UniProt accession
A0ABZ0Z7R3 [UniProt]
Protein name
SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,54
Protein sequence
MAGFMDNNKYGHHNIPPVGLNGFNKICFTDQKEAENMLLNKALLPGQLTFAYYYDNDSTNGINVMAAVGTLKGEKDNHIFVSYETINQLIDSIDDSLDDYDTSLIYIRKEVINKLSVLEDEQTKLSNKVDSILPDMQPKFDEIYTKLETLESAGKEYTDTKVNELTELTKYINSSVMEKINNYEGAMSDMILDASSKLDNMQKEFEVKAEELLNKHENVYNTLDVSLRNYVDNEMLGMQQYVHSETTQAVIDINAKYAVLKKAVASINASVNDVDIKHTKKETELNRTIVETATQLTEDLQVANVSLINYINQQSELFNKRIDKKIDELEFNVKSKNIDLTNTVEEYQHNIKNDIAVFNTSMRTFVKSSLATVQTDVNSKYSELKTYVTSNDASLLNYVNALEVAQKTYINKHDSEIKSWIASANTSLFNIVRSTDSKLKDDIDAMDSRHQAMYRSVESRLDNLIDDISTDLNILVNEYNKEIKNFTRKHVSDLENQLKVQNVSLVNYIDDKAQEGVNETRLLNASLRTQLKNTVNLLNTSINNSIQYTDDEISNLKTYVDNENSSIITYIDNQDSKVKLYTELKDKELKNYIDDLEEQLKKYSNEGDSSVVNYIKLTKENIEEFVKKQDEDTLKKAYIHDDEIRNNMIADYNAFVRKQKDIDSSLLNYVKNTDTSLFNYIKNRDEQIKRWIAIGDTSIYNYFESINTSLFNYVTKKDTDLQNTIVNTGTKLQNDMEVFKTNVNSKIDSANINLDNKMNSYNTSMMSYIQSNDISIISAVNSKDHDLETKLNNEISKVKTQLETQDSSILNYVLNADSSIKNNIAIINDTINNELRIDIKKLNTKVDVTESSIVNYINTNDHKLGSYIDTEITKATNNCKANDSSVVNFIKKENSSIVNYVNGTVKQDLLNMINDTNTSIINYVAANSSLFNYITNNETLLKALIESKDGSILNSLTSADASIINLIEKYNTDLTNKINSNDSSINSKVDKFNASTFNHFTLQDANIQAKSDLADTSIVSYVDSQLSDFNTSINKSVSNINNKIDTVKNDLENSIETNNSSIVNYVKAHDAEIENMVATNKEVYNYINTQDTSIINLIKKQNSELDTKLSTIDNNINNKLDSQNTELKQDIINKANEVYYTLSNQVNNLQNSVNDNNTSLINYVKSADNALNNKLLQLDTNIHDELNNNKSELTNTINSAITAYENKRNEYETKVDNIISTFKTDVSTKISTFNTTLHNEMDELVSNINTSINVTNQSTINYLENEISKFDNKVNNQNSSLSVAFENYKETTDTIINNKLDSFNTKFDNAIKEKFTEVDIDLNNVKSDLNNTNEIFKNEINNKVNNLNTEVDNKLNDLKSYVNSENISQNIKSETQYNTLKNDISTLDNQVNTRITTHEKLCAADIENAKIEINNKVNTINSSIVSYIDKNETSIKQDVNNKISELTNYVNEKDASLNRKIDKVNNNLTETITNVNSSVTNSINTIKSDMRNEVSRLDNKIESTERSIRTDMTNADDALRSEITKVNHDIRQDMNSHDNDLQQQISDVSQDIKQFVVDSSNMITKHIANVSSDIHDVISNTSTLIWDYIDNTSNAIVGYVKQADTSLKNYSDIEDNKLKLRIENVSSKLIDVNNALNKLIGSDGDVTTAIDSFKEIEEFLKTYSNKDSLTALLQTNSDADKAYADSILQRFKEYIENYILDGSTYIINKIHNTSNDIVYFIQDISNKFKSYIDTQDSKLDGKITALRTDLDTTNSNITDLKDYVDDQDAAINRTITTLTNTVDQNKTDINQKVDLLKNYVNNDVSNKIVAYVNNVSNNIVTKFETEVGRLDTRIDNTSDYIVHYLNDTSNAIVEYIETRTNTLNTKIDNVSDYIVHQFNDVSDGLYKLIQLKQNSSLSIDNESVKKLQADVQSIQQEVNRISTTTDTLNQDVEDISVNVTAIDNKYTEKFDTLYNKDLKDINSSISNIKENFVTTEYLNNEFKTNITDDINATLTTYINDISVLNTSVSGLSDKYNELDSKIDSTNTSVSDLSEKYNTLDGKIDTTNTTLSGISGKYNELDGKISTINTSLSGLSDKYNELDGKIDTTNTTLSGISGKYNELDGKISTINTSLSGLSDKYNELDGKIDTNNTTLSGISGKYNELDGKISTINTSLSGLSDKYNELDGKISTINTSVYGLSEKYNTLDSKIDTTKSDIITIIDTYDTSLVTYTNLKCSELSTEINNINSSLSGKITSVNSSITQSVKDLSTYIDNQYWQKITNHVSDETKKLSDRIDALNPGGGSTGDPNLNLFEVKIKQYINDQDKLYDGSVNEVSTRLSTTNASLNALKEQFTTLTSENVDGTINTYKEVEKFLKDINDTTTLVSLLSTTKAEAIETANQQLNTSINNFKDNYINPQFTTYNTKFNTIDGSINTLETSVAELETQSSKYLTSINEATTTALGGIKIGYVDSEKNVAVRLSEQKAYVTITDAAIKKALGFTPAAQNENGEAYTLPTASDVKLGGIKTGYTPTGVNANKELPVTLNSEGCAYVTLTEKAISSAYSYTLPTAMQSALGGIKTGYTNTDKNIGVNVDNDGNAYVTLTEAAIKNAYTYTLPTASISKLGGICTGFTNIDSKVKVDMSDNNAYVEITKDAINSALGYTPSEPISKADENTLGLLKVGYTFNKNNSILNIPVKLDEEGNAYISINLEDLNCYGYKQ
Physico‐chemical
properties
protein length:2700 AA
molecular weight: 302850,85510 Da
isoelectric point:4,68003
aromaticity:0,06593
hydropathy:-0,59500

Domains

Domains [InterPro]
Coil
Unmapped
1183–1221
A0ABZ0Z7R3
1 2700
Architecture
STR
STR
STR
STR
STR
STR
STR 437-615 | STR 1078-1365 | STR 1379-1557 | STR 1701-1932 | STR 1949-2210 | STR 2509-2584 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage phage Lak_Megaphage_RVC_AP1_GC26
[NCBI]
3109224 Uroviricota > Caudoviricetes > Caudoviricetes code 15 clade >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WQJ54512.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR769218 [NCBI]
CDS location
range 509473 -> 517575
strand +
CDS
ATGGCAGGATTTATGGATAATAACAAATATGGTCATCATAATATTCCACCTGTTGGCCTTAATGGATTTAATAAGATATGTTTCACTGATTAGAAAGAAGCAGAAAATATGTTGTTAAATAAGGCATTGTTACCAGGTTAGCTTACATTCGCATACTATTATGATAATGATTCAACTAATGGTATTAATGTCATGGCAGCAGTCGGCACATTAAAAGGTGAGAAAGACAATCATATTTTTGTTAGTTACGAAACTATAAATTAGTTAATTGACTCTATAGATGATTCATTGGATGATTATGATACTAGCTTAATATATATTCGCAAGGAAGTTATAAATAAACTTTCTGTTTTAGAAGATGAATAGACTAAATTATCAAATAAGGTTGATAGCATCTTACCAGATATGCAACCAAAGTTTGATGAAATATATACAAAGTTAGAAACATTAGAATCAGCAGGAAAAGAATATACAGATACAAAAGTTAATGAATTAACTGAATTAACTAAATATATTAATTCTTCTGTAATGGAAAAAATTAATAATTATGAAGGTGCAATGTCTGATATGATTTTGGATGCATCTTCTAAATTAGATAACATGCAGAAAGAATTTGAAGTAAAAGCAGAAGAACTTCTTAACAAACATGAAAATGTATATAATACTCTTGATGTTTCACTTCGTAATTATGTTGATAATGAAATGTTAGGAATGCAACAGTATGTTCATTCAGAAACAACACAGGCAGTTATTGACATAAATGCAAAATATGCTGTTTTGAAAAAAGCAGTTGCATCTATAAACGCATCAGTTAATGATGTAGATATAAAACATACCAAAAAGGAAACAGAATTAAATAGAACTATTGTTGAAACAGCAACTCAATTAACAGAAGATTTACAGGTTGCTAATGTTTCACTTATTAATTATATTAATCAATAGTCTGAATTATTTAATAAGAGAATCGATAAAAAGATTGATGAACTTGAATTTAATGTAAAATCTAAAAATATTGATTTAACAAATACAGTAGAAGAATATCAGCATAATATTAAAAATGATATTGCAGTATTCAATACATCAATGAGAACTTTTGTTAAATCAAGTCTTGCCACAGTTTAGACAGATGTAAATTCAAAGTATTCAGAATTAAAAACATATGTTACATCAAATGATGCATCTTTATTAAATTATGTTAATGCTCTTGAAGTTGCACAGAAAACATATATTAATAAACATGATTCTGAAATTAAATCTTGGATTGCAAGTGCTAATACTTCTTTATTTAATATTGTACGTTCAACTGATAGTAAGTTAAAGGATGATATTGATGCAATGGATTCACGTCATCAGGCAATGTATCGTTCAGTAGAATCAAGACTCGATAATCTTATTGATGATATTTCAACAGATCTTAATATCCTTGTTAATGAATATAATAAGGAAATTAAAAACTTTACACGTAAACATGTAAGTGATCTTGAAAACCAGCTTAAGGTTCAAAATGTAAGTCTTGTAAATTATATTGACGATAAAGCACAGGAAGGTGTTAATGAAACTCGTTTACTAAATGCATCTCTTCGCACACAATTAAAGAATACTGTAAATTTACTTAATACAAGTATTAATAATTCTATTCAATATACAGACGATGAAATTTCTAATTTAAAGACATATGTAGATAATGAAAATTCATCTATTATAACTTATATTGATAATCAAGATTCAAAGGTTAAATTATATACGGAATTAAAAGATAAAGAACTTAAAAATTATATCGATGATTTAGAAGAACAACTTAAGAAATATTCTAATGAAGGCGATTCTTCTGTCGTTAATTATATTAAATTAACAAAAGAGAATATTGAAGAATTTGTTAAAAAACAGGATGAAGATACATTAAAGAAAGCATATATCCATGATGATGAAATCAGAAATAATATGATTGCAGACTATAATGCATTTGTTCGTAAACAAAAAGATATTGATTCCTCTTTATTAAATTATGTTAAAAATACAGATACTTCATTATTTAATTATATTAAGAATAGAGATGAGCAAATAAAGAGATGGATTGCTATTGGTGATACTTCAATTTATAATTATTTCGAGTCTATTAATACATCATTATTTAATTATGTAACAAAGAAAGATACTGATTTACAGAATACCATTGTAAATACAGGTACAAAGTTACAAAATGATATGGAAGTATTCAAGACAAATGTTAATTCAAAGATTGATTCTGCGAATATTAATCTTGATAATAAGATGAATTCTTATAATACTTCAATGATGTCTTATATACAGTCTAATGACATTTCTATTATAAGTGCAGTTAACAGTAAAGATCATGATCTTGAAACAAAATTAAATAATGAAATTTCTAAAGTAAAAACACAATTAGAAACACAGGATTCATCAATTTTGAATTATGTATTAAATGCTGATTCATCTATTAAGAATAATATTGCTATTATTAACGATACAATTAATAATGAACTTAGAATTGATATTAAGAAACTCAATACAAAAGTTGATGTAACTGAATCATCTATTGTTAATTATATCAATACTAATGATCATAAATTAGGTTCTTATATTGATACAGAAATTACTAAAGCTACAAATAATTGTAAAGCAAATGATTCTTCAGTCGTTAACTTTATTAAGAAAGAAAATTCATCTATTGTTAATTATGTTAATGGTACAGTTAAGTAGGATTTACTTAATATGATTAATGACACAAATACATCAATCATTAATTATGTTGCTGCGAATTCTTCATTATTTAATTACATAACAAATAATGAAACATTACTTAAAGCACTTATTGAAAGTAAAGATGGTTCTATTCTTAATTCATTAACATCTGCAGATGCTTCAATTATTAACTTAATAGAAAAATACAATACTGATTTAACAAATAAAATTAATTCAAATGATTCTTCTATTAATTCAAAGGTTGATAAGTTTAATGCTTCTACATTTAATCATTTTACATTACAAGATGCAAATATTCAAGCCAAATCAGATTTAGCTGATACATCTATTGTAAGTTATGTAGATTCACAACTTTCTGACTTCAATACAAGTATTAATAAATCAGTTTCTAATATTAATAATAAAATAGATACTGTAAAGAATGATCTTGAAAATAGTATAGAAACAAATAATTCTTCTATTGTTAATTATGTTAAAGCACATGATGCTGAAATTGAAAACATGGTAGCGACAAATAAGGAAGTTTATAACTATATTAATACACAAGATACATCTATTATTAATTTAATTAAAAAACAGAATTCTGAACTCGATACTAAACTGTCTACAATAGATAATAATATTAATAATAAGTTAGATTCATAGAATACTGAATTAAAACAAGATATTATTAACAAAGCAAATGAAGTTTATTATACATTATCAAATCAAGTAAATAATTTACAAAATTCTGTAAATGATAATAATACATCATTAATTAATTATGTTAAATCTGCTGATAATGCATTAAATAATAAGTTATTACAGTTAGATACTAATATTCATGATGAATTAAATAATAATAAATCTGAATTAACTAACACTATTAATTCTGCTATTACAGCGTATGAAAATAAGAGAAATGAATATGAAACTAAAGTTGATAATATTATAAGTACATTTAAAACTGATGTTTCTACAAAAATCTCTACATTCAATACAACATTACATAATGAAATGGATGAGTTAGTATCTAATATTAACACAAGTATTAATGTTACTAATCAGTCTACCATTAATTATCTTGAAAATGAAATTTCTAAATTTGATAATAAAGTTAATAATTAGAATTCTTCATTATCAGTTGCATTTGAAAATTATAAAGAAACAACAGATACTATAATTAATAATAAGTTAGATTCTTTTAATACTAAATTTGATAATGCAATTAAAGAAAAATTTACTGAGGTTGATATTGATCTAAATAATGTTAAATCGGATTTAAATAATACCAATGAAATATTTAAAAATGAAATTAATAATAAAGTTAATAATTTAAATACTGAAGTTGATAATAAATTAAATGATTTAAAATCATATGTTAATTCCGAAAATATTAGTTAGAATATTAAAAGTGAAACACAGTATAATACATTAAAGAATGATATTTCAACATTAGATAATTAGGTAAATACACGTATTACTACTCATGAGAAGTTATGTGCAGCAGATATTGAAAATGCAAAAATTGAAATCAATAATAAGGTTAATACTATTAATTCATCAATAGTAAGTTATATTGATAAGAATGAAACATCTATTAAACAAGATGTTAATAATAAAATATCTGAATTGACAAATTATGTTAATGAGAAAGATGCATCATTAAACAGAAAAATTGACAAAGTTAATAATAACTTAACTGAAACAATTACCAATGTTAATTCAAGTGTTACTAATTCTATTAATACTATTAAATCTGATATGAGAAATGAAGTTTCTAGATTAGATAATAAGATAGAATCTACAGAAAGAAGTATCAGAACTGATATGACTAATGCAGATGATGCATTACGATCAGAAATAACAAAGGTAAATCATGATATTCGTCAAGATATGAATTCTCATGATAATGATTTACAATAGCAAATATCAGATGTTAGTCAAGATATTAAACAATTTGTTGTTGATTCATCTAATATGATTACAAAACATATTGCTAATGTTTCATCTGATATTCATGATGTTATTTCCAATACATCTACATTAATTTGGGATTATATTGATAACACATCTAATGCTATTGTTGGTTATGTTAAGCAGGCTGATACATCACTTAAAAATTATTCAGATATAGAAGATAATAAGTTAAAATTAAGAATTGAAAATGTTTCTTCTAAATTAATAGATGTAAATAATGCATTAAATAAACTTATTGGTTCAGATGGTGACGTTACTACAGCGATAGATTCATTCAAGGAAATTGAAGAATTCTTAAAAACATATAGTAATAAAGATTCATTAACAGCATTATTACAAACTAATTCAGACGCTGATAAAGCATATGCGGATTCTATCTTGCAACGTTTTAAAGAATATATTGAAAATTATATCTTAGATGGATCTACATATATTATCAATAAGATTCATAATACATCAAATGATATTGTTTATTTCATTCAGGATATTTCAAATAAGTTCAAATCTTATATTGATACTCAAGACAGTAAATTAGATGGAAAAATTACAGCATTAAGAACAGATCTTGATACTACAAATAGTAATATTACTGATTTAAAAGATTATGTTGATGATCAGGATGCAGCAATAAACAGAACGATTACAACATTAACAAATACAGTAGATCAAAATAAGACAGATATTAATCAAAAAGTTGATTTATTGAAAAATTATGTTAATAATGATGTTTCTAATAAGATTGTTGCATATGTTAATAATGTTTCAAATAATATCGTAACTAAATTTGAAACTGAAGTAGGAAGATTAGATACTCGTATTGATAATACCTCTGACTATATTGTTCATTATTTAAATGATACATCAAATGCTATTGTTGAATATATTGAAACAAGAACAAATACACTTAACACTAAAATTGATAATGTTTCAGATTATATTGTTCATCAATTTAATGATGTATCTGATGGATTATATAAATTAATACAACTTAAACAGAATAGTTCATTATCGATAGATAATGAATCAGTTAAAAAACTTTAGGCGGATGTTTAGAGTATTCAACAAGAAGTTAATAGGATTTCTACTACTACTGATACATTAAATCAAGATGTTGAAGATATTTCAGTTAATGTAACGGCAATTGATAACAAATATACTGAAAAGTTCGATACTTTATATAATAAAGATCTTAAAGATATTAATTCTTCTATCAGTAATATTAAGGAAAATTTTGTTACAACAGAATATCTTAATAATGAATTCAAAACTAACATTACAGATGATATAAATGCTACATTAACTACTTATATTAACGATATATCTGTACTTAATACTTCAGTATCTGGACTTTCAGACAAATATAATGAATTAGATAGTAAAATCGATTCAACTAATACTTCAGTATCTGATCTTTCAGAAAAATATAATACATTAGATGGTAAAATCGATACAACTAATACTACATTATCTGGTATTTCAGGCAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCAGTACAATTAATACTTCATTATCTGGACTTTCAGACAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCGATACAACTAATACTACATTATCTGGTATTTCAGGCAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCAGTACAATTAATACTTCATTATCTGGACTTTCAGACAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCGATACAAATAATACTACATTATCTGGTATTTCAGGCAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCAGTACAATTAATACTTCATTATCTGGACTTTCAGACAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCAGTACAATTAATACTTCAGTATATGGTCTTTCAGAAAAATATAATACATTAGATAGTAAAATCGATACAACCAAGTCTGATATTATTACAATAATTGATACATATGATACATCATTAGTAACATATACTAATCTAAAATGTAGTGAACTATCTACAGAAATTAATAATATTAATTCTTCATTATCAGGAAAGATAACATCTGTAAATTCATCAATTACACAATCAGTTAAGGATTTATCTACTTATATAGATAATCAATATTGGTAGAAAATTACAAATCACGTTTCAGATGAAACCAAAAAATTATCTGATAGAATTGATGCACTTAACCCTGGTGGTGGAAGTACAGGAGATCCAAATCTTAACTTATTCGAAGTAAAAATTAAGTAGTATATTAATGATCAAGATAAATTGTATGATGGATCTGTAAATGAGGTATCAACAAGATTATCAACAACTAATGCGTCTCTTAATGCACTTAAAGAACAATTTACTACATTAACATCTGAAAATGTAGATGGAACTATTAATACTTATAAAGAAGTTGAAAAATTCTTAAAAGATATTAATGATACAACAACATTAGTTTCACTATTATCAACTACTAAGGCTGAAGCTATTGAAACTGCTAATCAATAGTTAAATACAAGTATTAATAACTTTAAGGATAATTATATTAATCCATAGTTTACTACATATAATACTAAGTTTAATACTATTGATGGAAGTATTAATACATTAGAAACTTCAGTTGCAGAATTAGAAACACAATCTTCTAAATATTTAACTAGTATTAATGAAGCAACAACAACTGCATTAGGCGGTATTAAAATAGGTTATGTTGATTCTGAAAAGAATGTTGCAGTTCGTCTTTCTGAACAAAAGGCATATGTTACTATTACAGATGCTGCTATTAAGAAAGCACTTGGTTTCACGCCAGCTGCACAAAATGAAAATGGAGAAGCATATACATTACCAACAGCAAGCGATGTTAAATTAGGTGGTATTAAAACTGGTTATACGCCAACTGGTGTAAATGCTAATAAAGAATTGCCTGTAACATTAAATTCAGAGGGATGTGCATATGTTACACTTACAGAAAAAGCAATTTCATCAGCATATTCATATACATTACCGACTGCAATGCAATCTGCATTAGGTGGTATTAAAACTGGTTATACGAATACAGATAAAAACATAGGTGTAAATGTTGATAACGATGGAAATGCATATGTTACCCTTACTGAAGCAGCTATTAAAAATGCATATACATATACATTACCGACTGCAAGCATTTCTAAACTTGGCGGTATATGTACTGGCTTTACTAATATAGACTCTAAAGTAAAAGTTGACATGAGCGATAATAACGCATATGTTGAAATTACAAAAGATGCAATTAACTCAGCATTAGGTTATACGCCATCAGAACCAATATCAAAGGCAGATGAAAATACACTCGGTTTACTTAAAGTTGGATATACATTTAATAAGAATAATTCAATATTAAATATTCCTGTTAAACTTGATGAAGAAGGTAATGCATATATAAGTATTAACTTAGAAGACTTAAATTGTTACGGTTATAAACAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
e3274b4ec7c4c6e421823d8403ca4b5b00d2b14f49dad96b7e1f780fdddc12e7
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2596
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50