Protein

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Genbank accession
UAW59375.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
Protein sequence
MAGYSARQSSFTTGDTILAAHSNDEFNQVLAAFNATTGHSHDGTAGEGGPVGVLRDADSNNKVLVDTSNNHLEFYVEVSSAAVQQLRIQDGAIVPITDSDIDLGTSSLEFKDLFIDGTANIDALVADTADINGGTVDGATLGTNSAITQAVIDNININGATIGHTSDTDLLTLASGVLTVAGEVSVTTLDIGGTNVTSTAAELNIVDGDTSATSTTVVDADRVVLNDNGSMVQVAVTDLAAYFDDEITAMPNLTSVGTLTTLTVDNVIINGSNIGHTGDTDLLTVASGVLTVAGELDAGSLDISGDADIDGTLEADAITVNGATLTEFITDAVGGMVSSNTETGIAVTFEDSDNTLDFALGSSQTTISSLTNTSLVIGRDADNDIDFATDNTILFRADGADQIKLVNGALAPVTDNDIDLGTSSLEFKDGFFDGTVTADAFAGPLTGDVTGNVSGTAATVTGAAQSNITSLGTLTTLTVDNVIINGTTIGHTDDTDLITLADGIATVAGEVSLTTLDIGGTNVTATAAELNLLDGGTSVGSSLTLADSDGIIMNDGGTMKSMPASDIKTYVGAGAGAFSIANLDIDGGTDIGEAIVDADLFIVDNGAGGTNRKVAASRLVTYVDANSSAASVGKAIAMAIVFG
Physico‐chemical
properties
protein length:643 AA
molecular weight: 64578,76790 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,03733
hydropathy:0,20482

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC033P
[NCBI] 		2873403 No lineage information
Host Candidadtus Pelagibacter sp. HTCC1062
[NCBI] 		198252 Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales > Candidatus Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UAW59375.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ892993.1 [NCBI]
CDS location
range 36145 -> 38076
strand -
CDS
ATGGCAGGCTATTCGGCACGACAGTCTAGTTTCACAACAGGTGATACTATACTTGCAGCTCATTCTAACGATGAGTTTAACCAGGTATTAGCTGCATTTAATGCAACAACAGGACACTCACATGATGGCACAGCTGGTGAGGGTGGACCTGTAGGTGTTCTTAGAGATGCAGACTCAAATAATAAAGTATTAGTTGATACCTCTAATAATCATTTAGAATTTTATGTAGAAGTATCTTCAGCTGCTGTACAGCAGTTAAGAATACAAGATGGTGCTATAGTACCTATTACAGATAGTGACATAGACTTAGGAACTTCCTCTCTTGAGTTTAAAGATCTATTTATTGATGGTACAGCAAATATTGATGCATTAGTGGCCGATACAGCCGATATAAACGGTGGTACGGTAGATGGGGCTACCCTTGGTACCAATAGTGCTATAACACAGGCTGTGATCGATAATATAAATATTAACGGTGCAACTATAGGGCATACATCAGATACAGATTTATTAACACTTGCTAGTGGTGTATTAACAGTAGCAGGTGAAGTATCAGTGACTACCTTAGACATTGGTGGTACAAATGTAACTTCAACAGCTGCAGAGTTAAATATAGTTGATGGTGATACATCTGCTACATCTACTACGGTTGTTGATGCAGATAGAGTTGTATTAAATGATAATGGATCAATGGTACAAGTTGCAGTTACAGATTTAGCTGCATACTTTGACGATGAAATTACAGCAATGCCTAATCTTACATCAGTAGGCACACTTACAACTTTAACAGTTGATAACGTAATTATTAATGGTTCTAATATTGGGCATACAGGTGACACAGATTTATTAACAGTTGCTAGTGGTGTATTAACAGTAGCTGGAGAATTAGATGCAGGATCTTTAGATATATCTGGTGATGCAGATATTGATGGAACATTAGAAGCAGATGCTATTACAGTTAATGGTGCTACTTTAACAGAATTTATAACAGATGCTGTTGGTGGTATGGTATCTTCTAATACTGAAACAGGTATTGCAGTTACATTTGAAGATAGTGATAATACATTAGATTTTGCTTTAGGATCTTCTCAAACTACAATATCATCATTAACAAATACAAGTTTAGTTATTGGTAGAGATGCTGATAATGACATAGATTTTGCAACAGATAATACAATACTATTTAGAGCAGATGGTGCTGACCAAATTAAATTAGTTAATGGTGCACTTGCACCTGTAACAGATAATGATATTGATTTAGGTACATCATCATTAGAATTTAAAGATGGCTTTTTTGATGGTACAGTAACAGCTGATGCTTTTGCAGGACCTTTAACAGGTGATGTAACAGGTAATGTATCTGGAACAGCAGCTACAGTAACTGGTGCTGCACAATCAAATATTACTTCATTAGGAACATTAACAACTTTAACTGTTGATAATGTAATTATTAATGGTACAACAATTGGACACACAGATGATACAGATTTAATTACATTAGCTGATGGTATTGCTACAGTTGCAGGAGAAGTTTCTTTAACAACTTTAGATATAGGTGGAACTAATGTAACAGCTACAGCAGCAGAACTTAATTTATTAGATGGTGGAACATCAGTAGGTAGTTCATTAACATTAGCAGATTCTGATGGTATTATAATGAATGATGGTGGTACTATGAAAAGTATGCCAGCATCAGATATTAAAACTTATGTTGGTGCAGGAGCTGGTGCTTTTTCTATAGCTAACTTAGATATAGATGGAGGTACAGATATAGGAGAAGCTATTGTAGATGCAGATTTATTTATAGTAGATAATGGAGCAGGAGGCACTAATAGAAAAGTTGCTGCTTCAAGATTAGTAACATATGTTGATGCAAACTCTAGTGCTGCATCAGTAGGAAAAGCAATTGCAATGGCAATTGTATTTGGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
3532015567a7980a720f6c57d577af1b7e441eef416efc75532a646a9ed8688e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6281
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Newly identified HMO-2011-type phages reveal genomic diversity and biogeographic pattern of marine HMO-2011-type group Qin,F., Du,S., Zhang,Z., Ying,H., Wu,Y., Yang,M. and Zhao,Y. 2022-01-12 — GenBank