Protein

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Genbank accession
WVX92454.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MPKSGAMAPYVVVNRDAAVAGVFSVDGEAGAVVLTSKYLQISNYTIDKEELNTRLTGIDSSIQNNVEAIGNINTAIGSINSTLNTKAAKGANNDITELNALTKAITIAQGGTGASTAENARVNLELNRFKQFPGETLVYSPSATNYLTVGEGTTWGVYSTASGTFIPLPIQSGGTGASTPAEALTKLLDGKPLALAADGQAPYDAVTVRQLANISGGGGASMSGVMNNRIGAVEWFNGNRTKLPAGYIPADGQLVSRTDAKTADLWSAVSSGLFYSVSDALWINSGDPVRPCAWRASYSTGDGSTTFRVPDLNGTQLNSIKHLFLSGSSGATNEPSANQVWNQVAPNITGNFYTHGSNADAADAMGAFYLNAQDTGSSFNIGGTDKGDHLGFSASRSSKTYGRGVAYQPDPGGTSPIGDLYPNHAAGIWIIRANGSFNAASTDFSSINADASAPAVSTTVLGGKLTSQYRVGATDAYRMRMYAQGAYARNLVGVIAVENQLASEIDVAHFNFGLDGAIRLGKAIGGSSTSLAYGYTPFRAQDWWNTSPYGAFVPIVGGGTGGPGGAWRSYTALGTLTMGSDINTHPNAMLTQCWDYNLSTGESPSGNTVRNTIFNGTSYDITFGDNAGTVNYIFSKSPISDRNKKKDIESLSTSIALENIKQMEYISFKYIYDKGNQVRRGFIAQQLEEIDSQYVRKYESSDGSTSLALDENVLLLDALAAIQNLSNQIEELKLQIAELKAK
Physico‐chemical
properties
protein length:742 AA
molecular weight: 78195,74250 Da
isoelectric point:5,23512
aromaticity:0,08760
hydropathy:-0,21658

Domains

Domains [InterPro]
DC_0017
STR
1–742
DC_0017
IPR030392
CHP
640–736
IPR030392
IPR030392
CHP
640–695
IPR030392 Coil
WVX92454.1
1 742
Architecture
STR
STR 1-742
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoS_HZ_ZJUN2
[NCBI] 		3119841 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli NDM-1
[NCBI] 		1411081 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Escherichia > Escherichia coli

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WVX92454.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP216084.1 [NCBI]
CDS location
range 36529 -> 38757
strand +
CDS
ATGCCTAAATCTGGCGCAATGGCGCCTTACGTAGTAGTTAACAGAGACGCTGCAGTTGCAGGAGTATTCTCTGTTGATGGAGAGGCTGGTGCTGTTGTACTAACCTCCAAGTATCTTCAAATATCTAACTATACTATAGATAAAGAAGAATTAAATACTCGTTTAACTGGTATTGATAGTTCCATTCAGAACAATGTAGAGGCTATTGGCAATATTAATACTGCAATTGGTAGTATTAATAGTACTCTCAATACTAAAGCTGCTAAAGGTGCTAATAATGATATTACAGAATTAAATGCGCTTACTAAGGCTATTACTATAGCTCAGGGTGGGACAGGTGCTAGCACTGCGGAAAATGCTAGAGTTAACTTAGAGCTTAATAGGTTTAAGCAGTTCCCCGGTGAAACTCTAGTATATAGTCCTTCTGCGACAAACTATCTTACTGTTGGTGAAGGTACTACATGGGGAGTTTATAGCACAGCTTCTGGTACATTTATACCTTTACCTATTCAATCTGGTGGGACAGGTGCTAGTACTCCTGCGGAGGCCTTAACTAAGCTGCTAGATGGTAAACCTCTAGCATTAGCCGCCGATGGTCAAGCACCTTATGATGCTGTTACTGTTCGTCAGCTAGCTAATATCTCAGGAGGAGGTGGTGCTAGCATGAGTGGAGTTATGAATAATCGTATCGGTGCTGTTGAATGGTTCAATGGTAACCGTACTAAACTGCCAGCCGGCTATATACCAGCAGATGGTCAGTTAGTTAGCCGTACTGATGCTAAAACAGCAGATCTATGGTCTGCGGTATCTAGTGGTCTATTTTACTCTGTTTCCGACGCTTTATGGATTAATAGTGGGGATCCTGTTAGACCCTGCGCTTGGAGAGCTTCCTACTCTACTGGTGATGGTTCTACTACTTTCCGAGTTCCAGATCTTAACGGTACTCAGTTAAATAGTATTAAGCATTTATTTTTATCTGGTAGTTCAGGTGCTACTAATGAACCTTCGGCTAATCAGGTGTGGAATCAGGTTGCCCCTAATATTACTGGTAATTTCTACACTCATGGTAGTAACGCAGATGCTGCAGATGCCATGGGGGCTTTTTATTTAAATGCTCAAGATACAGGTAGTTCATTTAATATAGGAGGTACAGATAAGGGAGACCACTTAGGATTTTCGGCCTCTAGAAGTAGCAAGACATACGGTCGTGGTGTGGCTTACCAACCAGACCCTGGTGGTACCAGCCCTATTGGTGATCTATACCCTAACCATGCAGCCGGTATTTGGATTATCCGTGCTAACGGTTCTTTTAACGCTGCTAGTACAGACTTTTCTTCTATTAATGCTGATGCCTCGGCTCCTGCAGTTAGTACAACTGTATTAGGTGGTAAACTAACCTCTCAATACAGAGTGGGTGCAACAGATGCGTATAGGATGCGTATGTATGCTCAAGGTGCCTATGCGCGAAACTTAGTGGGTGTTATAGCTGTAGAAAACCAATTAGCAAGTGAGATAGATGTGGCCCACTTTAATTTCGGGTTAGATGGTGCAATTAGGTTGGGAAAAGCTATAGGAGGTTCTTCAACTTCTTTAGCTTATGGGTACACTCCTTTTAGAGCACAAGATTGGTGGAATACTTCCCCCTATGGAGCTTTTGTCCCTATTGTTGGTGGAGGTACAGGAGGGCCTGGAGGCGCTTGGAGAAGCTATACGGCTCTAGGTACACTTACTATGGGTAGTGATATTAACACTCACCCAAATGCAATGCTTACACAATGCTGGGATTACAATCTTAGTACTGGGGAATCCCCTAGTGGTAACACTGTTAGAAATACTATCTTTAATGGTACTAGTTATGATATTACTTTTGGTGATAATGCAGGTACTGTTAACTATATATTTAGTAAGTCTCCAATTTCAGATCGTAATAAGAAAAAGGATATTGAATCCTTAAGCACTTCCATTGCTCTGGAGAATATTAAGCAGATGGAGTATATCTCATTTAAGTACATATATGATAAAGGGAATCAGGTACGTAGAGGTTTTATCGCGCAACAACTAGAGGAGATTGATAGTCAATATGTAAGAAAATACGAATCTTCCGACGGTTCTACTTCTCTGGCCCTAGATGAGAATGTGCTTCTATTAGATGCTTTGGCGGCAATTCAAAATCTAAGTAATCAGATAGAGGAGCTAAAACTTCAGATAGCTGAGTTAAAGGCTAAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
eabb448475255c2bf437131339b4f8b6212036b71bac4a2a720607c1a12ef9eb
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6423
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50