Protein

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Genbank accession
WCZ57018.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,62
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MAITKIILQQMVTMDQNSITASKYPKYTVVLSNSISSITAGELTTAIESSKASAAAAKQSEINAKQSELNAKDSENEAEISAASSQQSATQSASSATASANSAKAAKTSETNAKASETAAKTSETNAKASETAAKTSETNANSSKAAAAASASAAKTSETNAAASASAAKTSETKAKASETAAKTSETNAKASELKAKEYADIVAPSNFLSKSQNLDDIPNKSAARLNLEVFHQSRVNLDDTNLDTLKGGQAGFYYQSANALATTEKGYPVRAAGSLEVIKNAANTVDGCHQIYRPYNTQDFYFSRWYDSAKSVWSTWSAFYAPESSDAYRTRIGLGALNNPQFANVNLVNVSDNAQAASGIISGYLNNNSGAQRARYRLYSEVRGDNKEWVTIHLQSDTNTNKYAGLSIDGNFQINGNFIGNAISLSDVATSKVNLKIDRLDQWGSETWVYNASKTMRLGLTDNSWGAYSDTEKRWIPLDVSHGGTGGNNTSDARRNLEVMYRRFSTLTGQNLNDLNGDYAGFYYQSLSANATTDRNYPIQEAGNLMVLQNSANGTPGCCQIYITFSTNRIYERSYNPGTSTWSAWGSILNSYDPSYCRQLIELGSQHAPLFAGLALTGYSDSTAAAGGIINSYLRATDGTQRVRMRLYPEKLADGVAAATLQIMGEDTGPSYKTFHFKHNGQLYVPNEINTETIAVRDLTVTQRNLGIPTTGFMGDYQTINAPAGAVDGKYYPVIIYTGGTNGYGITPVPIFVRTPGRSASHEMNNNVFSGYVTCGGWSDSPTMAHGMFTTYDPNELGILCIKGSNKDYAQHIAVYVHYKAFPINIMTDPKVEIIVPTEDYVLGTNGVKFKFGVTDAGDGNTEGNVKNILNFTGGGSGYYSTHPFRQGLSNNFALTNNLSTGDAFSATAPSFTFNGSVVGANSYSARGDAVTKNTYTSQLVNSDDNIVGQSEFRATEEAGQIIVRDMSSSASHKFFNFNKDGTFSAPSGILSSTGIDWNTQHNTINKFYGVAGQVNTPENNVVYGGIHVGFSGNYATQFVGRGSKFWARSIEGGTIGTWNRLITDKFADFGVPISISRNGECFTLRSSVSDTSESGYLAGRTANNTRMWYIGKSGGTKAVVVANDMTGASLNLGDDGNTSIRTPNYNGGIFADGSAVVVRRGNGRTFSYENNQTAAKSATILLWGNTTGRPSVVECKLSDGYLFYAQQSSDGSRVFNVNGKVEATNITQSSDRDLKDNIEEIQNATESLRKMKGYTYTLKENGLPYAGVIAQEVMEALPEAVSGFTKYTDLEGPTLTGEQLVGEERFYSVDYAAITGLLVQASRESDSRITALESEVSDLKKQIADLTLVVNSLLANR
Physico‐chemical
properties
protein length:1360 AA
molecular weight: 146110,28500 Da
isoelectric point:5,84785
aromaticity:0,09191
hydropathy:-0,41199

Domains

Domains [InterPro]
DC_0608
ATT
2–578
DC_0608 DC_1202
Coil
Unmapped
57–77
Coil cd19958 DC_1190 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
cd19958
STR
507–587
cd19958 IPR030392 Coil
WCZ57018.1
1 1360
Architecture
ATT
STR
ATT 2-578 | STR 579-1360
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage Kenya-K15
[NCBI] 		3027603 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella enterica
[NCBI] 		28901 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WCZ57018.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ291029.1 [NCBI]
