Protein

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Genbank accession
QBQ72525.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
Protein sequence
MAQDITIQLTSDGKTTVTFPGGGQQTVGGSTADAVKALKAAYGDRVAGVVSTDKTLAEITAEQQAERQSYRTKAVDFVEQGSGYYGEAGGATGYSEDDIQRYINSSANQAGPGYTSVQDYIDATLDRSDRLASKYFDPNEWNTFTDKQKLAAIELFHQGNGDTGRTNGLSAKDIEWVKNEANTFKGIVASPNTQAISTGFDPVINQTTSTIKKPTVPAVDTGPIATDSSVAGGGFTSVTPPTEVIELSPGEVPSINPNVSQTVTQQVAPVTYQDRTQTVAPVQAGTIAQPLQTAGLSAVPSQVTYKTQYAGTSGAVPQTLVTTAPGMGTTYDAGQTGYQTVTYGNDVGQRIPVTEFNGTPTTYVPPGFRPIEEIEQQQAATQSAVGQDGTVQAARGAYISGYNKGGDIELEGKYRIYTKQFGYTGPKTREAIEQFEEARPEVKRKGMAIGGYVRKFNRGGVVRGFDEGGLTQEQLAKMQASAVTQTMQPMQATTAMIQPTAAEFIPVDAGMTAPIAPFAEAATVGTVQQATMPTAMTPATAGVTTATPQVQEVTQAMQPVTGVVSPEAQVTAAQQQQTSVSGMEAAQGTAIMMNNPVQREIQEGELISGAANAEKASQYAEEIQAATATPTKQATVAGQLEGLMQQFEGGETPAWAAGSMRTAMQTLSARGLGASSLAGQAVIQAAMEAALPIAQMDAQTMAQFEAQNLSNRQQRQMLAAQQRATFLGQEFDQAFQARVANSARIGDIANMNFTAEQQVALENSRAANTVNLNNLSNRQAMVMAEAAALSQLDMANLNNRQQAAVQNAQNFLQMDMQNLSNEQQTAMFKAQQNIQALFTDQAAENAAAQFNAQSENQTNQFFANLSNQTAQFNATQQNAMDQFNVNSVNALREFNSELQQQRDMFNAQNGLVIAQSNAQWRQNIATLNTATQNQSNMDFAKTINGLTAANMDQIWQRERDIMSFAFGAAESAANRASQIAIAKLTADEQAKLQDSIGQGKLAAIALDAVLGKWL
Physico‐chemical
properties
protein length:1014 AA
molecular weight: 107892,30380 Da
isoelectric point:4,67139
aromaticity:0,06312
hydropathy:-0,39675

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Roseobacter phage CRP-2
[NCBI] 		2559281 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Rhodobacteraceae bacterium
[NCBI] 		1904441 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Rhodobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBQ72525.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK613344 [NCBI]
CDS location
range 27097 -> 30141
strand -
CDS
ATGGCTCAAGACATAACCATTCAGTTAACCTCAGACGGAAAGACTACTGTAACTTTCCCAGGCGGTGGTCAACAAACTGTAGGCGGTAGTACTGCTGATGCTGTTAAGGCGCTTAAAGCTGCTTATGGTGACCGTGTTGCTGGTGTTGTTAGCACAGATAAAACACTAGCTGAGATTACTGCTGAACAACAAGCTGAACGTCAGTCTTACAGAACTAAAGCTGTAGACTTTGTAGAACAAGGTTCAGGTTATTACGGCGAGGCTGGTGGTGCAACTGGTTACTCTGAGGATGATATTCAGCGTTACATTAATAGCTCTGCTAATCAAGCAGGACCAGGTTATACATCTGTTCAAGATTATATTGATGCTACTTTAGACAGATCAGACAGACTAGCCTCAAAATACTTTGACCCTAATGAGTGGAATACATTTACAGATAAACAAAAGCTTGCTGCTATAGAGTTGTTCCATCAAGGTAATGGTGATACAGGTAGAACTAATGGTCTATCTGCTAAAGACATTGAGTGGGTAAAGAATGAAGCCAACACATTTAAAGGTATTGTTGCAAGCCCTAACACTCAGGCTATCAGTACAGGTTTTGATCCTGTAATCAATCAAACTACTAGCACTATTAAAAAACCTACAGTACCTGCAGTCGATACAGGTCCGATTGCTACAGACTCTTCTGTGGCTGGTGGTGGCTTTACATCCGTTACACCGCCTACAGAGGTTATTGAGCTTTCACCAGGTGAAGTACCAAGTATTAATCCTAATGTCTCACAAACAGTAACACAACAAGTAGCCCCTGTTACGTATCAAGATAGAACACAGACTGTTGCACCTGTTCAAGCTGGTACTATAGCTCAGCCTTTACAGACTGCAGGTTTATCTGCTGTACCTAGTCAGGTTACTTATAAGACTCAGTATGCAGGAACTTCAGGTGCTGTACCTCAGACGTTAGTTACTACTGCTCCAGGTATGGGTACAACATATGATGCAGGACAAACAGGTTATCAAACTGTTACATATGGTAATGATGTAGGTCAACGTATACCTGTCACAGAATTTAACGGTACGCCTACCACATACGTACCACCTGGTTTTAGACCTATTGAAGAGATAGAGCAACAACAAGCGGCTACTCAGTCTGCTGTTGGTCAAGACGGTACGGTACAAGCTGCACGTGGTGCTTATATCAGTGGATACAATAAAGGCGGTGATATTGAACTAGAAGGTAAGTATCGCATCTATACTAAACAGTTTGGTTACACTGGTCCTAAGACACGTGAAGCTATTGAGCAGTTTGAGGAGGCACGTCCTGAAGTTAAACGTAAGGGTATGGCTATTGGTGGTTATGTCCGTAAGTTTAATAGAGGTGGTGTAGTACGTGGTTTTGATGAAGGCGGTCTAACACAAGAGCAACTAGCTAAGATGCAAGCCTCTGCTGTAACACAGACTATGCAGCCTATGCAAGCTACTACAGCTATGATTCAGCCTACTGCTGCAGAGTTTATTCCTGTTGATGCTGGTATGACTGCTCCGATAGCTCCTTTTGCTGAAGCTGCTACAGTAGGTACAGTACAACAAGCTACAATGCCTACAGCTATGACTCCTGCTACAGCAGGTGTTACTACAGCTACACCACAGGTACAAGAAGTCACACAGGCTATGCAACCTGTTACTGGTGTTGTATCACCTGAAGCACAAGTAACTGCTGCACAGCAACAGCAAACGTCTGTGTCAGGTATGGAAGCTGCGCAAGGTACAGCTATCATGATGAACAACCCTGTACAACGTGAGATACAAGAAGGTGAGCTTATCTCTGGTGCAGCTAATGCAGAGAAAGCATCACAATATGCTGAAGAAATACAAGCTGCCACAGCTACACCAACTAAACAAGCTACTGTAGCAGGACAACTAGAAGGTCTTATGCAGCAGTTTGAGGGTGGGGAGACACCTGCTTGGGCTGCTGGGTCTATGCGTACAGCGATGCAGACACTATCTGCTCGTGGTCTAGGTGCGTCTAGCCTAGCAGGTCAGGCTGTTATTCAAGCTGCTATGGAAGCTGCGCTACCTATCGCTCAGATGGATGCACAGACTATGGCACAGTTTGAAGCACAGAACCTGTCTAACCGTCAACAGCGTCAGATGCTAGCAGCACAACAACGTGCTACATTCTTAGGTCAAGAGTTTGATCAAGCATTCCAAGCTCGTGTAGCTAACTCAGCACGTATTGGTGATATTGCCAATATGAACTTCACTGCTGAACAGCAAGTAGCCTTAGAAAACTCTCGTGCTGCTAACACAGTAAATCTAAACAATCTGTCTAACCGTCAAGCTATGGTTATGGCTGAAGCTGCTGCATTGTCACAGCTAGACATGGCTAACTTGAACAATCGTCAACAAGCTGCTGTACAGAATGCTCAGAACTTCTTGCAGATGGATATGCAAAACTTATCCAATGAGCAACAGACAGCTATGTTCAAAGCACAGCAAAACATTCAAGCCTTGTTCACTGATCAAGCTGCTGAGAATGCTGCTGCACAGTTTAACGCACAAAGCGAGAATCAAACTAACCAGTTCTTTGCTAACCTGTCTAATCAAACTGCACAGTTCAATGCTACACAGCAGAACGCTATGGATCAGTTTAACGTGAATAGTGTTAATGCTCTACGTGAATTTAACTCAGAACTACAACAACAGCGTGACATGTTCAATGCACAGAACGGTCTTGTGATTGCTCAGTCTAATGCACAGTGGCGGCAGAACATTGCTACACTTAATACAGCAACACAGAATCAAAGTAACATGGACTTCGCTAAAACTATCAATGGTCTGACTGCAGCTAACATGGATCAGATATGGCAGCGTGAACGTGACATCATGAGCTTTGCATTCGGTGCAGCAGAAAGCGCAGCAAACAGAGCTTCACAGATTGCTATTGCTAAACTTACAGCAGATGAACAAGCTAAGCTACAAGATAGCATTGGTCAGGGTAAGCTAGCTGCTATTGCATTAGATGCTGTATTAGGAAAGTGGTTGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
34f931b7d1ef86dddf9f70932478d189aaa89170e32b095be3b0e39ac7b5e90c
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4368
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Diverse, abundant and novel viruses infecting the marine abundant Roseobacter RCA lineage Zhang,Z.F., Chen,F., Chu,X., Zhang,H., Luo,H.W., Zhai,Z.Q., Yang,M.Y. and Zhao,Y.L. 2019 — GenBank