTTGGTTTAATGCTGATGAAGGTTTAATTCGTAAATCTTTTAGACATAATAGATGGGAAGATGTTAGAGAACCTTATGTTATATCTACATTAAATGGTAGATATATTTTTATAGGTGCTAATACACCTACTGTATGGAGAAATAAAGATATTTTCATAAATGTAGTAGATAAACATACATATATAAATAATAATGGAAATAGTGAAATATTAGGAAACAATGTATTAGAAGTAGAGAATAATAATAAAATTCATTTTGTAGATAGTTACCCAAAAGGTATTGCAAAAACTGGGGATTTATGGGTAGATATAGACAATAATTATATTATTTATTTCTATCATAATGGAAATTGGGAAGGAAAACTGTTTAATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
3ddfaeb038f10875fbe5542c341117c1eda5460684f66f25e4d876c5abf7d938
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5514
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genomic, morphological and functional characterisation of novel bacteriophage Fnu1 capable of disrupt Fusobacterium nucleatum biofilm Kabwe,M., Brown,T.L., Dashper,S., Speirs,L., Ku,H., Petrovski,S., Chan,H.T., Lock,P. and Tucci,J. 2019-06-24 — GenBank