CDS location
range 79861 -> 83943
strand -
CDS
ATGGCTATAACTAAAATAATTCTACAGCAAATGGTCACTATGGACCAGAATAGTATAACTGCAAGTAAATATCCTAAGTATACAGTTGTGCTTTCTAATTCTATTAGTTCTATCACTGCTGGTGAGCTAACTACTGCAATAGAATCCTCTAAAGCTTCTGCAGCAGCAGCTAAACAATCTGAGATTAATGCTAAACAGTCGGAGCTAAATGCTAAAGATTCTGAAAATGAAGCAGAAATTTCTGCGGCATCTTCTCAGCAGTCTGCAACTCAGTCTGCTTCTTCTGCTACTGCTTCTGCTAATAGTGCTAAAGCTGCAAAAACTTCAGAAACCAATGCAAAAGCTAGTGAGACAGCTGCAAAAACTTCAGAAACCAATGCAAAAGCTAGTGAAACAGCTGCTAAAACTTCTGAGACTAATGCTAATAGTAGTAAAGCTGCTGCGGCTGCATCTGCTTCAGCAGCAAAAACCTCAGAAACTAATGCTGCTGCGTCTGCATCTGCTGCTAAAACTTCAGAAACTAAGGCAAAGGCTAGTGAGACAGCTGCTAAAACTTCTGAGACTAATGCAAAGGCTAGCGAGTTAAAGGCTAAGGAATATGCGGATATAGTTGCTCCTAGTAATTTTCTTTCTAAATCTCAAAATTTAGATGATATACCTAATAAATCTGCCGCTCGCCTTAATCTAGAAGTATTCCATCAATCAAGAGTAAACCTAGATGATACTAACTTAGATACTCTTAAAGGGGGTCAGGCCGGTTTTTATTACCAGTCCGCTAATGCCCTTGCTACCACAGAAAAAGGTTATCCAGTTAGAGCAGCAGGATCACTGGAGGTAATAAAAAATGCTGCTAATACAGTAGATGGTTGTCACCAAATATATAGACCATATAATACACAAGACTTCTATTTTTCTAGGTGGTATGATTCTGCCAAATCTGTATGGTCTACATGGTCTGCCTTTTATGCACCTGAATCCTCTGATGCATACAGAACTAGAATTGGTCTAGGGGCGCTCAATAACCCTCAATTTGCGAATGTTAATTTAGTAAATGTGTCTGATAATGCCCAGGCAGCCTCTGGTATTATAAGTGGATATTTAAACAATAATTCCGGTGCACAGAGGGCACGCTATAGGTTGTACTCCGAAGTACGTGGCGATAACAAAGAATGGGTTACTATACACCTACAATCAGATACTAATACTAATAAGTACGCAGGATTAAGTATTGATGGAAACTTTCAGATTAATGGAAATTTTATAGGTAATGCCATAAGCTTGTCAGATGTAGCTACTTCTAAAGTAAACTTGAAGATTGATAGGTTAGATCAGTGGGGAAGCGAAACCTGGGTCTACAATGCCTCTAAGACTATGCGTCTAGGACTTACTGACAACTCTTGGGGAGCATATAGTGACACAGAAAAAAGGTGGATTCCACTAGACGTATCCCATGGCGGTACTGGCGGTAATAATACTTCTGATGCGCGTAGAAATCTAGAAGTAATGTATCGTAGATTTTCTACCTTAACAGGGCAGAACTTGAATGACCTTAATGGTGATTACGCAGGTTTCTACTACCAGAGCCTATCAGCTAATGCAACTACAGACCGTAATTACCCTATTCAAGAAGCTGGAAACTTAATGGTACTACAAAATAGTGCTAATGGAACCCCAGGATGTTGTCAGATATACATTACCTTTAGTACTAATAGGATATACGAACGTAGTTATAACCCAGGTACCTCAACATGGTCTGCCTGGGGATCTATCCTTAATAGTTATGATCCTAGCTACTGTAGACAGCTTATTGAGCTAGGTTCCCAGCATGCACCATTATTTGCTGGTCTAGCATTAACTGGATATAGTGATAGTACGGCAGCTGCTGGAGGTATTATTAATAGCTATCTAAGAGCTACAGATGGTACTCAAAGGGTACGTATGCGCTTATACCCCGAGAAACTTGCTGATGGGGTTGCGGCTGCAACGCTACAGATTATGGGGGAAGATACTGGTCCATCTTATAAAACATTCCATTTTAAACACAATGGCCAATTATACGTACCAAATGAGATAAATACGGAGACTATAGCTGTTAGGGATCTTACTGTAACCCAACGAAATTTAGGTATACCTACTACTGGATTTATGGGTGATTACCAGACTATCAATGCACCCGCGGGTGCTGTAGATGGAAAATATTACCCAGTTATAATCTACACTGGGGGTACCAATGGTTATGGTATTACGCCTGTACCTATATTTGTGCGTACTCCTGGTAGATCTGCGTCCCATGAGATGAACAATAATGTTTTCTCTGGATATGTAACTTGTGGGGGTTGGAGTGATAGTCCCACTATGGCACACGGCATGTTTACAACATACGATCCTAATGAACTAGGGATCTTATGTATAAAGGGTAGTAACAAAGACTACGCCCAGCATATAGCAGTGTATGTACACTATAAGGCATTCCCTATAAATATTATGACAGACCCCAAGGTTGAGATAATTGTTCCAACTGAGGATTATGTATTAGGTACTAACGGTGTTAAATTTAAGTTTGGGGTAACAGATGCGGGTGATGGGAACACAGAAGGTAATGTGAAGAATATTCTAAACTTTACTGGTGGTGGTTCTGGTTACTACTCTACTCATCCTTTCCGCCAGGGATTATCTAATAATTTTGCCCTAACTAATAACCTTAGTACTGGAGATGCTTTTTCTGCTACTGCACCTTCTTTTACTTTTAATGGTAGTGTTGTCGGTGCTAATAGTTATTCTGCTAGAGGTGATGCTGTAACAAAAAATACGTATACATCTCAACTGGTAAATAGTGACGATAACATAGTAGGGCAGAGTGAGTTTAGGGCAACCGAAGAAGCAGGACAAATTATTGTTAGAGATATGAGTAGTTCTGCTAGCCATAAATTCTTTAACTTCAATAAGGATGGAACCTTTTCAGCTCCTTCTGGTATTTTATCTTCTACTGGTATAGACTGGAATACCCAACATAATACTATCAATAAATTTTATGGTGTTGCGGGTCAAGTTAATACTCCGGAAAATAATGTTGTATATGGTGGTATCCATGTAGGGTTTAGCGGTAATTATGCTACCCAGTTTGTAGGTCGTGGATCTAAATTCTGGGCTAGAAGTATTGAGGGTGGTACTATTGGAACATGGAACAGATTAATCACAGATAAATTTGCTGATTTTGGTGTTCCTATATCTATATCTCGAAATGGGGAATGCTTTACTCTAAGATCTAGCGTTAGTGATACTTCTGAAAGTGGTTATTTAGCTGGTAGAACAGCAAATAATACTAGAATGTGGTATATCGGTAAAAGCGGAGGTACTAAAGCTGTTGTTGTAGCTAATGATATGACAGGAGCTTCATTAAACTTGGGAGATGATGGTAATACCTCAATAAGAACTCCTAATTATAATGGGGGTATATTTGCTGATGGATCTGCAGTGGTTGTACGGCGAGGTAATGGTAGGACGTTTAGTTACGAAAATAATCAGACAGCAGCAAAAAGTGCTACTATCTTGCTATGGGGTAATACTACTGGGAGGCCCTCTGTTGTTGAATGTAAGCTATCAGATGGTTATTTGTTTTATGCTCAACAAAGCTCTGATGGATCCCGTGTTTTTAATGTTAATGGAAAAGTTGAAGCAACAAACATTACCCAGTCATCCGATAGAGATCTGAAGGATAATATTGAGGAAATCCAAAACGCCACTGAATCATTGCGTAAAATGAAAGGCTATACTTATACCCTTAAGGAAAATGGGCTACCTTACGCTGGTGTTATAGCTCAGGAAGTAATGGAAGCTCTACCTGAAGCTGTGAGTGGGTTTACAAAATATACAGATCTTGAAGGGCCTACACTTACTGGTGAGCAACTAGTTGGTGAGGAACGTTTCTATTCTGTTGACTATGCTGCCATAACAGGTCTACTAGTACAGGCAAGCAGAGAATCGGATAGCAGGATCACAGCTCTAGAATCAGAAGTATCTGATCTTAAAAAGCAAATTGCAGATCTAACCCTAGTAGTTAACTCTCTACTAGCAAATAGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b78f0072989dad2a27a9708c5b1de36392284e25ecf1f06c8851e65bc44a9298
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5558
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Whole genome sequence of Salmonella phage Kenya-K15 Gunathilake,D., Makumi,A., Loignon,S., Trembley,D., Labrie,S., Svitek,N. and Moineau,S. 2024-01-11 — GenBank