Protein

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Genbank accession
QQK88187.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,77
Protein sequence
MSENKSFRATYGLDASGEKVINVAKADKNILSDGVNVDFFIDQNTIQHYNPNRGYEKSFAIIYDNRIYVSNTAIDKPAGDFDKFKWDTLRVDPSYIQIHETVGNGYNLKSGEYITAYTNINDLTFNLPKQPIEGDTIYIKEMSGNNGYKFLKVKKTTHNLSWNGTLVDSHIITRPFAETLLVFSGSTWNLFQIEHEIVGRIVSTSLTKQKVSSGEKIYRRSSTGPINIELPKHATHGDIIEFYDIDQMTAINHLMVFVSNQDHSIGTLGQKDFEARTSGTGRLVFDSSVNLWRIWDGDLRTRLKTVTEDYDMLSNESVLVFGANNTEEKLITITLPKDIAEGDSAEIILTYMRKGQTVKIKCADKDIIFTDKKLLQFPKRSEYPPEVDWVEVSELEFNGTTDYVPYIKLAYTDKKDKQGWFVQLSVPTVERVDHLNPSRTGIIALATQEQANVDKDSNPEKEIAITPSTLANRTATEKREGIARISTTAEVNQISTATYLDTTIVTPKKLNERTATEDRRGLAELATQEETNKGLDDTTIVTPKKLNNRKASEELSGIAKIVSSKGTPGAQRDKAGTGVYDFNNNTDIVTPAAAHELISTEDAHGVVYLATETEVIDAPEMDPKFPVVVTPVQLHKKTATENRIGFGKIATQDEVNEGTDDFSYVTSKKLNERKASEILTGLSRYATQDEFNAGDKELISEPAKIKTFLKDKRLEVNTDSGLTLTGNIWDKATINIKASTETQRGTTTIASQVQVDEGTDHTIIVTPKTLHNKKSTEDKEGIIQVASYDETITGTVVNKAVSPKNFVDAIRTPKNGLEATTVNRGVVRLPADASVWEGTDKDGSTGKYEHEGFAVSPRELNKALGHYLPIKGRAVDSDKFNGLVEDDFVRRNKDQTIEGKITFKETVSLEKALTSTSDATFVNTNTDVINIGNGTKGTINFKSTTPWAIEAEDKLKINTVEIEQDGTINLKGLNATGVVDALIFNVDGTKVISKDGLNTDIGIKEQQLRLFSKDPNATKINDSTIIVDTNLKDKGKGHFILRGGDTVEGDMTFIKPIRVQKAQMKASVKPVAGSFTSEIKDKAIYDTYPGIAVPVIDPETSLVTDYTYVKGPGLLTQIGDSADFVYQTWIPQALGTEANQFNRTVWTRVYNPVKKDWDEWGRVYNTNNPPTAKDIGAVSTAGSTFETLTINQWLQVGPVRLVPNPVTKTVDFVWVG
Physico‐chemical
properties
protein length:1216 AA
molecular weight: 134667,47070 Da
isoelectric point:5,43195
aromaticity:0,07566
hydropathy:-0,46891

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–206
DC_1946 DC_1209
IPR048391
ATT
1073–1164
IPR048391
QQK88187.1
1 1216
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-206 | STR 343-1072 | ATT 1073-1164 | STR 1165-1199 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Providencia phage PSTRCR_127
[NCBI] 		2800827 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QQK88187.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW358927 [NCBI]
CDS location
range 84606 -> 88256
strand -
CDS
ATGTCAGAAAATAAATCATTTAGAGCCACATACGGTCTGGATGCTTCTGGTGAAAAAGTAATCAACGTGGCTAAGGCGGATAAAAATATTTTATCCGACGGTGTTAACGTTGATTTTTTTATTGACCAAAACACTATACAACATTATAACCCAAATCGTGGATACGAAAAATCATTCGCAATTATCTACGATAACCGCATTTATGTATCAAATACTGCCATAGATAAACCCGCAGGTGATTTTGATAAATTCAAATGGGACACCTTACGAGTTGACCCAAGTTATATTCAAATCCATGAAACTGTTGGTAATGGATATAACCTTAAATCTGGCGAGTATATTACTGCATACACTAATATAAATGATTTAACCTTTAACCTGCCTAAACAGCCTATCGAAGGTGACACAATTTATATTAAAGAAATGTCGGGTAATAACGGTTATAAATTCTTGAAAGTTAAAAAGACTACCCATAATTTATCATGGAACGGTACATTAGTCGATAGTCATATTATAACACGCCCATTTGCAGAAACTCTTTTAGTTTTCTCGGGTAGTACATGGAACTTATTCCAGATTGAACATGAAATTGTTGGACGTATTGTATCAACAAGTTTGACAAAGCAAAAAGTTTCATCTGGTGAAAAAATTTATAGAAGATCTTCAACAGGCCCTATTAATATTGAATTGCCTAAACATGCAACTCATGGTGATATTATTGAGTTCTATGATATTGATCAAATGACGGCTATTAACCACTTAATGGTATTTGTCAGCAATCAAGATCATTCAATAGGTACTCTTGGACAAAAAGACTTCGAGGCTAGAACTTCTGGTACTGGACGTTTAGTATTTGACTCATCTGTCAATTTATGGCGAATTTGGGATGGTGATCTTCGTACTCGTCTTAAAACTGTAACTGAAGATTATGACATGTTATCAAATGAATCAGTTTTAGTATTTGGCGCAAATAATACAGAAGAAAAATTAATCACAATTACACTACCTAAAGATATTGCAGAAGGTGACTCAGCCGAAATTATTTTGACTTATATGCGTAAAGGCCAAACGGTTAAAATCAAATGTGCTGATAAAGATATTATTTTCACTGATAAAAAATTACTTCAATTTCCTAAACGCAGTGAATATCCACCTGAAGTTGATTGGGTAGAAGTAAGCGAATTAGAATTTAATGGCACAACTGACTATGTCCCGTATATTAAATTAGCGTATACAGACAAAAAAGATAAACAAGGCTGGTTTGTACAATTAAGTGTTCCAACTGTTGAGCGTGTCGACCATTTAAATCCGTCTCGCACCGGCATTATTGCTCTTGCTACCCAAGAGCAGGCCAATGTTGATAAAGATAGTAACCCAGAAAAAGAAATAGCGATTACTCCTTCTACTTTGGCTAATCGTACAGCCACTGAAAAACGTGAAGGTATTGCCCGTATTTCTACTACTGCTGAAGTTAATCAGATTTCTACGGCGACTTATCTTGATACCACTATTGTTACTCCTAAAAAGTTAAACGAGCGTACTGCAACAGAAGATCGTCGTGGTCTGGCTGAATTAGCTACTCAGGAAGAAACGAATAAAGGTTTAGACGATACCACTATTGTTACTCCTAAAAAGTTAAATAATCGTAAGGCATCAGAAGAACTTTCAGGTATTGCAAAAATTGTTTCTTCAAAAGGTACTCCAGGAGCACAGAGAGACAAAGCTGGTACGGGTGTATATGATTTCAATAATAACACAGATATTGTTACTCCAGCGGCTGCTCATGAATTAATTTCGACTGAAGATGCGCATGGCGTAGTTTATCTGGCAACCGAAACCGAGGTTATTGATGCTCCTGAAATGGATCCTAAATTCCCAGTCGTAGTTACTCCAGTTCAATTACATAAAAAGACTGCTACTGAAAATCGTATTGGTTTTGGTAAAATAGCTACTCAAGACGAAGTTAATGAAGGTACAGATGATTTTTCTTATGTCACGTCTAAGAAATTAAACGAACGTAAGGCGTCTGAGATCTTAACAGGTTTATCAAGATACGCAACGCAGGATGAATTTAATGCCGGTGATAAAGAATTAATTTCTGAACCTGCAAAAATTAAAACATTTCTGAAAGATAAACGTCTTGAGGTTAATACTGATTCAGGATTAACTTTGACGGGTAATATCTGGGACAAAGCAACAATTAATATCAAGGCTTCAACTGAAACTCAGCGTGGTACGACAACTATCGCGTCACAGGTACAAGTTGATGAAGGAACTGATCATACTATTATTGTTACGCCTAAAACTCTGCATAATAAAAAATCAACTGAAGATAAAGAAGGTATTATCCAGGTTGCTAGTTATGACGAGACAATAACAGGTACAGTAGTTAATAAGGCAGTTTCACCTAAGAATTTTGTTGATGCTATCCGTACACCAAAAAACGGTTTAGAAGCAACAACTGTCAATCGTGGTGTTGTTCGTTTACCTGCAGATGCTTCTGTCTGGGAAGGTACTGATAAAGATGGTTCAACTGGTAAATATGAACACGAAGGCTTTGCGGTTTCACCTCGTGAATTAAATAAAGCTCTCGGTCATTATCTCCCTATTAAAGGAAGAGCTGTTGATAGTGATAAATTTAATGGACTGGTTGAAGATGATTTTGTTCGCCGCAATAAAGATCAAACCATCGAAGGTAAAATCACGTTCAAAGAAACAGTTTCACTTGAAAAAGCTTTAACCAGCACAAGTGATGCGACCTTTGTTAATACTAATACTGATGTTATTAATATCGGTAACGGAACCAAAGGTACAATTAATTTTAAATCAACTACTCCTTGGGCCATCGAGGCAGAAGATAAACTTAAAATTAATACTGTTGAAATTGAGCAAGACGGTACGATTAACCTTAAAGGACTAAACGCGACTGGTGTTGTTGATGCATTGATTTTTAATGTTGACGGTACTAAAGTTATTTCTAAAGACGGTTTAAACACCGATATCGGTATCAAAGAACAACAGTTAAGACTTTTCAGTAAAGATCCGAATGCAACAAAAATAAATGATTCGACTATTATCGTTGATACCAATCTGAAAGATAAAGGTAAAGGACACTTTATTTTACGTGGTGGTGATACAGTCGAAGGTGATATGACTTTCATTAAGCCTATCAGAGTTCAGAAAGCACAAATGAAAGCTTCTGTTAAACCAGTTGCAGGTTCATTTACTTCTGAGATCAAAGATAAAGCAATATATGATACATATCCAGGAATTGCAGTTCCGGTTATTGATCCTGAAACTTCTTTAGTAACTGATTATACTTATGTCAAAGGTCCAGGTTTATTAACTCAGATCGGTGATTCAGCTGATTTTGTATATCAGACTTGGATTCCACAGGCATTAGGTACAGAAGCTAACCAGTTCAACAGAACAGTATGGACCCGTGTTTATAACCCGGTTAAAAAAGATTGGGATGAATGGGGACGTGTCTATAATACTAATAATCCTCCAACAGCTAAAGATATTGGTGCAGTTTCAACTGCAGGTTCAACTTTCGAAACATTAACCATTAACCAGTGGTTACAAGTTGGTCCAGTCAGATTGGTTCCAAACCCAGTTACTAAAACTGTTGATTTTGTTTGGGTAGGTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
354e7d5a93aa18fe8af5dc547ad472b788a408445d089b811b7435cf5659e22a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5748
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50