Protein
View in Explore- Genbank accession
- QIN97146.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNTLRYERPVESNTNTPNTLVQRDADGNFAAGTITGTLIGNASTATRLDQTRQIQLSGDVTATGNFDGSQNLNLSTALGLLSSLPHYLEGGQSDTTRTFTEVTVDQKGRVVNARTAAQMNLADYGLDGSATSDITLAQPWNPNLQAISNESGTGFYVRTGAGTLETRLLSGASGQIVITNANAVSANPIISLAVQAGVVAGDYNTESLTSVTQAGPNGEPFGTETVNAIKLSVDDKGRLTSIDNVPIATATEGSKYASYGAGTTYARYDIIENASKVYQAYQAISAGSGAPTHTSGDSGGWRYLAAAATEQKGLASFAQEDFDVDGNGHVTIAALGVDNTQLQNNRISFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYIKVNNTNGNLLFGANNTGDGGAGEVDINVRTYFSDPDIMLDGLLDQTISKVATGNLNITSVQNDGVGKEFNIGITNVGAGSSTLNLTAEDVVSVQATDANGKVHVEDARFQSNYIATTNATLNLDPGDDRAVTGLVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQIDDPIITLGGDTAPVADDNLDRGVEFRYYDTQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNTSEVFTGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDSTLRVHSTSRFDDSMVIQGASKTLQLNNGTGTTRIELQSTTGNADFYGIVNITNDLNINTNKFNVASATGNTLIAGTLGVTGITTLSSDLGVTGNTTLTGYLDLNNTLNVSGLVYLENVDEPTIALNGTTGLYEIGSSDYGALRVDGGGYVEGDILFNSDVYVNGQFIQKEDTTANYNRQNYLEVRYKLRTGTRGQYTPSYAEHDTSNLRVYGGAGVATSLHVGGRDAGEGLFVGKQLSGDTVKFSVLGASGNTDIVGTLNVDSAVTFGSTLTVTGTTEFNNTVDVDNNFAVRTSGGVDVFTVASASGNTVVTGTLDVDDATVITNTLNVTNGVDFDTTLNVDGAVDFNSTLVVDGQTTIYDSLILRSDNEVFSIGTGANIEKFSVDFDNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGASGIVTFTNNTDQTLTGLYAADGAVRLTGGAAIQRNLAVGGNMRVYGDFEISGSTTQSGNTGFSGRVSITNTSDATTFADNSVALTTDGGFRASKNAWVGGDFHVWDDANSRDAFVVDVSTGDATLYNTLTVGGNLVVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTTPVANDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGFDRSSSQFTFLTDSTNVSEVHTGTDAALRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIVSQVASGPALVIPNTTKINNLNADLLDGYTTATANTASTVVVRDASGDFAANQITVNNGIGALAGIQGNATTADALRTARTITIDGVVDGSVSFNGSTNVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVTRTAANTYAQRTLSKVGSGITITNGDGVAGNPTINIASASTNSANNLVIRDASGNFAAGTITADLVGDVTGTVSSIANHSTTNLTEGTNLYFTNERVDDRVAALIAGGTGITATYNDAGNLLTLSAEFSEFDTDDIVEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIEHDGSGTLSVTQADINTDNVTEGLTNIFYTEARFNSSLAGKTTDNVAEGSTNLYYTDARADARIAAATTDDLTEGATNLYYTTVRANSDFDTKLAAASTDDLSEGLTNLYYTDGRADARVDAGFTAKSTSDLSEGTNQYYTEARVQSKLDNAFAQLQAMLNNLATTTTLTLNLSGDPTPGAVVTAGAVTEGGVGGFTAGTNVATTGGTGSSLTVDTTVVGGVITAVAVNTPGSDYLIDDTITITNPNAGGVATFNFASLSGGTGYTAAGSNVATTTSGSGIGLTVNTTVSGGAITGVTVASAGTGYAPGDVITITGGNGDATIDVSTVFVDATFALADITTMEVGATVTGATSGTTGVITALGTNQITVDTVSGFFKVGEVVSANDVTTLTIQSFG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2036 AA molecular weight: 209736,49750 Da isoelectric point: 4,16018 aromaticity: 0,06631 hydropathy: -0,12092
Domains
Domains [InterPro]
DC_1619
ATT
1–474
ATT
1–474
SSF69349
STR
4–201
STR
4–201
IPR041352
ATT
5–43
ATT
5–43
1
2036
Architecture
ATT 1-474 | STR 475-963 | STR 1062-1568 | RBD 1655-2036
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-H25 [NCBI] |
2718941 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Synechococcus sp. WH 8102 [NCBI] |
