Protein

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Genbank accession
AGF87544.1 [GenBank]
Protein name
gp58-like protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,80
Protein sequence
MEVQGLIYLKDGNIPLNLAYDDDIVQEANSTYQLSFKFPLTDGKWNLLRREVFLLADDLHGEQEFFIFEVKKAKGHVQVYAKQVATLLNYYSINSISVDRVPGQTVMTALAGSVKRPCPFTFFSDILDRHTFNESNVSVMAALAKDKHSIVGQWGGDLVRDKYQVKLLKNGGIENESLFMYKKNLSSYEESENINNLKTRLHLKKTIKGQSEGEADRVIAVTVDSPLIGQYRQIYEADIEVNDQDVTDVASLTAYGKRYFSSTLCDLVENSINLDVKGKSDVSVKMFDMVSVFHERFDVDLRLKISSYHFGPMSKRLKSIGFGKVSQSFGSTVASMVAGSVDKATGRLSASFEQKLQKEIDNANRHFDAEFDKRVESINDGIEQAQAEAERYADAIKQEIDTEIAQVNQSMQSQEQEHDREVANILSKTQSVESLANQAKADAANAIARANQVKTEAIADARAQVATVNQALNTAKTDLQNQVNAIDAKAVQAQRDITQAKYDLQSQASQLIAQATKQVELTKLTTETKKLADGTLTSLNELTKTVDKTTGDLTSVTNRTKVVEDSLAGVKTNYTQLNQTVNAQTGQIDSINRKTADLQSGIDGVTERFKSLKIGSRNYFKNSKSRKYYITSLTTQDVRTYIDEEFWQNDTRFVKDYVRVSFDIAFNPALQSDFTTTVHFSATPWYGAGITFKGGTTALQHFDLKFNLSDATKAYKTDNVFIRLTNTIPLNTAVSLENFNLYLSAVIEDYSQSNADFESKIAEYKRTADQNYAGLQSTVSTLDGKVTQNKTEANQTATQLSNRLTSLETYKDGESTRAQSYFEASKTETAKQLTAERTAIATNYVAKSTYTEDVRGTTQKLNEIKSTADTAKQNLATYQNTVDRKLEELTSSTQTLDGKINTASAKVDTVAGQIRTEIGTVEAKIPTEAGGRNYILKSQAEISSTGRWVSKPFNLSSDLLSNLSKIKTVTISCDVEGINVSALNSRKRYGLACSVEINGVVNYWEVWQTQDTTKKRISQTFTVPEGKVITKFHSPTLWIQAAGDIKVSNPKIEFGRVPTDHTLAPEDFANELSSVKTTITQTASGVEQLSTSLATTDNKVTTAEAKIRQLISDVSSKVSQTDYNTLTGRVDDAETAITQNATEISKRLTKTQVDKAITDKGFQTASQVDTAIAGKGYQTKSDVDNNITGRGYITSSALQPYALSTTVQNLVKETAGSFERQITETRGLIPSNAGTRNLLKGTKDLSGNDAKSFNTSDKYLDFNIARSRPTTGYSDTFSAYTTIPVTANDYIISFYAKSDVDGATLYCHFYNPNTTTKAESSTGYKSGSSDGLARVQVTTEWQRYWVKWSQSKTDTVKKVIIGRNNSADGIKIIEVAGVALYEGALNKGHFDAPEDLATVTALHNVNDTVDSHTRTIGAVGTTGSILDNVSKVTQTAAGLVQEVSGTNGLKTQVSTLAGSYAIKSLTKAGDVLGQINLNRDGSIKLDGSLVQITGKTYIQDGVISAAKIGDLDAGKIKTGTLDAARIKANSIDGSKLVFDQAFVNKMTANEALFKQLFAQSAFITSVQAVAVSAKQIAGGIAKALNGGMDVNFDESKINFYTNVAAIRRIYTGHPTQFIKFETEGNYSRTIIGSNRNGGEVFNSATFAGIVVENTNNINTEDNVRIYGDNTLLRHAQGDVGWNINSVTQRIVPANMNAESEIWSKHFVAPDKNSKPVRLDTAVAALWDIWNHIIYNNFEFNAALRTHIKARRDNWKFELNL
Physico‐chemical
properties
protein length:1760 AA
molecular weight: 193489,64180 Da
isoelectric point:6,58346
