Protein

View in Explore
Genbank accession
WJJ54249.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIGTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKTVFDPTGSSEINIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQNIQGDANLLRLRNQNANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGSDEVKLYNNKYNSVLTVASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNTFSGLNTFSTSVSISSNAAAIMLKNKAVDESLFIQAKDVENNNLWYIGKGGANDNITFYDYKGDTSIVLNSSGAAFNKTVKITGQVQPSDWDNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFKSGQTIVADGQALLLRSATDSPSLYVRGQNQSGTNKWYVGFSTSNVLGLSNEASGTTLTLDSAGINSNKNLNITGQVKPSDFSNLDARYFTQSASDSRYLRIRSTNFNNGNDDKWAKIATVVMPPSASTAVIEVFGGSGYNYGFPYQASKTEIVLRAGGDSPKGLNIVAWKNSENLIITDIGYVNTSGDTYDIYCRVGPFQNDTTSRVQSSSNASVQLFEAPQTFDDAPQGIVKGTIARYYTSMQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHQFGGYINSFYGDSSHTSFQPGGGAWTQAAGDHSHSVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:812 AA
molecular weight: 87334,28870 Da
isoelectric point:7,18078
aromaticity:0,09236
hydropathy:-0,37537

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–268
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 SSF88874
IPR048388
ATT
159–247
IPR048388 IPR048388 IPR048388 IPR005003 IPR005003 DC_2042
G3DSA:6.20.80.10
STR
159–218
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 DC_0387 IPR005003
WJJ54249.1
1 812
Architecture
ATT
ATT
STR
RBD
ATT 1-361 | ATT 380-465 | STR 466-784 | RBD 785-812
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage MBP4696116
[NCBI] 		3042442 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella pullorum
[NCBI] 		605 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WJJ54249.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP515798.1 [NCBI]
CDS location
range 55531 -> 57969
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGGTACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACAGGTGACTTAGGAATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGACAGTATTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTAATATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTCTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTTACAAACACATTCTCTGGGACTCAGAACATTCAAGGTGATGCTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATTGAAGGTGTAAACCTAGATGGTTCGGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGTAATGGCTCTGACGAAGTAAAGCTGTACAATAACAAATACAACTCAGTCTTGACTGTTGCAAGTAATATCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAACACTTTTAGTGGTTTAAATACATTCAGTACTAGTGTTAGTATTAGCTCTAATGCTGCTGCTATCATGCTAAAAAATAAAGCTGTTGATGAGTCTTTGTTCATCCAAGCAAAAGATGTTGAAAACAATAACCTGTGGTATATTGGTAAAGGTGGTGCAAATGACAATATCACATTTTATGATTACAAGGGCGACACTTCTATTGTATTAAACTCGTCTGGTGCTGCATTCAACAAGACTGTAAAAATCACTGGTCAAGTCCAACCTTCAGATTGGGATAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAAATCTGGGCAGACAATTGTAGCAGATGGTCAAGCACTATTGTTAAGAAGTGCAACTGATAGTCCCTCTCTCTATGTTAGAGGCCAAAACCAATCTGGAACTAATAAATGGTATGTTGGATTTAGTACTTCAAATGTTCTTGGATTATCAAATGAAGCCTCTGGCACGACATTGACATTGGATTCAGCAGGTATTAATTCTAATAAGAATTTAAATATCACTGGTCAAGTTAAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAAAGTGCTAGTGATAGTAGATACCTGAGAATCAGAAGTACTAACTTCAATAATGGAAACGATGACAAGTGGGCTAAAATTGCTACTGTTGTAATGCCGCCTTCCGCATCTACTGCGGTGATTGAAGTGTTTGGTGGGTCAGGTTATAACTATGGTTTCCCTTACCAAGCTAGTAAAACGGAAATTGTTCTCAGAGCAGGGGGTGATAGCCCAAAAGGTTTAAATATTGTTGCTTGGAAAAACTCGGAGAATCTCATTATTACGGATATCGGTTATGTTAATACATCTGGTGATACTTATGACATTTACTGTAGAGTTGGTCCATTCCAAAATGACACAACATCAAGAGTTCAATCTTCTAGCAATGCAAGTGTGCAATTGTTTGAAGCCCCACAAACATTTGATGATGCTCCACAAGGTATTGTAAAGGGTACAATTGCAAGATACTACACAAGTATGCAAAAACCAACCCCTTCAGATATCGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACCGCACTTCCTGGATTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGGATTGCAGCAGCGAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACATTAGCAGTTGGAAACTTGCCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCATACTCACCAGTTCGGCGGTTATATCAACTCGTTCTATGGAGACTCCAGTCACACCTCATTTCAGCCTGGAGGTGGTGCGTGGACACAGGCCGCTGGCGACCATTCCCACTCTGTAGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTAGTACAGGCTCTGGTTCGGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7ce9f22a7b8323283a0ee3d36be3de9a38b9b4261141678595a11a10e506394b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6953
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome of Salmonella phage MBP4696116 Bao,H. 2022-06-16 — GenBank