Protein

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Genbank accession
UIU28192.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTLFTKDDSGNIIDLSISTGGNISGNITQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHKNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVNEGSFKIQYINESGDSKYWTFNRNGSFIVDNGSIEVRAGNISASGNINSATGFVSAPRVNTKNINLSSKTFIPNNDTGYDIVSLPTWIYNPPADGSDRDTNGLNYMRKMRASNTSSIFHEIVDCRSGKPQEISWWTGVGPSSFQWAFDTSGRITAGKSISVGLPDNGTNGRYPLESAISIGIAIGDNDTGIKWVRDGVYDLMANGISSATILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDFPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNSKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDIKTGSNRVAIRADGTFDSTQRISMRTGLFLSGDDNTNALSFKAPTGVDGTKTINWDAGTRNGQNKNTVTIKAWGNSFNSNPGNRETVFEVSDSQGYYFYAQRTNPAPGQTVGPVNFKFNGTVETGHIIGLGNISASGTGSFGGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSESNLYIIPTPKGAGESGGISNLRPLIIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGTRSWYVGLGGAGNDLSLYSQSYGHGLVISDNFTSITKPLKVGNAQLGTDGNITNGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGSTAGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIVGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPADLNAVLYTRTSGMYSAAFRNISVNNVSGNTYDIYVYAGTYCNQLVCEWSCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVDGQVANVLNNLVDRGKVKRFEADSEIAINNQTGIRIRSNSDKTGSVATMLRNDGGSFYILFTDKNATDGAATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVLMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKAPGGANRFVVNNATVAGVNQMNSFGININNALGGNSIAFGDNDTGIKQSGDGLLDIITNAARRMRFQTGDTYSDMNINAPNVYIRSDIRLKSNFRPIENALEKVEQLDGLIYDKADYIGGEIVQTEAGIVAQTLQDVLPEAVREVEDIKGNKILTVSSQSQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1269 AA
molecular weight: 136093,60480 Da
isoelectric point:7,91106
aromaticity:0,08432
hydropathy:-0,33349

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–999
DC_0538 DC_1942
IPR048390
ATT
511–651
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392 Coil
IPR048388
ATT
700–772
IPR048388 IPR030392
UIU28192.1
1 1269
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR 1-510 | ATT 511-651 | STR 652-699 | ATT 700-772 | STR 773-999 | ATT 1056-1268 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
UIU28192.1
1 1269
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 310 310 0,1066
Central domain 311 509 200 0,5298
C-terminal 510 1269 759 0,6788
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-310
Central
311-509
C-terminal
510-1269

