Protein

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Genbank accession
XYM58838.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLSRLENFLKNAEGNILYVNPSDFDATDSIENRGNSQTRPFKTIQRALIEAARFSYQTGKNNDKIDRTTILVFPGVHYIDNRPGYTVTNNNGSAEFRVRKNAGWQTADLTQFTSETNFDVLDPNNELYKYNSTEGGAILPRGTSIIGLDLRKTKLRPLYVPDPLNDNQLYGGILRVTGTCYFTAFTIFDADISKNAYYDYDSNTKIPTYSHHKLAAFTYADGVNNVLINGTDSGLTDLDMFYFKVAQAYGDASGRPVPDFPTFDDFEPSVDEFRIVGDLAADPVGITSIKAGDGNTPNNVITVDTTKAHGLFKDTPVLIAGITTSVNSYNGSFLVEEVISDTQFRYLAPSVPITALPTPQEIQNSSVIIEPDTVGSASPYVFNCSLRSVFGLNGLDCDGDKATGFKSMVCAQFTGISIQKDDNAFVLYNPDTAVFNDDLSVSDSDRPLHSNSRAVYKPTFETSHMRVRNNAVVQLVSIFAIAYARHFHAERGGDASITNSNSNFGQTALESSGFRPESFNRDDVGYITHVLPPREIPKNETTASWLTLDTQKTVGIGITDRLYLFSYNTEEIVPPAQVDSYRIGAKKRDKLFLSVVNTLTGQAVQETYETPILMQVPSGTGVESEKEYQVIRNSGVNAIISNVISFTTNHQLNNGEKIRVFSNTGETPNGIVNDKIYYAIAGGNLAANRIQLASTFNDALSRRPLTGISNGGGELTVVSRVTDKLPGDPGHPIQFDSINNQWYILGHPSETFNQITPALRTIGAGVIGNETGSTYVKRRVDNRSLIDRLYRVRYVLPKEHVDARAPKPGFVLQESKTVGIGSASFLTADLSNPTQLKNVKIIKKANYSNTTLTFETELPHRLSEGDLVKVRNVESVNNPLNNFNVGYNGEHVVDNIISSKAFTVTGITTDPGLFLNENNQRTTQQQIEDLPTVERSKSKDSFYVYRVQESKPHIPGTAGQDGVYNITLVCGSIPLDKDLGFGVSFKSFSQDIRNLYPQQDRDNYDSDPQASISHANANVIGNVVSNNRQKSLTREALSYFMQGQEVGYAVTGAVVTGTGNTTLTMFTKAEHRFNQIKGLRIINPGAGYNNGSGIATVIYSADLENVTLTGRQASAKVQISAAGTVTSVEIIDGGTGYGIGNTMTISAYPAGSPTTNAVVEVTGVFDNVYDGMHLSGFADPLLNGTFKIVDIPSSKSISVEIPQSRGLGPYYTVRDDRRLPSYHLANIGVGVTYIHVTNRDEGTVQILTDANHTLVAGNCFTIQGTGNTNWDDQIFIVDDVDQNNPLRSIHFNVGVHTVGFVTSYDTINTRLFGTGISANAKTLGLGENNLAGRASYFYTGISTTVASPITTTDTQLTLTSIEGFKKGDYIIIGSEIMRFTNDNINNVLRGQFGTVNASAPVGATIKKINVLPMELRRPSILRASGHTFEYLGYGSGNYSTSLPQKQDRVLTDQETLAAQKKELDGGKVVYTGMNDSGDFYTGYKRLSSITGEEEVVGAPIFTYTGDDAEAEGTKRVAGVFDELLVRESITVEGGDNNNRTSQFYGPVNFTEKLANSSDDGIETKNFFLRGNAPQGKLLTVGIQTPTGAARAGDLSFAGIPDNGGYLGHIYAEGDWRRFGVISREKNRNFYTVDQVSIGASDGQTFRWRDALEVNGVTKLDHLFVTGIVTFASNQTFSGVTYDSIVVRQLANFYGYNLSGGFSDEGIAWENYGFYTIVDEGGTARLNNMEVVGTYVSFKASAQVDILSQLTSGYTGINSIKGDITCSNISVREQDPLNGSGKFFAEDLVVQTGFATDFNVGSTGTGGVLTVGNRAGSTLNGHANIVSITGPGMPDDTGGGSVALPPQGGGQTYQGVSRVAITSAYVNVGVITNFHAPSVSYLNQPKIASGVATSFEVTNNLTVNDAGSSATIATLNFTTGSGTNLTLSQDLTVRGGSSVARLREIEFDTQIVGPTALFNDVKCTTLNPKTSGTLAINCTTLTATNTITCQGSSFSRINKLNSQEIVMEPLASGSIKTGKLQVGDTSSNSPSSDAKIRYLNGLTVGSSNPRLDINCGPQGKITAFQIESTAASGNPPFVVRSTTKVNDLNADLLDGLDTSSNDRSGDSVVVRDNGNFEAGTITADNFNGGDFSGASLALSGNLACSGTVTSTFSGNLSGTASNATKATDVDLGKGVLYNTGQTATTVSSNFYYQSNILYAPRFSGNHSGNGSGLTSLPAGQLTGTLPDGVLGSIDAADLTGDNGSLPARLVPTLNQDTTGNAATASEIRVSGLGNGAGPHYLLMQEGTAPGNHYTRARVDGGIWYRSHTDSLYVSGDLIAFASDDRLKTNKKIIENALEKVRSLNGFTFNFNETAAELGKDTETTHVGVSAQEVEKVLPEAVTESATEGYLTVKYDKMVALLIEAIKEQSEQIDYLKEEIEKLK
Physico‐chemical
properties
protein length:2423 AA
molecular weight: 260576,01890 Da
isoelectric point:5,15862
aromaticity:0,08378
hydropathy:-0,27994

Domains

Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–2421
DC_0066
IPR023366
STR
290–355
IPR023366 IPR036388
IPR030392
CHP
2322–2419
IPR030392
IPR030392
CHP
2322–2382
IPR030392 Coil
XYM58838.1
1 2423
Architecture
STR
STR 1-2423
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-FS3
[NCBI] 		3413219 No lineage information
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM58838.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340856.1 [NCBI]
CDS location
range 22298 -> 29569
strand +
CDS
ATGCCTCTATCAAGATTAGAAAATTTTCTGAAGAACGCAGAAGGTAACATTCTATATGTAAACCCAAGTGATTTTGACGCTACCGATAGTATTGAAAACCGTGGTAACTCGCAGACGAGACCTTTCAAAACTATTCAAAGAGCATTGATCGAGGCTGCTCGTTTTTCATATCAAACGGGAAAAAATAATGACAAAATCGACAGAACAACTATTCTGGTTTTTCCTGGCGTTCACTACATTGATAACAGACCAGGATATACTGTAACAAATAATAATGGAAGTGCTGAGTTTAGAGTAAGAAAAAATGCTGGTTGGCAAACTGCTGACCTGACTCAGTTCACTTCTGAGACTAACTTTGATGTTTTAGATCCAAACAACGAACTCTATAAGTATAACTCTACAGAAGGTGGAGCAATTCTCCCCCGTGGTACTTCCATCATCGGTTTAGATCTCCGCAAAACTAAACTGAGACCACTATATGTACCCGATCCTCTAAATGATAACCAACTATATGGTGGTATTCTTCGTGTTACTGGTACTTGTTACTTCACTGCTTTCACAATCTTTGATGCAGATATTTCTAAAAATGCATATTATGATTATGACAGCAATACAAAAATTCCAACATATTCTCACCATAAACTTGCTGCATTTACATATGCGGATGGTGTAAATAATGTATTGATTAATGGAACCGACTCTGGTCTAACTGACCTGGATATGTTCTATTTCAAAGTAGCACAAGCTTATGGTGATGCTTCGGGTAGACCAGTTCCCGACTTCCCCACATTTGATGATTTTGAACCAAGTGTAGACGAATTTAGAATTGTTGGTGACCTAGCTGCGGACCCCGTTGGCATTACCTCTATTAAGGCCGGTGATGGTAACACTCCTAACAATGTCATTACCGTCGATACAACTAAAGCACATGGATTATTCAAAGATACTCCTGTTCTTATTGCTGGTATCACAACATCTGTCAACTCATATAACGGATCCTTCTTAGTAGAAGAAGTTATTAGTGACACACAGTTTAGATACTTAGCTCCCAGTGTTCCTATTACTGCACTCCCAACTCCACAAGAGATTCAAAACTCTTCTGTAATTATTGAACCAGATACTGTTGGTTCTGCATCTCCATATGTTTTCAACTGTTCTCTTCGTTCCGTTTTCGGTCTAAACGGGTTAGATTGTGATGGAGATAAAGCTACTGGATTTAAATCCATGGTTTGTGCTCAGTTTACGGGCATCTCTATTCAAAAGGATGATAATGCTTTTGTCCTCTATAATCCAGATACCGCAGTATTTAACGATGACTTAAGTGTATCGGATTCTGATAGACCTCTGCACTCAAACTCCAGAGCAGTCTATAAACCAACCTTTGAGACCTCTCACATGAGAGTGAGAAACAATGCTGTTGTTCAGTTGGTTTCTATCTTCGCTATTGCATATGCACGTCACTTCCATGCAGAAAGAGGTGGTGACGCATCTATTACTAACTCCAACTCTAACTTTGGACAAACGGCTCTAGAGTCTAGTGGTTTCAGACCAGAGTCATTTAACCGTGATGATGTTGGATATATCACTCACGTTCTTCCCCCTAGAGAGATTCCAAAGAATGAAACTACAGCATCTTGGTTAACACTCGACACACAGAAGACGGTTGGTATTGGCATTACAGATCGACTATATCTTTTCAGTTATAACACTGAAGAAATTGTTCCACCTGCACAGGTTGACTCATATAGAATTGGTGCGAAGAAAAGAGATAAATTATTCCTCTCTGTTGTAAATACTCTCACTGGACAAGCTGTTCAAGAGACTTATGAAACCCCGATTCTTATGCAGGTTCCTTCTGGGACGGGTGTTGAATCGGAGAAAGAATATCAAGTCATCAGAAATTCTGGTGTTAATGCTATTATTTCTAACGTCATTAGTTTTACAACTAATCATCAGCTTAATAATGGAGAAAAGATTAGAGTTTTTTCCAACACTGGTGAAACTCCAAATGGTATTGTAAATGATAAAATCTATTATGCTATTGCTGGTGGAAATCTCGCTGCAAATAGAATTCAGTTAGCATCTACATTTAATGATGCACTATCTCGTAGACCTTTAACTGGTATTTCTAATGGTGGTGGAGAACTAACTGTAGTTTCTAGAGTTACCGATAAATTGCCAGGAGATCCTGGACACCCAATTCAATTTGATAGTATCAATAACCAATGGTACATCTTGGGTCACCCAAGTGAAACCTTTAACCAAATTACCCCAGCACTTAGAACTATTGGTGCAGGTGTTATTGGAAATGAAACTGGTTCCACTTATGTAAAACGTAGAGTAGATAATAGATCTCTGATTGATAGGTTATATCGTGTAAGATATGTTCTGCCTAAGGAACATGTTGATGCTCGTGCTCCTAAACCTGGATTTGTTCTACAAGAATCTAAGACTGTTGGTATTGGTAGTGCATCATTCCTGACCGCTGATCTATCCAACCCAACTCAACTTAAGAATGTTAAGATTATCAAAAAAGCTAATTATAGCAATACTACCTTAACATTTGAGACAGAACTTCCTCACAGATTGAGTGAAGGTGATTTGGTAAAGGTAAGAAATGTAGAATCTGTTAATAATCCTCTCAATAATTTTAACGTTGGATATAACGGCGAACATGTTGTCGATAATATCATTTCCAGCAAAGCATTTACTGTAACTGGAATCACCACAGATCCTGGTCTTTTCCTCAATGAAAACAACCAGAGAACAACACAACAACAAATTGAAGATTTACCAACAGTAGAAAGATCCAAATCTAAGGATTCTTTCTATGTTTATCGAGTACAGGAATCTAAACCACATATTCCTGGAACTGCTGGACAAGATGGTGTATATAACATCACTCTAGTTTGTGGATCTATCCCATTAGATAAAGATCTTGGTTTTGGTGTATCCTTCAAATCATTTTCACAAGACATTAGAAACCTTTATCCGCAACAGGATAGAGATAACTATGACTCTGATCCACAAGCGTCTATCTCACATGCAAATGCAAATGTCATTGGTAATGTAGTCTCCAATAATAGACAAAAATCACTAACTCGCGAAGCGTTATCTTACTTCATGCAGGGTCAAGAAGTTGGATATGCTGTTACTGGCGCAGTTGTTACTGGTACAGGTAATACCACTCTTACGATGTTTACAAAAGCTGAACATCGATTCAATCAAATTAAGGGGTTACGTATTATCAATCCTGGAGCAGGATACAATAATGGTTCTGGTATTGCAACTGTTATCTATTCCGCAGATCTTGAGAACGTTACTCTAACTGGTAGACAAGCATCGGCTAAGGTACAGATCTCTGCTGCGGGTACTGTAACTAGTGTAGAGATTATTGATGGTGGTACTGGTTATGGTATCGGAAATACCATGACTATCTCTGCATATCCAGCAGGATCTCCTACGACTAATGCTGTTGTTGAAGTTACTGGTGTATTTGATAATGTTTATGATGGTATGCACTTATCTGGCTTCGCAGATCCTCTTCTGAACGGAACATTTAAGATCGTAGATATTCCATCTTCCAAGTCTATTTCTGTTGAGATACCTCAATCAAGAGGACTTGGACCTTACTATACTGTAAGAGATGACAGAAGACTGCCATCATATCACCTGGCAAACATTGGTGTTGGTGTAACCTATATCCATGTTACTAATAGAGATGAAGGCACAGTACAGATTTTGACTGATGCAAACCATACTTTAGTTGCTGGTAATTGTTTCACCATTCAAGGAACTGGAAATACTAACTGGGATGATCAAATCTTTATCGTTGATGATGTTGATCAGAACAATCCACTAAGAAGTATTCACTTCAATGTTGGTGTCCATACTGTTGGTTTTGTAACCTCTTATGATACAATCAACACCAGATTGTTTGGTACTGGTATTAGTGCAAATGCCAAGACTCTTGGTTTGGGTGAAAACAATCTTGCTGGTAGAGCATCTTACTTCTATACTGGTATTTCTACCACAGTTGCTTCTCCAATCACAACAACAGATACCCAACTTACTCTTACTTCTATAGAAGGATTTAAGAAAGGTGATTATATCATTATTGGATCGGAAATCATGCGATTCACCAATGATAACATCAATAATGTTCTCCGTGGTCAGTTTGGTACAGTCAACGCATCTGCTCCTGTTGGAGCAACCATCAAAAAGATTAATGTTCTACCAATGGAATTGCGTAGACCATCTATTCTTCGTGCATCTGGTCATACGTTTGAATATCTTGGTTATGGATCTGGTAACTACTCCACATCTCTGCCACAAAAACAGGATAGAGTTCTAACAGACCAAGAAACACTTGCTGCACAGAAGAAAGAACTTGATGGTGGTAAAGTTGTCTACACTGGTATGAATGACAGTGGTGACTTCTATACTGGATACAAGAGACTATCTTCAATCACTGGTGAAGAAGAAGTTGTTGGCGCACCTATTTTCACTTATACTGGTGATGATGCAGAGGCAGAGGGAACTAAAAGAGTTGCGGGTGTATTTGACGAATTACTTGTTAGAGAATCTATCACAGTTGAGGGTGGAGATAACAACAATAGAACATCACAATTCTATGGTCCCGTAAACTTCACAGAAAAACTCGCCAATAGTTCTGATGATGGTATTGAAACCAAGAACTTCTTCTTACGAGGAAATGCACCTCAGGGCAAATTATTAACTGTTGGTATTCAAACTCCAACTGGTGCAGCTCGTGCTGGAGATCTTTCATTTGCTGGTATTCCAGATAATGGTGGATACCTTGGACATATCTATGCTGAGGGTGATTGGAGAAGATTTGGTGTTATTTCTAGAGAAAAGAATAGAAATTTCTATACTGTAGATCAAGTATCTATTGGAGCTAGTGACGGACAAACTTTTAGATGGAGAGATGCTCTTGAAGTTAATGGTGTCACCAAACTGGATCACCTATTTGTTACTGGTATTGTTACGTTTGCATCTAACCAGACATTCTCTGGTGTTACCTATGATTCAATTGTTGTCAGACAACTTGCAAACTTCTATGGTTATAACTTAAGTGGTGGATTTTCGGATGAAGGTATTGCTTGGGAAAACTATGGATTCTATACCATTGTTGATGAAGGTGGTACAGCAAGACTCAACAACATGGAAGTTGTTGGTACTTATGTTTCATTTAAAGCTTCTGCACAAGTTGACATTCTCTCACAGTTAACTTCTGGTTATACTGGTATTAACTCTATCAAGGGTGACATTACCTGTAGTAATATCTCGGTAAGAGAACAAGATCCTCTGAATGGCAGTGGCAAGTTCTTCGCTGAAGATCTCGTAGTTCAAACTGGTTTTGCTACCGATTTCAATGTTGGATCTACTGGAACTGGTGGAGTCCTGACAGTTGGTAATAGAGCAGGATCTACACTTAATGGACATGCAAACATTGTAAGTATTACTGGTCCTGGTATGCCAGATGATACTGGTGGAGGTTCTGTTGCACTACCACCACAAGGTGGTGGTCAAACATATCAAGGTGTTTCTAGAGTTGCTATTACTAGTGCATACGTAAATGTTGGTGTCATCACCAACTTCCATGCACCTTCTGTCTCTTACCTAAATCAACCAAAAATTGCAAGTGGTGTTGCAACTTCTTTTGAAGTTACAAATAATCTAACTGTTAATGATGCTGGTTCTAGTGCAACTATTGCTACTCTGAACTTTACCACTGGTAGTGGCACAAATCTAACCTTGAGTCAAGATCTGACAGTTCGGGGTGGTTCTTCTGTTGCAAGACTTAGGGAAATTGAATTTGATACTCAAATTGTAGGACCAACAGCATTATTCAATGATGTAAAATGTACTACTTTGAATCCCAAAACAAGCGGAACATTAGCAATAAATTGTACTACATTAACTGCGACAAATACGATTACTTGTCAAGGATCTTCTTTCTCAAGAATTAATAAACTCAATTCTCAAGAAATTGTGATGGAACCATTAGCTAGTGGTTCTATCAAAACTGGTAAATTGCAAGTTGGCGATACAAGTTCCAACTCACCAAGTTCTGATGCTAAAATTAGATATTTGAATGGATTGACAGTTGGTAGTTCTAATCCAAGACTGGATATTAATTGTGGTCCTCAAGGAAAAATTACAGCTTTCCAAATTGAATCTACTGCAGCTTCTGGTAATCCACCGTTTGTAGTAAGATCTACGACCAAAGTTAATGATCTAAATGCCGATTTATTGGATGGACTCGACACATCTTCCAACGATAGAAGTGGAGATAGTGTTGTTGTTAGAGACAATGGTAATTTTGAGGCGGGAACTATTACAGCTGATAACTTCAATGGGGGAGATTTCTCTGGCGCGAGCCTTGCTCTTTCTGGAAATCTTGCATGTAGTGGTACAGTTACAAGTACATTTTCGGGTAACTTATCAGGAACTGCATCTAATGCAACTAAAGCTACAGATGTTGATCTTGGAAAGGGTGTTCTATACAACACTGGCCAGACTGCAACAACAGTCTCTAGTAATTTCTATTATCAGTCAAATATACTATATGCTCCTAGATTCTCTGGTAATCACAGCGGTAATGGTTCTGGACTAACCAGTCTTCCTGCTGGCCAACTCACAGGAACCTTGCCTGATGGTGTACTTGGCAGTATAGATGCTGCCGACCTCACAGGAGATAATGGATCCCTTCCTGCAAGACTAGTCCCAACTCTAAACCAGGATACAACAGGAAATGCGGCAACAGCTAGTGAAATTAGAGTTAGTGGTTTAGGAAATGGTGCGGGACCACATTATCTTCTCATGCAGGAGGGAACAGCTCCAGGAAATCATTACACCAGAGCAAGAGTTGATGGAGGAATTTGGTATAGATCCCACACCGACTCACTATATGTTTCTGGTGATCTTATCGCTTTCGCATCAGATGATAGACTTAAGACTAACAAAAAGATCATTGAAAATGCACTTGAAAAAGTACGTTCTCTAAATGGTTTTACCTTCAACTTCAATGAAACTGCTGCGGAACTTGGTAAAGACACCGAAACCACACATGTTGGTGTTTCTGCACAAGAGGTTGAAAAAGTTCTACCTGAAGCAGTTACTGAATCTGCAACTGAGGGTTATTTAACTGTCAAGTATGACAAAATGGTTGCCCTTCTTATTGAAGCAATCAAGGAACAGTCTGAACAGATTGATTATCTTAAGGAGGAGATTGAAAAGTTGAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6ab1a63b2be8acf4b248cb9d493754874172f4e371b0466537eede5d3a65f9d0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6819
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50