aromaticity:0,07784
hydropathy:-0,42307

Domains

Domains [InterPro]
DC_1274
ATT
2–662
DC_1274 DC_0093 IPR012892
IPR007119
Unmapped
24–323
IPR007119 PTHR34707 G3DSA:1.20.5.340
Coil
Unmapped
375–417
Coil Coil Coil Coil Coil DC_1418
AGF87544.1
1 1760
Architecture
ATT
STR
ATT 2-662 | STR 729-1756 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage phi891591
[NCBI] 		1289599 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus suis 89/1591
[NCBI] 		286604 Bacillota > Bacilli > Lactobacillales > Streptococcaceae > Streptococcus > Streptococcus suis

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGF87544.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC348602 [NCBI]
CDS location
range 2238 -> 7520
strand -
CDS
TTGGAGGTACAAGGTTTGATTTATCTAAAAGACGGTAATATCCCGCTTAATCTTGCTTACGATGATGACATCGTGCAGGAGGCCAATAGCACCTACCAACTTTCCTTTAAATTTCCGCTGACTGATGGGAAGTGGAATCTGCTTAGACGGGAAGTTTTTCTGCTGGCTGATGATCTACACGGTGAACAGGAATTTTTTATTTTTGAAGTAAAAAAAGCCAAAGGTCATGTGCAGGTCTATGCTAAGCAGGTCGCAACATTATTGAATTACTACTCTATCAACTCTATTTCGGTTGACAGGGTACCAGGGCAGACGGTTATGACTGCTTTGGCAGGTAGCGTTAAACGACCATGTCCATTTACGTTTTTTAGTGATATATTAGACCGTCATACGTTTAATGAGTCCAATGTATCTGTAATGGCTGCTTTGGCCAAGGATAAACACTCTATTGTCGGTCAGTGGGGTGGTGACTTGGTGCGTGACAAGTACCAGGTTAAATTGTTGAAAAATGGCGGCATTGAGAATGAGTCGCTATTTATGTATAAAAAGAATCTCAGTAGCTATGAAGAGTCTGAGAACATTAACAACTTAAAGACACGATTGCATCTCAAAAAGACGATCAAAGGACAGTCTGAGGGTGAGGCAGACCGTGTAATTGCAGTGACTGTGGATAGTCCGTTGATTGGGCAATATCGTCAAATCTACGAAGCAGATATTGAGGTCAATGACCAAGATGTGACAGATGTGGCTAGCTTAACTGCCTACGGGAAACGTTATTTCAGTTCAACACTTTGCGATTTGGTTGAAAATTCTATCAATCTGGATGTCAAAGGCAAGTCTGATGTATCTGTTAAGATGTTCGACATGGTAAGTGTATTCCACGAGCGATTCGATGTGGATTTGCGTTTGAAAATTTCTAGCTACCATTTCGGACCGATGTCTAAGCGATTGAAGTCAATTGGTTTTGGCAAGGTGTCGCAGTCATTTGGCTCGACAGTAGCGAGCATGGTCGCTGGCAGTGTTGATAAAGCAACTGGAAGATTGTCAGCATCCTTTGAACAGAAACTGCAGAAGGAAATTGACAATGCAAACCGCCATTTCGACGCTGAATTCGACAAGCGAGTTGAATCCATCAATGACGGTATCGAGCAAGCCCAAGCTGAGGCTGAGCGGTATGCTGACGCTATTAAACAGGAAATTGATACTGAAATCGCCCAAGTCAACCAATCCATGCAATCCCAGGAACAGGAACACGACAGAGAGGTTGCGAACATCCTGTCTAAAACCCAGTCTGTCGAGTCGCTTGCCAACCAGGCCAAGGCAGATGCGGCAAACGCCATCGCTAGAGCTAACCAGGTCAAGACCGAAGCTATCGCAGATGCAAGAGCGCAGGTTGCGACCGTTAATCAAGCGTTAAATACTGCTAAGACTGATTTGCAAAATCAAGTTAACGCGATTGATGCTAAGGCTGTGCAAGCACAACGAGATATCACACAAGCTAAGTATGATTTACAAAGTCAGGCCTCACAGCTTATCGCACAAGCGACTAAACAAGTTGAGTTGACCAAGCTTACCACCGAAACGAAAAAGCTTGCAGATGGCACGCTAACGAGCTTAAACGAGCTGACTAAAACTGTCGACAAAACGACTGGCGACCTTACGAGCGTGACCAATCGTACTAAAGTCGTTGAGGATAGTCTAGCTGGTGTTAAAACTAATTACACTCAACTCAATCAGACGGTAAATGCCCAGACTGGTCAAATTGATAGTATCAATCGTAAGACTGCTGATTTACAAAGTGGTATTGATGGCGTTACAGAGCGGTTTAAGAGTTTAAAAATTGGTAGTCGTAACTATTTTAAAAACTCAAAATCTCGTAAATACTACATTACTAGTTTAACAACTCAAGATGTGAGGACTTATATTGATGAGGAGTTTTGGCAAAATGATACACGATTTGTCAAAGATTATGTAAGGGTGTCTTTTGATATAGCGTTTAATCCAGCCTTACAATCAGACTTTACAACAACTGTCCATTTTTCGGCAACTCCGTGGTATGGAGCAGGTATCACGTTTAAAGGTGGCACAACTGCGTTACAACATTTTGACTTAAAGTTTAATTTGAGCGACGCAACAAAAGCTTATAAGACAGACAATGTATTCATCCGTCTCACAAATACAATCCCTCTCAATACCGCTGTAAGTCTCGAAAATTTTAATCTATATTTATCCGCAGTAATCGAGGATTACTCTCAAAGCAACGCTGATTTTGAGTCCAAAATCGCCGAGTACAAGCGGACTGCCGACCAAAACTACGCTGGCTTACAATCAACCGTTAGCACGTTAGATGGTAAGGTCACTCAGAATAAGACCGAAGCCAATCAGACAGCTACGCAGTTATCTAACAGATTAACAAGCCTTGAAACATACAAGGACGGCGAATCAACTCGCGCTCAGTCGTATTTTGAGGCATCAAAGACAGAGACGGCCAAACAGTTAACAGCCGAGCGTACTGCAATTGCTACTAATTATGTGGCTAAGTCAACATACACAGAGGATGTCCGTGGAACGACCCAAAAACTTAACGAGATTAAGTCAACCGCTGACACTGCAAAGCAAAATTTAGCAACGTATCAAAACACGGTTGACCGTAAGTTGGAAGAACTGACATCAAGTACTCAAACGCTTGACGGTAAAATCAATACAGCGAGCGCAAAGGTTGATACTGTAGCCGGTCAGATACGGACTGAGATTGGCACTGTTGAGGCGAAGATTCCGACTGAGGCAGGCGGAAGAAATTACATTTTGAAATCTCAAGCCGAAATCAGTAGCACAGGTAGGTGGGTAAGCAAACCATTTAATTTGTCGAGTGACTTACTATCTAATTTGTCGAAAATCAAAACTGTCACAATATCTTGTGATGTCGAGGGTATCAATGTTTCCGCTTTAAATTCACGAAAAAGGTATGGTTTAGCTTGTTCAGTTGAGATAAACGGTGTAGTGAATTATTGGGAAGTTTGGCAAACGCAAGATACCACGAAGAAGCGAATTAGCCAGACGTTTACTGTTCCTGAAGGGAAAGTAATTACCAAATTTCACTCGCCGACATTATGGATACAGGCAGCCGGAGATATAAAAGTTTCCAATCCCAAAATCGAGTTTGGAAGGGTACCTACAGATCACACATTGGCGCCTGAAGATTTTGCCAATGAATTATCATCAGTCAAAACCACAATCACTCAGACTGCATCCGGTGTAGAGCAGTTATCAACTAGCTTAGCTACGACTGATAACAAAGTCACGACTGCTGAGGCTAAAATCCGACAGTTAATTAGCGATGTGTCAAGCAAAGTATCGCAAACGGACTACAATACGCTGACCGGCCGTGTGGATGATGCTGAAACAGCTATTACTCAAAATGCGACCGAGATTAGCAAGCGATTGACAAAGACGCAAGTTGATAAAGCAATCACAGATAAAGGGTTTCAGACTGCATCGCAAGTAGACACTGCAATCGCTGGTAAAGGTTACCAGACCAAGTCTGATGTTGACAACAACATCACAGGTCGTGGATACATTACTAGTAGTGCTCTGCAACCTTATGCGCTATCTACGACCGTACAAAATCTTGTGAAAGAGACAGCTGGTAGCTTTGAGCGTCAGATTACAGAAACAAGAGGTCTGATACCTAGCAACGCTGGAACCCGAAATCTACTAAAAGGGACAAAAGATTTAAGCGGTAATGATGCTAAAAGCTTTAACACATCAGATAAATACCTTGATTTTAACATCGCACGCTCGAGACCTACAACTGGATATTCTGACACGTTTAGCGCGTATACGACAATACCCGTAACGGCAAATGATTATATCATTAGCTTTTACGCTAAATCTGATGTTGATGGCGCAACGCTTTATTGCCATTTTTACAATCCAAACACGACTACAAAAGCCGAATCAAGCACAGGTTATAAAAGTGGTAGTTCGGACGGATTAGCGCGGGTACAGGTAACAACTGAGTGGCAACGTTACTGGGTCAAGTGGTCTCAAAGCAAAACTGACACAGTAAAAAAAGTGATTATTGGTCGAAACAATAGCGCAGACGGTATCAAAATCATAGAAGTTGCTGGTGTCGCGTTGTACGAAGGTGCATTAAATAAAGGCCATTTTGATGCGCCAGAAGACCTCGCCACCGTCACAGCTCTTCACAACGTTAACGACACAGTCGACAGTCACACTCGTACCATCGGCGCTGTCGGTACGACAGGAAGTATTTTGGATAATGTCAGCAAGGTTACGCAGACTGCAGCAGGCTTGGTCCAGGAGGTGTCTGGTACTAACGGGCTTAAGACCCAGGTCAGCACACTTGCAGGGTCTTATGCGATCAAAAGCCTGACAAAGGCTGGCGATGTGTTGGGCCAGATTAATCTAAACAGAGATGGCTCTATTAAGCTTGACGGCAGTCTCGTACAGATTACCGGCAAGACATATATCCAAGATGGTGTAATCAGCGCTGCTAAAATTGGCGATTTGGATGCTGGTAAAATCAAGACTGGTACGCTGGATGCTGCACGGATCAAAGCTAATTCCATCGACGGTAGTAAGCTTGTATTCGACCAAGCTTTTGTCAACAAGATGACAGCAAACGAAGCTTTGTTTAAGCAGCTGTTTGCTCAAAGCGCATTTATCACAAGCGTCCAGGCAGTGGCTGTGTCAGCTAAACAGATTGCTGGCGGTATTGCTAAAGCACTCAACGGTGGTATGGATGTCAATTTCGACGAAAGTAAAATCAACTTTTACACAAACGTAGCTGCAATAAGACGTATCTATACTGGACACCCTACTCAATTTATAAAATTCGAAACCGAAGGGAATTACTCGCGAACAATCATCGGGAGTAACCGTAATGGAGGAGAAGTTTTTAATTCGGCAACATTTGCAGGGATTGTTGTAGAGAACACAAACAATATAAACACAGAAGACAATGTGAGGATTTATGGAGATAACACGCTATTAAGACATGCACAAGGCGATGTCGGTTGGAATATCAATTCTGTCACTCAACGTATAGTCCCAGCTAACATGAACGCAGAGTCCGAAATTTGGTCTAAGCACTTTGTGGCTCCGGATAAAAATTCAAAGCCTGTCCGATTGGATACAGCAGTGGCAGCATTATGGGACATTTGGAATCACATCATCTACAACAATTTTGAGTTCAACGCAGCGCTTCGCACACACATAAAAGCTAGACGGGACAACTGGAAATTTGAATTAAATTTATAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ecf1c7b37fc26e9474584c0c50386f1537146f2a34205e64afe6a234a1af59dd
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7087
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50