Genbank accession
QIN97146.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNTLRYERPVESNTNTPNTLVQRDADGNFAAGTITGTLIGNASTATRLDQTRQIQLSGDVTATGNFDGSQNLNLSTALGLLSSLPHYLEGGQSDTTRTFTEVTVDQKGRVVNARTAAQMNLADYGLDGSATSDITLAQPWNPNLQAISNESGTGFYVRTGAGTLETRLLSGASGQIVITNANAVSANPIISLAVQAGVVAGDYNTESLTSVTQAGPNGEPFGTETVNAIKLSVDDKGRLTSIDNVPIATATEGSKYASYGAGTTYARYDIIENASKVYQAYQAISAGSGAPTHTSGDSGGWRYLAAAATEQKGLASFAQEDFDVDGNGHVTIAALGVDNTQLQNNRISFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYIKVNNTNGNLLFGANNTGDGGAGEVDINVRTYFSDPDIMLDGLLDQTISKVATGNLNITSVQNDGVGKEFNIGITNVGAGSSTLNLTAEDVVSVQATDANGKVHVEDARFQSNYIATTNATLNLDPGDDRAVTGLVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQIDDPIITLGGDTAPVADDNLDRGVEFRYYDTQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNTSEVFTGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDSTLRVHSTSRFDDSMVIQGASKTLQLNNGTGTTRIELQSTTGNADFYGIVNITNDLNINTNKFNVASATGNTLIAGTLGVTGITTLSSDLGVTGNTTLTGYLDLNNTLNVSGLVYLENVDEPTIALNGTTGLYEIGSSDYGALRVDGGGYVEGDILFNSDVYVNGQFIQKEDTTANYNRQNYLEVRYKLRTGTRGQYTPSYAEHDTSNLRVYGGAGVATSLHVGGRDAGEGLFVGKQLSGDTVKFSVLGASGNTDIVGTLNVDSAVTFGSTLTVTGTTEFNNTVDVDNNFAVRTSGGVDVFTVASASGNTVVTGTLDVDDATVITNTLNVTNGVDFDTTLNVDGAVDFNSTLVVDGQTTIYDSLILRSDNEVFSIGTGANIEKFSVDFDNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGASGIVTFTNNTDQTLTGLYAADGAVRLTGGAAIQRNLAVGGNMRVYGDFEISGSTTQSGNTGFSGRVSITNTSDATTFADNSVALTTDGGFRASKNAWVGGDFHVWDDANSRDAFVVDVSTGDATLYNTLTVGGNLVVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTTPVANDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGFDRSSSQFTFLTDSTNVSEVHTGTDAALRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIVSQVASGPALVIPNTTKINNLNADLLDGYTTATANTASTVVVRDASGDFAANQITVNNGIGALAGIQGNATTADALRTARTITIDGVVDGSVSFNGSTNVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVTRTAANTYAQRTLSKVGSGITITNGDGVAGNPTINIASASTNSANNLVIRDASGNFAAGTITADLVGDVTGTVSSIANHSTTNLTEGTNLYFTNERVDDRVAALIAGGTGITATYNDAGNLLTLSAEFSEFDTDDIVEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIEHDGSGTLSVTQADINTDNVTEGLTNIFYTEARFNSSLAGKTTDNVAEGSTNLYYTDARADARIAAATTDDLTEGATNLYYTTVRANSDFDTKLAAASTDDLSEGLTNLYYTDGRADARVDAGFTAKSTSDLSEGTNQYYTEARVQSKLDNAFAQLQAMLNNLATTTTLTLNLSGDPTPGAVVTAGAVTEGGVGGFTAGTNVATTGGTGSSLTVDTTVVGGVITAVAVNTPGSDYLIDDTITITNPNAGGVATFNFASLSGGTGYTAAGSNVATTTSGSGIGLTVNTTVSGGAITGVTVASAGTGYAPGDVITITGGNGDATIDVSTVFVDATFALADITTMEVGATVTGATSGTTGVITALGTNQITVDTVSGFFKVGEVVSANDVTTLTIQSFG
Physico‐chemical
properties
protein length:2036 AA
