Protein

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Genbank accession
WEY10222.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,52
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDINAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKLQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMIIFANRLWHFWEAANEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDIIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETEWVLNDVLTFNGNISYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTTPATARDTVGTNVYNKNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQSASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQTETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLTGIARIATQVEFDAGTLDNVISTPLKIKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEGALTHSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTANITGNTILGSLEVTGNSTFKNDVSVSSGKSIKFVGPQSGAGSWDSQATNFAPIFSEINSTVDASYHPIVKQRLGQGTFSLGTLNDGSGDFKIHHISSASGALKSSYWTFNTTGDFAVNSGSISISKNANITGITTSNGVSTTTLNASALSSLQNVTTSGTIVSTGQVSANNGLVAQKYVRSVGVKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDSATFNLFPGYWTMKTKRQVNIDTVQTKPAGVSDEIWNASGWLTETGAFSSPAIRYRNEDGSFGDEVLSTSGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1350 AA
molecular weight: 146231,02470 Da
isoelectric point:5,75059
aromaticity:0,08074
hydropathy:-0,32852

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1144–1177
IPR048391 IPR048391
WEY10222.1
1 1350
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1143 | ATT 1144-1177 | STR 1178-1235 | ATT 1236-1298 | STR 1299-1332 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage LHE83
[NCBI] 		3035933 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli BL21
[NCBI] 		511693 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Escherichia > Escherichia coli

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WEY10222.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ561750.1 [NCBI]
CDS location
range 137502 -> 141554
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCAATGCTCCAGCAGGAACCTTTGTACCTGGTTATTGGACTGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACCGTAGCATCTCCTACACGCCAGCTGGCTTCCGGTGAATATATTGCTGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCGAACCCTACTGATGGTGATACCATCGTAATCAAGGATATTGGTGGCCGTGTAGGTTATAATGAAATTAAGCTCCAGTCTAGTTCTGCTCCAGGTGGTGGTAATCAGAAAATTGTCCGTTTCGGTAACCAGTTCACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCCTATAATATGATTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAAGCAGCTAATGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACACCGCCCAGTTCCAATCACAAGCGGGTGATAACGTTTTACGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGTGATATTATTAAAACCGTTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAATTCCACTTAATCGTTGAAACATTTGATGCGTCATCTTCATTAGGTAAGCCTGGCCAGCATAGCATGGAATTCCGTACTTCAGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGCGACCGACAAACTCGTTTACGTGTAATTCGTGACGATGTTGAACTCTTGGCTAACGAAAGTGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACGACACCCCAGACAATTAATATCACATTACCTACCGGTGTGGCCCAGGGCGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACAGTAAATATTAAGGCTGCCGTAGGAGATAAGATTGCTTCATCCGTCCAGTTGCTTCAATTCCCTAAACGTTCAGAATATCCACCAGAAACCGAATGGGTATTGAATGACGTACTGACCTTTAATGGCAATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACACCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCCCAGAACGTTCCTACTATAGAACGTGTGGATTCTAAAGATGATTTAACTCGTGCTCGTTTAGGTGTTATTGCCCTTGCGTCCCAGACTCAAGCAAACGTTGACCATGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTGGCAATTACTCCGCAGACTTTAGCTAATCGTGTGGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTGAACCAGGACACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACTCGCCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACTAACACGGGTACAGATGATACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCACGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCACTCCTGCGACTGCTAGAGACACTGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTCGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACAGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGTCAATCGGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCTGAAACATTACATGCTCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAAACAGAGACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCAGGTACGTTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACTGCTCGCCTGGCAACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACTGATGACAAAACTATCATCACTCCTTTGAAATTGCATTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCAACGAATACCGAAACAACCGCAGGAACTTCTAAAGTTCTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAAACCGAAACCACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAACTAACCGAAGGTGCTTTAACCCATTCAGGAAATAAAGTTACCGGTTCCGGTGTTAAATTTAACTCAGGCACAGGCCTTTATGAGAACGATGATACTGTTCTGAACGCAGCGAACTACCCTAAAACGGGTTATGCTGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTGGATTCACTTCAGTTCATTCGTAGAGACGTCGACCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACCCTGACCAAACAATTGAACCTGGCAGCTCCTCTAGTGTCTTCTAGTACTGCTAATATTACTGGCAATACTATTTTAGGTTCTCTAGAAGTAACTGGAAATTCTACTTTTAAAAATGATGTATCTGTTAGCTCAGGTAAATCTATTAAATTTGTAGGACCCCAGTCTGGCGCAGGTTCTTGGGATTCTCAGGCAACTAATTTTGCACCTATTTTCTCTGAGATAAATTCTACTGTTGATGCTAGTTATCACCCTATTGTTAAGCAACGATTAGGGCAGGGTACTTTCTCTTTAGGTACTTTAAATGACGGTTCCGGCGATTTTAAAATCCATCATATCAGCAGTGCTTCTGGTGCTTTAAAATCTTCCTACTGGACCTTTAATACGACCGGTGATTTTGCTGTTAATAGTGGTTCTATTAGTATTTCCAAGAACGCTAATATCACAGGTATAACCACTTCTAACGGTGTTTCTACAACCACACTAAATGCTTCTGCTCTGTCTTCGTTGCAAAACGTAACTACTTCAGGTACTATCGTTTCCACCGGACAGGTATCGGCAAATAATGGTTTGGTTGCTCAAAAATACGTCCGTTCTGTTGGTGTTAAACCTACATTAGCATCCCAGGCCCCTACTGCAGAAACAGTTGGATTCTGGTCTGTTGATATCAATGATTCGGCCACATTTAACCTGTTCCCTGGTTATTGGACGATGAAAACGAAACGTCAGGTTAATATTGATACGGTCCAAACTAAACCTGCTGGTGTTTCTGACGAGATATGGAATGCTTCTGGTTGGTTAACAGAAACAGGCGCATTTAGTTCTCCGGCTATTCGTTATCGTAACGAAGACGGTAGTTTTGGTGACGAAGTTCTAAGTACATCAGGTCAGAAATTACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAATACTCTGGATTCATGTTATCAGGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGATTGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCGTGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACCGCAGATAACCCTCCTTCTGCAGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCTACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCCGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
abfb48cdc11d182319e483b2f96fc3aaf61941a148656b698fe3d7e50c9c4e5f
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5292
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50