Protein

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Genbank accession
YP_010247069.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,66
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPSAPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLVFVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIITLVDLDKLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDASNSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATTGTINLTLPTGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAATGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTNSYVPVLELAYIEDTDSDTHYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQTETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAIDSEVIAGQSQSGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRRATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQNLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGASTRLIFEKGPQTGNNPAQAMNIRVWGNQFAGGSDTSRATIFEVGDETSNHFYSQRDNLGNITFSINGTVRPINVNASGTLNANGAATFGRSVTAQGEFITYSANAFRAISGNYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTADLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139537,46590 Da
isoelectric point:5,33607
aromaticity:0,07436
hydropathy:-0,30991

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–200
DC_1946 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1065–1276
DC_1209
YP_010247069.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-200 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1276 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage HX01
[NCBI] 		1237364 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010247069.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_018855 [NCBI]
CDS location
range 121318 -> 125193
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGATTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACTGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAGTGCACCAGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCATCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTAGTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATCATTGATTACGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGACACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCACCCTAGTCGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTTCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCTGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACAACCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTACTGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCAGCTACTGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTTTCTGTTACTGAATTGGAATTCAATGGTACTAATTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCATATATTGAAGATACCGATTCTGACACCCATTATTGGGTTGTGCAACAGAATGTCCCTACGGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCGGCTAAAGAAGTTGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCATCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGACTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACGCCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGTTCCGAAACACTATCGGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCCGAAACTCGTGGGGCTGCAGGCACTAATGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTACGCCCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTATTGATAGTGAAGTAATTGCTGGACAATCTCAGTCTGGATACTCTCATGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAGAGCGACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGTGTAATCAAGGTTGCAACCCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCGAACACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCAACATGGGCTGCTACTACAGCAATTCGCGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACACAAAACTTAGAGCTATACGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCGTATGAATTAAACCGTGTATTGGCAAATTACTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGCCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACGGCTACGTTTGGTGGTTCGGTATCTGCTAATAGTACATTAACTATTTCTAATACAGGTGCTTCAACTCGCTTAATATTTGAAAAAGGTCCACAAACTGGAAACAACCCTGCTCAGGCGATGAATATCCGTGTATGGGGTAACCAATTCGCCGGCGGTTCTGATACATCTCGTGCTACGATATTTGAAGTTGGTGATGAAACATCTAACCACTTTTATTCACAACGGGATAACCTTGGTAATATTACTTTCAGCATCAACGGTACAGTTCGGCCGATTAATGTTAATGCATCCGGAACATTGAATGCTAATGGTGCGGCAACATTTGGACGTTCGGTGACAGCACAGGGTGAATTTATAACCTATAGTGCAAACGCATTCAGAGCAATTAGTGGTAATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGCTGCTAATACCTATTTTATGCTTACTGCATCAGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCCGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGCACTAAAACCGCTGATTTATACACCCGTGCACCGACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGACATTAATGATTCAGCTACTTATAACCAATTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCGAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGCGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGCGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTTCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5c2b20e4342a0ee739b5a68fc2e584839c45a154d04d71349e36247501887059
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8025
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50