Protein

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Genbank accession
UYE94920.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,68
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRTVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNAPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLVFVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDRLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHTAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATTGTINLTLPTGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPGAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELSYIEDTVAGTRYWVVQQNVPTVERVDAGSDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAIDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGADYTRAVTPKTLNDRRATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQNLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTGEFGGSLAANSTFTIRNTGASTRLIFEKGPQTGNNPFQTMNIRVWGNQFAGGSDTSRSTIFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDGTNTYFLLTAAGDQTGGFNGLRPLAINNTSGQVTIAEGLVIAKGVTINSGGLTVYPGIRSQGSKTADLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139414,48520 Da
isoelectric point:5,38984
aromaticity:0,07591
hydropathy:-0,29853

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–141
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1001–1275
DC_1209
UYE94920.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-141 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1275 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM-pJBB
[NCBI] 		3458551 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYE94920.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP114733.1 [NCBI]
CDS location
range 20358 -> 24233
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTACAGTTCGTACCGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAATGCGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACACGACCACGTTCACAACTAGTGTTTGTGTTTAGCAATCGTTTGTGGCAGATGTATATCATTGATTACGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGACACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAGATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATACTGCCGAAGGCAGAAATGACTCCGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAATGCTACAACCGGAACTATCAATCTTACGCTGCCTACCGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCGGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCGTTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGGTGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTATCGTATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTTCAACAAAACGTCCCTACGGTAGAACGTGTTGATGCTGGATCTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCATCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGCTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACGCCTAAGAAATTGCAGGCACGTCAGGGCTCTGAAACGCTGTCTGGTATAGTTAAATATGTATCGACTACTTCTGCTACTCCTGCTGAAACTCGTGGGGCTGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATGCTCAACAAGGCGCAGTAATTTTAGCTATTGATAGTGAAGTAATTGCTGGTCAATCACAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGGCTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAGAGCGACAGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAAGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAGTGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCCGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACACAGAACTTAGAGCTATACGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACACGAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACATTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGGTGAATTTGGTGGTTCTTTAGCTGCTAATAGCACATTTACTATTCGTAATACAGGTGCTTCAACTCGTTTGATATTTGAAAAAGGACCACAAACTGGAAATAACCCGTTTCAAACCATGAATATCCGAGTATGGGGTAACCAATTCGCTGGTGGTTCTGATACAAGTCGTTCTACGATATTTGAAGTTGGCGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAACGCAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGTATCAATGGTACTGTAATGCCAATAAACGTTAATGCTTCGGGTTCTTTGAACGCGAACGGCGTTGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACTGCTAATGGTGAATTCATCAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGGCACTAATACCTATTTTTTGCTCACTGCAGCAGGTGATCAGACTGGTGGTTTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATACATCCGGTCAGGTTACAATTGCCGAAGGGCTTGTTATTGCCAAAGGTGTTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACGGTTTATCCAGGAATTCGTTCACAAGGTTCTAAAACTGCTGACTTATATACCCGTGCACCAACATCTGATACCGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGTGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGAAACCCTCCTCAGCCATCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4493d4ad684e52196e852313c288164ce3cb604120c7512b698d6da4aafe1ba4
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5620
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Escherichia phage vB_EcoM-pJBB, a member of Mosigvirus Park,S.Y., Kwon,H.M. and Kim,J.H. 2019-03-28 — GenBank