Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0ABZ0Z7R3 [UniProt]
- Protein name
- SbcC-like subunit of palindrome specific endonuclease
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MAGFMDNNKYGHHNIPPVGLNGFNKICFTDQKEAENMLLNKALLPGQLTFAYYYDNDSTNGINVMAAVGTLKGEKDNHIFVSYETINQLIDSIDDSLDDYDTSLIYIRKEVINKLSVLEDEQTKLSNKVDSILPDMQPKFDEIYTKLETLESAGKEYTDTKVNELTELTKYINSSVMEKINNYEGAMSDMILDASSKLDNMQKEFEVKAEELLNKHENVYNTLDVSLRNYVDNEMLGMQQYVHSETTQAVIDINAKYAVLKKAVASINASVNDVDIKHTKKETELNRTIVETATQLTEDLQVANVSLINYINQQSELFNKRIDKKIDELEFNVKSKNIDLTNTVEEYQHNIKNDIAVFNTSMRTFVKSSLATVQTDVNSKYSELKTYVTSNDASLLNYVNALEVAQKTYINKHDSEIKSWIASANTSLFNIVRSTDSKLKDDIDAMDSRHQAMYRSVESRLDNLIDDISTDLNILVNEYNKEIKNFTRKHVSDLENQLKVQNVSLVNYIDDKAQEGVNETRLLNASLRTQLKNTVNLLNTSINNSIQYTDDEISNLKTYVDNENSSIITYIDNQDSKVKLYTELKDKELKNYIDDLEEQLKKYSNEGDSSVVNYIKLTKENIEEFVKKQDEDTLKKAYIHDDEIRNNMIADYNAFVRKQKDIDSSLLNYVKNTDTSLFNYIKNRDEQIKRWIAIGDTSIYNYFESINTSLFNYVTKKDTDLQNTIVNTGTKLQNDMEVFKTNVNSKIDSANINLDNKMNSYNTSMMSYIQSNDISIISAVNSKDHDLETKLNNEISKVKTQLETQDSSILNYVLNADSSIKNNIAIINDTINNELRIDIKKLNTKVDVTESSIVNYINTNDHKLGSYIDTEITKATNNCKANDSSVVNFIKKENSSIVNYVNGTVKQDLLNMINDTNTSIINYVAANSSLFNYITNNETLLKALIESKDGSILNSLTSADASIINLIEKYNTDLTNKINSNDSSINSKVDKFNASTFNHFTLQDANIQAKSDLADTSIVSYVDSQLSDFNTSINKSVSNINNKIDTVKNDLENSIETNNSSIVNYVKAHDAEIENMVATNKEVYNYINTQDTSIINLIKKQNSELDTKLSTIDNNINNKLDSQNTELKQDIINKANEVYYTLSNQVNNLQNSVNDNNTSLINYVKSADNALNNKLLQLDTNIHDELNNNKSELTNTINSAITAYENKRNEYETKVDNIISTFKTDVSTKISTFNTTLHNEMDELVSNINTSINVTNQSTINYLENEISKFDNKVNNQNSSLSVAFENYKETTDTIINNKLDSFNTKFDNAIKEKFTEVDIDLNNVKSDLNNTNEIFKNEINNKVNNLNTEVDNKLNDLKSYVNSENISQNIKSETQYNTLKNDISTLDNQVNTRITTHEKLCAADIENAKIEINNKVNTINSSIVSYIDKNETSIKQDVNNKISELTNYVNEKDASLNRKIDKVNNNLTETITNVNSSVTNSINTIKSDMRNEVSRLDNKIESTERSIRTDMTNADDALRSEITKVNHDIRQDMNSHDNDLQQQISDVSQDIKQFVVDSSNMITKHIANVSSDIHDVISNTSTLIWDYIDNTSNAIVGYVKQADTSLKNYSDIEDNKLKLRIENVSSKLIDVNNALNKLIGSDGDVTTAIDSFKEIEEFLKTYSNKDSLTALLQTNSDADKAYADSILQRFKEYIENYILDGSTYIINKIHNTSNDIVYFIQDISNKFKSYIDTQDSKLDGKITALRTDLDTTNSNITDLKDYVDDQDAAINRTITTLTNTVDQNKTDINQKVDLLKNYVNNDVSNKIVAYVNNVSNNIVTKFETEVGRLDTRIDNTSDYIVHYLNDTSNAIVEYIETRTNTLNTKIDNVSDYIVHQFNDVSDGLYKLIQLKQNSSLSIDNESVKKLQADVQSIQQEVNRISTTTDTLNQDVEDISVNVTAIDNKYTEKFDTLYNKDLKDINSSISNIKENFVTTEYLNNEFKTNITDDINATLTTYINDISVLNTSVSGLSDKYNELDSKIDSTNTSVSDLSEKYNTLDGKIDTTNTTLSGISGKYNELDGKISTINTSLSGLSDKYNELDGKIDTTNTTLSGISGKYNELDGKISTINTSLSGLSDKYNELDGKIDTNNTTLSGISGKYNELDGKISTINTSLSGLSDKYNELDGKISTINTSVYGLSEKYNTLDSKIDTTKSDIITIIDTYDTSLVTYTNLKCSELSTEINNINSSLSGKITSVNSSITQSVKDLSTYIDNQYWQKITNHVSDETKKLSDRIDALNPGGGSTGDPNLNLFEVKIKQYINDQDKLYDGSVNEVSTRLSTTNASLNALKEQFTTLTSENVDGTINTYKEVEKFLKDINDTTTLVSLLSTTKAEAIETANQQLNTSINNFKDNYINPQFTTYNTKFNTIDGSINTLETSVAELETQSSKYLTSINEATTTALGGIKIGYVDSEKNVAVRLSEQKAYVTITDAAIKKALGFTPAAQNENGEAYTLPTASDVKLGGIKTGYTPTGVNANKELPVTLNSEGCAYVTLTEKAISSAYSYTLPTAMQSALGGIKTGYTNTDKNIGVNVDNDGNAYVTLTEAAIKNAYTYTLPTASISKLGGICTGFTNIDSKVKVDMSDNNAYVEITKDAINSALGYTPSEPISKADENTLGLLKVGYTFNKNNSILNIPVKLDEEGNAYISINLEDLNCYGYKQ
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2700 AA molecular weight: 302850,85510 Da isoelectric point: 4,68003 aromaticity: 0,06593 hydropathy: -0,59500
Domains
Domains [InterPro]
Coil
Unmapped
108–128
Unmapped
108–128
Coil
Unmapped
586–606
Unmapped
586–606
Coil
Unmapped
1117–1137
Unmapped
1117–1137
Coil
Unmapped
1183–1221
Unmapped
1183–1221
1
2700
Architecture
STR 437-615 | STR 1078-1365 | STR 1379-1557 | STR 1701-1932 | STR 1949-2210 | STR 2509-2584 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
phage Lak_Megaphage_RVC_AP1_GC26 [NCBI] |
3109224 | Uroviricota > Caudoviricetes > Caudoviricetes code 15 clade > |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WQJ54512.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR769218
[NCBI]
CDS location
range 509473 -> 517575
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGGATTTATGGATAATAACAAATATGGTCATCATAATATTCCACCTGTTGGCCTTAATGGATTTAATAAGATATGTTTCACTGATTAGAAAGAAGCAGAAAATATGTTGTTAAATAAGGCATTGTTACCAGGTTAGCTTACATTCGCATACTATTATGATAATGATTCAACTAATGGTATTAATGTCATGGCAGCAGTCGGCACATTAAAAGGTGAGAAAGACAATCATATTTTTGTTAGTTACGAAACTATAAATTAGTTAATTGACTCTATAGATGATTCATTGGATGATTATGATACTAGCTTAATATATATTCGCAAGGAAGTTATAAATAAACTTTCTGTTTTAGAAGATGAATAGACTAAATTATCAAATAAGGTTGATAGCATCTTACCAGATATGCAACCAAAGTTTGATGAAATATATACAAAGTTAGAAACATTAGAATCAGCAGGAAAAGAATATACAGATACAAAAGTTAATGAATTAACTGAATTAACTAAATATATTAATTCTTCTGTAATGGAAAAAATTAATAATTATGAAGGTGCAATGTCTGATATGATTTTGGATGCATCTTCTAAATTAGATAACATGCAGAAAGAATTTGAAGTAAAAGCAGAAGAACTTCTTAACAAACATGAAAATGTATATAATACTCTTGATGTTTCACTTCGTAATTATGTTGATAATGAAATGTTAGGAATGCAACAGTATGTTCATTCAGAAACAACACAGGCAGTTATTGACATAAATGCAAAATATGCTGTTTTGAAAAAAGCAGTTGCATCTATAAACGCATCAGTTAATGATGTAGATATAAAACATACCAAAAAGGAAACAGAATTAAATAGAACTATTGTTGAAACAGCAACTCAATTAACAGAAGATTTACAGGTTGCTAATGTTTCACTTATTAATTATATTAATCAATAGTCTGAATTATTTAATAAGAGAATCGATAAAAAGATTGATGAACTTGAATTTAATGTAAAATCTAAAAATATTGATTTAACAAATACAGTAGAAGAATATCAGCATAATATTAAAAATGATATTGCAGTATTCAATACATCAATGAGAACTTTTGTTAAATCAAGTCTTGCCACAGTTTAGACAGATGTAAATTCAAAGTATTCAGAATTAAAAACATATGTTACATCAAATGATGCATCTTTATTAAATTATGTTAATGCTCTTGAAGTTGCACAGAAAACATATATTAATAAACATGATTCTGAAATTAAATCTTGGATTGCAAGTGCTAATACTTCTTTATTTAATATTGTACGTTCAACTGATAGTAAGTTAAAGGATGATATTGATGCAATGGATTCACGTCATCAGGCAATGTATCGTTCAGTAGAATCAAGACTCGATAATCTTATTGATGATATTTCAACAGATCTTAATATCCTTGTTAATGAATATAATAAGGAAATTAAAAACTTTACACGTAAACATGTAAGTGATCTTGAAAACCAGCTTAAGGTTCAAAATGTAAGTCTTGTAAATTATATTGACGATAAAGCACAGGAAGGTGTTAATGAAACTCGTTTACTAAATGCATCTCTTCGCACACAATTAAAGAATACTGTAAATTTACTTAATACAAGTATTAATAATTCTATTCAATATACAGACGATGAAATTTCTAATTTAAAGACATATGTAGATAATGAAAATTCATCTATTATAACTTATATTGATAATCAAGATTCAAAGGTTAAATTATATACGGAATTAAAAGATAAAGAACTTAAAAATTATATCGATGATTTAGAAGAACAACTTAAGAAATATTCTAATGAAGGCGATTCTTCTGTCGTTAATTATATTAAATTAACAAAAGAGAATATTGAAGAATTTGTTAAAAAACAGGATGAAGATACATTAAAGAAAGCATATATCCATGATGATGAAATCAGAAATAATATGATTGCAGACTATAATGCATTTGTTCGTAAACAAAAAGATATTGATTCCTCTTTATTAAATTATGTTAAAAATACAGATACTTCATTATTTAATTATATTAAGAATAGAGATGAGCAAATAAAGAGATGGATTGCTATTGGTGATACTTCAATTTATAATTATTTCGAGTCTATTAATACATCATTATTTAATTATGTAACAAAGAAAGATACTGATTTACAGAATACCATTGTAAATACAGGTACAAAGTTACAAAATGATATGGAAGTATTCAAGACAAATGTTAATTCAAAGATTGATTCTGCGAATATTAATCTTGATAATAAGATGAATTCTTATAATACTTCAATGATGTCTTATATACAGTCTAATGACATTTCTATTATAAGTGCAGTTAACAGTAAAGATCATGATCTTGAAACAAAATTAAATAATGAAATTTCTAAAGTAAAAACACAATTAGAAACACAGGATTCATCAATTTTGAATTATGTATTAAATGCTGATTCATCTATTAAGAATAATATTGCTATTATTAACGATACAATTAATAATGAACTTAGAATTGATATTAAGAAACTCAATACAAAAGTTGATGTAACTGAATCATCTATTGTTAATTATATCAATACTAATGATCATAAATTAGGTTCTTATATTGATACAGAAATTACTAAAGCTACAAATAATTGTAAAGCAAATGATTCTTCAGTCGTTAACTTTATTAAGAAAGAAAATTCATCTATTGTTAATTATGTTAATGGTACAGTTAAGTAGGATTTACTTAATATGATTAATGACACAAATACATCAATCATTAATTATGTTGCTGCGAATTCTTCATTATTTAATTACATAACAAATAATGAAACATTACTTAAAGCACTTATTGAAAGTAAAGATGGTTCTATTCTTAATTCATTAACATCTGCAGATGCTTCAATTATTAACTTAATAGAAAAATACAATACTGATTTAACAAATAAAATTAATTCAAATGATTCTTCTATTAATTCAAAGGTTGATAAGTTTAATGCTTCTACATTTAATCATTTTACATTACAAGATGCAAATATTCAAGCCAAATCAGATTTAGCTGATACATCTATTGTAAGTTATGTAGATTCACAACTTTCTGACTTCAATACAAGTATTAATAAATCAGTTTCTAATATTAATAATAAAATAGATACTGTAAAGAATGATCTTGAAAATAGTATAGAAACAAATAATTCTTCTATTGTTAATTATGTTAAAGCACATGATGCTGAAATTGAAAACATGGTAGCGACAAATAAGGAAGTTTATAACTATATTAATACACAAGATACATCTATTATTAATTTAATTAAAAAACAGAATTCTGAACTCGATACTAAACTGTCTACAATAGATAATAATATTAATAATAAGTTAGATTCATAGAATACTGAATTAAAACAAGATATTATTAACAAAGCAAATGAAGTTTATTATACATTATCAAATCAAGTAAATAATTTACAAAATTCTGTAAATGATAATAATACATCATTAATTAATTATGTTAAATCTGCTGATAATGCATTAAATAATAAGTTATTACAGTTAGATACTAATATTCATGATGAATTAAATAATAATAAATCTGAATTAACTAACACTATTAATTCTGCTATTACAGCGTATGAAAATAAGAGAAATGAATATGAAACTAAAGTTGATAATATTATAAGTACATTTAAAACTGATGTTTCTACAAAAATCTCTACATTCAATACAACATTACATAATGAAATGGATGAGTTAGTATCTAATATTAACACAAGTATTAATGTTACTAATCAGTCTACCATTAATTATCTTGAAAATGAAATTTCTAAATTTGATAATAAAGTTAATAATTAGAATTCTTCATTATCAGTTGCATTTGAAAATTATAAAGAAACAACAGATACTATAATTAATAATAAGTTAGATTCTTTTAATACTAAATTTGATAATGCAATTAAAGAAAAATTTACTGAGGTTGATATTGATCTAAATAATGTTAAATCGGATTTAAATAATACCAATGAAATATTTAAAAATGAAATTAATAATAAAGTTAATAATTTAAATACTGAAGTTGATAATAAATTAAATGATTTAAAATCATATGTTAATTCCGAAAATATTAGTTAGAATATTAAAAGTGAAACACAGTATAATACATTAAAGAATGATATTTCAACATTAGATAATTAGGTAAATACACGTATTACTACTCATGAGAAGTTATGTGCAGCAGATATTGAAAATGCAAAAATTGAAATCAATAATAAGGTTAATACTATTAATTCATCAATAGTAAGTTATATTGATAAGAATGAAACATCTATTAAACAAGATGTTAATAATAAAATATCTGAATTGACAAATTATGTTAATGAGAAAGATGCATCATTAAACAGAAAAATTGACAAAGTTAATAATAACTTAACTGAAACAATTACCAATGTTAATTCAAGTGTTACTAATTCTATTAATACTATTAAATCTGATATGAGAAATGAAGTTTCTAGATTAGATAATAAGATAGAATCTACAGAAAGAAGTATCAGAACTGATATGACTAATGCAGATGATGCATTACGATCAGAAATAACAAAGGTAAATCATGATATTCGTCAAGATATGAATTCTCATGATAATGATTTACAATAGCAAATATCAGATGTTAGTCAAGATATTAAACAATTTGTTGTTGATTCATCTAATATGATTACAAAACATATTGCTAATGTTTCATCTGATATTCATGATGTTATTTCCAATACATCTACATTAATTTGGGATTATATTGATAACACATCTAATGCTATTGTTGGTTATGTTAAGCAGGCTGATACATCACTTAAAAATTATTCAGATATAGAAGATAATAAGTTAAAATTAAGAATTGAAAATGTTTCTTCTAAATTAATAGATGTAAATAATGCATTAAATAAACTTATTGGTTCAGATGGTGACGTTACTACAGCGATAGATTCATTCAAGGAAATTGAAGAATTCTTAAAAACATATAGTAATAAAGATTCATTAACAGCATTATTACAAACTAATTCAGACGCTGATAAAGCATATGCGGATTCTATCTTGCAACGTTTTAAAGAATATATTGAAAATTATATCTTAGATGGATCTACATATATTATCAATAAGATTCATAATACATCAAATGATATTGTTTATTTCATTCAGGATATTTCAAATAAGTTCAAATCTTATATTGATACTCAAGACAGTAAATTAGATGGAAAAATTACAGCATTAAGAACAGATCTTGATACTACAAATAGTAATATTACTGATTTAAAAGATTATGTTGATGATCAGGATGCAGCAATAAACAGAACGATTACAACATTAACAAATACAGTAGATCAAAATAAGACAGATATTAATCAAAAAGTTGATTTATTGAAAAATTATGTTAATAATGATGTTTCTAATAAGATTGTTGCATATGTTAATAATGTTTCAAATAATATCGTAACTAAATTTGAAACTGAAGTAGGAAGATTAGATACTCGTATTGATAATACCTCTGACTATATTGTTCATTATTTAAATGATACATCAAATGCTATTGTTGAATATATTGAAACAAGAACAAATACACTTAACACTAAAATTGATAATGTTTCAGATTATATTGTTCATCAATTTAATGATGTATCTGATGGATTATATAAATTAATACAACTTAAACAGAATAGTTCATTATCGATAGATAATGAATCAGTTAAAAAACTTTAGGCGGATGTTTAGAGTATTCAACAAGAAGTTAATAGGATTTCTACTACTACTGATACATTAAATCAAGATGTTGAAGATATTTCAGTTAATGTAACGGCAATTGATAACAAATATACTGAAAAGTTCGATACTTTATATAATAAAGATCTTAAAGATATTAATTCTTCTATCAGTAATATTAAGGAAAATTTTGTTACAACAGAATATCTTAATAATGAATTCAAAACTAACATTACAGATGATATAAATGCTACATTAACTACTTATATTAACGATATATCTGTACTTAATACTTCAGTATCTGGACTTTCAGACAAATATAATGAATTAGATAGTAAAATCGATTCAACTAATACTTCAGTATCTGATCTTTCAGAAAAATATAATACATTAGATGGTAAAATCGATACAACTAATACTACATTATCTGGTATTTCAGGCAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCAGTACAATTAATACTTCATTATCTGGACTTTCAGACAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCGATACAACTAATACTACATTATCTGGTATTTCAGGCAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCAGTACAATTAATACTTCATTATCTGGACTTTCAGACAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCGATACAAATAATACTACATTATCTGGTATTTCAGGCAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCAGTACAATTAATACTTCATTATCTGGACTTTCAGACAAATATAATGAATTAGATGGTAAAATCAGTACAATTAATACTTCAGTATATGGTCTTTCAGAAAAATATAATACATTAGATAGTAAAATCGATACAACCAAGTCTGATATTATTACAATAATTGATACATATGATACATCATTAGTAACATATACTAATCTAAAATGTAGTGAACTATCTACAGAAATTAATAATATTAATTCTTCATTATCAGGAAAGATAACATCTGTAAATTCATCAATTACACAATCAGTTAAGGATTTATCTACTTATATAGATAATCAATATTGGTAGAAAATTACAAATCACGTTTCAGATGAAACCAAAAAATTATCTGATAGAATTGATGCACTTAACCCTGGTGGTGGAAGTACAGGAGATCCAAATCTTAACTTATTCGAAGTAAAAATTAAGTAGTATATTAATGATCAAGATAAATTGTATGATGGATCTGTAAATGAGGTATCAACAAGATTATCAACAACTAATGCGTCTCTTAATGCACTTAAAGAACAATTTACTACATTAACATCTGAAAATGTAGATGGAACTATTAATACTTATAAAGAAGTTGAAAAATTCTTAAAAGATATTAATGATACAACAACATTAGTTTCACTATTATCAACTACTAAGGCTGAAGCTATTGAAACTGCTAATCAATAGTTAAATACAAGTATTAATAACTTTAAGGATAATTATATTAATCCATAGTTTACTACATATAATACTAAGTTTAATACTATTGATGGAAGTATTAATACATTAGAAACTTCAGTTGCAGAATTAGAAACACAATCTTCTAAATATTTAACTAGTATTAATGAAGCAACAACAACTGCATTAGGCGGTATTAAAATAGGTTATGTTGATTCTGAAAAGAATGTTGCAGTTCGTCTTTCTGAACAAAAGGCATATGTTACTATTACAGATGCTGCTATTAAGAAAGCACTTGGTTTCACGCCAGCTGCACAAAATGAAAATGGAGAAGCATATACATTACCAACAGCAAGCGATGTTAAATTAGGTGGTATTAAAACTGGTTATACGCCAACTGGTGTAAATGCTAATAAAGAATTGCCTGTAACATTAAATTCAGAGGGATGTGCATATGTTACACTTACAGAAAAAGCAATTTCATCAGCATATTCATATACATTACCGACTGCAATGCAATCTGCATTAGGTGGTATTAAAACTGGTTATACGAATACAGATAAAAACATAGGTGTAAATGTTGATAACGATGGAAATGCATATGTTACCCTTACTGAAGCAGCTATTAAAAATGCATATACATATACATTACCGACTGCAAGCATTTCTAAACTTGGCGGTATATGTACTGGCTTTACTAATATAGACTCTAAAGTAAAAGTTGACATGAGCGATAATAACGCATATGTTGAAATTACAAAAGATGCAATTAACTCAGCATTAGGTTATACGCCATCAGAACCAATATCAAAGGCAGATGAAAATACACTCGGTTTACTTAAAGTTGGATATACATTTAATAAGAATAATTCAATATTAAATATTCCTGTTAAACTTGATGAAGAAGGTAATGCATATATAAGTATTAACTTAGAAGACTTAAATTGTTACGGTTATAAACAATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
e3274b4ec7c4c6e421823d8403ca4b5b00d2b14f49dad96b7e1f780fdddc12e7
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50