Protein

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Genbank accession
BDE75798.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
Protein sequence
MEDKEKNLLQINEEINSIKSKFNSLLQEQDSIKNLSEDNKNRINVLNTSIDSLDKENDNLIEKLRNLDGSHDIDLDLSNYVTLDTLKTELRKYQKLSIDYIDSVAEGGWDSDIKGNLDSLNGRVSSNEESLSIAMSKVNKYESSIQYLSTKVEQTAESIKSIATDYTLNEINDSITKLESFREQTARVLQDTVTRADIDTVNNKVTEFESQISQFADLIEQTVSKSEIDGIVIGGKNLLENSLAVSGNWLLKPDALNSSNPNALTFGQDSDGKSYFTINTEGIEGQVGAQSYNGFKLEYNETYTISFDFRSDTFNRLDYCYFIDPSGNYSTPIAEKYLDIDEEWHRYSFVYKQTLTGRNNTKLLLGVDTDLNGLSGTFDIARVKVERGSVSSDWTSAPEDYDNMLENYNKTINGKITNIEKNAVGLGDTVTEAFKDGIISNAERIAIDKQKNVIDKDKAEIDKIFNTLYPNKMMANSVKTDLKNKYDLFNEKYNILIQDITNTISDGVATQEEIAQFNTNYLRYNEAQSNIKDAIQKAIDSISNGYAVTEAGKITVGGMNLISIANITPIGSVTLTKTNYLEYGELNAALTANGQGIKFKLDKVRNRREHILSFNLEKKTGTLTNVDISIPNSTITNTFVNGVAKGQDSRNITFDDTSALTLIEVVFIPNDSFTVDTLINMIINKNGTFPMSVDIEGLKVEEGNKSTAWQPSIKDSNARITNMESRISQTENNIALSVTKETYNADKTKIEKMGSALSLLADGITMSSSSNDKLSSFDIDPNSIKLKSKMVDINDGDVIISNGRATIKEAAITNLMSKNIVVQTMLDAMGEVKGGITIKRPDGGYLVYNGMPRFTTAYVRSEPGVQDLMSNGTPRFKNVGNAFMFSDKTTGSYFRRAMTLYGQHETRWLHIGIWYATPQCGIDIKVDSFNEQNGVIFDKTVSIPKDTSTSVTKTKFKEIIVDLGIPQQSIASVAIRARVKPGQKGNAWFLNSYIYGRN
Physico‐chemical
properties
protein length:998 AA
molecular weight: 111089,01690 Da
isoelectric point:4,96190
aromaticity:0,07715
hydropathy:-0,45802

