Protein

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Genbank accession
QHR66938.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,60
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MANIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDRLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNGTAGTINLTLPSGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTVAGTRYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTVVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGTAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNDGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNEFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGTLNANGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFLIRNDGSNTYFLLTHPGGQTGGFSGLRPLAINNQSGQVTIAEGLVIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGNKTSDLYTRAPTSDNVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139337,31550 Da
isoelectric point:5,42536
aromaticity:0,07281
hydropathy:-0,31789

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–140
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1000–1276
DC_1209
QHR66938.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-140 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1276 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage mogra
[NCBI] 		2696422 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR66938.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850579 [NCBI]
CDS location
range 20058 -> 23933
strand -
CDS
ATGGCCAACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACTGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCAGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAATACGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTACCGATTACGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGACACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAGATTAAACCCGCTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGGTACAGCCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTTCCGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTTCAACAAAACGTCCCAACTGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCGGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCATCATTTGTGGACGATACTGTTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGCTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACGCCTAAGAAATTACAGGCCCGTCAGGGTTCTGAAACACTATCTGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCTGAAACTCGTGGTACCGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAACTGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATGCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTCGATAGTGAAGTAATTGCTGGTCAATCCCAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGATGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGACGATACTCGTATCTCAACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACAAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCGATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTCGTTGGTAATGATACGGTTGGTTCAACACAACCTTTAGAATCATATGAAAAAAATAGCTATGCTATATCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTGAAAGCTAAAGCCGTAGATAGTAATTTATTAGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCGGTATCTGCTAATAGTACACTGACTATTTCTAATACGGGAACAGCTACTCGTCTAATTTTTGAGAAAGGACCTCAGACTGGAACTAACCCAGCACAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATGAATTTGGTGGTGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTCGAAGTCGGTGATGAAACATCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAATAAATGTTAACGCTTCAGGCACGTTAAATGCGAATGGTGTAGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATTAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTACGGATTCCTTATTCGCAATGATGGCTCTAATACCTATTTTTTGCTAACCCATCCAGGAGGCCAGACTGGCGGATTTAGTGGATTGCGTCCTTTAGCTATTAATAATCAATCCGGCCAGGTTACAATTGCCGAAGGGCTTGTTATTGCTAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTGACTGTTAACTCTAGAATTCGTTCTCAGGGTAATAAAACATCTGATTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATAATGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACCCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACTCGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAAGTATTTGATGGGGGTAACCCTCCTCAGCCATCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
da36a8acace57687d5e41fc9219e52f5abebcf9112fe0e7396d7868d1e8532f0
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5522
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank