Protein

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Genbank accession
YP_011108619.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MKTQKQDLGKVSLTCNGTWDAGKQYYRLCIVNDGNFASYISKKDVPIGTVLSDERFWQPIANLRDDIKIDYETFKKEWLELLASIQIKLRSARVVVANEEARNNLTWLEVAAGCEVYELDTQLTYILDSIVPVINLKSWHLVVGSLLDSEAKFQLDGTYELTAERAIADRWGYIIDEVYVSKKEVKNLVLSIVNDKLENMSITIPPNSITPEDLSQAVLDLIGSGGNVVNNPDEEDITSESLSNGTSVLKFKDRDYVEGTFNGLGEVILRKNQVGIINLLEQANINKPNTVYVVRYDFCLGGATITLPKNSTLKFEGGSIDNGTIVGNNSCIISDIDKTILGKDLVIEGTWNIEHIYDKWFAFDSSADFLSNQIITNILALSNDNVYNTIHFDADRTYYFENTYKGKTNLGDDVRPNYWLLNTPDYDFLRIFTGFTSNTHLIVNNTIQMLPTNQGAYFIFHIENKENITISGTGAINGDAKDHLYTDPFAGTNYYGEWGHVLNFRSCNNVVVRDITIGYAFGDGIALGNAAYNNSGVKEAGLATKNVTIDAVKVLYARRNGISLGGNNYTITNVYFEGNGSDTIKGTAPMAAIDFENDYVDIEPSGLCTNVSMNNCKFKDNKYDVSSTIRDDLYEVPRGELVNISDCNFTSPLRLNRTNGLTFSNCHIVGITNVDNSIAAWYVSKDLVFNSCIFDELNPYLAISAEEQNKKFINPTYPEDIRYSTTFQHNLPVGKALKFTIPKPLVGEVELTAFCSNPNYSAIQMPINTTIYTFGPSQRLTGIRDIKIKASQDSTPRYSMYKNTPVFSYINYTEDSNNFIIYFAIGGDLIGDSYASATSVNIFLTSKTKFIIVEAPVSGRPDYAGMYGGKWSELSAIIKESVEISSIPSTVTFPSKEMYSGNMLADLPTSLTADKVGFSQFVLDSTYKRPVFWDSYSNVFRTADGNKALERRVTSLAELDVLTAKLTVDDRGYVVYYTVTTSYLTWRGTDWTNEDGSLFSKVKYIKQTNTIDILNIMFSYSGVIYKICADIDLGGGTLTIATGSTLDFQGGSFNNGTIIGQNTKIESGLTKIFGTDITLSGIWIADSLSPEHFGITGIDATQDTTYIQKALDCCSTINIKTVKLQNKIYQINSSLLIQSNIKLEGATSRVWNNGSATILSLAENIVGITVESTGVEINDLKIIGNTTNTGISFTNRSYYFSGNRIITTGLGIGFDIQSSWTYIFNLCRIEGGTIGFKIQEGTSGTFNSCVAFSCSEYGFYVTKLNYGSFNGCGTDGCKYGFYFTDACRGVTLSSCGCENTQVGGYMVKCGARAYVTITAFSVGTMADVDCDLFIFEADCRVSLIDLNVGSLYHPTGNTLNVASGAAVALINCYLTGTSVGLENCSVISPYGNTLKYSTTVDKINTKELVTSSLATNATYTVLSTAPLNSVYLITAVTNGNSAARGLAIVTIPTDYGMASVDNLVANANCQISIDATGNIIVTNTSTSAKAYRVSLLKLV
Physico‐chemical
properties
protein length:1499 AA
molecular weight: 164511,39660 Da
isoelectric point:4,88505
aromaticity:0,10407
hydropathy:-0,06978

Domains

Domains [InterPro]
IPR012334
STR
429–813
IPR012334 IPR006626 IPR039448
IPR011050
STR
433–681
IPR011050 IPR011050
IPR006626
Unmapped
507–529
IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR012334
IPR006626
Unmapped
1172–1195
IPR006626 IPR006626 IPR006626
YP_011108619.1
1 1499
Architecture
STR
STR
STR 429-813 | STR 1080-1426 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_011108619.1
1 1499
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 306 306 0,9880
Central domain 307 840 535 0,9698
C-terminal 841 1499 658 0,1791
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-306
Central
307-840
C-terminal
841-1499

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Caudoviricetes sp. 'Rudgehvirus jaberico'
[NCBI] 		3028515 Uroviricota > Caudoviricetes > Crassvirales > Crudevirinae >
Host Bacteroides cellulosilyticus
[NCBI] 		246787 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > FCB group > Bacteroidota/Chlorobiota group > Bacteroidota

