Protein

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Genbank accession
CAD7712074.1 [GenBank]
Protein name
gp37 long tail fiber, distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTLFTKDDSGNIIDLSISTGGNISGNITQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVNEGSFKIHYINESGTSKYWTFRRDGGFVVDTGSLTVTDGNISASGNINSATGVVSAPRVNTKNINISTKTFIPNNDAGYDIVSLPTWVYNPPADGSDNTTNGLNYLRKLRASSASSIFHEIVDCRKGKPQEISWWTGVGPSSFQWAFDTSGRITAGKSISVGLPDSGTNGRYPLDSAISIGIAIGDNDTGIKWVRDGVYDLMANGISSATILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDFPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDIKTGSNSVAIRADGTINSTQRISMRTGLFLNGDDNTNALSFKAPSGVDGTKTINWDAGTRNGQNKNTVTIKAWGNSFNAEKGNRETVFEVSDSQGYYFYAQRTNPASGQTVGPVNFKFNGTVETGHIIGLGNISASGTGSFGGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSESNFYIIPTLKDAGESGGISNLRPLIIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGIRSWYVGLGGAGSDLSLYSQSYGHGLVISDNFVSISKPLKVGNAQLGTDGNITNGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATAGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIAGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPADLNAVLYTRTIAAAFKNIAVNNVSGDTYDIYVYAGTYCNQLTCEWSCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVDGQVANVLNNLVDRGKVKRYEADSEIAINNQTGIRIRSNSDKTGSVATMLRNDGSSFYILFTDKNATDGEATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVLMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKAPGGANRFVVNNATVAGVNQMNSFGININNALGGNSIAFGDSDTGIKQNGDGLLDIYANSVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1266 AA
molecular weight: 135415,85590 Da
isoelectric point:7,15560
aromaticity:0,08531
hydropathy:-0,30063

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1003
DC_0538 DC_1942
IPR048390
ATT
511–651
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 DC_0932 IPR030392 Coil
IPR048388
ATT
700–772
IPR048388
CAD7712074.1
1 1266
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR 1-510 | ATT 511-651 | STR 652-699 | ATT 700-772 | STR 773-1087 | ATT 1088-1265 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
CAD7712074.1
1 1266
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 764 764 0,0467
Central domain 765 965 202 0,6055
C-terminal 966 1266 300 0,8054
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-764
Central
765-965
C-terminal
966-1266