84588 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QIN97146.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT162468
[NCBI]
CDS location
range 89363 -> 95473
strand +
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAAGAATGGGCAAACGCTAACCCTACCCTTGCACAAGGAGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGTATCAAAATCGGTGATGGTGTTACCGCATGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTTGAATCTAACACTAATACACCAAACACTCTTGTACAAAGAGATGCTGATGGCAATTTTGCTGCTGGTACTATTACTGGTACTCTGATTGGTAATGCTTCTACTGCAACCAGATTAGACCAGACTCGTCAAATTCAGTTATCTGGTGACGTTACTGCTACTGGAAACTTTGATGGTTCTCAAAACCTGAACCTTAGCACGGCATTAGGACTTCTTAGTTCACTTCCACACTACTTAGAAGGTGGTCAAAGTGATACAACCAGAACATTTACTGAGGTAACTGTTGACCAAAAGGGTAGAGTAGTTAATGCAAGAACTGCTGCCCAGATGAACCTTGCTGATTATGGTCTTGATGGTTCTGCTACCAGTGACATTACTCTGGCACAACCTTGGAATCCCAATCTTCAAGCGATTTCAAATGAAAGTGGTACTGGTTTCTATGTGAGAACTGGTGCAGGTACTCTGGAAACAAGACTTCTTTCTGGTGCTTCTGGTCAGATTGTTATCACTAACGCTAATGCTGTTAGCGCAAACCCAATTATTTCTCTTGCTGTTCAAGCAGGTGTTGTTGCTGGAGACTATAATACCGAATCTCTAACCTCGGTTACCCAAGCAGGTCCAAACGGAGAACCATTCGGAACTGAGACAGTAAACGCAATTAAATTATCGGTTGACGATAAAGGGCGTCTTACTTCTATTGATAATGTGCCTATTGCTACTGCTACTGAGGGTAGTAAGTATGCTAGCTATGGTGCAGGTACTACTTATGCTCGCTATGACATCATTGAGAATGCCTCAAAGGTTTACCAAGCATATCAGGCAATCAGTGCTGGTTCTGGTGCTCCTACTCATACCAGTGGTGATAGTGGAGGTTGGCGCTACCTCGCGGCTGCGGCAACCGAGCAGAAGGGATTGGCTTCTTTTGCACAGGAAGATTTCGATGTTGACGGCAACGGGCACGTTACCATCGCCGCCCTCGGTGTAGATAATACCCAACTTCAAAACAACCGAATTTCCTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAATTAGACCAAGAATTAACAGCAACAACTGGATACAGAGGTTTTAACTACCTTAACTATATTAAGGTTAACAACACTAATGGCAATCTCCTGTTTGGTGCAAATAACACTGGAGATGGTGGTGCTGGTGAAGTTGATATCAACGTAAGAACATATTTCTCCGATCCAGATATTATGCTGGATGGATTGTTAGACCAGACCATTTCTAAAGTTGCTACTGGTAACCTCAATATCACTAGCGTTCAAAATGATGGTGTTGGTAAAGAATTTAATATTGGTATTACCAATGTTGGTGCTGGTTCCAGCACACTGAATCTAACTGCTGAAGATGTCGTTAGTGTTCAGGCAACAGACGCTAATGGTAAAGTTCATGTTGAAGATGCTCGTTTCCAAAGCAATTATATTGCTACAACTAATGCAACCCTCAACCTTGATCCTGGCGATGACCGTGCCGTTACTGGTCTCGTCAGAGTTTGGGGCGATTTACAGGTTGACGGCACCACGACGACTGTCAACTCAACAACCCTTCAGATTGACGACCCCATCATTACTCTGGGCGGTGATACTGCTCCAGTTGCTGACGATAATCTGGATAGGGGTGTTGAATTCCGCTATTACGACACTCAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACCAACTATACCGATTTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCACGCTGCTACAAATACTTCCGAAGTCTTTACTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATGTAAAACTGACAACTGGCACTAACTCTACCTCTAATACAACTGGCGACCTCGTAGTTGCTGGCGGCGCTGGTATTGGTCAAGACGTTAACATTGGTGGACTGCTTGATGTTGACAGCACTCTGCGCGTCCACAGCACCTCTCGTTTTGATGACAGCATGGTCATTCAAGGTGCTTCTAAGACACTGCAATTGAATAATGGCACTGGCACTACTCGTATTGAATTACAGTCTACAACGGGTAATGCAGATTTCTACGGTATCGTTAATATTACAAATGATCTCAATATTAATACTAATAAGTTTAATGTTGCTTCTGCGACTGGTAACACCCTCATAGCAGGAACACTTGGCGTTACTGGAATTACGACACTTAGCAGCGATTTAGGTGTAACTGGAAACACCACTCTCACTGGTTATCTTGACCTCAACAATACTCTGAATGTTTCTGGTCTTGTTTACCTTGAGAACGTTGACGAACCAACTATTGCTCTCAATGGCACAACTGGTCTCTATGAGATTGGTAGCAGTGACTATGGTGCTCTTCGTGTTGATGGTGGCGGTTATGTTGAGGGTGACATCCTTTTCAACAGTGATGTCTATGTAAACGGTCAGTTTATCCAGAAAGAAGATACTACCGCGAACTATAACAGACAGAACTACTTGGAAGTTCGTTATAAGTTACGCACAGGTACAAGAGGACAATATACACCATCTTATGCAGAGCATGACACTTCCAACTTAAGAGTTTATGGTGGTGCTGGTGTTGCTACAAGTCTGCATGTTGGCGGTAGAGATGCTGGAGAGGGTCTGTTTGTTGGTAAACAACTTTCTGGCGACACAGTTAAATTCTCTGTCCTTGGTGCATCTGGTAACACCGATATTGTTGGAACACTGAATGTTGATAGTGCGGTAACCTTTGGCAGCACATTAACAGTAACTGGTACAACGGAATTTAATAATACCGTTGATGTTGATAATAACTTTGCAGTAAGAACTTCTGGAGGCGTAGATGTATTTACTGTTGCTTCTGCTAGCGGCAACACTGTTGTTACTGGCACCCTGGATGTTGATGATGCAACTGTCATCACAAATACACTCAACGTCACGAATGGCGTTGACTTTGATACAACTCTCAACGTTGATGGTGCCGTTGACTTTAATAGTACTTTGGTTGTTGACGGTCAAACAACTATCTACGATTCTCTGATTCTTAGATCCGATAACGAAGTCTTCTCTATTGGCACTGGAGCAAATATTGAGAAATTTAGCGTTGACTTCGATAACGGTAACACAAACATTATTGGTACACTGACCGTTGGTGACGCAACTCAGATTAATGATACTCTGGGTGCGTCTGGTATTGTTACCTTTACAAATAACACCGACCAGACTCTCACAGGACTCTATGCTGCTGACGGTGCTGTAAGATTGACAGGTGGTGCTGCAATCCAAAGAAACCTCGCTGTTGGTGGCAACATGCGTGTTTATGGAGACTTTGAGATTTCTGGTAGCACAACTCAGTCTGGTAACACTGGATTTAGTGGTCGTGTTTCGATTACTAACACTTCTGATGCAACTACCTTTGCCGATAACTCTGTTGCTCTCACAACCGATGGTGGTTTCAGAGCAAGCAAGAATGCATGGGTTGGTGGCGATTTCCACGTTTGGGATGATGCAAACTCCAGAGATGCATTCGTTGTTGATGTAAGCACAGGCGATGCTACTCTTTATAATACTCTAACGGTTGGAGGAAACTTAGTTGTAAATGGAACGACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTCTGGGTGGTGACACAACACCAGTCGCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATTCGACAGGTCTTCCTCCCAATTCACGTTCTTAACAGATTCTACAAATGTATCTGAGGTTCACACAGGCACAGATGCTGCTCTTCGTGCTGGTAGTCTGAATCTGACTGGCGCTGGTACATCTCTTGATGTTGATGCTAATGCAAACATTGATGGCACTCTGACTGTTGATGGTCAAATTGTTTCTCAAGTTGCATCGGGTCCTGCTCTGGTTATTCCCAACACCACCAAGATTAACAACCTGAACGCTGACTTACTGGACGGTTATACAACTGCAACTGCGAATACGGCATCTACAGTCGTTGTAAGAGATGCTTCTGGTGACTTTGCCGCAAATCAAATTACAGTCAATAATGGTATTGGTGCTCTTGCTGGTATTCAGGGTAATGCAACTACTGCAGACGCTTTGAGAACTGCAAGAACAATCACTATTGATGGTGTTGTTGATGGTTCGGTTTCCTTTAATGGTTCTACAAATGTAACCATCAGCACTACTTATAATGATGCAGATATTACTGCTCTTGCTGCAATGGCAGGTACTGGTCTTGTCACCAGAACCGCTGCAAATACCTATGCTCAGCGCACTCTGAGTAAGGTTGGTAGTGGTATCACTATCACTAATGGTGATGGTGTTGCGGGCAATCCAACAATCAACATTGCTTCTGCTAGCACCAATTCTGCTAACAACCTTGTTATTCGTGATGCGTCTGGTAATTTTGCAGCAGGTACAATCACCGCAGATTTGGTTGGTGACGTAACAGGTACAGTTTCTAGCATTGCAAACCATAGCACAACTAATCTGACTGAGGGAACCAACCTCTACTTTACTAATGAGCGTGTTGATGACCGTGTTGCTGCTCTGATTGCAGGCGGCACTGGTATTACTGCTACTTACAACGATGCAGGTAACCTGCTCACCCTGAGTGCTGAGTTTAGTGAGTTTGATACCGACGATATTGTCGAAGGTTCTACCAACCTCTTTACCACTGCCGCTCGCACCCGTACACACTTCACTTATGGTACAGGTATTGAGCACGATGGTTCTGGCACTCTGAGTGTCACCCAGGCAGATATCAACACGGATAACGTAACTGAAGGTCTTACCAACAT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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
303806dc351aa7720bcbddf9efbf22085e73795a79ea94645b61a04d552baacf
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| The Isolation and Genome Sequence of a Novel Cyanophage S-H25 from the Huanghai Sea, China | Jiang,T. | 2019-04-04 | — | GenBank |