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_011108619.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_091965 [NCBI]
CDS location
range 12150 -> 16649
strand +
CDS
ATGAAAACTCAGAAACAAGATTTAGGTAAAGTTAGTCTAACTTGTAATGGTACTTGGGATGCTGGTAAACAGTATTATAGACTTTGTATTGTTAATGATGGAAACTTTGCTTCATATATATCTAAGAAAGATGTTCCTATTGGTACTGTTCTTTCTGATGAAAGATTTTGGCAGCCTATTGCTAATCTTCGAGATGATATTAAGATAGATTACGAAACTTTTAAGAAAGAATGGTTAGAACTTCTTGCTTCTATTCAAATTAAACTTAGAAGTGCTCGTGTAGTTGTAGCTAACGAAGAAGCTCGTAATAATCTTACTTGGCTTGAAGTTGCAGCAGGTTGCGAAGTTTATGAACTTGATACTCAATTGACTTATATACTTGATAGTATAGTACCTGTTATTAATTTAAAAAGCTGGCATTTAGTAGTAGGTAGTTTATTAGATAGTGAAGCTAAGTTTCAATTAGATGGTACATACGAACTTACTGCTGAACGTGCTATTGCTGATAGATGGGGATATATTATTGACGAAGTTTATGTTAGTAAGAAAGAAGTTAAAAACTTAGTTCTTTCTATTGTAAACGATAAGTTAGAAAATATGTCTATTACTATTCCGCCTAATAGTATTACACCAGAAGATTTAAGTCAAGCTGTACTTGATCTTATCGGAAGCGGCGGCAATGTAGTTAATAATCCTGATGAAGAAGATATTACTTCTGAATCTCTTAGTAATGGAACTTCTGTTCTTAAGTTTAAAGATAGAGATTATGTAGAAGGAACATTTAATGGATTAGGTGAAGTTATTCTTCGTAAGAATCAAGTAGGTATAATCAATCTTCTTGAACAAGCAAATATTAATAAACCTAATACAGTATATGTTGTAAGATATGATTTCTGTTTAGGTGGAGCTACTATAACACTTCCTAAGAATAGTACTCTTAAATTTGAAGGTGGTTCAATAGATAATGGTACAATAGTTGGTAATAACTCATGTATTATTTCTGATATAGATAAAACTATTTTAGGTAAAGATCTTGTTATTGAAGGTACTTGGAATATAGAACATATTTATGATAAATGGTTTGCTTTTGATAGTTCTGCTGATTTCTTATCTAATCAAATTATAACTAATATATTAGCTCTTTCAAATGATAATGTATATAATACTATTCATTTTGATGCTGATAGAACTTATTATTTTGAAAATACATATAAAGGAAAGACTAATCTTGGAGATGATGTAAGACCAAATTATTGGTTGCTTAATACTCCCGATTATGATTTTCTTAGAATCTTTACAGGATTTACTTCTAATACACATCTTATAGTTAATAATACTATTCAGATGTTACCCACTAATCAAGGTGCTTATTTTATATTTCATATAGAGAATAAAGAGAATATTACGATTAGTGGTACAGGTGCTATTAACGGAGATGCTAAAGATCATTTATATACTGATCCTTTTGCTGGTACTAATTATTATGGTGAGTGGGGGCATGTTCTTAATTTTAGAAGTTGTAATAATGTAGTAGTTAGAGATATTACTATAGGATATGCTTTTGGAGATGGAATAGCTTTAGGTAACGCTGCTTATAATAATAGCGGAGTAAAAGAAGCTGGTTTAGCTACTAAAAATGTTACAATAGATGCTGTTAAAGTATTATATGCAAGACGTAACGGTATTTCTTTAGGAGGTAATAATTATACTATAACTAATGTTTATTTTGAAGGAAATGGTAGTGATACTATTAAAGGTACTGCTCCCATGGCAGCAATTGACTTTGAAAACGATTATGTAGATATAGAACCTTCTGGTTTATGTACAAATGTTTCAATGAATAATTGTAAATTTAAAGATAATAAATATGACGTTTCTTCTACTATTAGAGATGATTTATATGAAGTTCCAAGAGGAGAATTAGTTAATATTAGTGATTGTAATTTTACTTCTCCTTTAAGATTAAATAGGACTAACGGACTTACGTTTAGTAATTGTCATATAGTGGGTATTACTAATGTAGATAATTCTATTGCTGCTTGGTATGTAAGTAAGGATCTAGTATTTAATAGTTGTATATTTGATGAACTTAATCCTTATCTTGCTATTAGTGCAGAAGAACAGAATAAAAAGTTTATTAATCCTACTTATCCAGAAGATATTAGATATAGTACTACATTTCAACATAATCTTCCAGTAGGAAAAGCATTAAAATTTACTATACCTAAACCATTAGTTGGAGAAGTAGAACTTACAGCTTTTTGTAGTAATCCTAATTATAGTGCTATTCAAATGCCTATTAATACTACAATATATACATTTGGTCCAAGTCAAAGATTAACAGGTATTAGAGATATAAAAATAAAAGCCAGTCAAGATAGTACTCCGAGATACTCTATGTATAAGAATACTCCTGTGTTTTCTTATATAAATTATACAGAAGATTCTAATAATTTTATTATATATTTTGCTATTGGTGGAGATTTAATTGGAGATTCATATGCTTCTGCTACTTCTGTTAATATATTCTTAACTTCTAAAACTAAGTTTATTATTGTAGAAGCTCCTGTAAGTGGAAGACCTGATTATGCTGGCATGTATGGAGGTAAATGGTCTGAGTTATCTGCAATAATTAAAGAAAGTGTTGAGATATCTTCTATTCCATCTACTGTTACATTCCCCAGTAAAGAAATGTATTCAGGTAATATGCTTGCTGATTTACCTACATCTCTTACTGCTGATAAGGTTGGATTTAGTCAATTTGTTTTGGATAGTACTTATAAACGTCCTGTATTTTGGGATTCTTATTCTAATGTATTTAGAACAGCCGATGGAAATAAAGCATTAGAAAGAAGAGTGACATCTCTTGCAGAATTAGATGTTTTAACTGCTAAACTTACAGTAGATGATAGAGGTTATGTAGTATATTATACTGTAACAACTTCGTATCTTACTTGGAGAGGTACAGATTGGACAAATGAAGACGGAAGTTTATTTAGTAAAGTAAAATATATTAAGCAAACTAATACTATAGATATACTAAATATAATGTTTAGTTATTCTGGTGTTATATACAAAATTTGTGCAGATATAGATTTAGGTGGCGGAACGTTAACTATTGCTACTGGTTCTACTCTTGATTTTCAAGGTGGTAGTTTTAATAATGGAACGATTATAGGACAAAATACTAAAATAGAATCTGGATTAACTAAAATATTTGGAACAGATATAACTCTTAGTGGTATATGGATTGCAGATTCATTATCTCCTGAACATTTTGGAATTACTGGTATAGATGCTACTCAAGATACTACATATATTCAAAAAGCATTAGATTGCTGTTCGACTATTAATATAAAAACTGTTAAGTTACAAAATAAAATATATCAGATAAATAGTTCTTTACTTATACAAAGTAATATAAAATTAGAAGGAGCTACTTCAAGAGTTTGGAATAATGGTAGTGCAACAATATTATCTTTGGCTGAAAATATAGTAGGTATTACTGTAGAATCTACTGGAGTAGAAATAAATGATTTAAAAATAATAGGTAATACTACTAATACAGGTATTAGTTTTACTAATAGATCTTACTATTTTTCAGGTAATAGAATCATAACTACTGGACTTGGAATAGGTTTTGATATACAAAGCTCATGGACTTATATATTTAACTTATGTAGAATTGAAGGAGGAACTATTGGATTTAAGATTCAAGAAGGGACAAGTGGAACGTTTAATTCTTGTGTTGCATTTAGTTGTTCAGAATATGGATTCTATGTGACTAAATTAAATTATGGTAGTTTCAATGGTTGTGGAACAGATGGTTGTAAATATGGTTTTTATTTTACAGATGCTTGTAGAGGCGTTACTTTATCTTCTTGTGGATGTGAAAATACACAAGTAGGCGGTTATATGGTTAAGTGTGGTGCAAGAGCTTACGTTACTATAACAGCATTTAGTGTTGGTACTATGGCAGATGTAGATTGTGATCTATTTATATTTGAAGCTGATTGTAGAGTTAGTTTAATAGATTTAAATGTTGGTTCATTATATCATCCAACAGGTAATACCTTAAATGTGGCAAGTGGTGCTGCTGTTGCTTTAATTAATTGTTATTTAACTGGAACCAGTGTTGGATTAGAAAATTGTTCAGTTATTAGTCCTTATGGTAATACTCTTAAATATTCTACTACTGTAGATAAAATTAATACTAAAGAACTTGTTACTTCTTCTTTAGCAACTAATGCTACATATACTGTTTTATCAACTGCTCCATTAAATTCAGTATATTTAATTACTGCTGTTACTAATGGTAATTCTGCTGCAAGAGGTCTTGCTATTGTTACAATTCCTACTGACTATGGAATGGCAAGTGTTGATAATTTGGTAGCTAATGCAAATTGTCAAATTTCAATAGATGCTACTGGAAATATCATAGTAACAAATACAAGTACTTCAGCTAAAGCATATAGAGTATCTTTACTAAAACTTGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f022df76104a1e817b21fd0d5528138e95d727d1157e4248f0d99b11ecc1ca89
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8022
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Host interactions of novel Crassvirales species belonging to multiple families infecting bacterial host, Bacteroides cellulosilyticus WH2 Papudeshi,B., Vega,A.A., Souza,C., Giles,S.K., Mallawaarachchi,V., Roach,M.J., An,M., Jacobson,N., McNair,K., Mora,M.F., Pastrana,K., Boling,L., Leigh,C., Cram,C., Plewa,W.S., Grigson,S.R., Bouras,G., Decewicz,P., Luque,A., Droit,L., Handley,S.A., Wang,D., Segall,A., Dinsdale,E.A. and Edwards,R.A. 2023 — GenBank