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_Eco_NR1
[NCBI] 		2780512 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAD7712074.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR990704 [NCBI]
CDS location
range 86105 -> 89905
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACACTTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGATTTAAGCATTTCCACTGGCGGTAATATCAGTGGAAATATCACTCAAACTGGAGATTATTTACAGAACGGTACATATAATCTCAATGGAAATCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACTGCAGGTAATGGCGCTTGGGCAAATCAACACCTAAATAAAGCCCCTATTTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTACTTCAGAATACCATCCGCTAATTAAACAGCGTTATAAAGATGGGACTTTTTCTGTTGGTACGCTAGTAAACGAAGGAAGTTTTAAAATTCATTATATCAATGAATCGGGAACTTCAAAATACTGGACATTTCGTAGAGATGGTGGATTTGTTGTTGATACAGGAAGTTTGACAGTAACAGATGGAAATATTTCTGCTTCTGGTAATATTAATTCGGCTACTGGGGTAGTTTCTGCGCCACGTGTCAACACAAAAAATATTAACATAAGCACGAAAACCTTTATCCCGAATAATGACGCGGGTTATGACATTGTTTCTTTACCTACCTGGGTTTATAACCCACCGGCCGATGGTTCCGACAATACTACAAATGGATTGAACTATTTGCGTAAATTACGTGCATCAAGCGCATCAAGTATTTTCCATGAAATTGTTGATTGTCGAAAAGGTAAGCCGCAAGAAATTTCTTGGTGGACTGGTGTAGGACCTTCGTCTTTCCAGTGGGCGTTTGATACCTCTGGACGTATTACTGCAGGTAAATCTATTTCTGTAGGTCTTCCTGATAGTGGTACAAATGGTCGTTATCCTTTAGATTCTGCAATTTCTATTGGTATTGCGATTGGCGATAACGATACCGGTATTAAATGGGTCCGCGATGGCGTTTATGACCTGATGGCTAACGGTATTTCATCTGCTACCATTTTGAATAATGGTATTAATAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCCGGTTCTACTTGGGATTTCCCAAATAATAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGCGATGGACAGACTCATATCGGATATAGCAGCAATGCTAAGATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGTCCGTTAGTATGGGTGATGGGCTTCTTGTTGAGCCTGGCATTTTAGATATTAAAACCGGTTCTAATAGCGTTGCTATTAGAGCAGACGGAACAATTAACTCCACCCAGCGTATTTCTATGCGTACGGGCTTGTTTTTAAATGGTGATGATAATACTAATGCTTTATCGTTTAAAGCTCCTTCCGGTGTAGATGGTACCAAAACCATTAACTGGGATGCAGGTACTCGTAATGGTCAGAATAAAAATACCGTAACCATTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCTGAAAAGGGTAATAGAGAAACTGTATTCGAAGTTTCAGATTCACAAGGTTATTATTTCTACGCTCAACGTACTAATCCTGCGTCAGGTCAAACAGTAGGTCCGGTTAACTTTAAATTTAACGGAACTGTCGAAACAGGCCATATCATAGGCCTTGGTAATATAAGTGCCTCCGGTACAGGTTCTTTTGGTGGCAATGTTACTATGTCTAACGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACAGGCCAAGTAAAAATTGGTGGAACAGCTGACGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGCGCAATTTTCCGTCGTTCTGAAAGTAACTTTTATATTATTCCAACTCTTAAAGATGCTGGAGAATCAGGTGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGATAATAGAACTGAACACCGGCACAGTTAAAATGTCGCATGATGTTCATTTAGGAGATTCTGGATCTGGTACAGGATTATTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGTAATGCAGCGCTTACTCTAGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTACAAGGTTCTAAAGCTGGAATTAGATCGTGGTATGTTGGTCTTGGTGGCGCTGGAAGTGATTTATCGCTTTATAGTCAATCATATGGACACGGTCTTGTTATAAGCGATAATTTCGTGTCAATCAGTAAACCTCTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACTGACGGTAATATTACCAACGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTAAACACCACGCTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACTGCTGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCCACTTCTACGGTCTTCTTTAAAATAGCCGGTGGTTCTGGATTTAATAGTGGATTATTCACACAATGCAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGTAATGAAAGACCTGCTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACAATTGCAGCTGCATTTAAAAATATTGCAGTTAATAACGTCTCTGGAGATACATATGACATTTATGTTTATGCCGGAACATATTGCAATCAATTAACTTGTGAATGGTCATGTACCGAAAATGCTACTGTTAGCGTTATTGGTATTAACTCATCTACCCAATCACCTGTGGATGCTCTTCCAGATACAGCAGTTGATGGGCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGCGGCAAAGTTAAGCGTTATGAAGCCGATTCTGAAATAGCTATTAATAACCAAACTGGTATTCGTATTAGAAGCAACAGCGATAAAACTGGTTCTGTTGCTACAATGCTACGAAATGATGGCAGTAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGAAGCAACTGTTAACGGTGATTGGAATAGTAAGCGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACAGGCGAAGTATTAATGAATAACGGCATAGCTGTTCGCAGTGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAATGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAGTCTGGTGCTAACCCAAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGCGATGCTTCTCGTGGTAACCGTATTGAAATTGCCGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAGCTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTAGCTGGTGTTAACCAAATGAATTCATTTGGTATTAATATCAATAACGCACTTGGTGGAAATAGTATAGCATTTGGTGATAGCGATACTGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAGCGTACAAGTATTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGCTTAAAATCTAATTTCAAACCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTCAATGGTGTCATTTATGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTAGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCCGTCCGTGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACGCTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0ebdb3b4d96b5bcd24dd658a5518d194314a1f2a316f4d299fe05dfdb6ac684d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5178
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50