molecular weight: 209736,49750 Da
isoelectric point:4,16018
aromaticity:0,06631
hydropathy:-0,12092

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–201
IPR041352
ATT
5–43
QIN97146.1
1 2036
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 1-474 | STR 475-963 | STR 1062-1568 | RBD 1655-2036
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-H25
[NCBI]
2718941 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 8102
[NCBI]
84588 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QIN97146.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT162468 [NCBI]
CDS location
range 89363 -> 95473
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAAGAATGGGCAAACGCTAACCCTACCCTTGCACAAGGAGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGTATCAAAATCGGTGATGGTGTTACCGCATGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTTGAATCTAACACTAATACACCAAACACTCTTGTACAAAGAGATGCTGATGGCAATTTTGCTGCTGGTACTATTACTGGTACTCTGATTGGTAATGCTTCTACTGCAACCAGATTAGACCAGACTCGTCAAATTCAGTTATCTGGTGACGTTACTGCTACTGGAAACTTTGATGGTTCTCAAAACCTGAACCTTAGCACGGCATTAGGACTTCTTAGTTCACTTCCACACTACTTAGAAGGTGGTCAAAGTGATACAACCAGAACATTTACTGAGGTAACTGTTGACCAAAAGGGTAGAGTAGTTAATGCAAGAACTGCTGCCCAGATGAACCTTGCTGATTATGGTCTTGATGGTTCTGCTACCAGTGACATTACTCTGGCACAACCTTGGAATCCCAATCTTCAAGCGATTTCAAATGAAAGTGGTACTGGTTTCTATGTGAGAACTGGTGCAGGTACTCTGGAAACAAGACTTCTTTCTGGTGCTTCTGGTCAGATTGTTATCACTAACGCTAATGCTGTTAGCGCAAACCCAATTATTTCTCTTGCTGTTCAAGCAGGTGTTGTTGCTGGAGACTATAATACCGAATCTCTAACCTCGGTTACCCAAGCAGGTCCAAACGGAGAACCATTCGGAACTGAGACAGTAAACGCAATTAAATTATCGGTTGACGATAAAGGGCGTCTTACTTCTATTGATAATGTGCCTATTGCTACTGCTACTGAGGGTAGTAAGTATGCTAGCTATGGTGCAGGTACTACTTATGCTCGCTATGACATCATTGAGAATGCCTCAAAGGTTTACCAAGCATATCAGGCAATCAGTGCTGGTTCTGGTGCTCCTACTCATACCAGTGGTGATAGTGGAGGTTGGCGCTACCTCGCGGCTGCGGCAACCGAGCAGAAGGGATTGGCTTCTTTTGCACAGGAAGATTTCGATGTTGACGGCAACGGGCACGTTACCATCGCCGCCCTCGGTGTAGATAATACCCAACTTCAAAACAACCGAATTTCCTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAATTAGACCAAGAATTAACAGCAACAACTGGATACAGAGGTTTTAACTACCTTAACTATATTAAGGTTAACAACACTAATGGCAATCTCCTGTTTGGTGCAAATAACACTGGAGATGGTGGTGCTGGTGAAGTTGATATCAACGTAAGAACATATTTCTCCGATCCAGATATTATGCTGGATGGATTGTTAGACCAGACCATTTCTAAAGTTGCTACTGGTAACCTCAATATCACTAGCGTTCAAAATGATGGTGTTGGTAAAGAATTTAATATTGGTATTACCAATGTTGGTGCTGGTTCCAGCACACTGAATCTAACTGCTGAAGATGTCGTTAGTGTTCAGGCAACAGACGCTAATGGTAAAGTTCATGTTGAAGATGCTCGTTTCCAAAGCAATTATATTGCTACAACTAATGCAACCCTCAACCTTGATCCTGGCGATGACCGTGCCGTTACTGGTCTCGTCAGAGTTTGGGGCGATTTACAGGTTGACGGCACCACGACGACTGTCAACTCAACAACCCTTCAGATTGACGACCCCATCATTACTCTGGGCGGTGATACTGCTCCAGTTGCTGACGATAATCTGGATAGGGGTGTTGAATTCCGCTATTACGACACTCAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACCAACTATACCGATTTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCACGCTGCTACAAATACTTCCGAAGTCTTTACTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATGTAAAACTGACAACTGGCACTAACTCTACCTCTAATACAACTGGCGACCTCGTAGTTGCTGGCGGCGCTGGTATTGGTCAAGACGTTAACATTGGTGGACTGCTTGATGTTGACAGCACTCTGCGCGTCCACAGCACCTCTCGTTTTGATGACAGCATGGTCATTCAAGGTGCTTCTAAGACACTGCAATTGAATAATGGCACTGGCACTACTCGTATTGAATTACAGTCTACAACGGGTAATGCAGATTTCTACGGTATCGTTAATATTACAAATGATCTCAATATTAATACTAATAAGTTTAATGTTGCTTCTGCGACTGGTAACACCCTCATAGCAGGAACACTTGGCGTTACTGGAATTACGACACTTAGCAGCGATTTAGGTGTAACTGGAAACACCACTCTCACTGGTTATCTTGACCTCAACAATACTCTGAATGTTTCTGGTCTTGTTTACCTTGAGAACGTTGACGAACCAACTATTGCTCTCAATGGCACAACTGGTCTCTATGAGATTGGTAGCAGTGACTATGGTGCTCTTCGTGTTGATGGTGGCGGTTATGTTGAGGGTGACATCCTTTTCAACAGTGATGTCTATGTAAACGGTCAGTTTATCCAGAAAGAAGATACTACCGCGAACTATAACAGACAGAACTACTTGGAAGTTCGTTATAAGTTACGCACAGGTACAAGAGGACAATATACACCATCTTATGCAGAGCATGACACTTCCAACTTAAGAGTTTATGGTGGTGCTGGTGTTGCTACAAGTCTGCATGTTGGCGGTAGAGATGCTGGAGAGGGTCTGTTTGTTGGTAAACAACTTTCTGGCGACACAGTTAAATTCTCTGTCCTTGGTGCATCTGGTAACACCGATATTGTTGGAACACTGAATGTTGATAGTGCGGTAACCTTTGGCAGCACATTAACAGTAACTGGTACAACGGAATTTAATAATACCGTTGATGTTGATAATAACTTTGCAGTAAGAACTTCTGGAGGCGTAGATGTATTTACTGTTGCTTCTGCTAGCGGCAACACTGTTGTTACTGGCACCCTGGATGTTGATGATGCAACTGTCATCACAAATACACTCAACGTCACGAATGGCGTTGACTTTGATACAACTCTCAACGTTGATGGTGCCGTTGACTTTAATAGTACTTTGGTTGTTGACGGTCAAACAACTATCTACGATTCTCTGATTCTTAGATCCGATAACGAAGTCTTCTCTATTGGCACTGGAGCAAATATTGAGAAATTTAGCGTTGACTTCGATAACGGTAACACAAACATTATTGGTACACTGACCGTTGGTGACGCAACTCAGATTAATGATACTCTGGGTGCGTCTGGTATTGTTACCTTTACAAATAACACCGACCAGACTCTCACAGGACTCTATGCTGCTGACGGTGCTGTAAGATTGACAGGTGGTGCTGCAATCCAAAGAAACCTCGCTGTTGGTGGCAACATGCGTGTTTATGGAGACTTTGAGATTTCTGGTAGCACAACTCAGTCTGGTAACACTGGATTTAGTGGTCGTGTTTCGATTACTAACACTTCTGATGCAACTACCTTTGCCGATAACTCTGTTGCTCTCACAACCGATGGTGGTTTCAGAGCAAGCAAGAATGCATGGGTTGGTGGCGATTTCCACGTTTGGGATGATGCAAACTCCAGAGATGCATTCGTTGTTGATGTAAGCACAGGCGATGCTACTCTTTATAATACTCTAACGGTTGGAGGAAACTTAGTTGTAAATGGAACGACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTCTGGGTGGTGACACAACACCAGTCGCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATTCGACAGGTCTTCCTCCCAATTCACGTTCTTAACAGATTCTACAAATGTATCTGAGGTTCACACAGGCACAGATGCTGCTCTTCGTGCTGGTAGTCTGAATCTGACTGGCGCTGGTACATCTCTTGATGTTGATGCTAATGCAAACATTGATGGCACTCTGACTGTTGATGGTCAAATTGTTTCTCAAGTTGCATCGGGTCCTGCTCTGGTTATTCCCAACACCACCAAGATTAACAACCTGAACGCTGACTTACTGGACGGTTATACAACTGCAACTGCGAATACGGCATCTACAGTCGTTGTAAGAGATGCTTCTGGTGACTTTGCCGCAAATCAAATTACAGTCAATAATGGTATTGGTGCTCTTGCTGGTATTCAGGGTAATGCAACTACTGCAGACGCTTTGAGAACTGCAAGAACAATCACTATTGATGGTGTTGTTGATGGTTCGGTTTCCTTTAATGGTTCTACAAATGTAACCATCAGCACTACTTATAATGATGCAGATATTACTGCTCTTGCTGCAATGGCAGGTACTGGTCTTGTCACCAGAACCGCTGCAAATACCTATGCTCAGCGCACTCTGAGTAAGGTTGGTAGTGGTATCACTATCACTAATGGTGATGGTGTTGCGGGCAATCCAACAATCAACATTGCTTCTGCTAGCACCAATTCTGCTAACAACCTTGTTATTCGTGATGCGTCTGGTAATTTTGCAGCAGGTACAATCACCGCAGATTTGGTTGGTGACGTAACAGGTACAGTTTCTAGCATTGCAAACCATAGCACAACTAATCTGACTGAGGGAACCAACCTCTACTTTACTAATGAGCGTGTTGATGACCGTGTTGCTGCTCTGATTGCAGGCGGCACTGGTATTACTGCTACTTACAACGATGCAGGTAACCTGCTCACCCTGAGTGCTGAGTTTAGTGAGTTTGATACCGACGATATTGTCGAAGGTTCTACCAACCTCTTTACCACTGCCGCTCGCACCCGTACACACTTCACTTATGGTACAGGTATTGAGCACGATGGTTCTGGCACTCTGAGTGTCACCCAGGCAGATATCAACACGGATAACGTAACTGAAGGTCTTACCAACATCTTCTACACTGAAGCACGTTTTAATAGCAGTCTTGCTGGTAAGACAACTGACAATGTAGCAGAAGGTTCTACTAATCTCTACTACACAGATGCTCGTGCTGATGCACGTATTGCTGCAGCAACTACTGACGACCTCACAGAAGGCGCTACAAACCTCTATTACACTACTGTAAGGGCAAACAGCGACTTTGATACAAAACTTGCTGCAGCGTCTACAGATGACCTCTCAGAAGGTCTTACAAACCTGTATTACACTGATGGTCGTGCTGATGCAAGAGTTGATGCTGGATTTACTGCTAAGTCCACTTCTGATTTGTCTGAAGGAACTAATCAGTATTACACTGAGGCACGAGTTCAGAGCAAACTCGATAATGCGTTCGCTCAACTTCAAGCAATGCTCAATAACCTTGCAACTACTACCACACTGACATTAAATCTGTCGGGTGACCCTACTCCTGGGGCAGTTGTAACTGCTGGTGCAGTTACTGAAGGTGGTGTTGGAGGATTTACCGCTGGAACTAATGTTGCTACTACTGGTGGAACTGGAAGCAGTTTGACTGTTGATACAACCGTTGTTGGTGGAGTAATCACTGCTGTTGCAGTTAATACCCCTGGTTCTGATTATCTGATTGATGACACCATCACGATTACTAACCCCAACGCTGGTGGTGTTGCAACTTTCAACTTCGCATCCCTATCTGGTGGAACTGGATATACTGCAGCAGGCTCTAATGTTGCAACTACAACAAGTGGTAGTGGCATTGGATTGACAGTAAACACTACTGTTTCTGGTGGTGCTATTACTGGTGTTACTGTTGCATCCGCTGGCACTGGATACGCTCCTGGCGATGTAATCACTATTACAGGTGGTAATGGTGATGCAACCATTGATGTTTCTACAGTCTTTGTTGATGCAACGTTTGCTCTTGCAGATATCACTACGATGGAAGTTGGAGCAACTGTAACAGGTGCCACTTCTGGTACTACTGGCGTTATTACTGCACTTGGCACCAACCAAATCACAGTTGATACCGTTAGCGGGTTCTTCAAAGTTGGAGAAGTCGTTAGTGCAAATGATGTTACTACACTTACTATCCAATCATTCGGTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
303806dc351aa7720bcbddf9efbf22085e73795a79ea94645b61a04d552baacf
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5048
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Isolation and Genome Sequence of a Novel Cyanophage S-H25 from the Huanghai Sea, China Jiang,T. 2019-04-04 — GenBank