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_SA20RB
[NCBI] 		2909738 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UIU28192.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL960581 [NCBI]
CDS location
range 152538 -> 156347
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACACTTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGATTTAAGCATTTCCACTGGCGGTAATATCAGTGGAAATATCACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAATGGAACATATAATCTTAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACTGCTGGTAATGGTGCTTGGGCAAACCAACATAAAAATAAAGCTCCTATCTTTACCGATTTGAGTTCAACTACTTCTACTTCAGAATACCATCCGCTAATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGTTGGTACGTTAGTAAATGAAGGAAGTTTTAAAATTCAATATATCAATGAATCTGGTGATTCAAAATATTGGACTTTTAATCGAAACGGTAGTTTTATTGTAGATAATGGCAGTATTGAAGTCCGTGCAGGTAATATTTCGGCTTCAGGTAATATTAACTCGGCAACTGGATTTGTTTCTGCACCGCGCGTCAATACAAAAAATATTAACCTGAGTTCTAAAACCTTTATACCGAATAATGACACGGGTTATGACATTGTTTCTTTACCTACTTGGATTTATAATCCACCAGCAGATGGTTCTGACCGTGATACAAACGGATTGAACTACATGCGTAAAATGCGGGCTTCAAATACTTCTAGCATTTTCCATGAAATAGTTGACTGTCGTTCGGGAAAGCCGCAAGAAATTTCTTGGTGGACCGGCGTAGGACCTTCGTCTTTCCAGTGGGCGTTTGATACCTCTGGACGTATTACCGCAGGTAAATCTATTTCAGTAGGTCTTCCTGATAATGGTACAAATGGGCGTTATCCTTTAGAGTCTGCCATTTCCATTGGTATTGCAATTGGCGATAACGATACTGGTATTAAATGGGTCCGTGATGGCGTTTATGACCTGATGGCTAACGGTATTTCATCCGCTACCATTTTGAATAATGGTATTAATAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGCCGTGATTCCGGCTCTACTTGGGATTTCCCAAATAACAACCAGGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGCGATGGTCAGACTCATATCGGTTATAGCAGCAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGCACAGGTCGTATGTCTGTTAGCATGGGCGATGGACTTCTTGTTGAGCCAGGTATTTTAGATATTAAAACTGGGTCTAATAGAGTTGCTATTAGAGCAGATGGTACATTTGACTCAACCCAACGTATTTCAATGCGCACTGGGTTATTTTTATCAGGTGATGACAATACCAATGCTCTGTCATTTAAAGCGCCTACAGGTGTTGACGGGACAAAAACCATTAACTGGGATGCAGGTACTCGTAATGGTCAGAATAAAAATACTGTAACCATTAAAGCGTGGGGTAACTCATTTAACTCAAATCCGGGTAATAGAGAAACTGTATTCGAAGTTTCAGATTCACAAGGTTATTATTTCTACGCTCAACGTACTAATCCTGCGCCAGGTCAAACAGTAGGTCCGGTTAACTTTAAATTTAACGGAACTGTCGAAACAGGCCATATCATAGGCCTTGGTAATATAAGTGCCTCTGGTACAGGTTCTTTTGGTGGCAATGTTACCATGTCTAATGGTTTGTTTGTTCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAGGTAAAAATTGGTGGAACAGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATATGGTGCTATTTTCCGCCGTTCGGAAAGTAATCTTTATATTATCCCGACTCCTAAAGGTGCCGGAGAATCAGGCGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGATAATAGAACTGAACACCGGCACAGTTAAAATGTCGCATGATGTTCATTTAGGAGATTCTGGATCTGGTACAGGATTATTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGTAATGCAGCGCTTACTTTAGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTGCAGGGTTCTAAAGCTGGAACTAGATCGTGGTATGTTGGTCTTGGTGGTGCTGGAAATGATTTATCACTTTATAGCCAATCTTATGGACATGGTCTTGTTATAAGTGATAATTTCACGTCAATCACTAAACCTCTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACTGACGGTAATATTACCAACGGTTCAGGAAACTTTGCCAACTTAAATACCACGTTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTACGGTTCAACTGCTGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCTACTTCGACAGTCTTCTTTAAAATAGTTGGAGGTTCTGGATTTAATAGCGGATTATTCACCCAATGTAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGTAATGAAAGACCTGCTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACATCTGGAATGTATAGCGCAGCATTTAGAAATATTTCAGTTAACAATGTCTCTGGAAATACATATGACATTTATGTTTATGCTGGAACATATTGTAATCAACTAGTTTGTGAGTGGTCATGTACCGAAAATGCTACTGTTAGTGTTATTGGTATTAACTCATCTACCCAATCACCGGTGGATGCTCTTCCAGATACAGCAGTCGATGGGCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAATTTAGTTGATCGTGGCAAAGTTAAGCGCTTCGAAGCTGATTCTGAAATAGCTATTAATAATCAAACCGGTATTCGTATCAGAAGCAACAGCGATAAAACTGGTTCTGTTGCTACAATGCTACGAAATGATGGCGGTAGTTTTTATATTCTATTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGCAGCAACCGTTAATGGTGATTGGAATAGTAAACGTCCTTTTGCAATTAACTTAACAACCGGCGAAGTGCTAATGAATAACGGCATAGCTGTTCGCAGCGCTGCTTTATTCTATAATAGTATAAATGTCAAAGATAACGGTTCTATTAACTTTGATAAGTCTGGTGCTAACCCAAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGCGATGCTTCTCGTGGTAACCGTATTGAAATTGCAGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAGCTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTAGCTGGTGTTAATCAAATGAATTCATTTGGTATTAACATCAATAACGCACTTGGTGGAAATAGTATAGCATTTGGTGATAATGATACTGGAATTAAACAATCCGGCGACGGACTTCTTGATATTATTACTAACGCCGCACGCCGAATGAGATTCCAGACGGGTGACACTTATTCTGACATGAATATAAATGCCCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTGAAATCTAATTTCAGACCTATTGAAAATGCTCTTGAAAAGGTTGAACAGCTTGATGGTTTAATCTATGATAAAGCTGACTATATAGGTGGTGAAATTGTTCAGACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACACTGCAAGACGTTTTACCAGAAGCAGTTCGTGAAGTTGAAGACATTAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAATCCCAGATTGCTCTTCTAGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
46b9011cb0da0f6e605528ad837f732fa484dcc4ca4301013ad0d4b4aa359edc
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2722
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50