Domains

Domains [InterPro]
Coil
Unmapped
1–28
Coil Coil G3DSA:2.60.120.260 Coil
DC_2057
STR
2–428
DC_2057
IPR008979
STR
270–386
IPR008979
DC_1272
STR
323–750
DC_1272
BDE75798.1
1 998
Architecture
STR
STR 2-750 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage S6
[NCBI] 		2913378 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BDE75798.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC680885 [NCBI]
CDS location
range 248220 -> 251216
strand -
CDS
ATGGAAGATAAAGAAAAAAATCTTCTTCAAATAAATGAAGAAATAAATTCTATTAAATCGAAATTCAATTCTTTATTACAAGAACAAGATAGCATTAAAAATCTGTCAGAAGATAATAAAAATAGAATTAATGTCTTAAATACAAGTATTGATTCTTTAGATAAAGAAAATGATAATTTAATAGAAAAATTAAGAAATTTAGATGGTAGTCACGATATTGATTTAGATTTATCTAACTATGTTACACTTGATACATTAAAAACTGAATTAAGAAAATACCAAAAACTAAGTATTGACTATATTGATAGCGTTGCTGAAGGTGGATGGGATTCTGATATTAAAGGTAATCTAGATTCTTTAAATGGAAGAGTTTCATCTAATGAAGAGTCCCTATCAATAGCAATGTCTAAAGTTAATAAATATGAATCATCTATACAATATTTAAGTACTAAAGTAGAACAAACTGCAGAGTCCATTAAGAGTATAGCTACTGATTATACTCTTAATGAAATTAATGATAGTATTACTAAATTAGAATCATTTAGAGAACAAACAGCTAGAGTTCTACAAGATACAGTTACTAGAGCTGATATAGATACGGTTAATAATAAAGTAACTGAATTTGAAAGTCAGATATCTCAATTTGCAGACTTAATAGAACAAACAGTTTCTAAATCTGAAATTGACGGTATTGTTATTGGTGGTAAAAACTTATTAGAAAATTCTTTAGCTGTTTCAGGTAATTGGTTGTTAAAACCGGATGCTTTAAATTCATCAAACCCAAATGCTTTAACTTTTGGACAAGATAGTGACGGTAAAAGTTATTTTACAATTAATACTGAAGGTATTGAAGGTCAAGTAGGTGCTCAAAGTTATAATGGTTTTAAACTAGAATACAATGAGACTTATACTATTTCATTTGATTTTAGATCAGATACATTTAATAGACTTGATTATTGTTACTTCATTGATCCTTCTGGTAATTATTCTACACCAATCGCTGAAAAGTATTTAGATATTGATGAAGAATGGCATAGATATTCATTCGTATATAAACAAACACTAACTGGAAGAAATAATACTAAATTACTTCTTGGAGTAGACACTGATCTTAATGGATTAAGTGGTACATTTGATATTGCTAGAGTTAAAGTTGAACGAGGTAGTGTGTCTTCTGACTGGACATCTGCACCTGAAGATTATGATAATATGTTAGAAAACTATAATAAAACCATTAATGGTAAAATAACTAATATCGAAAAGAATGCTGTAGGTTTAGGTGATACAGTTACTGAAGCTTTCAAAGATGGTATTATATCTAATGCTGAAAGAATTGCTATTGATAAACAGAAAAATGTTATTGATAAAGATAAAGCTGAAATAGATAAAATCTTTAATACACTTTATCCTAATAAAATGATGGCTAATTCAGTAAAAACAGATTTAAAAAATAAATATGATTTATTTAATGAGAAATATAATATACTAATACAAGATATCACTAATACTATTAGTGACGGTGTAGCTACTCAAGAAGAAATAGCTCAATTTAATACTAACTACTTGAGATATAATGAAGCTCAATCGAATATTAAAGATGCTATTCAAAAAGCTATTGACAGTATTTCTAATGGTTATGCTGTTACAGAAGCCGGTAAAATTACAGTTGGCGGTATGAACTTAATTAGCATTGCTAATATTACACCAATTGGTTCTGTAACTTTAACTAAAACTAATTATTTAGAATACGGAGAACTTAATGCAGCTTTAACTGCTAACGGTCAAGGTATTAAATTTAAATTAGATAAAGTTAGAAATAGACGTGAACACATATTAAGCTTTAACTTAGAAAAGAAAACTGGTACATTAACTAATGTTGATATTAGTATACCTAATTCAACTATAACTAATACTTTTGTTAATGGTGTTGCTAAAGGTCAAGATTCACGTAATATTACGTTTGATGATACTTCTGCTTTAACATTAATAGAAGTAGTATTTATTCCTAATGATTCATTTACAGTTGACACATTAATTAATATGATTATTAATAAAAATGGAACTTTCCCAATGTCTGTTGATATTGAAGGATTAAAAGTTGAAGAAGGTAATAAATCTACTGCTTGGCAACCATCTATTAAAGATAGTAATGCTAGAATTACTAATATGGAAAGTAGAATTAGTCAAACAGAAAATAATATCGCTTTAAGTGTTACTAAAGAAACTTACAATGCTGATAAAACTAAAATAGAAAAAATGGGTTCTGCATTATCTTTATTAGCTGATGGTATTACTATGTCATCTTCTTCTAATGATAAATTGTCTTCTTTTGATATTGATCCTAATAGTATTAAATTAAAATCTAAGATGGTTGATATTAATGATGGTGATGTAATAATTTCTAATGGTAGAGCTACTATTAAAGAAGCTGCTATTACTAATTTAATGTCTAAAAATATAGTTGTTCAAACTATGTTAGACGCTATGGGAGAAGTTAAAGGCGGTATCACTATCAAACGCCCTGATGGTGGTTATTTAGTATACAATGGTATGCCACGATTCACTACAGCTTATGTACGTTCAGAACCTGGTGTGCAAGATTTAATGTCTAATGGTACTCCTAGATTTAAAAATGTCGGTAATGCATTTATGTTTAGTGATAAGACTACAGGTAGCTACTTTAGACGTGCTATGACATTATACGGTCAACATGAAACTAGATGGTTACACATTGGTATATGGTATGCTACTCCACAATGTGGTATAGATATTAAAGTAGACTCTTTTAACGAACAGAATGGTGTAATTTTTGATAAAACTGTATCAATACCTAAAGACACTTCTACTAGTGTTACTAAAACTAAATTTAAAGAGATTATTGTTGATTTAGGAATACCACAACAATCTATAGCTTCAGTAGCTATACGAGCTCGTGTTAAACCAGGTCAAAAAGGAAATGCTTGGTTCCTAAACTCTTATATTTATGGAAGAAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b18b691bb002dec9bfc8e5507ec934170e3eb03eee444fb8b7bd2accf1f37999
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6638
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Staphylococcus phage S6 Uchiyama,J. and Matsuzaki,S. 2022-02-27 — GenBank